Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 474 cluster # 474       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_474#0 length = 650 sequences # 4  

consensusID : consensus_474#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 650
fasta sequence
                              [AGGATACAGCGGAGGATCGATATGTCGTCGGTGTCGAGTTGGATATTGGTCGTGGTTGGCCTGATCGTTTCGATTCAATCGGGTTCAGCTTTACAATGTTGGGATTGCGCTTCCAACACCAACCCTTTGTGTGGTGATCCGATGAACGTGACTGATCATCATGGCATCTTCCATGTGAAAACATGCGAATCTGGAATTTACGATACGTCGAGAAAAATTTGCCGAAAAATCGTGAAAAGAGAGAATGGCGAAAGAGTTGTGATTCGTCAGTGTTCGACACCGAACGTCGACGAAGCGGACATAGTGGATGGTCCTTGCAGTGCAACCGCAATTTCAACTCGAAATTTAATCGAATGTTATATTTGCAGCACCGATCTCTGCAATTCCGCAATGGGAGTATCGGTTACACGATCTCTTTTCATGGTCACGTTGACTATTATCGGCTACTGTTACGTACAATCGAAATACATCGCCCTTTAATGAAAAACTTTAACCTATACACATTTTCCACTTTGAAAAATAACCACATAAGTGCGCCACTTTTAAACGATTTTAAATTATTACCATCTTAAATTAAAACGTAATAATGAAGTGTTCGATTTATCGTAGTCTTGGTTAATAACAATTAATTATCAATCTTAGAAGTCGTT]

[+] EMBL BI511321             [AGGATACAGCGGAGGATCGATATGTCGTCGGTGTCGAGTTGGATATTGGTCGTGGTTGGCCTGATCGTTTCGATTCAATCGGGTTCAGCTTTACAATGTTGGGATTGCGCTTCCAACACCAACCCTTTGTGTGGTGATCCGATGAACGTGACTGATCATCATGGCATCTTCCATGTGAAAACATGCGAATCTGGAATTTACGATACGTCGAGAAAAATTTGCCGAAAAATCGTGAAAAGAGAGAATGGCGAAAGAGTTGTGATTCGTCAGTGTTCGACACCGAACGTCGACGAAGCGGACATAGTGGATGGTCCTTGCAGTGCAACCGCAATTTCAACTCGAAATTTAATCGAATGTTATATTTGCAGCACCGATCTCTGCAATTCCGCAATGGGAGTATCGGTTACACGATCTCTTTTCATGGTCACGTTGACTATTATCGGCTACTGTTACGTACAATCGAAATACATCGCCCTTTAATGAAAAACTTTAACCTATACACATTTTCCACTTTGAAAAATAACCA                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI516266             [                          GTCGGTGTCGAGTTGGATATTGGTCGTGGTTGGCCTGATCGTTTCGATTCAATCGGGTTCAGCTTTACAATGTTGGGATTGCGCTTCCAACACCAACCCTTTGTGTGGTGATCCGATGAACGTGACTGATCATCATGGCATCTTCCATGTGAAAACATGCGAATCTGGAATTTACGATACGTCGAGAAAAATTTGCCGAAAAATCGTGAAAAGAGAGAATGGCGAAAGAGTTGTGATTCGTCAATGTTCGACACCGAACGTCGACGAAGCGGACATAGTGGATGGTCCTTGCAGTGCAACCGCAATTTCAACTCGAAATTTAATCGAATGTTATATTTGCAGCACCGACCTCTGCAATTCCGCAATGGGAGTATCGGTTACACGATCTCTTTTCATGGTCACGTTGACTATTATCGGCTACTGTTACGTACAATCGAAATACATCCCCCTTTAATGAAAAATTTTAACCTATACACATTTTCCACTTTGAAAAATAACCACATAAGTGCGCCACTTTTAAACGATTTTA                                                                                               ]
[+] EMBL BI515712             [                                                           CCTGATCGTTTCGATTCAATCGGGTTCAGCTTTACAATGTTGGGATTGCGCTTCCAACACCAACCCTTTGTGTGGTGATCCGATGAACGTGACTGATCATCATGGCATCTTCCATGTGAAAACATGCGAATCTGGAATTTACGATACGTCGAGAAAAATTTGCCGAAAAATCGTGAAAAGAGAGAATGGCGAAAGAGTTGTGATTCGTCAGTGTTCGACACCGAACGTCGACGAAGCGGACATAGTGGATGGTCCTTGCAGTGCAACCGCAATTTCAACTCGAAATTTAATCGAATGTTATATTTGCAGCACCGATCTCTGCAATTCCGCAATGGGAGTATCGGTTACACGATCTCTTTTCATGGTCACGTTGACTATTATCGGCTACTGTTACGTACAATCGAAATACATCGCCCTTTAATGAAAAACTTTAACCTATACACATTTTCCACTTTGAAAAATAACCACATAATTGCGCCACTTTTAAACGATTTTAAATTATTACCATCTTAAATT                                                                           ]
[+] EMBL BI509575             [                                                                                     CAGCTTTACAATGTTGGGATTGCGCTTCCAACACCAACCCTTTGTGTGGTGATCCGATGAACGTGACTGATCATCATGGCATCTTCCATGTGAAAACATGCGAATCTGGAATTTACGATACGTCGAGAAAAATTTGCCGAAAAATCGTGAAAAGAGAGAATGGCGAAAGAGTTGTGATTCGTCAGTGTTCGACACCGAACGTCGACGAAGCGGACATAGTGGATGGTCCTTGCAGTGCAACCGCAATTTCAACTCGAAATTTAATCGAATGTTATATTTGCAGCACCGATCTCTGCAATTCCGCAATGGGAGTATCGGTTACACGATCTCTTTTCATGGTCACGTTGACTATTATCGGCTACTGTTACGTACAATCGAAATACATCGCCCTTTAATGAAAAACTTTAACCTATACACATTTTCCACTTTGAAAAATAACCACATAAGTGCGCCACTTTTAAACGATTTTAAATTATTACCATCTTAAATTAAAACGTAATAATGAAGTGTTCGATTTATCGTAGTCTTGGTTAATAACAATTAATTATCAATCTTAGAAGTCGTT]


>consensus_474#0 AGGATACAGCGGAGGATCGATATGTCGTCGGTGTCGAGTTGGATATTGGTCGTGGTTGGC CTGATCGTTTCGATTCAATCGGGTTCAGCTTTACAATGTTGGGATTGCGCTTCCAACACC AACCCTTTGTGTGGTGATCCGATGAACGTGACTGATCATCATGGCATCTTCCATGTGAAA ACATGCGAATCTGGAATTTACGATACGTCGAGAAAAATTTGCCGAAAAATCGTGAAAAGA GAGAATGGCGAAAGAGTTGTGATTCGTCAGTGTTCGACACCGAACGTCGACGAAGCGGAC ATAGTGGATGGTCCTTGCAGTGCAACCGCAATTTCAACTCGAAATTTAATCGAATGTTAT ATTTGCAGCACCGATCTCTGCAATTCCGCAATGGGAGTATCGGTTACACGATCTCTTTTC ATGGTCACGTTGACTATTATCGGCTACTGTTACGTACAATCGAAATACATCGCCCTTTAA TGAAAAACTTTAACCTATACACATTTTCCACTTTGAAAAATAACCACATAAGTGCGCCAC TTTTAAACGATTTTAAATTATTACCATCTTAAATTAAAACGTAATAATGAAGTGTTCGAT TTATCGTAGTCTTGGTTAATAACAATTAATTATCAATCTTAGAAGTCGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)