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Apis mellifera
cluster # 471 cluster # 471       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_471#0 length = 741 sequences # 4  

consensusID : consensus_471#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 741
fasta sequence
                              [TTCGAATTTTAGTTTTAAGAATATTCTTATTTTATCATCGATTTGTTTTAAGTTGCTCCTCCATTTCTTTTATTTATATTAACGTTAAGATAAGATAGAATTAACAGTTTTTGGCTGGTACGAATTATCTTTTGTACCGCCCTGTGTACTGCACGTTTTTCTCATTTTATGTATTAGTAATAATTCAAATTAGTTGTTAGTCTTTATTTTAAACGCAATAAGAATTTTATCGTTTTATTATTCACGCATTGAACCCGGTTATCGTTCATTATAATTCAGAAATTAAACATGAATTCACTTTTAAAAATCGAAAACGATTATTAAAATCGAACGATATGACGATTTTTACTGTTATCTATGGTATCTTTGTTCAACGGAACGAACGTATTTTTTTAAAGTCTCAACGAACGTGTTACACTCGTCCTCGTCGACGGTCGTTTTTTTAATAATGAAATCTCAAATTAAAAAAAAAAGTGTGCGATTACATAAAGGCGCGACTGTAATCCAATAATCCATCGCATTCATCGCAAATACTCGCAAATACGATTCTCGTACAACATCAGAAACAACGAAAAATCATGATTTTACTTAACTGTAACTTTTACAGAGGAGCAAGGTGAGAAAGAATGAAACGAGAGGAGTAAAATGCAAAATTCAAAACGGAGAGAAGGTACTCGTCGAAGCGATGCGTACGAAGTAAATTTATTCTCGAGTACGATAACTAATAGATCGATTATTTCA]

[+] EMBL BI507926             [TTCGAATTTTAGTTTTAAGAATATTCTTATTTTATCATCGATTTGTTTTAAGTTGCTCCTCCATTTCTTTTATTTATATTAACGTTAAGATAA CTAGAATTAACAGTTTTTGGCTGGTACGAATTATCTTTTGTACCGCCCTGTGTACTGCACGTTTTTCTCATTTTATGTATTAGTAATAATTCAAATTAGTTGTTAGTCTTTATTTTAAACGCAATAAGAATTTTATCGTTTTATTATTCACGCATTGAACCCGGTTATCGTTCATTATAATTCAGAAATTAAACATGAATTCACTTTTAAAAATCGAAAACGATTATTAAAATCGAACGATATGACGATTTTTACTGTTATCTATGGTATCTTTGTTCAACGGAACGAACGTATTTTTTTAAAGTCTCAACGAACGTGTTACACTCGTCCTCGTCGACGGTCGTTTTTTTAATAATGAAATCTCAAATT AAAAAAAAAGTGTGCGATTACATAAAGGCGCGACTGTAATCCAATAATCCATCGCATTCATCGCAAATACTCGCAAATACGA                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI509024             [                 AGAATATTCTTATTTTATCATCGATTTGTTTTAAGTTGCTCCTCCATTTCTTTTATTTATATTAACGTTAAGATAAGATAGAATTAACAGTTTTTGGCTGGTACGAATTATCTTTTGTACCGCCCTGTGTACTGCACGTTTTTCTCATTTTATGTATTAGTAATAATTCAAATTAGTTGTTAGTCTTTATTTTAAACGCAATAAGAATTTTATCGTTTTATTATTCACGCATTGAACCCGGTTATCGTTCATTATAATTCAGAAATTAAACATGAATTCACTTTTAAAAATCGAAAACGATTATTAAAATCGAACGATATGACGATTTTTACTGTTATCTATGGTATCTTTGTTCAACGGAACGAACGTATTTTTTTAAAGTCTCAACGAACGTGTTACACTCGTCCTCGTCGACGGTCGTTTTTTTAATAATGAAATCTCAAATTAAAAAAAAAAGTGTGCGATTACATAAAGGCGCGACTGTAATCCAATAATCCATCGCATTCATCGCAAATACTCGCAAATACGATTCTCGTACAACATCAGAAACAACGAAAAATCATGATTTTACTTAACTGTAACTTTTACAGAGGAGCAAGGTGAGAAAGAA                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI509232             [                                                                                                              TTGGCTGGTACGAATTATCTTTTGTACCGCTCTGTGTACTGCACGTTTTTCTCATTTTATGTATTAGTAATAGTTCAAATTAGTTGTTAGTCTTTATTTTAAACGCAATAAGAATTTTATCGTTTTATTATTCACGCATTGAACCCGGTTATCGTTCATTATAATTCAGAAATTAAACATGAATTCACTTTTAAAAATCGAAAACGATTATTAAAATCGAACGATATGACGATTTTTACTGTTATCTATGGTATCTTTGTTCAACGGAACGAACGTATTTTTTTAAAGTCTCAACGAACGTGTTACACTCGTCCTCGTCGACGGTCGTTTTTTTAATAATGAAATCTCAAATTAAAAAAAAAAGTGTGCGATTACATAAAGGCGCGACTGTAATCCAATAATCCATCGCATTCATCGCAAATACTCGCAAATACGATTCTCGTACAACATCAGAAACAACGAAAAATCATGATTTTACTTAACTGTAACTTTTACAGAGGAGCAAGGTGAGAAAGAATGAAACGAGAGGAGTAAAATGCAAAATTCAAAACGGAGAGAAGGTACTCGTCGAAGCGATGCGTACGAAGTAAATTTATTCTCGAGTACGATAACTAATAGATCGATTATTTCA]
[-] EMBL BI512592             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGATATGACGATTTTTACTGTTATCTATGGTATCTTTGTTCAACGGAACGAACGTATTTTTTTAAAGTCTCAACGAACGTGTTACACTCGTCCTCGTCGACGGTCGTTTTTTTAATAATGAAATCTCAAATTAAAAAAAAAAGTGTGCGATTACATAAAGGCGCGACTGTAATCCAATAATCCATCGCATTCATCGCAAATACTCGCAAATACGATTCTCGTACAACATCAGAANNAACGAAAAATCATGATTTTACTTAACTGTAACTTTTACAGAGGAGCAAGGTGAGAAAGAATGAAACGAGAGGAATAAAATGCAAAATTCAAAACGGAGAGAAGGTACTCGTCGAAGCGATGCGTACGAAGTAAATTTATTCTCGAGTACGATAACTAATAGATCGAT       ]


>consensus_471#0 TTCGAATTTTAGTTTTAAGAATATTCTTATTTTATCATCGATTTGTTTTAAGTTGCTCCT CCATTTCTTTTATTTATATTAACGTTAAGATAAGATAGAATTAACAGTTTTTGGCTGGTA CGAATTATCTTTTGTACCGCCCTGTGTACTGCACGTTTTTCTCATTTTATGTATTAGTAA TAATTCAAATTAGTTGTTAGTCTTTATTTTAAACGCAATAAGAATTTTATCGTTTTATTA TTCACGCATTGAACCCGGTTATCGTTCATTATAATTCAGAAATTAAACATGAATTCACTT TTAAAAATCGAAAACGATTATTAAAATCGAACGATATGACGATTTTTACTGTTATCTATG GTATCTTTGTTCAACGGAACGAACGTATTTTTTTAAAGTCTCAACGAACGTGTTACACTC GTCCTCGTCGACGGTCGTTTTTTTAATAATGAAATCTCAAATTAAAAAAAAAAGTGTGCG ATTACATAAAGGCGCGACTGTAATCCAATAATCCATCGCATTCATCGCAAATACTCGCAA ATACGATTCTCGTACAACATCAGAAACAACGAAAAATCATGATTTTACTTAACTGTAACT TTTACAGAGGAGCAAGGTGAGAAAGAATGAAACGAGAGGAGTAAAATGCAAAATTCAAAA CGGAGAGAAGGTACTCGTCGAAGCGATGCGTACGAAGTAAATTTATTCTCGAGTACGATA ACTAATAGATCGATTATTTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)