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Apis mellifera
cluster # 2054 cluster # 2054       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2054#0 length = 1187 sequences # 2  

consensusID : consensus_2054#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1187
fasta sequence
                              [GGATTAGTTCGTATTATTACGATTTTCTCCAAATAGACCGAAGCTCAAAAATGATTGCTGTTTCGGGACCAAGTTATGAAGCTTTCTCTTACGGTGGCCAAGCCAGATTCAATAATCAAACAGTGGTTGACAAAGTTCCACCTGATATGCTTCATCTGATTGACGCTAATTGGTATCAATACCCGCCATTAAATCCTATGTGGCATGGAATCCTTGGATTCGTAATAGGCATGCTTGGCTTTGTCTCGGCTATGGGAAATGGAATGGTCGTATATATATTTCTTTCAACAAAAAGTCTTCGCACGCCAAGCAATTTGTTCGTAATCAACCTTGCCATCAGTAATTTCCTCATGATGTTTTGCATGTCTCCACCTATGGTAATCAATTGTTATTACGAGACATGGGTACTAGGACCTCTTTTCTGTCAAATCTACGCGATGTTGGGCTCCTTGTTCGGATGTGGCTCCATTTGGACAATGACGATGATCGCATTCGACAGATACAACGTAATCGTGAAAGGTTTATCCGGTAAACCGCTGTCCATTAATGGGGCTCTCATTCGTATAATAGCTATATGGTTGTTCTCTCTCGGATGGACTATTGCACCTATGTTTGGCTGGAATCGATATGTACCTGAAGGTAATATGACCGCTTGCGGCACCGATTACTTCAACAGAGGATTATTATCTGCTTCTTACCTTGTCTGCTACGGCATTTGGGTTTACTTCGTCCCTCTGTTCCTCATCATTTATAGCTATTGGTTTATCATTCAAGCGGTAGCTGCCCATGAGAAGAATATGCGCGAGCAAGCAAAAAAGATGAATGTTGCTTCTCTCCGATCGTCTGAGAATCAAAACACTAGTGCCGAATGTAAATTGGCCAAAGTTGCTCTTATGACAATCTCTTTATGGTTTATGGCTTGGACTCCGTATCTCGTCATTAATTTCTCGGGTATATTCAATCTCGTTAAAATCAGCCCACTTTTTACCATCTGGGGTTCTCTCTTTGCCAAAGCCAACGCAGTTTACAATCCGATCGTTTATGGAATTAGTCATCCGAAATATCGAGCTGCGCTGTTTGCGAAATTCCCATCATTGGCGTGCGCTGCTGAACCATCCTCAGACGCTGTATCCACAACCTCCGGTACAACTACTGTTACGGATAACGAAAAATCTAATGCGTAAAAT]

