These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_292#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 600 fasta sequence [GACTTTAATATTTTCGTCGACCTTTCGTTCTTTTGTTCA--CATTTATTGATCACGTTACGAGCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGTACCTAACGAACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTAAGACAGAAAGTTAGAAGAGAAAT-AAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTACATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTCGGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAGGAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAA-AGAGANNNAGAGAGCAAACGAGTAAAAAATAATAATAAACGAGTAAAGAGAAATTTTTTCATCTTAATTGCACGTTTATCCAAGTTCTTCCTCTCGTGATATAGCGTTTACACTTTTAACGATTTATCT--AAAAAAAAAAAAAAGTTTCTAAAATATAAGAGGAGAGATTATTGATGATAAATTAATTAATTAATTAAAAAAAAAAAAGTGGAAAAAA] [+] EMBL BI515459 [GACTTTAATATTTTCGTCGACCTTTCGTTCTTTTGTTCA CATTTATTGATCACGTTACGAGCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGTACCTAACGAACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTAAGACAGAAAGTTAGAAGAGAAAT AAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTACATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTCGGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAGGAGAAAAAAAGAAAAAAAAAAAN NNAGATATAGAGAGCAAACGAGTAAAAAATAATAATAAACGAGTAAAGAGAAATTTTTTCATCTTAATTGCACGTTTATCCAAGTTCTTCCTCTC ] [+] EMBL BI506249 [ GACCTTTCGTTCTTTTGTTCA CATTTATTGATCACGTTACGAGCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGTACCTAACGAACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTAAGACAGAAAGTTAGAAGAGAAAT AAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTACATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTCGGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAGGAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAGAGAGATATAGAGAGCAAACGAGTAAAAAATAATAATAAACGAGTAAAGAGAAATTTTTTCATCTTAATTGCACGTTTATCCAAGTTCTTCCTCTCGTGATATAGCGTTTACACTTTTAACGATTTATCT AAAAAAAAAAAAAAGTTTCTAAAATATAAGAGGAGAGATTATTGATGATAAATTAATTAATTAATTAAAAAAAAAAAAGTGGAAAAAA] [+] EMBL BI509760 [ GACCTTTCGTTCTTTTGTTCA CATTTATTGATCACGTTACGAGCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGTACCTAACGAACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTAAGACAGAAAGTTAGAAGAGAAAT AAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTACATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTCGGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAGGAGAAAAAAG AAAAAAAAAAAA AGAGANNNAGAGAGCAAACGAGTAAAAAATAATAATAAACGAGTAAAGAGAAATTTTTTCATCTTAATTGCACGTTTATCCAAGTTCTTCCTCTCGTGATATAGCGTTTACACTTTTAACGATTTATCT AAAAAAAAAAAAAAGTTTCTAAAATATAAGAGGAGAGATTATTGATGATAAATTAATTAATTAATTAAAAAAAAAAAAGTGGAAAAAA] [+] EMBL BI506737 [ TCGTTCTTTTGTTCACTCATTTATTGATCACGTTACGAGCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGCACCTAACGAACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTAAGACAGAAAGTTAGAAGAGAAATAAAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTACATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTCGGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAGGAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAA AGANNNAGAGAGCAAACGAGTAAAAAATAATAATAAACGAGTAAAGAGAAATTTTTTCATCTTAATTGCACGTTTATCCAAGTTCTTCCTCTCGTGATATAGCGTTTACACTTTTAACGATTTATCTAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTCTAAAATATAAGAGGAGAGATTATTGATGATAAATTAATTAATTA ] [+] EMBL BI504618 [ TTTTCACT CATTTATTGATCACGTTACGAGCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGCACCTAACGAACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTAAGACAGAAAGTTAGAAGAGAAATAAAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTACATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTCGGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAGGAGAAAAAAAAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |