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Apis mellifera
cluster # 248 cluster # 248       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_248#0 length = 596 sequences # 5  

consensusID : consensus_248#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 596
fasta sequence
                              [ATAATTGCAAAAATTTGAATAAAAGGTGTCATAAAAATGGTATCTGTTTTGAATACGGTTGATACCGGTCATGAAGATATGATTCATGATGCCGAAATGGATTATTATGGTTTGAGGTTAGCAACTTGTTCCAGTGATAATTCGATTAAAATTTTTGACTTAAAAAACGGAACGCAAAGTTTAGTGGCTGATCTTAAAGGTCATGTTGGACCTGTATGGCAGGTTACTTGGGCACATCCTAAGTTCGGAAATCTTTTAGCGTCCTGTAGTTATGATCGAAAAGTAATTATTTGGAAAGAATTAGGAGAATGGACCAAGATTTATGAGCACAATGGTCATGATTCCTCTGTTAATTCAGTAGCTTGGGCACCACATGAATTTGGCTTAATTTTAGCTTGTGGCAGCTCTGATGGTTCAGTATCTATACTTATTAATAATGGTGATACATGGGATACACAAAAAATTACAAATGCTCATTCAATTGGATGTAATGCTGTGAGTTGGTGTCCTGCTATTGAACCTAGTTTTGATGCTAGTGGAACACAAAGAAATGGACCAATAAAAAGATTAGNTACAGGAGGTTGTGATAATTTGGT]

