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Apis mellifera
cluster # 2881 cluster # 2881       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2881#0 length = 1009 sequences # 2  

consensusID : consensus_2881#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1009
fasta sequence
                              [CGCCCATGGTTTCAAGTAATGTTTAAAGATAATTTTAAATATTATAAAAGTCGAAATCCTCGTCCTAATTTAAAAAATGTGATCGATTTGAATAATCCAGATTATAATAAAGTTATTAATTTTAAAGAAAAATTGCTTGATGTACAATGCGAACATGAATTGGGATTAAAATCAATAAAACATTGGAAAGTTTTTGAATTTTTAGATATTCCAGGACTTATTTTTATAAAAAATCCATTTACTACATATGGGCAACGATATTGGATTATAAAATGTTTAAAAGAATATTCAAAAAAACCACATAAATTAAATTTACATGCTCATGATATTTTAAATGATGATGAAAATTGGTGGGATATATGTTTTAAGAACTTTGATAAAGGTGAAATTAATACCAAATTAATATCAAAATTAAGATGGGCAACATTTGGATATCATCACAACTGGGAATACAAAATTATATTCTGAAAACATGCAAGACAAAAATACCTATAGAATTATCATTGTTAACATCATTTTTAGCACAAACATTAGGTTTTAAAGATTTTAAAGCTGAAGCAGCTATCATTAATTATTACAGAATGAATTCAACTTTAGCAGGGTCATACCGACCATTCTGAACTTAATGTAGAAGCTCCCTTATTTTCTATAAGTTTTGGTCAAACTGCAATATTTTTAATTGGGGGACTTATGCAAGAGGATACAACTAATGCTATATTTTTACGGAGTGGAGATATAATAATAATGTCTGGAATGTCTCGATTGAGATATCATGGTATACCAAAAATATTACTAACCATTGATAAACCATGGGATAATGAAGAATTAAATGATGATCAATGTAGTAGATTAAATCAAAATGATTGGAAAAAAGCAAAAATTTATATTTCTGATGCTAGAATAAATATGAATGTAAGACAAGTGTTAAAAGTTGGACAATTCTCCTTGTTATAAAATGCAAAATTGTCTTGTATATTTTTTATTAAAAATACTTATATCAATTACAAAA]

[+] EMBL BE844444             [CGCCCATGGTTTCAAGTAATGTTTAAAGATAATTTTAAATATTATAAAAGTCGAAATCCTCGTCCTAATTTAAAAAATGTGATCGATTTGAATAATCCAGATTATAATAAAGTTATTAATTTTAAAGAAAAATTGCTTGATGTACAATGCGAACATGAATTGGGATTAAAATCAATAAAACATTGGAAAGTTTTTGAATTTTTAGATATTCCAGGACTTATTTTTATAAAAAATCCATTTACTACATATGGGCAACGATATTGGATTATAAAATGTTTAAAAGAATATTCAAAAAAACCACATAAATTAAATTTACATGCTCATGATATTTTAAATGATGATGAAAATTGGTGGGATATATGTTTTAAGAACTTTGATAAAGGTGAAATTAATACCAAATTAATATCAAAATTAAGATGGGCAACATTTGGATATCATCACAACTGGG ATACAAAATTATATTCTG AAACATGCAAGACAAAAATACCTATAGAATTATCATTGTTAACATCATTTTTAGCACAAACATTAGGTTTTAAAGATTTTAAAGCTGAAGCAGCTATCATTAATTATTACAGAATGAATTCAACTTTAGCAGGGTCATACCGACCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL BE844445             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAAAATTAAGATGGGCAACATTTGGATATCATCACAACTGGGAATACAAAATTATATTCTGAAAACATGCAAGACAAAAATACCTATAGAATTATCATTGTTAACATCATTTTTAGCACAAACATTAGGTTTTAAAGATTTTAAAGCTGAAGCAGCTATCATTAATTATTACAGAATGAATTCAACTTTAGCA GGTCATACCGACCATTCTGAACTTAATGTAGAAGCTCCCTTATTTTCTATAAGTTTTGGTCAAACTGCAATATTTTTAATTGGGGGACTTATGCAAGAGGATACAACTAATGCTATATTTTTACGGAGTGGAGATATAATAATAATGTCTGGAATGTCTCGATTGAGATATCATGGTATACCAAAAATATTACTAACCATTGATAAACCATGGGATAATGAAGAATTAAATGATGATCAATGTAGTAGATTAAATCAAAATGATTGGAAAAAAGCAAAAATTTATATTTCTGATGCTAGAATAAATATGAATGTAAGACAAGTGTTAAAAGTTGGACAATTCTCCTTGTTATAAAATGCAAAATTGTCTTGTATATTTTTTATTAAAAATACTTATATCAATTACAAAA]


>consensus_2881#0 CGCCCATGGTTTCAAGTAATGTTTAAAGATAATTTTAAATATTATAAAAGTCGAAATCCT CGTCCTAATTTAAAAAATGTGATCGATTTGAATAATCCAGATTATAATAAAGTTATTAAT TTTAAAGAAAAATTGCTTGATGTACAATGCGAACATGAATTGGGATTAAAATCAATAAAA CATTGGAAAGTTTTTGAATTTTTAGATATTCCAGGACTTATTTTTATAAAAAATCCATTT ACTACATATGGGCAACGATATTGGATTATAAAATGTTTAAAAGAATATTCAAAAAAACCA CATAAATTAAATTTACATGCTCATGATATTTTAAATGATGATGAAAATTGGTGGGATATA TGTTTTAAGAACTTTGATAAAGGTGAAATTAATACCAAATTAATATCAAAATTAAGATGG GCAACATTTGGATATCATCACAACTGGGAATACAAAATTATATTCTGAAAACATGCAAGA CAAAAATACCTATAGAATTATCATTGTTAACATCATTTTTAGCACAAACATTAGGTTTTA AAGATTTTAAAGCTGAAGCAGCTATCATTAATTATTACAGAATGAATTCAACTTTAGCAG GGTCATACCGACCATTCTGAACTTAATGTAGAAGCTCCCTTATTTTCTATAAGTTTTGGT CAAACTGCAATATTTTTAATTGGGGGACTTATGCAAGAGGATACAACTAATGCTATATTT TTACGGAGTGGAGATATAATAATAATGTCTGGAATGTCTCGATTGAGATATCATGGTATA CCAAAAATATTACTAACCATTGATAAACCATGGGATAATGAAGAATTAAATGATGATCAA TGTAGTAGATTAAATCAAAATGATTGGAAAAAAGCAAAAATTTATATTTCTGATGCTAGA ATAAATATGAATGTAAGACAAGTGTTAAAAGTTGGACAATTCTCCTTGTTATAAAATGCA AAATTGTCTTGTATATTTTTTATTAAAAATACTTATATCAATTACAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)