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Apis mellifera
cluster # 1809 cluster # 1809       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1809#0 length = 600 sequences # 2  

consensusID : consensus_1809#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 600
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTCAAGCGAATCGATTGTGATGTAAATCGAACCGTGATTAACAACGAGGAAGTTAGAGTGTCGCGAACGGCCGAGATTAATTTAGTAATTGTTAATACTATACCAGGCAATGCGACACGTACATAGCGACATACCTGCTGTCGAATTCGCCAGTCCGCTTAACGCTGAAACACAGAACACGTTCACGATATTAACAAGCGGAGTTAGTAACGTGTTTACATATTCAGCACGTATAAACTTGGAAATTTATTTTAGCCGATAACTCAACGTACGAAATAAAATATTCGTCGTGCGATATCATTGTTATTGCGATTACTTTGGCGTGCTTGGAGCGATCGACCTCGATCGCGGTTAACGATAGATAGACACGGAAGTATATATATATATGTGTATGTGTATACACATATATATATACATAAGTGACAAGAAGAAGACAGAAGGAATCGCGTTAATTTAACGAGGATTATTAAGGAACATGGACAAACACAATTGGTAATAATAATAATAATGAAAATAAATAAATTTCAACGTTACCGCGTCTCTATAATTATGTGCTTGATGGAAGTTTCTTGTTTTACTC]

[+] EMBL BI504945             [TTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTCAAGCGAATCGATTGTGATGTAAATCGAACCGTGATTAACAACGAGGAAGTTAGAGTGTCGCGAACGGCCGAGATTAATTTAGTAATTGTTAATACTATACCAGGCAATGCGACACGTACATAGCGACATACCTGCTGTCGAATTCGCCAGTCCGCTTAACGCTGAAACACAGAACACGTTCACGATATTAACAAGCGGAGTTAGTAACGTGTTTACATATTCAGCACGTATAAACTTGGAAATTTATTTTAGCCGATAACTCAACGTACGAAATAAAATATTCGTCGTGCGATATCATTGTTATTGCGATTACTTTAGCGTGCTTTGAGCGATCGACCTCGATCGCGGTTAACGATAGATAGACACGGAAG  TATATATATATGTATATGTATATACATATATATATATACATAAGTGACAAGAAGAAGACAGAAGGAATCGCGTTAATTTAACGAAGATTATTAAGGAACATGGACAAACACAATTGGTAATAATAATAATAATGAAAATAAA                                                              ]
[+] EMBL BI505883             [                                                GAACCGTGATTAACAACGAGGAAGTTAGAGTGTCGCGAACGGCCGAGATTAATTTAGTAATTGTTAATACTATACCAGGCAATGCGACACGTACATAGCGACATACCTGCTGTCGAATTCGCCAGTCCGCTTAACGCTGAAACACAGAACACGTTCACGATATTAACAAGCGGAGTTAGTAACGTGTTTACATATTCAGCACGTATAAACTTGGAAATTTATTTTAGCCGATAACTCAACGTACGAAATAAAATATTCGTCGTGCGATATCATTGTTATTGCGATTACTTTGGCGTGCTTGGAGCGATCGACCTCGATCGCGGTTAACGATAGATAGACACGGAAGTATATATATATATATGTATATGTATATACATATATATATACATAAGTGACAAGAAGAAGACAGAAGGAATCGCGTTAATTTAACGAGGATTATTAAGGAACATGGACAAACACAATTGGTAATAATAATAATAATGAAAATAAATAAATTTCAACGTTACCGCGTCTCTATAATTATGTGCTTGATGGAAGTTTCTTGTTTTACTC]


>consensus_1809#0 TTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTCAAGCGAATCGATTGTGATGTAAATCGAACCGTGATTA ACAACGAGGAAGTTAGAGTGTCGCGAACGGCCGAGATTAATTTAGTAATTGTTAATACTA TACCAGGCAATGCGACACGTACATAGCGACATACCTGCTGTCGAATTCGCCAGTCCGCTT AACGCTGAAACACAGAACACGTTCACGATATTAACAAGCGGAGTTAGTAACGTGTTTACA TATTCAGCACGTATAAACTTGGAAATTTATTTTAGCCGATAACTCAACGTACGAAATAAA ATATTCGTCGTGCGATATCATTGTTATTGCGATTACTTTGGCGTGCTTGGAGCGATCGAC CTCGATCGCGGTTAACGATAGATAGACACGGAAGTATATATATATATGTGTATGTGTATA CACATATATATATACATAAGTGACAAGAAGAAGACAGAAGGAATCGCGTTAATTTAACGA GGATTATTAAGGAACATGGACAAACACAATTGGTAATAATAATAATAATGAAAATAAATA AATTTCAACGTTACCGCGTCTCTATAATTATGTGCTTGATGGAAGTTTCTTGTTTTACTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)