Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 670 cluster # 670       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_670#0 length = 830 sequences # 3  

consensusID : consensus_670#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 830
fasta sequence
                              [TTTATATTTTATCAATTTGAATATTAATATTTTTTTATTAAATCAATTTTATTATCATATTTATTTTATTTTTTAATATATTTATTAGTTTTATAATGAATTTAAGTTTATTCCCTGTGTATTGTGTAACATATATAAGTACTATATAATATATACAAAATGATTTTTTTTTTCATTTACATAATACGAAATACAATAAAAAAATTTTAATTTATTAAAATTTCTATTTTTAATAAAAATTAACACTTTAAAACCAGAAGTATATAAAAGTATTTTAAAATAAATTATTATGTTATGATATACTGTAGATAATTATGTATCTAGTATTAAGGATTAAAAAAAGTAAATGTTCATTTTTTGATTTTTATTACTAACATTCTTCATATTCCAGTGAATCATCAGCTTGCTGAATACTTTTATATTGAAAAAAAGGTGCATTGAACTTCTTCTTAGTTAAAATGATACGACGAAGTCCAACAAGAATCGACTTACGATTAGATGATCTGCAAGAATATGAAGCAATGAGGAAAGCTCTTGAAGCTAAGAAAGAATCAGAAAGACCGCCAACATTTAATCCTCCTTCGTGGGGTGGTAAAGTACCGCAAAGCGAAATTCAAGAACGTATCGGTTATATGCCACAACAAAATCAACCTACGCATTCTCGACCAAATATATAGTTTTTTACGTAATATATACATATATATATATATATATATATATACATACATGTTCTAAATTGCATTATTTTCTATTGTTATTTTATTTATATGTTCGTTGTAACATTATTATATAATCAATTGTAAATTAAGATTAAATAAAATAAATACGTT]

[+] EMBL BI507964             [TTTATATTTTATCAATTTGAATATTAATATTTTTTTATTAAATCAATTTTATTATCATATTTATTTTATTTTTTAATATATTTATTAGTTTTATAATGAATTTAAGTTTATTCCCTGTGTATTGTGTAACATATATAAGTACTATATAATATATACAAAATGATTTTTTTTTTCATTTACATAATACGAAATACAATAAAAAAATTTTAATTTATTAAAATTTCTATTTTTAATAAAAATTAACACTTTAAAACCAGAAGTATATAAAAGTATTTTAAAATAAATTATTATGTTATGATATACTGTAGATAATTATGTATCTAGTATTAAGGATTAAAAAAAGTAAATGTTCATTTTTTGATTTTTATTACTAACATTCTTCATATTCCAGTGAATCATCAGCTTGCTGAATACTTTTATATTGAAAAAAAGGTGCATTGAACTTCTTCTTAGTTAAAATGATACGACGAAGTCCAACAAGAATCGACTTACGATTAGATGATCTGCAAGAATATGAAGCAATGAGGAAAGCTCTTGAAGCTNNGAAAGAATCAGAAAGACCGCCAACATTTAATCCTCCTTCGTGGGGTGGTAAAGTACCGCAAAGCGAAA                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI506646             [                                                                                                                                                                                       ATACGAAATACAATAAAAAAATTTTAATTTATTAAAATTTCTATTTTTAATAAAAATTAACACTTTAAAACCAGAAGTATATAAAAGTATTTTAAAATAAATTATTATGTTATGATATACTGTAGATAATTATGTATCTAGTATTAAGGATTAAAAAAAGTAAATGTTCATTTTTTGATTTTTATTACTAACATTCTTCATATTCCAGTGAATCATCAGCTTGCTGAATACTTTTATATTGAAAAAAAGGTGCATTGAACTTCTTCTTAGTTAAAATGATACGACGAAGTCCAACAAGAATCGACTTACGATTAGATGATCTGCAAGAATATGAAGCAATGAGGAAAGCTCTTGAAGCTAAGAAAGAATCAGAAAGACCGCCAACATTTAATCCTCCTTCGTGGGGTGGTAAAGTACCGCAAAGCGAAATTCAAGAACGTATCGGTTATATGCCACAACAAAATCAACCTACGCATTCTCGACCAAATATATAGTTTTTTACGTAATATATAC  ATATATATATATATATATATATACATACATGTTCTAAAT                                                                                             ]
[-] EMBL BI509280             [                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAAAATAAATTATTATGTTATGATATACTGTAGATAATTATGTATCTAGTATTAAGGATTAAAAAAAGTAAATGTTCATTTTTTGATTTTTATTACTAACATTCTTCATATTCCAGTGAATCATCAGCTTGCTGAATACTTTTATATTGAAAAAAAGGTGCATTGAACTTCTTCTTAGTTAAAATGATACGACGAAGTCCAACAAGAATCGACTTACGATTAGATGATCTGCAAGAATATGAAGCAATGAGGAAAGCTCTTGAAGCTAAGAAAGAATCAGAAAGACCGCCAACATTTAATCCTCCTTCGTGGGGTGGTAAAGTACCGCAAAGCGAAATTCAAGAACGTATCGGTTATATGCCACAACAAAATCAACCTACGCATTCTCGACCAAATATATAGTTTTTTACGTAATATATACATATATATATATATATATATATATACATACATGTTCTAAATTGCATTATTTTCTATTGTTATTTTATTTATATGTTCGTTGTAACATTATTATATAATCAATTGTAAATTAAGATTAAATAAAATAAATACGTT]


>consensus_670#0 TTTATATTTTATCAATTTGAATATTAATATTTTTTTATTAAATCAATTTTATTATCATAT TTATTTTATTTTTTAATATATTTATTAGTTTTATAATGAATTTAAGTTTATTCCCTGTGT ATTGTGTAACATATATAAGTACTATATAATATATACAAAATGATTTTTTTTTTCATTTAC ATAATACGAAATACAATAAAAAAATTTTAATTTATTAAAATTTCTATTTTTAATAAAAAT TAACACTTTAAAACCAGAAGTATATAAAAGTATTTTAAAATAAATTATTATGTTATGATA TACTGTAGATAATTATGTATCTAGTATTAAGGATTAAAAAAAGTAAATGTTCATTTTTTG ATTTTTATTACTAACATTCTTCATATTCCAGTGAATCATCAGCTTGCTGAATACTTTTAT ATTGAAAAAAAGGTGCATTGAACTTCTTCTTAGTTAAAATGATACGACGAAGTCCAACAA GAATCGACTTACGATTAGATGATCTGCAAGAATATGAAGCAATGAGGAAAGCTCTTGAAG CTAAGAAAGAATCAGAAAGACCGCCAACATTTAATCCTCCTTCGTGGGGTGGTAAAGTAC CGCAAAGCGAAATTCAAGAACGTATCGGTTATATGCCACAACAAAATCAACCTACGCATT CTCGACCAAATATATAGTTTTTTACGTAATATATACATATATATATATATATATATATAT ACATACATGTTCTAAATTGCATTATTTTCTATTGTTATTTTATTTATATGTTCGTTGTAA CATTATTATATAATCAATTGTAAATTAAGATTAAATAAAATAAATACGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)