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Apis mellifera
cluster # 551 cluster # 551       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_551#0 length = 1017 sequences # 4  

consensusID : consensus_551#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1017
fasta sequence
                              [GATATCGCTGATTTTCTGAGCTTTGTATCGTCATTGCCTCCTTAGTAATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTACTTTTATTTGAAATCTTTGCGGTTTCAATGTTGTTTAACATTAATGTTAGGAAAAGAAACTGCATCAGGATTTTGTAAATATTTGCACTCTTGTTAATTCTCTTTGCATCGTACAGTCTTTTTTAAAGTTGTTGATGTTATTATGCAATTTCTAACAGACTTAAAACTTGCCTATTTTTTTTTTTTTGTTTGTTTTGCAAAAAACACCATTCCATCAATTGCTCTTTAAAGAGCGGTTTATAATGCACCATATTATTGTATAAATTATCAAGGTCACACCGCTCTGTATAAAGTTACACTCGCAATATGTTGATTTGCCATGACTTCAACAATCGCATCGCGTATACCATAACAAAATGTGCAACCAAATGGATTTGTTGTATTCGTCGAGGAAGCACGGTTTAATACTACTGGCCGTGCACTAGCTTTCAACTGCTCACTTATTCTATCCCATTTTGTATAGGCAGTGATCGTAACTGGAGAAGGGGAAACATCTATGAGTTTTCCCGATTCNGTGGAATTATTTTCTGGTGGAAGAGTTAAAGAAAACTCGCAGCGATGATACATATTAAAATTATAATGCCCTGGATAATTTGTGTGTAATACAAACTTCTTAACACATTGAGTTTTGGCATCAAATAAAACATCCAATCNNAAAGTAAAATAATTATAGAAGAAATCCGCCCGTCTTATTTTATCACGTTTATGCGCATGAGGACTATGAANACGCATTTTATCCTCGGCTTTAAAAAACACACGAGATGGTGCTCCTAAAGCACTTAAAACANNNTCACAAGTATCCCCAAATAACACCTCTTTGGTTAAGCAACGTTTTTTCGGTTCCAATAATACTCTTGTTACAGAGCTACCTTCANNNAAGAGATGCAATTTAAGACCTCGTGTACGCATTTTGTCACGTATGACATCTGCCTTTTNNAAATACAA]

