These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_408#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 672 fasta sequence [TGAAAAATGTCTATGGATGTCTGTCCATGTCAACACTATCAGCTGCTGCAGGAGTTTACATTCACATGTTCTCAGAGCTTTTACAAGCTAATTTCCTAACAACTCTTGGTACATTGGGTCTTCTCTTTGCCTTAGTCAGCACACCAGACAATGGAAAAAATCAAAAATTACGTCTTAGCTATCTTCTGGGATTTGCATTCTTCTCTGGACTTGGCCTGGGTCCTTTACTTCAATTAGTTATGAATGTTAATCCAAGTATTATAGTAACTGCTTTGATAGGAACAACTATTATATTTGTATCATTCAGTATTTCTTCTCTTTTGGCTGAAAGAGGACGTTGGTTGTATCTTGGTGGTACCTTAATTAGCTTGCTAAATATTATGGTTTTATTTTCATTCGTCAATCTCTTTTTACGTTGGTCCCTATTTTACCAAGCCCATTTATACATTGGTCTATTCTTGATGTGTNNNNNTTGTTATTTATGATACACAATTAATCATTGAAAAATTCCATATTGGTAGCAAAGATTTCATCCTACACTCCCTAGATCTATTCGTAGATTTCATCGGTATTTTCCGCTACCTCGTCATAATTCTCACACAAAAGGAAATGTCAAAAGATCAACGTAAACGCAGAGATTAAATGAAAGTAAAGAAAGCTGTAAAATATCAT] [+] EMBL BI517036 [TGAAAAATGTCTATGGATGTCTGTCCATGTCAACACTATCAGCTGCTGCAGGAGTTTACATTCACATGTTCTCAGAGCTTTTACAAGCTAATTTCCTAACAACTCTTGGTACATTGGGTCTTCTCTTTGCCTTAGTCAGCACACCAGACAATGGAAAAAATCAAAAATTACGTCTTAGCTATCTTCTGGGATTTGCATTCTTCTCTGGACTTGGCCTGGGTCCTTTACTTCAATTAGTTATGAATGTTAATCCAAGTATTATAGTAACTGCTTTGATAGGAACAACTATTATATTTGTATCATTCAGTATTTCTTCTCTTTTGGCTGAAAGAGGACGTTGGTTGTATCTTGGTGGTACCTTAATTAGC ] [+] EMBL BI517168 [ ATGGATGTCTGTCCATGTCAACACTATCAGCTGCTGCAGGAGTTTACATTCACATGTTCTCAGAGCTTTTACAAGCTAATTTCCTAACAACTCTTGGTACATTGGGTCTTCTCTTTGCCTTAGTCAGCACACCAGACAATGGAAAAAATCAAAAATTACGTCTTAGCTATCTTCTGGGATTTGCATTCTTCTCTGGACTTGGCCTGGGTCCTTTACTTCAATTAGTTATGAATGTTAATCCAAGTATTATAGTAACTGCTTTGATAGGAACAACTATTATATTTGTATCATTCAGTATTTCTTCTCTTTTGGCTGAAAGAGGACGTTGGTTGTATCTTGGTGGTACCTTAATTAGCTTGCTAAATATTATGGTTTTATTTTCATTCGTCAATCTCTTTTTACGTTGGTCCCTATTTTACCAAGCCCATTTATACAT ] [+] EMBL BI509836 [ GTCAACACTATCAGCTGCTGCAGGAGTTTACATTCACATGTTCTCAGAGCTTTTACAAGCTAATTTCCTAACAACTCTTGGTACATTGGGTCTTCTCTTTGCCTTAGTCAGCACACCAGACAATGGAAAAAATCAAAAATTACGTCTTAGCTATCTTCTGGGATTTGCATTCTTCTCTGGACTTGGCCTGGGTCCTTTACTTCAATTAGTTATGAATGTTAATCCAAGTATTATAGTAACTGCTTTGATAGGAACAACTATTATATTTGTATCATTCAGTATTTCTTCTCTTTTGGCTGAAAGAGGACGTTGGTTGTATCTTGGTGGTACCTTAATTAGCTTGCTAAATATTATGGTTTTATTTTCATTCGTCAATCTCTTTTTACGTTGGTCCCTATTTTACCAAGCCCATTTATACATTGGTCTATTCTTGATGTGTNNNNNTTGTTATTTATGATACACAATTAATCATTGAAAAATTCCATATTGGTAGCAAAGATTTCATCCTACACTCCCTAGATCTATTCGTAGATTTCATCGGTATTTTCCGCTACCTCGTCATAATTCTCACACAAAAGGAAATGTCAAAAGATCAACGTAAACGCAGAGATTAAATGAAAGTAAAGAAAGCTGTAAAATATCAT] [+] EMBL BI511071 [ ACATTGGGTCTTCTCTTTGCCTTAGTCAGCACACCAGACAATGGAAAAAATCAAAAATTACGTCTTAGCTATCTTCTGGGATTTGCATTCTTCTCTGGACTTGGCCTGGGTCCTTTACTTCAATTAGTTATGAATGTTAATCCAAGTATTATAGTAACTGCTTTGATAGGAACAACTATTATATTTGTATCATTCAGTATTTCTTCTCTTTTGGCTGAAAGAGGACGTTGGTTGTATCTTGGTGGTACCTTAATTAGCTTGCTAAATATTATGGTTTTATTTTCATTCGTCAATCTCTTTTTACGTTGGTCCCTATTTTACCAAGCCCATTTATACATTGGTCTATTCTTGATGTGT GGTTTTGTTATTTATGATACACAATTAATCATTGAAAAATTCCATATTGGTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |