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Apis mellifera
cluster # 398 cluster # 398       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_398#0 length = 575 sequences # 4  

consensusID : consensus_398#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 575
fasta sequence
                              [CTATGAATGGGAGAATATAATAACAATCAAAGTTATTACAATAATCGAGAGACGAAATTATGTCGTGATAACATGGAGAGGGATTCGATATCGTGATCGATATTCCTATAAAAATTTCTATAAAAAATGAATTNNNNGATAGAATGAAAACGAATATAAAAAAACGAATACATTTTCAATATTGTCGAACGAGCTACTCGACGAGATTATTAAAAATTTGTTATTGATTCAACGATTGGCAAGTTAAACATAATCGAAACGTGTTGCTCTTGGAATCTTTTTAAGATATTCTTTTTCGTTTTGAAACACCTCGAAAACTGATAGAAGATAAATTAAGTAACAATTCCTTGACCCTCGTTATCGATGAGCACACTTGTATCACGTTGAAGCACGTGTTGATATATATATTGCCTTGAAAATCGCGCGCCAGTTCCTCCGAAACCGACCACGGTCAATTATTATTATTATTACTGTTAATTATTTTATTAATAATTATTGCTATTATTATTATTATTATTATTTATACTATTATATATATATATTATATATATATAAACGTTTTAAAGATGAAGAAG]

[+] EMBL BI505011             [CTATGAATGGGAGAATATAATAACAATCAAAGTTATTACAATAATCGAGAGACGAAATTATGTCGTGATAACATGGAGAGGGATTCGATATCGTGATCGATATTCCTATAAAAATTTCTATAAAAAATGAATTNNNNGATAGAATGAAAACGAATATAAAAAAACGAATACATTTTCAATATTGTCGAACGAGCTACTCGACGAGATTATTAAAAATTTGTTATTGATTCAACNNTTGGCAAGTTAAACATAATCGAAACGTGTTGCTCTTGGAATCTTTTTAAGNTATTCTTTTTCGTTTTGAAACGCCTCGA    NNNTGGAAGATAAATTAAGTAACAATTCCTTGACCCTCGTTATCGATGAGCACACTTGTATC                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI504339             [CTATGAATGGGAGAATATAATAACAATCAAAGTTATTACAATAATCGAGAGACGAAATTATGTCGTGATAACATGGAGAGGGATTCGATATCGTGATCGATATTCCTATAAAAATTTCTATAAAAAATGAATTNNNNNATAGAATGAAAACGAATATAAAAAAACGAATACATTTTCAATATTGTCGAACGAGCTACTCGACGAGATTATTAAAAATTTGTTATTGATTCAACAATTGGCAAGTTAAACATAATCGAAACGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL BI505116             [                                                        ATTATGTTGTGATAACATGGAGAGGGATTCGATATCGTGATCGATATTCCTATAAAAATTTCTATAAAAAATGAATTGTAAGATAGAATGAAAACGAATATAAAAAAACGAATACATTTTCAATATTGTCGAACGAGCTACTCGACGAGATTATTAAAAATTTGTTATTGATTCAACGATTGGCAAGTTAAACATAATCAAAACGTGTTGCTCTTGGAATCTTTTTAAGATATTCTTTTTCGTTTTGAAACACCTCGAAAACTGATAGAAGATAAATTAAGTAACAATTCCTTGACCCTCGTTATCGATGAGCACACTTGTATCACGTTGAAGCACGTGTTGATATATATATTGCCTTGAAAATCGCGCGCCAGTTCCTCCGAAACCGACCACGGTCAATTATTATTATTATTACTGTTAATTATTTTATTAATAATTATTGCTATTATTATTATTATTATTATTTATACTATTATATATATATATTATATATATATAAACGTTTTAAAGATGAAGAAG]
[+] EMBL BI512308             [                                                              TTGTGATAACATGGAGAGGGATTCGATATCGTGATCGATATTCCTATAAAAATTTCTATAAAAAATGAATTGTAAGATAGAATGAAAACGAATATAAAAAAACGAATACATTTTCAATATTGTCGAACGAGCTACTCGACGAGATTATTAAAAATTTGTTATTGATTCAACGATTGGCAAGTTAAACATAATCAAAACGTGTTGCTCTTGGAATCTTTTTAAGATATTCTTTTTCGTTTTGAAACACCTCGAAAACTGATAGAAGATAAATTAAGTAACAATTCCTTGACCCTCGTTATCGATGAGCACACTTGTATCACGTTGAAGCACG                                                                                                                                                                                      ]


>consensus_398#0 CTATGAATGGGAGAATATAATAACAATCAAAGTTATTACAATAATCGAGAGACGAAATTA TGTCGTGATAACATGGAGAGGGATTCGATATCGTGATCGATATTCCTATAAAAATTTCTA TAAAAAATGAATTNNNNGATAGAATGAAAACGAATATAAAAAAACGAATACATTTTCAAT ATTGTCGAACGAGCTACTCGACGAGATTATTAAAAATTTGTTATTGATTCAACGATTGGC AAGTTAAACATAATCGAAACGTGTTGCTCTTGGAATCTTTTTAAGATATTCTTTTTCGTT TTGAAACACCTCGAAAACTGATAGAAGATAAATTAAGTAACAATTCCTTGACCCTCGTTA TCGATGAGCACACTTGTATCACGTTGAAGCACGTGTTGATATATATATTGCCTTGAAAAT CGCGCGCCAGTTCCTCCGAAACCGACCACGGTCAATTATTATTATTATTACTGTTAATTA TTTTATTAATAATTATTGCTATTATTATTATTATTATTATTTATACTATTATATATATAT ATTATATATATATAAACGTTTTAAAGATGAAGAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)