[+] EMBL AM26026              [GGATTAGTTCGTATTATTACGATTTTCTCCAAATAGACCGAAGCTCAAAAATGATTGCTGTTTCGGGACCAAGTTATGAAGCTTTCTCTTACGGTGGCCAAGCCAGATTCAATAATCAAACAGTGGTTGACAAAGTTCCACCTGATATGCTTCATCTGATTGACGCTAATTGGTATCAATACCCGCCATTAAATCCTATGTGGCATGGAATCCTTGGATTCGTAATAGGCATGCTTGGCTTTGTCTCGGCTATGGGAAATGGAATGGTCGTATATATATTTCTTTCAACAAAAAGTCTTCGCACGCCAAGCAATTTGTTCGTAATCAACCTTGCCATCAGTAATTTCCTCATGATGTTTTGCATGTCTCCACCTATGGTAATCAATTGTTATTACGAGACATGGGTACTAGGACCTCTTTTCTGTCAAATCTACGCGATGTTGGGCTCCTTGTTCGGATGTGGCTCCATTTGGACAATGACGATGATCGCATTCGACAGATACAACGTAATCGTGAAAGGTTTATCCGGTAAACCGCTGTCCATTAATGGGGCTCTCATTCGTATAATAGCTATATGGTTGTTCTCTCTCGGATGGACTATTGCACCTATGTTTGGCTGGAATCGATATGTACCTGAAGGTAATATGACCGCTTGCGGCACCGATTACTTCAACAGAGGATTATTATCTGCTTCTTACCTTGTCTGCTACGGCATTTGGGTTTACTTCGTCCCTCTGTTCCTCATCATTTATAGCTATTGGTTTATCATTCAAGCGGTAGCTGCCCATGAGAAGAATATGCGCGAGCAAGCAAAAAAGATGAATGTTGCTTCTCTCCGATCGTCTGAGAATCAAAACACTAGTGCCGAATGTAAATTGGCCAAAGTTGCTCTTATGACAATCTCTTTATGGTTTATGGCTTGGACTCCGTATCTCGTCATTAATTTCTCGGGTATATTCAATCTCGTTAAAATCAGCCCACTTTTTACCATCTGGGGTTCTCTCTTTGCCAAAGCCAACGCAGTTTACAATCCGATCGTTTATGGAATTAGTCATCCGAAATATCGAGCTGCGCTGTTTGCGAAATTCCCATCATTGGCGTGCGCTGCTGAACCATCCTCAGACGCTGTATCCACAACCTCCGGTACAACTACTGTTACGGATAACGAAAAATCTAATGCGTAAAAT]
[+] EMBL BI504256             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GCTGGAATCGATATGTACCTGAAGGTAATATGACCGCTTGCGGCACCGATTACTTCAACAGAGGATTATTATCTGCTTCTTACCTTGTCTGCTACGGCATTTGGGTTTACTTCGTCCCTCTGTTCCTCATCATTTATAGCTATTGGTTTATCATTCAAGCGGTAGCTGCCCATGAGAAGAATATGCGCGAGCAAGCAAAAAAGATGAATGTTGCTTCTCTCCGATCGTCTGAGAATCAAAACACTAGTGCCGAATGTAAATTGGCCAAAGTTGCTCTTATGACAATCTCTTTATGGTTTATGGCTTGGACTCCGTATCTCGTCATTAATTTCTCGGGTATATTCAATCTCGTTAAAATCAGCCCACTTTTTACCATCTGGGGTTCTCTCTTTGCCAAAGCCAACGCAGTTTACAATCCGATCGTTTATGGAATTAGTCATCCGAAATATCGAGCTGCGCTGTTTGCGAAATTCCCATCATTGGCGTGCGCTGCTGAACCA                                                                        ]


>consensus_2054#0 GGATTAGTTCGTATTATTACGATTTTCTCCAAATAGACCGAAGCTCAAAAATGATTGCTG TTTCGGGACCAAGTTATGAAGCTTTCTCTTACGGTGGCCAAGCCAGATTCAATAATCAAA CAGTGGTTGACAAAGTTCCACCTGATATGCTTCATCTGATTGACGCTAATTGGTATCAAT ACCCGCCATTAAATCCTATGTGGCATGGAATCCTTGGATTCGTAATAGGCATGCTTGGCT TTGTCTCGGCTATGGGAAATGGAATGGTCGTATATATATTTCTTTCAACAAAAAGTCTTC GCACGCCAAGCAATTTGTTCGTAATCAACCTTGCCATCAGTAATTTCCTCATGATGTTTT GCATGTCTCCACCTATGGTAATCAATTGTTATTACGAGACATGGGTACTAGGACCTCTTT TCTGTCAAATCTACGCGATGTTGGGCTCCTTGTTCGGATGTGGCTCCATTTGGACAATGA CGATGATCGCATTCGACAGATACAACGTAATCGTGAAAGGTTTATCCGGTAAACCGCTGT CCATTAATGGGGCTCTCATTCGTATAATAGCTATATGGTTGTTCTCTCTCGGATGGACTA TTGCACCTATGTTTGGCTGGAATCGATATGTACCTGAAGGTAATATGACCGCTTGCGGCA CCGATTACTTCAACAGAGGATTATTATCTGCTTCTTACCTTGTCTGCTACGGCATTTGGG TTTACTTCGTCCCTCTGTTCCTCATCATTTATAGCTATTGGTTTATCATTCAAGCGGTAG CTGCCCATGAGAAGAATATGCGCGAGCAAGCAAAAAAGATGAATGTTGCTTCTCTCCGAT CGTCTGAGAATCAAAACACTAGTGCCGAATGTAAATTGGCCAAAGTTGCTCTTATGACAA TCTCTTTATGGTTTATGGCTTGGACTCCGTATCTCGTCATTAATTTCTCGGGTATATTCA ATCTCGTTAAAATCAGCCCACTTTTTACCATCTGGGGTTCTCTCTTTGCCAAAGCCAACG CAGTTTACAATCCGATCGTTTATGGAATTAGTCATCCGAAATATCGAGCTGCGCTGTTTG CGAAATTCCCATCATTGGCGTGCGCTGCTGAACCATCCTCAGACGCTGTATCCACAACCT CCGGTACAACTACTGTTACGGATAACGAAAAATCTAATGCGTAAAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)