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Apis mellifera
cluster # 1643 cluster # 1643       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1643#0 length = 756 sequences # 2  

consensusID : consensus_1643#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 756
fasta sequence
                              [CTTTTACATAGCACGGAACATGTTTATTATATTTCCACTTGTGTTTTTATTCTGTTAATTTCTCATATAATACTAACAAAAACATTTAATTACAAAACATGGTACGGGTTGGTGTGTTGTATTTTTTCTTTTTTGTATGTATTATGTATGTGTCATATGTAAATATATGTATATGTAAATATGTGTATATATGTATTGTGTGATGAAAGCATTAATTATGCGTCTCTATGTGGTATGCATATCATCTGGTTAATGTAAATATTACGATTATTTCATAAGTTCTCTACAAGTAGATGGATTTTATAACGACAATTTACACGCTGAACGCGTGCAGTAAATACGTCCCATTTGCCCGCAGCGTCTCTTCGTTTAATTTTACATTCATCACGACTTCGTCTTGTATGGGCCTACGACCAATTCTTTTCTATAATTCTATTCCGATGAATATGCAAACGCAAAAGAGATAGAAACGCTACTATATAGTATGCGATACAATAATATATAATCGTATCTCAATATTAATCAATATTATAAATAGTTTTTAATAATTATTTGTCCAAACACTGAATATTTTACAACAGCCATCGATCTCAACTATTCATAATTCTATTAAACAGTTTGCAACTTTTACAGTNNNAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATATTATGCGTAGCGTGTCTGATCCAATATCATATCAATAATAGGGATATATCATAAATTTTGTAATTTGCTAAAAAATATTCTCTAAAAAAA]

[-] EMBL BI515938             [CTTTTACATAGCACGGAACATGTTTATTATATTTCCACTTGTGTTTTTATTCTGTTAATTTCTCATATAATACTAACAAAAACATTTAATTACAAAACATGGTACGGGTTGGTGTGTTGTATTTTTTCTTTTTTGTATGTATTATGTATGTGTCATATGTAAATATATGTATATGTAAATATGTGTATATATGTATTGTGTGATGAAAGCATTAATTATGCGTCTCTATGTGGTATGCATATCATCTGGTTAATGTAAATATTACGATTATTTCATAAGTTCTCTACAAGTAGATGGATTTTATAACGACAATTTACACGCTGAACGCGTGCAGTAAATACGTCCCATTTGCCCGCAGCGTCTCTTCGTTTAATTTTACATTCATCACGACTTCGTCTTGTATGGGCCTACGACCAATTCTTTTCTATAATTCTATTCCGATGAATATGCAAACGCAAAAGAGATAGAAACG                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI505543             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGTAAATACGTCCCATTTGCCCGCAGCGTCTCTTCGTTTAATTTTACATTCATCACGACTTCGTCTTGTATGGGCCTACGACCAATTCTTTTCTATAATTCTATTCCGATGAATATGCAAACGCAAAAGAGATAGAAACGCTACTATATAGTATGCGATACAATAATATATAATCGTATCTCAATATTAATCAATATTATAAATAGTTTTTAATAATTATTTGTCCAAACACTGAATATTTTACAACAGCCATCGATCTCAACTATTCATAATTCTATTAAACAGTTTGCAACTTTTACAGTNNNAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATATTATGCGTAGCGTGTCTGATCCAATATCATATCAATAATAGGGATATATCATAAATTTTGTAATTTGCTAAAAAATATTCTCTAAAAAAA]


>consensus_1643#0 CTTTTACATAGCACGGAACATGTTTATTATATTTCCACTTGTGTTTTTATTCTGTTAATT TCTCATATAATACTAACAAAAACATTTAATTACAAAACATGGTACGGGTTGGTGTGTTGT ATTTTTTCTTTTTTGTATGTATTATGTATGTGTCATATGTAAATATATGTATATGTAAAT ATGTGTATATATGTATTGTGTGATGAAAGCATTAATTATGCGTCTCTATGTGGTATGCAT ATCATCTGGTTAATGTAAATATTACGATTATTTCATAAGTTCTCTACAAGTAGATGGATT TTATAACGACAATTTACACGCTGAACGCGTGCAGTAAATACGTCCCATTTGCCCGCAGCG TCTCTTCGTTTAATTTTACATTCATCACGACTTCGTCTTGTATGGGCCTACGACCAATTC TTTTCTATAATTCTATTCCGATGAATATGCAAACGCAAAAGAGATAGAAACGCTACTATA TAGTATGCGATACAATAATATATAATCGTATCTCAATATTAATCAATATTATAAATAGTT TTTAATAATTATTTGTCCAAACACTGAATATTTTACAACAGCCATCGATCTCAACTATTC ATAATTCTATTAAACAGTTTGCAACTTTTACAGTNNNAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT TTAATATTATGCGTAGCGTGTCTGATCCAATATCATATCAATAATAGGGATATATCATAA ATTTTGTAATTTGCTAAAAAATATTCTCTAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)