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Apis mellifera
cluster # 713 cluster # 713       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_713#0 length = 850 sequences # 3  

consensusID : consensus_713#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 850
fasta sequence
                              [ACAAACATAAAACATTAAACATAAAAATATTAAATTTTATAACACTTATTGTTAAGTTTCTTTTTAAATATTATTGTAACAGTGTACATTTTTGAAGTGCTTTCAAGAAGTGCTGGTCCCTTGAGCTTCTTGAGTAGCTTTGTAAGAATATTCCAAAGCAGTTGCTATAGTTCTCATATCTCCTTCAATGCTGCGTGCCCAATTTTCAGCATCACCAATTTCTTTTAGTGCACTAGAAAATGCTTCTACTAGGTTCAACCATGATTGTGTTTGTTTTGCAAAATTTGTTGCACTATGTTGCAATTGTTTTGCCTCTGCATCTAATTTCTTTTGATTGAGATATGCTTGTGCCACACCTACATTTAGATGATCAACCAAAGCTTGTGTCAAGTTACTTGCAGCTTGTACAGCTTCTTTTCTTTTTTGTTCTTGTCTTTCTTTTCTCGCTGCTTGTTTGCTTTGGTGTTCTTTTACAATAGTAGATAACATTTTTTATAAAGAAATTTGTATTAATAAGGTATCAGTAGGTTACATTTATGGTAAAGATTAGAATCCTCTTTCTTCATTAAATTATAAATAATATTATTGATTTCTTTAAGTATTTCTTTTAAATATATATTGTTTGTAATAAATTTACTTACGATTATAATACGTTATATTAACATATTTATTAATTTTATTAAAAAACAAAAGAAATTATATTTTAATTTAAATATAAATATAAAAACTAAGATATTACACTATTAAATAATATATAAATAATGTTTTAACAATTTACATACATTAAAATTCAGCAACAAGCAATATTTAAATATGTGAGAATAGTATGTTCTATTAATAAACAATATGT]

[+] EMBL BI507664             [ACAAACATAAAACATTAAACATAAAAATATTAAATTTTATAACACTTATTGTTAAGTTTCTTTTTAAATATTATTGTAACAGTGTACATTTTTGAAGTGCTTTCAAGAAGTGCTGGTCCCTTGAGCTTCTTGAGTAGCTTTGTAAGAATATTCCAAAGCAGTTGCTATAGTTCTCATATCTCCTTCAATGCTGCGTGCCCAATTTTCAGCATCACCAATTTCTTTTAGTGCACTAGAAAATGCTTCTACTAGGTTCAACCATGATTGTGTTTGTTTTGCAAAATTTGTTGCACTATGTTGCAATTGTTTTGCCTCTGCATCTAATTTCTTTTGATTGAGATATGCTTGTGCCACACCTACATTTAGATGATCAACCAAAGCTTGTGTCAAGTTACTTGCAGCTTGTACAGCTTCTTTTCTTTTTTGTTCTTGTCTTTCTTTTCTCGCTGCTTGTTTGCTTTGGTGTTATTTTACAATAGTAGATAACATTTTTTATAAAGAAATTTGTATTAATAAGGTATCAGTAGGTTACATTTATGGTAAAGATTAGAATCCTCTTTCTTCATTAAATTATAAATAATATTATTGATTTCTTTAAGTATTTCTTTTAAATATATATTGTTTGTAATAAATTTACTTACGATTATAATACGTTATA                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL BI513126             [                                                                                                                                                                                                        AATTTTCAGCATCACCAATTTCTTTTAGTGCACTAGAAAATGCTTCTACTAGGTTCAACCATGATTGTGTTTGTTTTGCAAAATTTGTTGCACTATGTTGCAATTGTTTTGCCTCTGCATCTAATTTCTTTTGATTGAGATATGCTTGTGCCACACCTACATTTAGATGATCAACCAAAGCTTGTGTCAAGTTACTTGCAGCTTGTACAGCTTCTTTTCTTTTTTGTTCTTGTCTTTCTTTTCTCGCTGCTTGTTTGCTTTGGTGTTCTTTTACAATAGTAGATAACATTTTTTATAAAGAAATTTGTATTAATAAGGTATCAGTAGGTTACATTTATGGTAAAGATTAGAATCCTCTTTCTTCATTAAATTATAAATAATATTATTGATTTCTTTAAGTATTTCTTTTAAATATATATTGTTTGTAATAAATTTACTTACGATTATAATACGTTATATTAACATATTTATTAATTTTATTAAAAAACAAAAGAAATTA                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL BI510964             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CCAAAGCTTGTGTCAAGTTACTTGCAGCTTGTACAGCTTCTTTTCTTTTTTGTTCTTGTCTTTCTTTTCTCGCTGCTTGTTTGCTTTGGTGTTCTTTTACAATAGTAGATAACATTTTTTATAAAGAAATTTGTATTAATAAGGTATCAGTAGGTTACATTTATGGTAAAGATTAGAATCCTCTTTCTTCATTAAATTATAAATAATATTATTGATTTCTTTAAGTATTTCTTTTAAATATATATTGTTTGTAATAAATTTACTTACGATTATAATACGTTATATTAACATATTTATTAATTTTATTAAAAAACAAAAGAAATTATATTTTAATTTAAATATAAATATAAAAACTAAGATATTACACTATTAAATAATATATAAATAATGTTTTAACAATTTACATACATTAAAATTCAGCAACAAGCAATATTTAAATATGTGAGAATAGTATGTTCTATTAATAAACAATATGT]


>consensus_713#0 ACAAACATAAAACATTAAACATAAAAATATTAAATTTTATAACACTTATTGTTAAGTTTC TTTTTAAATATTATTGTAACAGTGTACATTTTTGAAGTGCTTTCAAGAAGTGCTGGTCCC TTGAGCTTCTTGAGTAGCTTTGTAAGAATATTCCAAAGCAGTTGCTATAGTTCTCATATC TCCTTCAATGCTGCGTGCCCAATTTTCAGCATCACCAATTTCTTTTAGTGCACTAGAAAA TGCTTCTACTAGGTTCAACCATGATTGTGTTTGTTTTGCAAAATTTGTTGCACTATGTTG CAATTGTTTTGCCTCTGCATCTAATTTCTTTTGATTGAGATATGCTTGTGCCACACCTAC ATTTAGATGATCAACCAAAGCTTGTGTCAAGTTACTTGCAGCTTGTACAGCTTCTTTTCT TTTTTGTTCTTGTCTTTCTTTTCTCGCTGCTTGTTTGCTTTGGTGTTCTTTTACAATAGT AGATAACATTTTTTATAAAGAAATTTGTATTAATAAGGTATCAGTAGGTTACATTTATGG TAAAGATTAGAATCCTCTTTCTTCATTAAATTATAAATAATATTATTGATTTCTTTAAGT ATTTCTTTTAAATATATATTGTTTGTAATAAATTTACTTACGATTATAATACGTTATATT AACATATTTATTAATTTTATTAAAAAACAAAAGAAATTATATTTTAATTTAAATATAAAT ATAAAAACTAAGATATTACACTATTAAATAATATATAAATAATGTTTTAACAATTTACAT ACATTAAAATTCAGCAACAAGCAATATTTAAATATGTGAGAATAGTATGTTCTATTAATA AACAATATGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)