[+] EMBL BI508083             [ATAATTGCAAAAATTTGAATAAAAGGTGTCATAAAAATGGTATCTGTTTTGAATACGGTTGATACCGGTCATGAAGATATGATTCATGATGCCGAAATGGATTATTATGGTTTGAGGTTAGCAACTTGTTCCAGTGATAATTCGATTAAAATTTTTGACTTAAAAAACGGAACGCAAAGTTTAGTGGCTGATCTTAAAGGTCATGTTGGACCTGTATGGCAGGTTACTTGGGCACATCCTAAGTTCGGAAATCTTTTAGCGTCCTGTAGTTATGATCGAAAAGTAATTATTTGGAAAGAATTAGGAGAATGGACCAAGATTTATGAGCACAATGGTCATGATTCCTCTGTTAATTCAGTAGCTTGGGCACCACATGAATTTGGCTTAATTTTAGCTTGTGGCAGCTCTGATGGTTCAGTATCTATACTTATTAATAATGGTGATACATGc                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI507516             [                                             GTTTTGAATACGGTTGATACCGGTCATGAAGATATGATTCATGATGCCGAAATGGATTATTATGGTTTGAGGTTAGCAACTTGTTCCAGTGATAATTCGATTAAAATTTTTGACTTAAAAAACGGAACGCAAAGTTTAGTGGCTGATCTTAAAGGTCATGTTGGACCTGTATGGCAGGTTACTTGGGCACATCCTAAGTTCGGAAATCTTTTAGCGTCCTGTAGTTATGATCGAAAAGTAATTATTTGGAAAGAATTAGGAGAATGGACCAAGATTTATGAGCACAATGGTCATGATTCCTCTGTTAATTCAGTAGCTTGGGCACCACATGAATTTGGCTTAATTTTAGNTTGTGGCAGCTCTGATGGTTCAGTATCTATACTTATTAATAATGGTGATACATGGGATACACAAAAAATTACAAATGCTCATTCAATTGGATGTAATGCTGTGAGTTGGTGTCCTGCTATTGAACCTAGTTTTGATGCTAGTGGAACACAAAGAAATGG                                          ]
[+] EMBL BI513053             [                                                                    TCATGAAGATATGATTCATGATGCCGAAATGGATTATTATGGTTTGAGGTTAGCAACTTGTTCCAGTGATAATTCGATTAAAATTTTTGACTTAAAAAACGGAACGCAAAGTTTAGTGGCTGATCTTAAAGGTCATGTTGGACCTGTATGGCAGGTTACTTGGGCACATCCTAAGTTCGGAAATCTTTTAGCGTCCTGTAGTTATGATCGAAAAGTAATTATTTGGAAAGAATTAGGAGAATGGACCAAGATTTATGAGCACAATGGTCATGATTCCTCTGTTAATTCAGTAGCTTGGGCACCACATGAATTTGGCTTAATTTTAGCTTGTGGCAGCTCTGATGGTTCAGTATCTATACTTATTAATAATGGTGATACATGGGATACACAAAAAATTACAAATGCTCATTCAATTGGATGTAATGCTGTGAGTTGGTGTCCTGCTATTGAACCTAGTTTTGATGCTAGTGGAA                                                       ]
[+] EMBL BI502708             [                                                                      ATGAAGATATGATTCATGATGCCGAAATGGATTATTATGGTTTGAGGTTAGCAACTTGTTCCAGTGATAATTCGATTAAAATTTTTGACTTAAAAAACGGAACGCAAAGTTTAGTGGCTGATCTTAAAGGTCATGTTGGACCTGTATGGCAGGTTACTTGGGCACATCCTAAGTTCGGAAATCTTTTAGCGTCCTGTAGTTATGATCGAAAAGTAATTATTTGGAAAGAATTAGGAGAATGGACCAAGATTTATGAGCACAATGGTCATGATTCCTCTGTTAATTCAGTAGCTTGGGCACCACATGAATTTGGCTTAATTTTAGCTTGTGGCAGCTCTGATGGTTCAGTATCTATACTTATTAATAATGGTGATACATGGGATACACAAAAAATTACAAATGCTCATTCAATTGGATGTAATGCTGTGAGTTGGTGTCCTGCTATTGAACCTAGTTTTGATGCTAGTGGAACACAAAGAAATGGACCAATAAAAAGATTAGNTACAGGAGGTTGTGATAATTTGGT]
[+] EMBL BI516499             [                                                                      ATGAAGATATGATTCATGATGCCGAAATGGATTATTATGGTTTGAGGTTAGCAACTTGTTCCAGTGATAATTCGATTAAAATTTTTGACTTAAAAAACGGAACGCAAAGTTTAGTGGCTGATCTTAAAGGTCATGTTGGACCTGTATGGCAGGTTACTTGGGCACATCCTAAGTTCGGAAATCTTTTAGCGTCCTGTAGTTATGATCGAAAAGTAATTATTTGGAAAGAATTAGGAGAATGGACCAAGATTTATGAGCACAATGGTCATGATTCCTCTGTTAATTCAGTAGCTTGGGCACCACATGAATTTGGCTTAATTTTAGCTTGTGGCAGCTCTGATGGTTCAGTATCTATACTTATTAATAATGGTGATACATGGGATACACAAAAAATTACAAATGCTCATTCAATTGGATGTAATGCTGTGAGTTGGTGTCCTGCTATTGAACCTNNTTTTGATGCTAGTGGAACACAAAGAAATGGACCAAT                                    ]


>consensus_248#0 ATAATTGCAAAAATTTGAATAAAAGGTGTCATAAAAATGGTATCTGTTTTGAATACGGTT GATACCGGTCATGAAGATATGATTCATGATGCCGAAATGGATTATTATGGTTTGAGGTTA GCAACTTGTTCCAGTGATAATTCGATTAAAATTTTTGACTTAAAAAACGGAACGCAAAGT TTAGTGGCTGATCTTAAAGGTCATGTTGGACCTGTATGGCAGGTTACTTGGGCACATCCT AAGTTCGGAAATCTTTTAGCGTCCTGTAGTTATGATCGAAAAGTAATTATTTGGAAAGAA TTAGGAGAATGGACCAAGATTTATGAGCACAATGGTCATGATTCCTCTGTTAATTCAGTA GCTTGGGCACCACATGAATTTGGCTTAATTTTAGCTTGTGGCAGCTCTGATGGTTCAGTA TCTATACTTATTAATAATGGTGATACATGGGATACACAAAAAATTACAAATGCTCATTCA ATTGGATGTAATGCTGTGAGTTGGTGTCCTGCTATTGAACCTAGTTTTGATGCTAGTGGA ACACAAAGAAATGGACCAATAAAAAGATTAGNTACAGGAGGTTGTGATAATTTGGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)