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Apis mellifera
cluster # 25 cluster # 25       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_25#0 length = 735 sequences # 13  

consensusID : consensus_25#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 735
fasta sequence
                              [GACAAAATGACTGGCTTCAGTAATAAGCCAATATTAATTGATGGCCGTGGCCATTTACTTGGTCGTTTAGCAGCAATTATTGCTAAAACGATTTTACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGTCATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTGGAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAAAGAGAGATAAACTCAAGAAACTTACCAAACAAGCTGGACAAACAGTTGCAAAGGCTACTGCACCATACACAGCAATTATTAATAATTTTGGATACAATTAATATAAAAATTATAAAAATAATAAAGTTCCATAAACATTTTATTTTGAATTNNNATTATATTTCAAATTATCATAATTATATATATATTTAATCCTTTAATAATATAATAAAATT]

[+] EMBL BI516966             [GACAAAATGACTGGCTTCAGTAATAAGCCAATATTAATTGATGGCCGTGGCCATTTACTTGGTCGTTTAGCAGCAATTATTGCTAAAACGATTTTACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGNTTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI511295             [                 CAGTAATAAGCCAATATTAATTGATGGCCGTGGCCATTTACTTGGTCGTTTAGCAGCAATTATTGCTAAAACGATTTTACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI505836             [                 CAGTAATAAGCCAATATTAATTGATGGCCGTGGCCATTTACTTGGTCGTTTAGCAGCAATTATTGCTAAAACGATTTTACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGTCATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTGGAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAA                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI509283             [                           CCAATATTAATTGATGGCCGTGGCCATTTACTTGGTCGTTTAGCAGCAATTATTGCTAAAACGATTTTACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGTCATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTGGAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAA                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI513133             [                                                   CATTTACTTGGTCGTTTAGCAGCAATTATTGCTAAAACGATTTTACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGTCATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTGGAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAAAGAGAGATAAACTCAAGAAACTTACCAAACAAGCTG                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI508777             [                                                     TTTACTTGGTCGTTTAGCAGCAATTATTGCTAAAACGATTTTACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGTCATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTGGAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAAAGAGAGATAAACTCAAGAAACTTACCAAACAAGCTGGACAAACAGTTGCAAAGGCTAC                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI506883             [                                                                                         GATTTTACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGTCATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTGGAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAAAGAGAGATAAACTCAAGAAACTTACCAAACAAGCTGGACAAACAGTTGCAAAGGCTACTGCACCATACACAGCAATTATTAATAATTTTGGATACAATTAATATAAAAATTATAAAAATAATAAAGTTCCATAAACATTTTATTTTGAATTGTTATTATATTTCAAATTATCATAATTATA                                  ]
[+] EMBL BI507898             [                                                                                               ACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAATACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGTCATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTGGAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAAAGAGAGATAAACTCAAGAAACTTACCAAACAAGCTGGACAAACAGTTGCAAAGGCTACTGCACCATACACAGCAATTAT                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI510699             [                                                                                               ACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGTCATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTGGAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAAAGAGAGATAAACTCAAGAAACTTACCAAACAAGCTGGACAAACAGTTGCAAAGGCTACTGCACCATACACAGCAATTATTAATAATTTTGGATACAATTAATATAAAAA                                                                                                          ]
[+] EMBL BI503472             [                                                                                               ACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGTCATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTGGAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAAAGAGAGATAAACTCAAGAAACTTACCAAACAAGCTGGACAAACAGTTGCAAAGGCTACTGCACCATACACAGCAATTATTAATAATTTTGGATACAATTAATATAAAAATT                                                                                                        ]
[+] EMBL BI515159             [                                                                                               ACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGTCATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTGGAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAAAGAGAGATAAACTCAAGAAACTTACCAAACAAGC                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BI503919             [                                                                                               ACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGTCATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTGGAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAAAGAGAGATAAACTCAAGAAACTTACCAAACAAGCTGGACAAACAGTTGCAAAGGCTACTGCACCATACACAGCAATTATTAATAATTTTGGATACAATTAATATAAAAATTATAAAAATAATAAAGTTCCATAAACATTTAAAAAAAAAaaa                                                               ]
[+] EMBL BI513244             [                                                                                               ACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTTCGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCCTTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCCAGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAAGATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAACGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGTCATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTGGAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAAAGAGAGATAAACTCAAGAAACTTACCAAACAAGCTGGACAAACAGTTGCAAAGGCTACTGCACCATACACAGCAATTATTAATAATTTTGGATACAATTAATATAAAAATTATAAAAATAATAAAGTTCCATAAACATTTTATTTTGAATTNNNATTATATTTCAAATTATCATAATTATATATATATTTAATCCTTTAATAATATAATAAAATT]


>consensus_25#0 GACAAAATGACTGGCTTCAGTAATAAGCCAATATTAATTGATGGCCGTGGCCATTTACTT GGTCGTTTAGCAGCAATTATTGCTAAAACGATTTTACAAGGCAATAAAGTAATTGTTGTT CGTAGTGAACAACTTAATATTTCTGGTAATTTTTTCAGAAACAAGTTAAAGTTTATGTCC TTTCTACGTAAAAGATGTAATGTCAATCCAGCTCGTGGACCATTTCATTTCCGTGCTCCC AGTAAAATACTTTGGAAAACAGTTCGTGGAATGATTCCACATAAAACACAAAGAGGAAAA GATGCTCTCAGAAGATTGAAAGTATATGAAGGTTGTCCACCTCCATATGATCGTAGAAAA CGTGTTGTAGTACCAGGTGCTATGAGAGTTATGTGTCTCAAACCTGGCAGAAAGTACTGT CATGTAGGAAGATTATCTCATGAAGTTGGATGGAAATATAAGGCTGTGGTACGTACATTG GAGAATAAGAGACGTGTTCGATCAATTCTTGAAGTTCAAAAGAGAGATAAACTCAAGAAA CTTACCAAACAAGCTGGACAAACAGTTGCAAAGGCTACTGCACCATACACAGCAATTATT AATAATTTTGGATACAATTAATATAAAAATTATAAAAATAATAAAGTTCCATAAACATTT TATTTTGAATTNNNATTATATTTCAAATTATCATAATTATATATATATTTAATCCTTTAA TAATATAATAAAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)