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Apis mellifera
cluster # 245 cluster # 245       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_245#0 length = 845 sequences # 5  

consensusID : consensus_245#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 845
fasta sequence
                              [AAAATTAAGAGAAGTTGTTGAAACACCTTTGTTACATCCAGAAAAATTTGTTAATTTGGGAATTGAACCACCTAAAGGAGTATTGTTATTTGGACCACCAGGTACAGGCAAAACTTTATGTGCTAGAGCTGTAGCTAATAGAACAGATGCTTGTTTTATTCGTGTAATTGGTTCAGAATTGGTTCAAAAATATGTTGGTGAGGGTGCTCGCATGGTAAGAGAATTATTCGAAATGGCACGTAGTAAAAAAGCTTGTTTAATATTTTTTGATGAAATTGATGCTATTGGAGGAGCTCGATTTGATGATGGAGCTGGTGGTGATAATGAAGTACAACGTACTATGCTTGAACTTATTAATCAATTAGATGGTTTTGATCCACGAGGTAATATTAAGGTATTAATGGCAACAAATAGACCAGATACACTAGATCCAGCATTGATGCGACCAGGACGTTTAGATAGGAAGGTAGAATTCGGATTACCGGACTTGGAAGGACGAACACATATTTTTAAAATTCATGCACGTTCAATGAGTGTAGAAAGAGACATCAGATTTGAACTTCTTGCACGTTTGTGCCCTAATAGTACTGGAGCTGAAATTCGTTCTGTTTGTACAGAAGCTGGTATGTTTGCAATTCGTGCACGTCGTAAAGTAGCTACGGAAAAAGACTTTTTAGAAGCTGTAAACAAAGTAATTAAATCTTATGCTAAATTTTCTGCAACTCCTAAATATATGACTTATAATTAAACAATTTATTCTTATTCTCAAATATTTATATGGTTACAATATTATATTGCTAATTATAACATACAAATTAATCATTATAATTTGATTATAAAATATA]

