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Apis mellifera
cluster # 75 cluster # 75       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_75#0 length = 857 sequences # 8  

consensusID : consensus_75#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 857
fasta sequence
                              [ACTGCGCCTATCCAGTTCCACCAGACCAAGGCTCTCGTGAAAGTGTAGGTTAAAGTGCTTGTTTACGTGATTCTTCTCACCGGCTACTACATCACGAAATGGCATCTGGAGTAACAGTGGCTGACGTTTGTAAGACAACGTACGAAGAGATTAAAAAAGACAAAAAACATCGATATGTAATCTTTTATATTAAAGATGAAAAACAAATTGATGTTGAAGTCATTGGACCTCGTGATGCAGCATATGATGCCTTCCTTGAAGATTTGCAAAAAGGTGGTAGCGGAGAATGTCGCTATGGCCTTTTCGATTTTGAATACACTCATCAATGTCAAGGAACTTCTGAGGCTTCCAAGAAACAAAAATTGTTTTTGATGTCGTGGTGTCCTGACACGGCTAAAGTTAAGAAGAAGATGTTGTACTCTAGTTCTTTTGATGCTTTGAAAAAGTCCTTAGTTGGTGTGCAAAAATATATACAGGCAACAGACCTATCAGAGGCTTCTGAAGAAGCTGTTGAAGAGAAGCTCCGAGCCACTGACAGGAATTAGGAGTATTTAAGCAAATCCAAAATTATTAATATTATTGAGAGAAATCAAGTGAAAAACAGTACGCAAATTCCCTTCCCCAAAATAATGCTCTGTACCGTCGTTGCATCGAACGTTCACGTTTTTACACATTTTTCACGTTTAAACGAAAACGATTACTAAGTATTTGTGCTACATGTATTAGTCATTGGGGAGCGTAAACATTNNNAGAAAGGAACATAAAAGGAACAAAAAATATATAAAGAAAAAAACACTTTTCATACTGCGAACGTTGTGTGAATCTGTCTGATATAATATTAATATTATACTATTATT]

