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Apis mellifera
cluster # 1701 cluster # 1701       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1701#0 length = 946 sequences # 2  

consensusID : consensus_1701#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 946
fasta sequence
                              [GGAGCGGCCGCGTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTGATCTGATTGATGCGCGAAAAATATTGCGCTGATATCGTTGCATAGTTGGATACGAGTGATCAAAACGACTGATTCTCTATATAAGGTTAGATAATCGAATCATAAAACGATATCTTGGAAAAAGAAATTTTTAATTCAGCATGTGAATCGTGACTTAACAGTAACGTTTATATTCTTTCCATGAAACTAATTTAATCGCAGCTCAGTTATGCTTTGCGTAAAATATGTCAAGAAAAATAATACCACAATTCTATTTAATATATTATCAAAGGGTTGCTATTCTCGACGTAGCAATAAAAGCACAAACTCATACAAAATCGTTCAAGCAAATAGTGAAAACTTGAATGATGTGGATGGTGCTATGCTTGGAATAAATTCTAATTGGGAACTTTTAACACCTAGAGGATTCAGATTTTACTTACCGGGAAGCATTGGCCCTGGTTGGTCAGATGTAACCACAACTATTCAAGTTAGAACGCAATTAGTTGATTTTCATGACAATGATAAACAGATATCGATAGATGATTCTAAAGAAAAATCTGCTCCTCGATCGAATCGTTTGAAAGGGACTCGACATTCAATGCTTCATTGTGTTGCACAAGAATGTCCTTTACTGTTGAGAAAAGGTATAGAGGAATTATTTCCTGGATGTTTAGATGTTGGTTCTCCACAACTTACTATAATTACTATCAGTCAATCAATTAATTTTAAAGTTATGAAATGGAATAAAGAAATAGAAACTGAGAAACTAGCTAAATATTTTGTATTAGCAGCTTCGGATATTTGCGCAAAATTAAGGAGAATGGGTTATTGGGCAGATTTCATCAATCCATTTAGTGGACAACCACATTTAAATTTACAAAAAAATAATACTCTTTATAAAACGGATGAGCGATTTCGATGTTTAGGATT]

[+] EMBL BI516282             [GGAGCGGCCGCGTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTGATCTGATTGATGCGCGAAAAATATTGCGCTGATATCGTTGCATAGTTGGATACGAGTGATCAAAACGACTGATTCTCTATATAAGGTTAGATAATCGAATCATAAAACGATATCTTGGAAAAAGAAATTTTTAATTCAGCATGTGAATCGTGACTTAACAGTAACGTTTATATTCTTTCCATGAAACTAATTTAATCGCAGCTCAGTTATGCTTTGCGTAAAATATGTCAAGAAAAATAATACCACAATTCTATTTAATATATTATCAAAGGGTTGCTATTCTCGACGTAGCAATAAAAGCACAAACTCATACAAAATCGTTCAAGCAAATAGTGAAAACTTGAATGATGTGGATGGTGCTATGCTTGGAATAAATTCTAATTGGGAACTTTTAACACCTAGAGGATTCAGATTTTACTTACCGGGAAGCATTGGCCCTGGTTGGTCAGATGTAACCACAACTATTCAAGTTAGAACGCAATTAGTTGATTTTCATGACAATGATAAACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI505325             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGCACAAACTCATACAAAATCGTTCAAGCAAATAGTGAAAACTTGAATGATGTGGATGGTGCTATGCTTGGAATAAATTCTAATTGGGAACTTTTAACACCTAGAGGATTCAGATTTTACTTACCGGGAAGCATTGGCCCTGGTTGGTCAGATGTAACCACAACTATTCAAGTTAGAACGCAATTAGTTGATTTTCATGACAATGATAAACAGATATCGATAGATGATTCTAAAGAAAAATCTGCTCCTCGATCGAATCGTTTGAAAGGGACTCGACATTCAATGCTTCATTGTGTTGCACAAGAATGTCCTTTACTGTTGAGAAAAGGTATAGAGGAATTATTTCCTGGATGTTTAGATGTTGGTTCTCCACAACTTACTATAATTACTATCAGTCAATCAATTAATTTTAAAGTTATGAAATGGAATAAAGAAATAGAAACTGAGAAACTAGCTAAATATTTTGTATTAGCAGCTTCGGATATTTGCGCAAAATTAAGGAGAATGGGTTATTGGGCAGATTTCATCAATCCATTTAGTGGACAACCACATTTAAATTTACAAAAAAATAATACTCTTTATAAAACGGATGAGCGATTTCGATGTTTAGGATT]


>consensus_1701#0 GGAGCGGCCGCGTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTGATCTGATTGATGCGCGAAAAATATTG CGCTGATATCGTTGCATAGTTGGATACGAGTGATCAAAACGACTGATTCTCTATATAAGG TTAGATAATCGAATCATAAAACGATATCTTGGAAAAAGAAATTTTTAATTCAGCATGTGA ATCGTGACTTAACAGTAACGTTTATATTCTTTCCATGAAACTAATTTAATCGCAGCTCAG TTATGCTTTGCGTAAAATATGTCAAGAAAAATAATACCACAATTCTATTTAATATATTAT CAAAGGGTTGCTATTCTCGACGTAGCAATAAAAGCACAAACTCATACAAAATCGTTCAAG CAAATAGTGAAAACTTGAATGATGTGGATGGTGCTATGCTTGGAATAAATTCTAATTGGG AACTTTTAACACCTAGAGGATTCAGATTTTACTTACCGGGAAGCATTGGCCCTGGTTGGT CAGATGTAACCACAACTATTCAAGTTAGAACGCAATTAGTTGATTTTCATGACAATGATA AACAGATATCGATAGATGATTCTAAAGAAAAATCTGCTCCTCGATCGAATCGTTTGAAAG GGACTCGACATTCAATGCTTCATTGTGTTGCACAAGAATGTCCTTTACTGTTGAGAAAAG GTATAGAGGAATTATTTCCTGGATGTTTAGATGTTGGTTCTCCACAACTTACTATAATTA CTATCAGTCAATCAATTAATTTTAAAGTTATGAAATGGAATAAAGAAATAGAAACTGAGA AACTAGCTAAATATTTTGTATTAGCAGCTTCGGATATTTGCGCAAAATTAAGGAGAATGG GTTATTGGGCAGATTTCATCAATCCATTTAGTGGACAACCACATTTAAATTTACAAAAAA ATAATACTCTTTATAAAACGGATGAGCGATTTCGATGTTTAGGATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)