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Apis mellifera
cluster # 518 cluster # 518       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_518#0 length = 1005 sequences # 4  

consensusID : consensus_518#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1005
fasta sequence
                              [TAATCTTGCGTTTTAATAAACATGGAGGTGGTAATTCTTGTCCTGGTTCCAACTTATGAGATTCAAGAGGAGCATCCAGCAACATTTCTCCAAATAATTCTCTACAATATTGAGCTATCTTAGCTTGCTGTCTTGGATTGCAATGATTTTCAAAACTAAGAATAACAGGATATTCTGATGTTTTAAAAGCACTTTCAGCAATCGCTTCAATCACATCTCGTGCATATATTTCAGGTACAAATGTATATCCATGAACAATGACAGGTTCTTCAAATTTTCCATTCCAAAAGTCCAATTCTACACATCGGCAACCAGCAAGCAGACATTGACGATATATTTCGACGGAACTTTTTCCAGTAAGTTGATGTCCTGTTAAGTATGTATTGTGACTAGAATTTATAAAGTAATGTGCAAGCGGTTGGTCCATGTCATCTGATAATTCAAGTTTCGATAAAGCCACGATTGGGTTATCTTCACTCATCAAATATCTCAAAAATCCATCAAAACTTAGCTGACCCCGATTTGCATTATATTTATTTGGTTCGTATTGACTTATAATATCCTTCGCTCTCGCCTCATTTGCATAAGGATACAATATTTCGTTTAAACGCGGATCTCTTTGAGTTTTATTCAAAAAGTCAACAAATTGAGTTACAGACATTAGCCTACGCTTATTATTGCCTACGATGCGTTCGAAAACTTTTTCAACATCCGATCGTTGAGTAAGAGATTTATAAAAGTTGAAAAAATCTTCAAATTGAAATTTTTGTAATGATATTACGTCATTTTTTCCAGATGGAAAACCAGAAATATCAAGAGCTTTTTCGACTCGTTTACGATCTTCTTTGTTTTGCGTAAACATTCTTATAATATTCTTAACAGGTATTTTTCCTGATTTATCAGCTGCAAGTGTAAGTTTGGTATGTGCTTTTTGCAAAAACATAGTTGTACTGATGTTTAATAGGGATAGATTATATGCAAGTTGAAAAATTTCTTCTGTCCAAT]

