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Apis mellifera
cluster # 1704 cluster # 1704       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1704#0 length = 824 sequences # 2  

consensusID : consensus_1704#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 824
fasta sequence
                              [CGTATAATACACACGAGAAGCAAAAAGTCGTGCCGATTTACGATAATTAACACGATAAATGGAGAGTGAATAGGGCGGGAGGGAGGGCAGCGAACGAATGAACACTAATTTCCAAGATGAAAAGGAGAGGGCGAGAAATATTTTGTTACGTATAATAATGTGTATACTAGCCATAACGCGCCCGTCAAGCAAATCCCCTTAAATAACATTTTTTATTGGCATGTGTTTATCTTCGAAGTCATCGAAAAAAATGTATTCAACACGCGAGGACGCCATTTTATCCGTTTAGTTTTTCACGCGATCGCAGCGCCAAGAGTTTTAGCAAATCTATTATAGAAGGATTATTCGATGCTTTTAAACGCTAAATTTAGCGGAAAATTTGGTTTAATTCTATATTTAAAGTATGTATACACTTAAAAATATACGTAATTTTGTATTTATATTATATAATATCAAATAATTAATATTAATCTTGCATCAATTTGTGCAATGCTATTAATATATTTTAAAAATATATTCCTGTATTAAAATTGTTGACGCAGAATATCTGCGAAAGAAAAAAAAAATAAATTTAAAAAAAATAATAATTCTATGATCTACATTGGTCATTCGATCGCAGGATTAATATTAATAATTTAATAATGTTAATATATATTGTAATAACATATTGATTTATTATTACGTCTGGAATGTATAAAATCAACTCATTTAATCTCTTCAGGTACAAGTGTTGACATTGATCACAATAGCCATCAAGTGCATATGTACAGATTTATATATATATATTAATTAAGAATTTTTAATTTCTTAATTATAATCATAAA]

[+] EMBL BI511953             [CGTATAATACACACGAGAAGCAAAAAGTCGTGCCGATTTACGATAATTAACACGATAAATGGAGAGTGAATAGGGCGGGAGGGAGGGCAGCGAACGAATGAACACTAATTTCCAAGATGAAAAGGAGAGGGCGAGAAATATTTTGTTACGTATAATAATGTGTATACTAGCCATAACGCGCCCGTCAAGCAAATCCCCTTAAATAACATTTTTTATTGGCATGTGTTTATCTTCGAAGTCATCGAAAAAAATGTATTCAACACGCGAGGACGCCATTTTATCCGTTTAGTTTTTCACGCGATCGCAGCGCCAAGAGTTTTAGCAAATCTATTATAGAAGGATTATTCGATGCTTTTAAACGCTAAATTTAGCGGAAAATTTGATTTAATTCTATATTTAAAGTATATATACACTTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI512657             [                                                                                                                                                                                                                                 TTTATCTTCGAAGTCATCGAAAAAAATGTATTCAACACGCGAGGACGCCATTTTATCCGTTTAGTTTTTCACGCGATCGCAGCGCCAAGAGTTTTAGCAAATCTATTATAGAAGGATTATTCGATGCTTTTAAACGCTAAATTTAGCGGAAAATTTGGTTTAATTCTATATTTAAAATATGTATACACTTAAAAATATACGTAATTTTGTATTTATATTATATAATATCAAATAATTAATATTAATCTTGCATCAATTTGTGCAATGCTATTAATATATTTTAAAAATATATTCCTGTATTAAAATTGTTGACGCAGAATATCTGCGAAAGAAAAAAAAAATAAATTTAAAAAAAATAATAATTCTATGATCTACATTGGTCATTCGATCGCAGGATTAATATTAATAATTTAATAATGTTAATATATATTGTAATAACATATTGATTTATTATTACGTCTGGAATGTATAAAATCAACTCATTTAATCTCTTCAGGTACAAGTGTTGACATTGATCACAATAGCCATCAAGTGCATATGTACAGATTTATATATATATATTAATTAAGAATTTTTAATTTCTTAATTATAATCATAAA]


>consensus_1704#0 CGTATAATACACACGAGAAGCAAAAAGTCGTGCCGATTTACGATAATTAACACGATAAAT GGAGAGTGAATAGGGCGGGAGGGAGGGCAGCGAACGAATGAACACTAATTTCCAAGATGA AAAGGAGAGGGCGAGAAATATTTTGTTACGTATAATAATGTGTATACTAGCCATAACGCG CCCGTCAAGCAAATCCCCTTAAATAACATTTTTTATTGGCATGTGTTTATCTTCGAAGTC ATCGAAAAAAATGTATTCAACACGCGAGGACGCCATTTTATCCGTTTAGTTTTTCACGCG ATCGCAGCGCCAAGAGTTTTAGCAAATCTATTATAGAAGGATTATTCGATGCTTTTAAAC GCTAAATTTAGCGGAAAATTTGGTTTAATTCTATATTTAAAGTATGTATACACTTAAAAA TATACGTAATTTTGTATTTATATTATATAATATCAAATAATTAATATTAATCTTGCATCA ATTTGTGCAATGCTATTAATATATTTTAAAAATATATTCCTGTATTAAAATTGTTGACGC AGAATATCTGCGAAAGAAAAAAAAAATAAATTTAAAAAAAATAATAATTCTATGATCTAC ATTGGTCATTCGATCGCAGGATTAATATTAATAATTTAATAATGTTAATATATATTGTAA TAACATATTGATTTATTATTACGTCTGGAATGTATAAAATCAACTCATTTAATCTCTTCA GGTACAAGTGTTGACATTGATCACAATAGCCATCAAGTGCATATGTACAGATTTATATAT ATATATTAATTAAGAATTTTTAATTTCTTAATTATAATCATAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)