[+] EMBL BI516802             [AAAATTAAGAGAAGTTGTTGAAACACCTTTGTTACATCCAGAAAAATTTGTTAATTTGGGAATTGAACCACCTAAAGGAGTATTGTTATTTGGACCACCAGGTACAGGCAAAACTTTATGTGCTAGAGCTGTAGCTAATAGAACAGATGCTTGTTTTATTCGTGTAATTGGTTCAGAATTGGTTCAAAAATATGTTGGTGAGGGTGCTCGCATGGTAAGAGAATTATTCGAAATGGCACGTAGTAAAAAAGCTTGTTTAATATTTTTTGATGAAATTGATGCTATTGGAGGAGCTCGATTTGATGATGGAGCTGGTGGTGATAATGAAGTACAACGTACTATGCTTGAACTTATTAATCAATTAGATGGTTTTGATCCACGAGGTAATATTAAGGTATTAATGGCAACAAATAGACCAGATACACTAGATCCAGCATTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI516856             [                                                             ATTGAACCACCTAAAGGAGTATTGTTATTTGGACCACCAGGTACAGGCAAAACTTTATGTGCTAGAGCTGTAGCTAATAGAACAGATGCTTGTTTTATTCGTGTAATTGGTTCAGAATTGGTTCAAAAATATGTTGGTGAGGGTGCTCGCATGGTAAGAGAATTATTCGAAATGGCACGTAGTAAAAAAGCTTGTTTAATATTTTTTGATGAAATTGATGCTATTGGAGGAGCTCGATTTGATGATGGAGCTGGTGGTGATAATGAAGTACAACGTACTATGCTTGAACTTATTAATCAATTAGATGGTTTTGATCCACGAGGTAATATTAAGGTATTAATGGCAACAAATAGACCAGATACACTAGATCCAGCATTGATGCGACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI509976             [                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTTGATGAAATTGATGCTATTGGAGGAGCTCGATTTGATGATGGAGCTGGTGGTGATAATGAAGTACAACGTACTATGCTTGAACTTATTAATCAATTAGATGGTTTTGATCCACGAGGTAATATTAAGGTATTAATGGCAACANATAGACCAGATACACNNNATCCAGNNNTGATGCGACCAGGACGTTTAGATAGGAAGGTAGANNNCGGATTACCGGACTTGGAAGGACGAACACATATTTTTAAAATTCATGCACGTTCAATGAGTGTAGAAAGAGACATCAGATTTGAACTTCTTGCACGTTTGTGCCCTAATAGTACTGGAGCTGAAATTCGTTCTGTTTGTACAGAAGCTGGTATGTTTGCAATTCGTGCACGTCGTAAAGTAGCTACGGAAAAAGACTTTTTAGAAGCTGTAAACAAAGTAATTAAATGTTATGCTAAATTTTCTGCAACTCCTAAATATATGACTTATAATTAAACAATTTAT                                                                                        ]
[+] EMBL BI511072             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCTATTGGAGGAGCTCGATTTGATGATGGAGCTGGTGGTGATAATGAAGTACAACGTACTATGCTTGAACTTATTAATCAATTAGATGGTTTTGATCCACGAGGTAATATTAAGGTATTAATGGCAACAAATAGACCAGATACACTAGATCCAGCATTGATGCGACCAGGACGTTTAGATAGGAAGGTAGAATTCGGATTACCGGACTTGGAAGGACGAACACATATTTTTAAAATTCATGCACGTTCAATGAGTGTAGAAAGAGACATCAGATTTGAACTTCTTGCACGTTTGTGCCCTAATAGTACTGGAGCTGAAATTCGTTCTGTTTGTACAGAAGCTGGTATGTTTGCAATTCGTGCACGTCGTAAAGTAGCTACGGAAAAAGACTTTTTAGAAGCTGTAAACAAAGTAATTAAATCTTATGCTAAATTTTCTGCAACTCCTAAATATATGACTTATAATTAAACA                                                                                              ]
[+] EMBL BI514928             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTGGAGGAGCTCGATTTGATGATGGAGCTGGTGGTGATAATGAAGTACAACGTACTATGCTTGAACTTATTAATCAATTAGATGGTTTTGATCCACGAGGTAATATTAAGGTATTAATGGCAACAAATAGACCAGATACACTAGATCCAGCATTGATGCGACCAGGACGTTTAGATAGGAAGGTAGAATTCGGATTACCGGACTTGGAAGGACGAACACATATTTTTAAAATTCATGCACGTTCAATGAGTGTAGAAAGAGACATCAGATTTGAACTTCTTGCACGTTTGTGCCCTAATAGTACTGGAGCTGAAATTCGTTCTGTTTGTACAGAAGCTGGTATGTTTGCAATTCGTGCACGTCGTAAAGTAGCTACGGAAAAAGACTTTTTAGAAGCTGTAAACAAAGTAATTAAATCTTATGCTAAATTTTCTGCAACTCCTAAATATATGACTTATAATTAAACAATTTATTCTTATTCTCAAATATTTATATGGTTACAATATTATATTGCTAATTATAACATACAAATTAATCATTATAATTTGATTATAAAATATA]


>consensus_245#0 AAAATTAAGAGAAGTTGTTGAAACACCTTTGTTACATCCAGAAAAATTTGTTAATTTGGG AATTGAACCACCTAAAGGAGTATTGTTATTTGGACCACCAGGTACAGGCAAAACTTTATG TGCTAGAGCTGTAGCTAATAGAACAGATGCTTGTTTTATTCGTGTAATTGGTTCAGAATT GGTTCAAAAATATGTTGGTGAGGGTGCTCGCATGGTAAGAGAATTATTCGAAATGGCACG TAGTAAAAAAGCTTGTTTAATATTTTTTGATGAAATTGATGCTATTGGAGGAGCTCGATT TGATGATGGAGCTGGTGGTGATAATGAAGTACAACGTACTATGCTTGAACTTATTAATCA ATTAGATGGTTTTGATCCACGAGGTAATATTAAGGTATTAATGGCAACAAATAGACCAGA TACACTAGATCCAGCATTGATGCGACCAGGACGTTTAGATAGGAAGGTAGAATTCGGATT ACCGGACTTGGAAGGACGAACACATATTTTTAAAATTCATGCACGTTCAATGAGTGTAGA AAGAGACATCAGATTTGAACTTCTTGCACGTTTGTGCCCTAATAGTACTGGAGCTGAAAT TCGTTCTGTTTGTACAGAAGCTGGTATGTTTGCAATTCGTGCACGTCGTAAAGTAGCTAC GGAAAAAGACTTTTTAGAAGCTGTAAACAAAGTAATTAAATCTTATGCTAAATTTTCTGC AACTCCTAAATATATGACTTATAATTAAACAATTTATTCTTATTCTCAAATATTTATATG GTTACAATATTATATTGCTAATTATAACATACAAATTAATCATTATAATTTGATTATAAA ATATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)