Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 582 cluster # 582       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_582#0 length = 966 sequences # 4  
consensusID : consensus_582#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 966
fasta sequence 
                              [CAAATGGAACTTGAAATAGTGTTATTATTGTGGAGGCATAGAGAAGTTAATTTTTCTCCTGTTCGATTAGCACGCTATACACTTGCCTTAAACGCTATGTGCACAGATCCAAGACAATTCCATGGTCATGATTTGATTGGTACACTTCAACATCATGAGCCACCGACTGATTTTGAATTTGCGTTAACAACATTAGCTGCGTGTAATGCACAAGCTCATGTTCGAAAGAGACAGATACGTCGATTATTAGATATTGCAAATGCTGCTCAAGATCATAATATTGATACTGTTGCAATGGTAATTTTGGCCTTAAAATGCATTGTTCAGGATCACAGACATCGAAATCTTCATCATTTTGTGCGTAAACCATCGGTCGGCTTAGCACAGCAACAAAAACTCGATGGTAGTTTTGGAGATATACGAACAACGGCTTTGGTAATGCAAGCTCTTGAAGAGATAGAAAATGAGCCTGCTGATAATTGGAATAGATCTGCCGCTTTAGCTTGGTTAACAAGTCAACAACAAACTGATGGTTCTTTTGGGGATGTTCGAGTAACTGCCGAAGCACTACTTGGTATAGCACCGCGTGGTTTAGCTAGTATTAGAACTCTTGATTGCGGACAAGGATTTTCTGAAACTTCATCACCAAAATTTACCACAAATGGTAACGAATCAGCGCCAGTTTCAAGTAATCGTAACGATAGTATATCAATATTTGTAATTTCTGGAACCAATACAAGTAATATTACTACTGGAAATAACGGAACTAATGGAAATAATAGTAATAGTGGAACTAATGGCAATAATGCAACAAATACTTTCAATGCAAATAATACAGACGGCGTAATCATTATTAATACAACACCAATCATGGTGAACGTTTCTTATACTTTATGGGTTGGCAGTAACGTGAATGAGACATACAGTTTGATAGTGACTGCTCCTAAAAATGAAACATTTTATGAA]

[+] EMBL BI507670             [CAAATGGAACTTGAAATAGTGTTATTATTGTGGAGGCATAGAGAAGTTAATTTTTCTCCTGTTCGATTAGCACGCTATACACTTGCCTTAAACGCTATGTGCACAGATCCAAGACAATTCCATGGTCATGATTTGATTGGTACACTTCAACATCATGAGCCACCGACTGATTTTGAATTTGCGTTAACAACATTAGCTGCGTGTAATGCACAAGCTCATGTTCGAAAGAGACAGATACGTCGATTATTAGATATTGCAAATGCTGCTCAAGATCATAATATTGATACTGTTGCAATGGTAATTTTGGCCTTAAAATGCATTGTTCAGGATCACAGACATCGAAATCTTCATCATTTTGTGCGTAAACCATCGGTCGGCTTAGCACAGCAACAAAAACTCGATGGTAGTTTTGGAGATATACGAACAACGGCTTTGGTAATGCAAGCTCTTGAAGAGATAGAAAATGAGCCTGCTGATAATTGGAATAGATCTGCCGCTTTAGCTTGGTTAACAAGTCAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI502928             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTTTGTGCGTAAACCATCGGTCGGCTTAGCACAGCAACAAAAACTCGATGGTAGTTTTGGAGATATACGAACAACGGCTTTGGTAATGCAAGCTCTTGAAGAGATAGAAAATGAGCCTGCTGATAATTGGAATAGATCTGCCGCTTTAGCTTGGTTAACAAGTCAACAACAAACTGATGGTTCTTTTGGGGATGTTCGAGTAACTGCCGAAGCACTACTTGGTATAGCACCGCGTGGTTTAGCTAGTATTAGAACTCTTGATTGCGGACAAGGATTTTCTGAAACTTCATCACCAAAATTTACCACAAATGGTAACGAATCAGCGCCAGTTTCAAGTAATCGTAACGATAGTATATCAATATTTGTAATTTCTGGAACCAATACAAGTAATATTACTACTGGAAATAACGGAACTAATGGAAATAATAGTAATAGTGGAACTAATGGCAATAATGCAACAAATACTTTCAATGCAAATAATACAGACGGCGTAATCATTATTAATACAACACCAATCATGGTGAACGTTTCTTATACTTTATGGGTTGGCAGTAACGTGAATGAGACATACAGTTTGATAGTGACTGCTCCTAAAAATGAAACATTTTATGAA]
