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Apis mellifera
cluster # 408 cluster # 408       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_408#0 length = 672 sequences # 4  

consensusID : consensus_408#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 672
fasta sequence
                              [TGAAAAATGTCTATGGATGTCTGTCCATGTCAACACTATCAGCTGCTGCAGGAGTTTACATTCACATGTTCTCAGAGCTTTTACAAGCTAATTTCCTAACAACTCTTGGTACATTGGGTCTTCTCTTTGCCTTAGTCAGCACACCAGACAATGGAAAAAATCAAAAATTACGTCTTAGCTATCTTCTGGGATTTGCATTCTTCTCTGGACTTGGCCTGGGTCCTTTACTTCAATTAGTTATGAATGTTAATCCAAGTATTATAGTAACTGCTTTGATAGGAACAACTATTATATTTGTATCATTCAGTATTTCTTCTCTTTTGGCTGAAAGAGGACGTTGGTTGTATCTTGGTGGTACCTTAATTAGCTTGCTAAATATTATGGTTTTATTTTCATTCGTCAATCTCTTTTTACGTTGGTCCCTATTTTACCAAGCCCATTTATACATTGGTCTATTCTTGATGTGTNNNNNTTGTTATTTATGATACACAATTAATCATTGAAAAATTCCATATTGGTAGCAAAGATTTCATCCTACACTCCCTAGATCTATTCGTAGATTTCATCGGTATTTTCCGCTACCTCGTCATAATTCTCACACAAAAGGAAATGTCAAAAGATCAACGTAAACGCAGAGATTAAATGAAAGTAAAGAAAGCTGTAAAATATCAT]

[+] EMBL BI517036             [TGAAAAATGTCTATGGATGTCTGTCCATGTCAACACTATCAGCTGCTGCAGGAGTTTACATTCACATGTTCTCAGAGCTTTTACAAGCTAATTTCCTAACAACTCTTGGTACATTGGGTCTTCTCTTTGCCTTAGTCAGCACACCAGACAATGGAAAAAATCAAAAATTACGTCTTAGCTATCTTCTGGGATTTGCATTCTTCTCTGGACTTGGCCTGGGTCCTTTACTTCAATTAGTTATGAATGTTAATCCAAGTATTATAGTAACTGCTTTGATAGGAACAACTATTATATTTGTATCATTCAGTATTTCTTCTCTTTTGGCTGAAAGAGGACGTTGGTTGTATCTTGGTGGTACCTTAATTAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI517168             [            ATGGATGTCTGTCCATGTCAACACTATCAGCTGCTGCAGGAGTTTACATTCACATGTTCTCAGAGCTTTTACAAGCTAATTTCCTAACAACTCTTGGTACATTGGGTCTTCTCTTTGCCTTAGTCAGCACACCAGACAATGGAAAAAATCAAAAATTACGTCTTAGCTATCTTCTGGGATTTGCATTCTTCTCTGGACTTGGCCTGGGTCCTTTACTTCAATTAGTTATGAATGTTAATCCAAGTATTATAGTAACTGCTTTGATAGGAACAACTATTATATTTGTATCATTCAGTATTTCTTCTCTTTTGGCTGAAAGAGGACGTTGGTTGTATCTTGGTGGTACCTTAATTAGCTTGCTAAATATTATGGTTTTATTTTCATTCGTCAATCTCTTTTTACGTTGGTCCCTATTTTACCAAGCCCATTTATACAT                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI509836             [                            GTCAACACTATCAGCTGCTGCAGGAGTTTACATTCACATGTTCTCAGAGCTTTTACAAGCTAATTTCCTAACAACTCTTGGTACATTGGGTCTTCTCTTTGCCTTAGTCAGCACACCAGACAATGGAAAAAATCAAAAATTACGTCTTAGCTATCTTCTGGGATTTGCATTCTTCTCTGGACTTGGCCTGGGTCCTTTACTTCAATTAGTTATGAATGTTAATCCAAGTATTATAGTAACTGCTTTGATAGGAACAACTATTATATTTGTATCATTCAGTATTTCTTCTCTTTTGGCTGAAAGAGGACGTTGGTTGTATCTTGGTGGTACCTTAATTAGCTTGCTAAATATTATGGTTTTATTTTCATTCGTCAATCTCTTTTTACGTTGGTCCCTATTTTACCAAGCCCATTTATACATTGGTCTATTCTTGATGTGTNNNNNTTGTTATTTATGATACACAATTAATCATTGAAAAATTCCATATTGGTAGCAAAGATTTCATCCTACACTCCCTAGATCTATTCGTAGATTTCATCGGTATTTTCCGCTACCTCGTCATAATTCTCACACAAAAGGAAATGTCAAAAGATCAACGTAAACGCAGAGATTAAATGAAAGTAAAGAAAGCTGTAAAATATCAT]
[+] EMBL BI511071             [                                                                                                              ACATTGGGTCTTCTCTTTGCCTTAGTCAGCACACCAGACAATGGAAAAAATCAAAAATTACGTCTTAGCTATCTTCTGGGATTTGCATTCTTCTCTGGACTTGGCCTGGGTCCTTTACTTCAATTAGTTATGAATGTTAATCCAAGTATTATAGTAACTGCTTTGATAGGAACAACTATTATATTTGTATCATTCAGTATTTCTTCTCTTTTGGCTGAAAGAGGACGTTGGTTGTATCTTGGTGGTACCTTAATTAGCTTGCTAAATATTATGGTTTTATTTTCATTCGTCAATCTCTTTTTACGTTGGTCCCTATTTTACCAAGCCCATTTATACATTGGTCTATTCTTGATGTGT GGTTTTGTTATTTATGATACACAATTAATCATTGAAAAATTCCATATTGGTA                                                                                                                                                        ]


>consensus_408#0 TGAAAAATGTCTATGGATGTCTGTCCATGTCAACACTATCAGCTGCTGCAGGAGTTTACA TTCACATGTTCTCAGAGCTTTTACAAGCTAATTTCCTAACAACTCTTGGTACATTGGGTC TTCTCTTTGCCTTAGTCAGCACACCAGACAATGGAAAAAATCAAAAATTACGTCTTAGCT ATCTTCTGGGATTTGCATTCTTCTCTGGACTTGGCCTGGGTCCTTTACTTCAATTAGTTA TGAATGTTAATCCAAGTATTATAGTAACTGCTTTGATAGGAACAACTATTATATTTGTAT CATTCAGTATTTCTTCTCTTTTGGCTGAAAGAGGACGTTGGTTGTATCTTGGTGGTACCT TAATTAGCTTGCTAAATATTATGGTTTTATTTTCATTCGTCAATCTCTTTTTACGTTGGT CCCTATTTTACCAAGCCCATTTATACATTGGTCTATTCTTGATGTGTNNNNNTTGTTATT TATGATACACAATTAATCATTGAAAAATTCCATATTGGTAGCAAAGATTTCATCCTACAC TCCCTAGATCTATTCGTAGATTTCATCGGTATTTTCCGCTACCTCGTCATAATTCTCACA CAAAAGGAAATGTCAAAAGATCAACGTAAACGCAGAGATTAAATGAAAGTAAAGAAAGCT GTAAAATATCAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)