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Apis mellifera
cluster # 664 cluster # 664       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_664#0 length = 620 sequences # 3  

consensusID : consensus_664#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 620
fasta sequence
                              [TCGTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTACATTACAATAGAGATGAAAATCTTGTATCATTTTATTCCATCCTTAAGTCTTTGTCATATCGAACGAAAAAAAAAGAAAATATTTCACAAAACGTCGATATTGAAAATTATCGGTCGATACGATAATATTATC---GAGATAAATTGATTCGTTAAAATCAAATCCGCGTACGTCGATTAATGGAAATTTCGGATTATTGCTGCTAATATAGTTTTATAATGCCGCCTGTACGGGATTAATTAATAAGTCGGGCAATCGAAAATCATTCCCTGATGATTTTATCAAGAAATCGATATTCATCGGCAATTCAATCGTTCGTTATTATTATACAAATATGAAGAAATTATATCCTTGTATCCACAAGACGCTATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCTTTCCGTTCCGTGTAAAAAGATATCGTGTAAAATTCTCTTATCGTATATATATTTGTCGCATGAAAGAAACTCTTTTTGAATACTTATTCTTTTCTTATTAAAAAAACATACGATTTAAAGTTATAATTATATTGTTGTACACGTATTTACATTGATCACATTGAAATACATCGAGTGATTATTACTAATAATAA]

[+] EMBL BI508118             [TCGTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTACATTACAATAGAGATGAAAATCTTGTATCATTTTATTCCATCCTTAAGTCTTTGTCATATCGAACGAAAAAAAAAGAAAATATTTCACAAAACGTCGATATTGAAAATTATCGGTCGATACGATAATATTATC   GAGATAAATTGATTCGTTAAAATCAAATCCGCGTACGTCGATTAATGGAAATTTCGGATTATTGCTGCTAATATAGTTTTATAATGCCGCCTGTACGGGATTAATTAATAAGTCGGGCAATCGAAAATCATTCCCTGATGATTTTATCAAGAAATCGATATTCATCGGCAATTCAATCGTTCGTTATTATTATACAAATATGAAGAAATTATATCCTTGTATCCACAAGACGCTATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCTTTCCGTTCCGTGTAAAAAGATATCGTGTAAAATTCTCTTATCGTATATATATTTGTCGCATGAAAGAAACTCTTTTTGAATACTTATTCTTTTCTTATTAAAAAAACATACGATTTAA                                                                            ]
[+] EMBL BI508070             [                                ACAATAGAGATGAAAATCTTGTATCATTTTATTCCATCCTTAAGTCTTTGTCATATCGAACGAAAAAAAAAGAAAATATTTCACAAAACGTCGATATTGAAAATTATCGGTCGATACGATAATATTATC   GAGATAAATTGATTCGTTAAAATCAAATCCGCGTACGTCGATTAATGGAAATTTCGGATTATTGCTGCTAATATAGTTTTATAATGCCGCCTGTACGGGATTAATTAATAAGTCGGGCAATCGAAAATCATTCCCTGATGATTTTATCAAGAAATCGATATTCATCGGCAATTCAATCGTTCGTTATTATTATACAAATATGAAGAAATTATATCCTTGTATCCACAAGACGCTATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCTTTCCGTTCCGTGTAAAAAGATATCGTGTAAAATTCTCTTATCGTATATATATTTGTCGCATGAAAGAAACTCTTTTTGAATACTTATTCTTTTCTTATTAAAAAAACATACGATTT                                                                              ]
[+] EMBL BI507838             [                                                                                                            TATTT  CAAAACGTCGATATTGAAAATTATCGGTCGATACGATAATATTATCGTGGAGACAAATTGATTCGTTAAAATCAAATCCGCGTACGTCGATTAATGGAAATTTCGGATTATTGCTGCTAATATAGTTTTATAATGCCGCCTGTACGGGATTAATTAATAAGTCGGGCAATCGAAAATCATCCCCTGATGATTTTATCAAGAAATCGATATTCATCGGCAATTCAATCGTTCGTTATTATTATACAAATATGAAGAAATTATATCCTTGTATCCACAAGACGCTATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCTTTCCGTTCCGTGTAAAAAGATATCGTGTAAAATTCTCTTATCGTATATATATTTGTCGCATGAAAGAAACTCTTTTTGAATACTTATTCTTTTCTTATTAAAAAAACATACGATTTAAAGTTATAATTATATTGTTGTACACGTATTTACATTGATCACATTGAAATACATCGAGTGATTATTACTAATAATAA]


>consensus_664#0 TCGTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTACATTACAATAGAGATGAAAATCTTGTATCATT TTATTCCATCCTTAAGTCTTTGTCATATCGAACGAAAAAAAAAGAAAATATTTCACAAAA CGTCGATATTGAAAATTATCGGTCGATACGATAATATTATCGAGATAAATTGATTCGTTA AAATCAAATCCGCGTACGTCGATTAATGGAAATTTCGGATTATTGCTGCTAATATAGTTT TATAATGCCGCCTGTACGGGATTAATTAATAAGTCGGGCAATCGAAAATCATTCCCTGAT GATTTTATCAAGAAATCGATATTCATCGGCAATTCAATCGTTCGTTATTATTATACAAAT ATGAAGAAATTATATCCTTGTATCCACAAGACGCTATAATAATAATAATAATAATAATAA TAATCTTTCCGTTCCGTGTAAAAAGATATCGTGTAAAATTCTCTTATCGTATATATATTT GTCGCATGAAAGAAACTCTTTTTGAATACTTATTCTTTTCTTATTAAAAAAACATACGAT TTAAAGTTATAATTATATTGTTGTACACGTATTTACATTGATCACATTGAAATACATCGA GTGATTATTACTAATAATAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)