Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 475 cluster # 475       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_475#0 length = 680 sequences # 4  

consensusID : consensus_475#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 680
fasta sequence
                              [ATGCGGGCGATTAAATGTTGGCGATCATATTCTTGCCGTCAATCATGTAGANNNNACAAATGTTTGTCATAAAGATATTGTGAATTTAATTAAAGACTCGGGTTATTCTGTTACATTGACAATTGGTTACCCTCTTGATGATTGTTGTAGTAATACATCTTTATCTCAAAAGGATGAACCAACATGTGATGGAGATGGAGGACAATATCATGCTGTTGAATTAACTCGTGGAACTAGAGGATTTGGTTTTAGTATTCGTGGAGGACGTGAATTTCAAAATATGCCATTATTTGTTTTACAAATTGCAGAAAATGGTCCAGCATCTATTGATAATCGATTAAGAGTCGGCGATCAAATAATTGAAATAAATGGAATTAATACTAAAAATATGACACATACAGAAGCTATTGAAATTATAAGAAATGGTGGACCATCTGTTCGACTTTTAGTTCGACGTGGTTGTCAAATGCCTTCAGTGGTAGGTGCTCCTCCACACCTCTACGACATGAATATATGAAATTAACCACTCTAAATAACAATACATTAATATTAAAAATATTAACGATATTTATTTCTGCAAATGATGATACTAATGCTAACGTTGTCCTTGTATAACATTCCTTAATAATTTTATTTGAAGCTTCAAAGTTTAACATTAGGTACCATAGTAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI505093             [ATGCGGGCGATTAAATGTTGGCGATCATATTCTTGCCGTCAATCATGTAGANNNNACAAATGTTTGTCATAAAGATATTGTGAATTTAATTAAAGACTCGGGTTATTCTGTTACATTGACAATTGGTTACCCTCTTGATGATTGTTGTAGTAATACATCTTTATCTCAAAAGGATGAACCAACATGTGATGGAGATGGAGGACAATATCATGCTGTTGAATTAACTCGTGGAACTAGAGGATTTGGTTTTAGTATTCGTGGAGGACGTGAATTTCAAAATATGCCATTATTTGTTTTACAAATTGCAGAAAATGGTCCAGCATCTATTGATAATCGATTAAGAGTCGGCGATCAAATAATTGAAATAAATGGAATTAATACTAAAAATATGACACATACAGAAGCTATTGAAATTATAAGAAATGGTGGACCATCTGTTCGACTTTTAGTTCGACGTGGTTGTCAAATGCCTTCAGTGGTAGGTGCTCCTCCACACCTCTACGACATGAATATATGAAATTAACCACTCTAAATAACAATACATTAATATTAAAAATATTAA                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI505102             [ATGCGGGCGATTAAATGTTGGCGATCATATTCTTGCCGTCAATCATGTAGATATTACAAATGTTTGTCATAAAGATATTGTGAATTTAATTAAAGACTCGGGTTATTCTGTTACATTGACAATTGGTTACCCTCTTGATGATTGTTGTAGTAATACATCTTTATCTCAAAAGGATGAACCAACATGTGATGGAGATGGAGGACAATATCATGCTGTTGAATTAACTCGTGGAACTAGAGGATTTGGTTTTAGTATTCGTGGAGGACGTGAATTTCAAAATATGCCATTATTTGTTTTACAAATTGCAGAAAATGGTCCAGCATCTATTGATAATCGATTAAGAGTCGGCGATCAAATAATTGAAATAAATGGAATTAATACTAAAAATATGACACATACAGAAGCTATTGAAATTATAAGAAATGGTGGACCATCTGTTCGACTTTTAGTTCGACGTGGTTGTCAAATGCCTTCAGTGGTAGGTGCTCCTCCACACCTCTACGACATGAATATATGAAATTAACCACTCTAAATAACAATACA                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI505479             [                                                                                                                   TTGACAATT GTTACCCTCTTGATGATTGTTGTAGTAATACATCTTTATCTCAAAAGGATGAACCAACATGTGATGGAGATGGAGGACAATATCATGCTGTTGAATTAACTCGTGGAACTAGAGGATTTGGTTTTAGTATTCGTGGAGGACGTGAATTTCAAAATATGCCATTATTTGTTTTACAAATTGCAGAAAATGGTCCAGCATCTATTGATAATCGATTAAGAGTCGGCGATCAAATAATTGAAATAAATGGAATTAATACTAAAAATATGACACATACAGAAGCTATTGAAATTATAAGAAATGGTGGACCATCTGTTCGACTTTTAGTTCGACGTGGTTGTCAAATGCCTTCAGTGGTAGGTGCTCCTCCACACCTCTACGACATGAATATATGAAATTAACCACTCTAAATAACAATACATTAATATTAAAAATATTAACGATATTTATTTCTGCAAATGATGATACTAATGCTAACGTTGTCCTTGTATAACATTCCTTAATAATTTTATTTGAAGCTTCAAAGTTTAACATTAGGTACCATAGTAAAAAAAA   ]
[-] EMBL BI512799             [                                                                                                                                                                                                                          AATTAACTCGTGGAACTAGAGGATTTGGTTTTAGTATTCGTGGAGGACGTGAATTTCAAAATATGCCATTATTTGTTTTACAAATTGCAGAAAATGGTCCAGCATCTATTGATAATCGATTAAGAGTCGGCGATCAAATAATTGAAATAAATGGAATTAATACTAAAAATATGACACATACAGAAGCTATTGAAATTATAAGAAATGGTGGACCATCTGTTCGACTTTTAGTTCGACGTGGTTGTCAAATGCCTTCAGTGGTAGGTGCTCCTCCACACCTTTACGACATGAATATATGAAATTAACCCCTCTAAATAACAATACATTAATATTAAAAATATTAACGATATTTATTTCTGCAAATGATGATACTAATGCTAACGTTGTCCTTGTATAACATTCCTTAATAATTTTATTTGAAGCTTCAAAGTTTAACATTAGGTACCATAGTAAAAAAAAAAA]


>consensus_475#0 ATGCGGGCGATTAAATGTTGGCGATCATATTCTTGCCGTCAATCATGTAGANNNNACAAA TGTTTGTCATAAAGATATTGTGAATTTAATTAAAGACTCGGGTTATTCTGTTACATTGAC AATTGGTTACCCTCTTGATGATTGTTGTAGTAATACATCTTTATCTCAAAAGGATGAACC AACATGTGATGGAGATGGAGGACAATATCATGCTGTTGAATTAACTCGTGGAACTAGAGG ATTTGGTTTTAGTATTCGTGGAGGACGTGAATTTCAAAATATGCCATTATTTGTTTTACA AATTGCAGAAAATGGTCCAGCATCTATTGATAATCGATTAAGAGTCGGCGATCAAATAAT TGAAATAAATGGAATTAATACTAAAAATATGACACATACAGAAGCTATTGAAATTATAAG AAATGGTGGACCATCTGTTCGACTTTTAGTTCGACGTGGTTGTCAAATGCCTTCAGTGGT AGGTGCTCCTCCACACCTCTACGACATGAATATATGAAATTAACCACTCTAAATAACAAT ACATTAATATTAAAAATATTAACGATATTTATTTCTGCAAATGATGATACTAATGCTAAC GTTGTCCTTGTATAACATTCCTTAATAATTTTATTTGAAGCTTCAAAGTTTAACATTAGG TACCATAGTAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)