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Apis mellifera
cluster # 501 cluster # 501       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_501#0 length = 1118 sequences # 4  

consensusID : consensus_501#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1118
fasta sequence
                              [AATCCGATTAGCAACAATAGTGCTTTTCAATTATTTGGTTTTCGTACTTGTACTAAAGTTTCAGGACCGATAAGAGTATATTTGGAAACAGGTGGAAAACTTCGATCAGTATATTCGCCAAGAGATGGCAAACATAAAGCTTCGCATAGATGTTTTCACGCGAAGAAACAACCTGCAGCACTTTATATAGAAGCAGAAGAATCGAGTGAATATCATGATGCGAGATTACAATACGATTTGGAATTACGATATATCGATAGTCGAAAAGAAATATCACGACGATTTAACGATGAAGAAGAAGATTGTAGACCATGCTCTATGGATGAATTAGCTAAAGCTTATTGTCAAAGCGACTTCATAGCCAGAGGTACAGTGAGTGCCGTTCAAAAACAACCGAATTTGGAAGCTGCTGAACTTATCCTTAGAGTAACAAAAATTTTGCGTCGAATCGAAGAAAACGAGAATAACGATGCAGATACCAGCGATTTCCATGATCACAGAAATATTCATATAAGAGTACCAGCTGCTTGTGACGCACGTCATGGTCAGGGCGAGTTTGTGATAATGGCTAAACGAAGACTCGGTGATCTTGTTTTGGTTTGTGCANCGAGAATNGAAACATGGGCTAAAACAGTCCGCGAGTTAGAAAGTGNNNCGTGTGTTCTTCGAAGTTAGTATATTCATTTAACGAAATACTTGTAAATAATTTATTTCCCTATTCTGAATATCGATCTCCAAACTGTGATATTGTTTTGTGGAAATTTTTTGTAAAAAATACACAATTTTTTAGCAAAAAAATTGATTATTTCCATCTATCCTTATCTTCATAATTTTATATCTATAATTTTGTGTAGATTCAATTGTCATCACTTAATTATATAATTTATTAAAAATTTAATATAATGCATACTTCATTTAGTCATAAGCGATTTGAAAAGTTAAACGATAATATATATATATTATATACGATTTTAATTTACATTTGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATTAAACTTTTAATTGCATATTAAATTAAAATTTTAACTTAGGTAAATTCATTCGTATTATACATTAAAATATTTCTTTAAAGATCACATCATATTATT]