[+] EMBL BI504215             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTTTGTGCGTAAACCATCGGTCGGCTTAGCACAGCAACAAAAACTCGATGGTAGTTTTGGAGATATACGAACAACGGCTTTGGTAATGCAAGCTCTTGAAGAGATAGAAAATGAGCCTGCTGATAATTGGAATAGATCTGCCGCTTTAGCTTGGTTAACAAGTCAACAACAAACTGATGGTTCTTTTGGGGATGTTCGAGTAACTGCCGAAGCACTACTTGGTATAGCACCGCGTGGTTTAGCTAGTATTAGAACTCTTGATTGCGGACAAGGATTTTCTGAAACTTCATCACCAAAATTTACCACAAATGGTAACGAATCAGCGCCAGTTTCAAGTAATCGTAACGATAGTATATCAATATTTGTAATTTCTGGAACCAATACAAGTAATATTACTACTGGAAATAACGGAACTAATGGAAATAATAGTAATAGTGGAACTAATGGCAATAATGCAACAAATACTTTCAATGCAAATAATACAGACGGCGTAATCATTATTAATACAACACCAATCATGGTGAACGTTTCTTATACTTTATGGGTTGGCAGTAACGTGAATGAGACATACAGTTTGATAGTGACTGCTC                       ]
[+] EMBL BI508347             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTTTGTGCGTAAACCATCGGTCGGCTTAGCACAGCAACAAAAACTCGATGGTAGTTTTGGAGATATACGAACAACGGCTTTGGTAATGCAAGCTCTTGAAGAGATAGAAAATGAGCCTGCTGATAATTGGAATAGATCTGCCGCTTTAGCTTGGTTAACAAGTCAACAACAAACTGATGGTTCTTTTGGGGATGTTCGAGTAACTGCCGAAGCACTACTTGGTATAGCACCGCGTGGTTTAGCTAGTATTAGAACTCTTGATTGCGGACAAGGATTTTCTGAAACTTCATCACCAAAATTTACCACAAATGGTAACGAATCAGCGCCAGTTTCAAGTAATCGTAACGATAGTATATCAATATTTGTAATTTCTGGAACCAATACAAGTAATATTACTACTGGAAATAACGGAACTAATGGAAATAATAGTAATAGTGGAACTAATGGCAATAATGCAACAAATACTTTCAAT                                                                                                                                             ]




>consensus_582#0
CAAATGGAACTTGAAATAGTGTTATTATTGTGGAGGCATAGAGAAGTTAATTTTTCTCCT
GTTCGATTAGCACGCTATACACTTGCCTTAAACGCTATGTGCACAGATCCAAGACAATTC
CATGGTCATGATTTGATTGGTACACTTCAACATCATGAGCCACCGACTGATTTTGAATTT
GCGTTAACAACATTAGCTGCGTGTAATGCACAAGCTCATGTTCGAAAGAGACAGATACGT
CGATTATTAGATATTGCAAATGCTGCTCAAGATCATAATATTGATACTGTTGCAATGGTA
ATTTTGGCCTTAAAATGCATTGTTCAGGATCACAGACATCGAAATCTTCATCATTTTGTG
CGTAAACCATCGGTCGGCTTAGCACAGCAACAAAAACTCGATGGTAGTTTTGGAGATATA
CGAACAACGGCTTTGGTAATGCAAGCTCTTGAAGAGATAGAAAATGAGCCTGCTGATAAT
TGGAATAGATCTGCCGCTTTAGCTTGGTTAACAAGTCAACAACAAACTGATGGTTCTTTT
GGGGATGTTCGAGTAACTGCCGAAGCACTACTTGGTATAGCACCGCGTGGTTTAGCTAGT
ATTAGAACTCTTGATTGCGGACAAGGATTTTCTGAAACTTCATCACCAAAATTTACCACA
AATGGTAACGAATCAGCGCCAGTTTCAAGTAATCGTAACGATAGTATATCAATATTTGTA
ATTTCTGGAACCAATACAAGTAATATTACTACTGGAAATAACGGAACTAATGGAAATAAT
AGTAATAGTGGAACTAATGGCAATAATGCAACAAATACTTTCAATGCAAATAATACAGAC
GGCGTAATCATTATTAATACAACACCAATCATGGTGAACGTTTCTTATACTTTATGGGTT
GGCAGTAACGTGAATGAGACATACAGTTTGATAGTGACTGCTCCTAAAAATGAAACATTT
TATGAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)