[+] EMBL BI504540             [TAATCTTGCGTTTTAATAAACATGGAGGTGGTAATTCTTGTCCTGGTTCCAACTTATGAGATTCAAGAGGAGCATCCAGCAACATTTCTCCAAATAATTCTCTACAATATTGAGCTATCTTAGCTTGCTGTCTTGGATTGCAATGATTTTCAAAACTAAGAATAACAGGATATTCTGATGTTTTAAAAGCACTTTCAGCAATCGCTTCAATCACATCTCGTGCATATATTTCAGGTACAAATGTATATCCATGAACAATGACAGGTTCTTCAAATTTTCCATTCCAAAAGTCCAATTCTACACATCGGCAACCAGCAAGCAGACATTGACGATATATTTCGACGGAACTTTTTCCAGTAAGTTGATGTCCTGTTAAGTATGTATTGTGACTAGAATTTATAAAGTAATGTGCAAGCGGTTGGTCCATGTCATCTGATAATTCAAGTTTCGATAAAGCCACGATTGGGTTATCTTCACTCATCAAATATCTCAAAAATCCATCAAAACTTAGCTGACCCCGATTTGCATTATATTTATTTGGTTCGTATTGACTTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI503511             [                                     TTGTCCTGGTTCCAACTTATGAGATTCAAGAGGAGCATCCAGCAACATTTCTCCAAATAATTCTCTACAATATTGAGCTATCTTAGCTTGCTGTCTTGGATTGCAATGATTTTCAAAACTAAGAATAACAGGATATTCTGATGTTTTAAAAGCACTTTCAGCAATCGCTTCAATCACATCTCGTGCATATATTTCAGGTACAAATGTATATCCATGAACAATGACAGGTTCTTCAAATTTTCCATTCCAAAAGTCCAATTCTACACATCGGCAACCAGCAAGCAGACATTGACGATATATTTCGACGGAACTTTTTCCAGTAAGTTGATGTCCTGTTAAGTATGTATTGTGACTAGAATTTATAAAGTAATGTGCAAGCGGTTGGTCCATGTCATCTGATAATTCAAGTTTCGATAAAGCCACGATTGGGTTATCTTCACTCATCAAATATCTCAAAAATCCATCAAAACTTAGCTGACCCCGATTTGCATTATATTTATTTGGTTCGTATTGACTTATAATATCCTTCGCTCTCGCCTCATTTGCATAAGGATACAATATTTCGTTTAAACGCGGATCTCTTTGAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI517014             [                                                                                 ACATTTCTCCAAATAATTCTCTACAATATTGAGCTATCTTAGCTTGCTGTCTTGGATTGCAATGATTTTCAAAACTAAGAATAACAGGATATTCTGATGTTTTAAAAGCACTTTCAGCAATCGCTTCAATCACATCTCGTGCATATATTTCAGGTACAAATGTATATCCATGAACAATGACAGGTTCTTCAAATTTTCCATTCCAAAAGTCCAATTCTACACATCGGCAACCAGCAAGCAGACATTGACGATATATTTCGACGGAACTTTTTCCAGTAAGTTGATGTCCTGTTAAGTATGTATTNNNACTAGAATTTATAAAGTAATGTGCAAGCGNTTGGTCCATGTCATCTGATAATTCAAGTTTCGATAAAGCCACGATTGGGTTATCTTCACTCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL BI509080             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTTAAGTATGTATTGTGACTAGAATTTATAAAGTAATGTGCAAGCGGTTGGTCCATGTCATCTGATAATTCAAGTTTCGATAAAGCCACGATTGGGTTATCTTCACTCATCAAATATCTCAAAAATCCATCAAAACTTAGCTGACCCCGATTTGCATTATATTTATTTGGTTCGTATTGACTTATAATATCCTTCGCTCTCGCCTCATTTGCATAAGGATACAATATTTCGTTTAAACGCGGATCTCTTTGAGTTTTATTCAAAAAGTCAACAAATTGAGTTACAGACATTAGCCTACGCTTATTATTGCCTACGATGCGTTCGAAAACTTTTTCAACATCCGATCGTTGAGTAAGAGATTTATAAAAGTTGAAAAAATCTTCAAATTGAAATTTTTGTAATGATATTACGTCATTTTTTCCAGATGGAAAACCAGAAATATCAAGAGCTTTTTCGACTCGTTTACGATCTTCTTTGTTTTGCGTAAACATTCTTATAATATTCTTAACAGGTATTTTTCCTGATTTATCAGCTGCAAGTGTAAGTTTGGTATGTGCTTTTTGCAAAAACATAGTTGTACTGATGTTTAATAGGGATAGATTATATGCAAGTTGAAAAATTTCTTCTGTCCAAT]


>consensus_518#0 TAATCTTGCGTTTTAATAAACATGGAGGTGGTAATTCTTGTCCTGGTTCCAACTTATGAG ATTCAAGAGGAGCATCCAGCAACATTTCTCCAAATAATTCTCTACAATATTGAGCTATCT TAGCTTGCTGTCTTGGATTGCAATGATTTTCAAAACTAAGAATAACAGGATATTCTGATG TTTTAAAAGCACTTTCAGCAATCGCTTCAATCACATCTCGTGCATATATTTCAGGTACAA ATGTATATCCATGAACAATGACAGGTTCTTCAAATTTTCCATTCCAAAAGTCCAATTCTA CACATCGGCAACCAGCAAGCAGACATTGACGATATATTTCGACGGAACTTTTTCCAGTAA GTTGATGTCCTGTTAAGTATGTATTGTGACTAGAATTTATAAAGTAATGTGCAAGCGGTT GGTCCATGTCATCTGATAATTCAAGTTTCGATAAAGCCACGATTGGGTTATCTTCACTCA TCAAATATCTCAAAAATCCATCAAAACTTAGCTGACCCCGATTTGCATTATATTTATTTG GTTCGTATTGACTTATAATATCCTTCGCTCTCGCCTCATTTGCATAAGGATACAATATTT CGTTTAAACGCGGATCTCTTTGAGTTTTATTCAAAAAGTCAACAAATTGAGTTACAGACA TTAGCCTACGCTTATTATTGCCTACGATGCGTTCGAAAACTTTTTCAACATCCGATCGTT GAGTAAGAGATTTATAAAAGTTGAAAAAATCTTCAAATTGAAATTTTTGTAATGATATTA CGTCATTTTTTCCAGATGGAAAACCAGAAATATCAAGAGCTTTTTCGACTCGTTTACGAT CTTCTTTGTTTTGCGTAAACATTCTTATAATATTCTTAACAGGTATTTTTCCTGATTTAT CAGCTGCAAGTGTAAGTTTGGTATGTGCTTTTTGCAAAAACATAGTTGTACTGATGTTTA ATAGGGATAGATTATATGCAAGTTGAAAAATTTCTTCTGTCCAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)