[+] EMBL BI505327             [AATCCGATTAGCAACAATAGTGCTTTTCAATTATTTGGTTTTCGTACTTGTACTAAAGTTTCAGGACCGATAAGAGTATATTTGGAAACAGGTGGAAAACTTCGATCAGTATATTCGCCAAGAGATGGCAAACATAAAGCTTCGCATAGATGTTTTCACGCGAAGAAACAACCTGCAGCACTTTATATAGAAGCAGAAGAATCGAGTGAATATCATGATGCGAGATTACAATACGATTTGGAATTACGATATATCGATAGTCGAAAAGAAATATCACGACGATTTAACGATGAAGAAGAAGATTGTAGACCATGCTCTATGGATGAATTAGCTAAAGCTTATTGTCAAAGCGACTTCATAGCCAGAGGTACAGTGAGTGCCGTTCAAAAACAACCGAATTTGGAAGCTGCTGAACTTATCCTTAGAGTAACAAAAATTTTGCGTCGAATCGAAGAAAACGAGAATAACGATGCAGATACCAGCGATTTCCATGATCACAGAAATATTCATATAAGAGTACCAGCTGCTTGTGACGCACGTCATGGTCAGGGCGAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI505994             [                                                  TACTAAAGTTTCAGGACCGATAAGAGTATATTTGGAAACAGGTGGAAAACTTCGATCAGTATATTCGCCAAGAGATGGCAAACATAAAGCTTCGCATAGATGTTTTCACGCGAAGAAACAACCTGCAGCACTTTATATAGAAGCAGAAGAATCGAGTGAATATCATGATGCGAGATTACAATACGATTTGGAATTACGATATATCGATAGTCGAAAAGAAATATCACGACGATTTAACGATGAAGAAGAAGATTGTAGACCATGCTCTATGGATGAATTAGCTAAAGCTTATTGTCAAAGCGACTTCATAGCCAGAGGTACAGTGAGTGCCGTTCAAAAACAACCGAATTTGGAAGCTGCTGAACTTATCCTTAGAGTAACAAAAATTTTGCGTCGAATCGAAGAAAACGAGAATAACGATGCAGATACCAGCGATTTCCATGATCACAGAAATATTCATATAAGAGTACCAGCTGCTTGTGACGCACGTCATGGTCAGGGCGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI507097             [                                                                                                                                                                                                                                                        ATATATCGATAGTCGAAAAGAAATATCACGACGATTTAACGATGAAGAAGAAGATTGTAGACCATGCTCTATGGATGAATTAGCTAAAGCTTATTGTCAAAGCGACTTCATAGCCAGAGGTACAGTGAGTGCCGTTCAAAAACAACCGAATTTGGAAGCTGCTGAACTTATCCTTAGAGTAACAAAAATTTTGCGTCGAATCGAAGAAAACGAGAATAACGATGCAGATACCAGCGATTTCCATGATCACAGAAATATTCATATAAGAGTACCAGCTGCTTGTGACGCACGTCATGGTCAGGGCGAGTTTGTGATAATGGCTAAACGAAGACTCGGTGATCTTGTTTTGGTTTGTGCACCGAGAATAGAAACATGGGCTAAAACAGTCCGCGAGTTAGAAAGTGCGCCGTGTGTTCTTCGAAGTTAGTATATTCATTTAACGAAATACTTGTAAATAATTTATTTCCCTATTCTGAATATCGATCTCCAAACTGTGATATTGTTTTGTGGAAATTTTTTGTAAAAAATACACAATTTTTTAGCAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL BI509589             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACGTCATGGTCAGGGCGAGTTTGTGATAATGGCTAAACGAAGACTCGGTGATCTTGTTTTGGTTTGTGCANCGAGAATNGAAACATGGGCTAAAACAGTCCGCGAGTTAGAAAGTGNNNCGTGTGTTCTTCGAAGTTAGTATATTCATTTAACGAAATACTTGTAAATAATTTATTTCCCTATTCTGAATATCGATCTCCAAACTGTGATATTGTTTTGTGGAAATTTTTTGTAAAAAATACACAATTTTTTAGCAACATAATTGATTATTTCCATCTATCCTTATCTTCATAATTTTATATCTATAATTTTGTGTAGATTCAATTGTCATCACTTAATTATATAATTTATTAAAAATTTAATATAATGCATACTTCATTTAGTCATAAGCGATTTGAAAAGTTAAACGATAATATATATATATTATATACGATTTTAATTTACATTTGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATTAAACTTTTAATTGCATATTAAATTAAAATTTTAACTTAGGTAAATTCATTCGTATTATACATTAAAATATTTCTTTAAAGATCACATCATATTATT]


>consensus_501#0 AATCCGATTAGCAACAATAGTGCTTTTCAATTATTTGGTTTTCGTACTTGTACTAAAGTT TCAGGACCGATAAGAGTATATTTGGAAACAGGTGGAAAACTTCGATCAGTATATTCGCCA AGAGATGGCAAACATAAAGCTTCGCATAGATGTTTTCACGCGAAGAAACAACCTGCAGCA CTTTATATAGAAGCAGAAGAATCGAGTGAATATCATGATGCGAGATTACAATACGATTTG GAATTACGATATATCGATAGTCGAAAAGAAATATCACGACGATTTAACGATGAAGAAGAA GATTGTAGACCATGCTCTATGGATGAATTAGCTAAAGCTTATTGTCAAAGCGACTTCATA GCCAGAGGTACAGTGAGTGCCGTTCAAAAACAACCGAATTTGGAAGCTGCTGAACTTATC CTTAGAGTAACAAAAATTTTGCGTCGAATCGAAGAAAACGAGAATAACGATGCAGATACC AGCGATTTCCATGATCACAGAAATATTCATATAAGAGTACCAGCTGCTTGTGACGCACGT CATGGTCAGGGCGAGTTTGTGATAATGGCTAAACGAAGACTCGGTGATCTTGTTTTGGTT TGTGCANCGAGAATNGAAACATGGGCTAAAACAGTCCGCGAGTTAGAAAGTGNNNCGTGT GTTCTTCGAAGTTAGTATATTCATTTAACGAAATACTTGTAAATAATTTATTTCCCTATT CTGAATATCGATCTCCAAACTGTGATATTGTTTTGTGGAAATTTTTTGTAAAAAATACAC AATTTTTTAGCAAAAAAATTGATTATTTCCATCTATCCTTATCTTCATAATTTTATATCT ATAATTTTGTGTAGATTCAATTGTCATCACTTAATTATATAATTTATTAAAAATTTAATA TAATGCATACTTCATTTAGTCATAAGCGATTTGAAAAGTTAAACGATAATATATATATAT TATATACGATTTTAATTTACATTTGTTATATATATATATATATATATATATATATATATA TTAAACTTTTAATTGCATATTAAATTAAAATTTTAACTTAGGTAAATTCATTCGTATTAT ACATTAAAATATTTCTTTAAAGATCACATCATATTATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)