Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 2215 cluster # 2215       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2215#0 length = 995 sequences # 2  
consensusID : consensus_2215#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 995
fasta sequence 
                              [TTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAATATGTTTCTAAGATTTAATTATTTATTATACATAAAATAATTGCCAATTAGGAATTTCAACTTTTAATATTTTTATGAGCGTTTTGTTTAGAATATATGTATTATCATATATATATATTTAAAACAATTTATACTCTATCCATGCATTGTACGTAAATTTACTTTATACATATGTACATATGTAATTAACTTAATAAAAGCTATGTATATATATGTGTATCAAACACACGATCTTGCTGACTTTACAGAAACATTTTAAAAAATATATTGTGAATATTTCATTCTAGTATTGATATCATTTCTATTTATATATTGAATTCGTATAATAATATACGCGTATATAAATATATAATTAAGAATGAAATATTCATAAAAAATATATGTATATATATATATATAATATATATAATATATATAATATATATATATAATATATATATATATATATAAATAAGGTACATATTTGTGCCATTAAGCGTTATATCTTTCAAATTCATTCAATTCAATGCAATTTAAAATTGCCATTAAAATGTATGTACACTTACATTAGTTGAAGCTTTTGAATTTTTATATAAACATTATTTGCCAGCAAATAATAGCATTTGTTAATTGACTCAATAATAATGTTATCCTAAATGTGTACCACAATAAATTAATTTGAATAACTTCAGATTTCTGGTGGTGGACCATACATTGGATTTAATTGTTGTGTACAACGTATAAATGTAGCACGTCGTGGTAGTTCACGTAATCGTTCAGCTCCTGTATACGTGCATGCTGATCGCAAACCACCCAATATATCCAATACAGTACTTTCTACTAGACCTTTGTAAGGCACTTCCACAGTTTTGCCTTCTGATGATCTATATTCAGCAANNNCAGCATGCTTCTTCATTGCTGTGCTTGAAGCCATGCCATAAAAAAGCTTATATTTTTTTCCATTTTTTTCTATAGTATCACCTCCACATTCC]

[+] EMBL BQ103768             [TTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAATATGTTTCTAAGATTTAATTATTTATTATACATAAAATAATTGCCAATTAGGAATTTCAACTTTTAATATTTTTATGAGCGTTTTGTTTAGAATATATGTATTATCATATATATATATTTAAAACAATTTATACTCTATCCATGCATTGTACGTAAATTTACTTTATACATATGTACATATGTAATTAACTTAATAAAAGCTATGTATATATATGTGTATCAAACACACGATCTTGCTGACTTTACAGAAACATTTTAAAAAATATATTGTGAATATTTCATTCTAGTATTGATATCATTTCTATTTATATATTGAATTCGTATAATAATATACGCGTATATAAATATATAATTAAGAATGAAATATTCATAAAAAATATATGTATATATATATATATAATATATATAATATATATAATATATATATATA  ATATATATATATATATAAATAAGGTACATATTTGTGCCATTAAGCGTTATATCTTTCAAATTCATTCAATTCAATGCAATTTAAAATTGCCATTAAAATGTATGTACACTTACATTAGTTGAAGCTTTTGAATTTTTATATAAACATTATTTGCCAGCAAATAATAGCATTTGTTAATTGACTCAATAATAATGTTATCCTAAATGTGTATCACAATAAATTAATTTGAATAACTTCAGATTTCTGGTGGTGGACCATACATTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL BI516270             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATATATATAATATATATAATATATATATATAATATATATATATATATATAAATAAGGTACATATTTGTGCCATTAAGCGTTATATCTTTCAAATTCATTCAATTCAATGCAATTTAAAATTGCCATTAAAATGTATGTACACTTACATTAGTTGAAGCTTTTGAATTTTTATATAAACATTATTTGCCAGCAAATAATAGCATTTGTTAATTGACTCAATAATAATGTTATCCTAAATGTGTACTACAATAAATTAATTTGAATAACTTCAGATTTCTGGTGGTGGACCATACATTGGATTTAATTGTTGTGTACAACGTATAAATGTAGCACGTCGTGGTAGTTCACGTAATCGTTCAGCTCCTGTATACGTGCATGCTGATCGCAAACCACCCAATATATCCAATACAGTACTTTCTACTAGACCTTTGTAAGGCACTTCCACAGTTTTGCCTTCTGATGATCTATATTCAGCAANNNCAGCATGCTTCTTCATTGCTGTGCTTGAAGCCATGCCATAAAAAAGCTTATATTTTTTTCCATTTTTTTCTATAGTATCACCTCCACATTCC]




>consensus_2215#0
TTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAATATGTTTCTAAGATTTAATTATTTATTATACATAAA
ATAATTGCCAATTAGGAATTTCAACTTTTAATATTTTTATGAGCGTTTTGTTTAGAATAT
ATGTATTATCATATATATATATTTAAAACAATTTATACTCTATCCATGCATTGTACGTAA
ATTTACTTTATACATATGTACATATGTAATTAACTTAATAAAAGCTATGTATATATATGT
GTATCAAACACACGATCTTGCTGACTTTACAGAAACATTTTAAAAAATATATTGTGAATA
TTTCATTCTAGTATTGATATCATTTCTATTTATATATTGAATTCGTATAATAATATACGC
GTATATAAATATATAATTAAGAATGAAATATTCATAAAAAATATATGTATATATATATAT
ATAATATATATAATATATATAATATATATATATAATATATATATATATATATAAATAAGG
TACATATTTGTGCCATTAAGCGTTATATCTTTCAAATTCATTCAATTCAATGCAATTTAA
AATTGCCATTAAAATGTATGTACACTTACATTAGTTGAAGCTTTTGAATTTTTATATAAA
CATTATTTGCCAGCAAATAATAGCATTTGTTAATTGACTCAATAATAATGTTATCCTAAA
TGTGTACCACAATAAATTAATTTGAATAACTTCAGATTTCTGGTGGTGGACCATACATTG
GATTTAATTGTTGTGTACAACGTATAAATGTAGCACGTCGTGGTAGTTCACGTAATCGTT
CAGCTCCTGTATACGTGCATGCTGATCGCAAACCACCCAATATATCCAATACAGTACTTT
CTACTAGACCTTTGTAAGGCACTTCCACAGTTTTGCCTTCTGATGATCTATATTCAGCAA
NNNCAGCATGCTTCTTCATTGCTGTGCTTGAAGCCATGCCATAAAAAAGCTTATATTTTT
TTCCATTTTTTTCTATAGTATCACCTCCACATTCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)