[+] EMBL BI508122             [GATATCGCTGATTTTCTGAGCTTTGTATCGTCATTGCCTCCTTAGTAATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTACTTTTATTTGAAATCTTTGCGGTTTCAATGTTGTTTAACATTAATGTTAGGAAAAGAAACTGCATCAGGATTTTGTAAATATTTGCACTCTTGTTAATTCTCTTTGCATCGTACAGTCTTTTTTAAAGTTGTTGATGTTATTATGCAATTTCTAACAGACTTAAAACTTGCCTATTTTTTTTTTTTTGTTTGTTTTGCAAAAAACACCATTCCATCAATTGCTCTTTAAAGAGCGGTTTATAATGCACCATATTATTGTATAAATTATCAAGGTCACACCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI508528             [                                                                                   AATCTTTGCGGTTTCAATGTTGTTTAACATTAATGTTAGGAAAAGAAACTGCATCAGGATTTTGTAAATATTTGCACTCTTGTTAATTCTCTTTGCATCGTACAGTCTTTTTTAAAGTTGTTGATGTTATTATGCAATTTCTAACAGACTTAAAACTTGCCTATTTTTTTTTTTTTGTTTGTTTTGCAAAAAACACCATTCCATCAATTGCTCTTTAAAGAGCGGTTTATAATGCACCATATTATTGTATAAATTATCAAGGTCACACCGCTCTGTATAAAGTTACACTCGCAATATGTTGATTTGCCATGACTTCAACAATCGCATCGCGTATACCATAACAAAATGTGCAACCAAATGGATTTGTTGTATTCGTCGAGGAAGCACGGTTTAATACTACTGGCCGTGCACTAGCTTTCAACTGCTCACTTATTCTATCCCATTTTGTATAGGCAGTGATCGTAACTGGAGAAGGGGAAACATCTATGAGTTTTCCCGATTCGGTGGAATTATTTTCTGGTGGAAGAGTTAAAGAAAACTCGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI505667             [                                                                                                                                                                                                                         CAATTTCTAACAGACTTAAAACTTGCCTATTTTTTTTTTTTTGTTTGTTTTGCAAAAAACACCATTCCATCAATTGCTCTTTAAAGAGCGGTTTATAATGCACCATATTATTGTATAAATTATCAAGGTCACACCGCTCTGTATAAAGTTACACTCGCAATATGTTGATTTGCCATGACTTCAACAATCGCATCGCGTATACCATAACAAAATGTGCAACCAAATGGATTTGTTGTATTCGTCGAGGAAGCACGGTTTAATACTACTGGCCGTGCACTAGCTTTCAACTGCTCACTTATTCTATCCCATTTTGTATAGGCAGTGATCGTAACTGGAGAAGGGGAAACATCTATGAGTTTTCCCGATTCNGTGGAATTATTTTCTGGTGGAAGAGTTAAAGAAAACTCGCAGCGATGATACATATTAAAATTATAATGCCCTGGATAATTTGTGTGTAATACAAACTTCTTAACACATTGAGTTTTGGCATCAAATAAAACATCCAATCCTAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL BI517276             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTAAAATTATAATGCCCTGGATAATTTGTGTGTAATACAAACTTCTTAACACATTGAGTTTTGGCATCAAATAAAACATCCAATCNNAAAGTAAAATAATTATAGAAGAAATCCGCCCGTCTTATTTTATCACGTTTATGCGCATGAGGACTATGAANACGCATTTTATCCTCGGCTTTAAAAAACACACGAGATGGTGCTCCTAAAGCACTTAAAACANNNTCACAAGTATCCCCAAATAACACCTCTTTGGTTAAGCAACGTTTTTTCGGTTCCAATAATACTCTTGTTACAGAGCTACCTTCANNNAAGAGATGCAATTTAAGACCTCGTGTACGCATTTTGTCACGTATGACATCTGCCTTTTNNAAATACAA]


>consensus_551#0 GATATCGCTGATTTTCTGAGCTTTGTATCGTCATTGCCTCCTTAGTAATCTTTTTTTTTT TTTTTTTTCTTACTTTTATTTGAAATCTTTGCGGTTTCAATGTTGTTTAACATTAATGTT AGGAAAAGAAACTGCATCAGGATTTTGTAAATATTTGCACTCTTGTTAATTCTCTTTGCA TCGTACAGTCTTTTTTAAAGTTGTTGATGTTATTATGCAATTTCTAACAGACTTAAAACT TGCCTATTTTTTTTTTTTTGTTTGTTTTGCAAAAAACACCATTCCATCAATTGCTCTTTA AAGAGCGGTTTATAATGCACCATATTATTGTATAAATTATCAAGGTCACACCGCTCTGTA TAAAGTTACACTCGCAATATGTTGATTTGCCATGACTTCAACAATCGCATCGCGTATACC ATAACAAAATGTGCAACCAAATGGATTTGTTGTATTCGTCGAGGAAGCACGGTTTAATAC TACTGGCCGTGCACTAGCTTTCAACTGCTCACTTATTCTATCCCATTTTGTATAGGCAGT GATCGTAACTGGAGAAGGGGAAACATCTATGAGTTTTCCCGATTCNGTGGAATTATTTTC TGGTGGAAGAGTTAAAGAAAACTCGCAGCGATGATACATATTAAAATTATAATGCCCTGG ATAATTTGTGTGTAATACAAACTTCTTAACACATTGAGTTTTGGCATCAAATAAAACATC CAATCNNAAAGTAAAATAATTATAGAAGAAATCCGCCCGTCTTATTTTATCACGTTTATG CGCATGAGGACTATGAANACGCATTTTATCCTCGGCTTTAAAAAACACACGAGATGGTGC TCCTAAAGCACTTAAAACANNNTCACAAGTATCCCCAAATAACACCTCTTTGGTTAAGCA ACGTTTTTTCGGTTCCAATAATACTCTTGTTACAGAGCTACCTTCANNNAAGAGATGCAA TTTAAGACCTCGTGTACGCATTTTGTCACGTATGACATCTGCCTTTTNNAAATACAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)