[+] EMBL BI503271             [ACTGCGCCTATCCAGTTCCACCAGACCAAGGCTCTCGTGAAAGTGTAGGTTAAAGTGCTTGTTTACGTGATTCTTCTCACCGGCTACTACATCACGAAATGGCATCTGGAGTAACAGTGGCTGACGTTTGTAAGACAACGTACGAAGAGATTAAAAAAGACAAAAAACATCGATATGTAATCTTTTATATTAAAGATGAAAAACAAATTGATGTTGAAGTCATTGGACCTCGTGATGCAGCATATGATGCCTTCCTTGAAGATTTGCAAAAAGGTGGTAGCGGAGAATGTCGCTATGGCCTTTTCGATTTTGAATACACTCATCAATGTCAAGGAACTTCTGAGGCTTCCAAGAAACAAAAATTGTTTTTGATGTCGTGGTGTCCTGACACGGCTAAAGTTAAGAAGAAGATGTTGTACTCTAGTTCTTTTGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI504217             [   GCGCCTATCCAGTTCCACCAGACCAAGGCTCTCGTGAAAGTGTAGGTTAAAGTGCTTGTTTACGTGATTCTTCTCACCGGCTACTACATCACGAAATGGCATCTGGAGTAACAGTGGCTGACGTTTGTAAGACAACGTACGAAGAGATTAAAAAAGACAAAAAACATCGATATGTAATCTTTTATATTAAAGATGAAAAACAAATTGATGTTGAAGTCATTGGACCTCGTGATGCAGCATATGATGCCTTCCTTGAAGATTTGCAAAAAGGTGGTAGCGGAGAATGTCGCTATGGCCTTTTCGATTTTGAATACACTCATCAATGTCAAGGAACTTCTGAGGCTTCCAAGAAACAAAAATTGTTTTTGATGTCGTGGTGTCCTGACACGGCTAAAGTTAAGAAGAAGATGTTGTACTCTAGTTCTTTTGATGCTTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI503296             [          TCCAGTTCCACCAGACCAAGGCTCTCGTGAAAGTGTAGGTTAAAGTGCTTGTTTACGTGATTCTTCTCACCGGCTACTACATCACGAAATGGCATCTGGAGTAACAGTGGCTGACGTTTGTAAGACAACGTACGAAGAGATTAAAAAAGACAAAAAACATCGATATGTAATCTTTTATATTAAAGATGAAAAACAAATTGATGTTGAAGTCATTGGACCTCGTGATGCAGCATATGATGCCTTCCTTGAAGATTTGCAAAAAGGTGGTAGCGGAGAATGTCGCTATGGCCTTTTCGATTTTGAATACACTCATCAATGTCAAGGAACTTCTGAGGCTTCCAAGAAACAAAAATTGTTTTTGATGTCGTGGTGTCCTGACACGGCTAAAGTTAAGAAGAAGATGTTGTACTCTAGTTCTTTTGATGCTTTGAAAAAGTCCTTAGTTGGTGTGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI506255             [                                                                                                             AGTAACAGTGGCTGACGTTTGTAAGACAACGTACGAAGAGATTAAAAAAGACAAAAAACATCGATATGTAATCTTTTATATTAAAGATGAAAAACAAATTGATGTTGAAGTCATTGGACCTCGTGATGCAGCATATGATGCCTTCCTTGAAGATTTGCAAAAAGGTGGTAGCGGAGAATGTCGCTATGGCCTTTTCGATTTTGAATACACTCATCAATGTCAAGGAACTTCTGAGGCTTCCAAGAAACAAAAATTGTTTTTGATGTCGTGGTGTCCTGACACGGCTAAAGTTAAGAAGAAGATGTTGTACTCTAGTTCTTTTGATGCTTTGAAAAAGTCCTTAGTTGGTGTGCAAAAATATATACAGGCAACAGACCTATCAGAGGCTTCTGAAGAAGCTGTTGAAGAGAAGCTCCGAGCCACTGACAGGAATTAGGAGTATTTAAGCAAATCCAAAATTATTAATATTATTGAGAGAAATCAAGTGAAAAACAGTACGCAAATTCCCTTCCCCAAAATAATGCTCTGTACCGTCGTTGCATCGAACGTTCACGTTTTTACACATTTTTCACGTTTAAACGAAAACGATTACTAAGTATTTGTGCTACATGTATTAGTCAT                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI504640             [                                                                                                                                   AAGACAACGTACGAAGAGATTAAAAAAGACAAAAAACATCGATATGTAATCTTTTATATTAAAGATGAAAAACAAATTGATGTTGAAGTCATTGGACCTCGTGATGCAGCATATGATGCCTTCCTTGAAGATTTGCAAAAAGGTGGTAGCGGAGAATGTCGCTATGGCCTTTTCGATTTTGAATACACTCATCAATGTCAAGGAACTTCTGAGGCTTCCAAGAAACAAAAATTGTTTTTGATGTCGTGGTGTCCTGACACGGCTAAAGTTAAGAAGAAGATGTTGTACTCTAGTTCTTTTGATGCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI504591             [                                                                                                                                                         AAAAAGACAAAAAACATCGATATGTAATCTTTTATATTAAAGATGAAAAACAAATTGATGTTGAAGTCATTGGACCTCGTGATGCAGCATATGATGCCTTCCTTGAAGATTTGCAAAAAGGTGGTAGCGGAGAATGTCGCTATGGCCTTTTCGATTTTGAATACACTCATCAATGTCAAGGAACTTCTGAGGCTTCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI513976             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GATTTTGAATACACTCATCAATGTCAAGGAACTTCTGAGGCTTCCAAGAAACAAAAATTGTTTTTGATGTCGTGGTGTCCTGACACGGCTAAAGTTAAGAAGAAGATGTTGTACTCTAGTTCTTTTGATGCTTTGAAAAAGTCCTTAGTTGGTGTGCAAAAATATATACAGGCAACAGACCTATCAGAGGCTTCTGAAGAAGCTGTTGAAGAGAAGCTCCGAGCCACTGACAGGAATTAGGAGTATTTAAGCAAATCCAAAATTATTAATATTATTGAGAGAAATCAAGTGAAAAACAGTACGCAAATTCCCTTCCCCAAAATAATGCTCTGTACCGTCGTTGCATCGAACGTTCACGTTTTTACACATTTTTCACGTTTAAACGAAAACGATTACTAAGTATTTGTGCTACATGTATTAGTCATTGGGGAGCGTAAACATTAGCAGAAAGGAACATAAAAGGAACAAAAAATATATAAAGAAAAAAAC                                                               ]
[+] EMBL BI513891             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAAATATATACAGGCAACAGACCTATCAGAGGCTTCTGAAGAAGCTGTTGAAGAGAAGCTCCGAGCCACTGACAGGAATTAGGAGTATTTAAGCAAATCCAAAATTATTAATATTATTGAGAGAAATCAAGTGAAAAACAGTACGCAAATTCCCTTCCCCAAAATAATGCTCTGTACCGTCGTTGCATCGAACGTTCACGTTTTTACACATTTTTCACGTTTAAACGAAAACGATTACTAAGTATTTGTGCTACATGTATTAGTCATTGGGGAGCGTAAACATTNNNAGAAAGGAACATAAAAGGAACAAAAAATATATAAAGAAAAAAACACTTTTCATACTGCGAACGTTGTGTGAATCTGTCTGATATAATATTAATATTATACTATTATT]


>consensus_75#0 ACTGCGCCTATCCAGTTCCACCAGACCAAGGCTCTCGTGAAAGTGTAGGTTAAAGTGCTT GTTTACGTGATTCTTCTCACCGGCTACTACATCACGAAATGGCATCTGGAGTAACAGTGG CTGACGTTTGTAAGACAACGTACGAAGAGATTAAAAAAGACAAAAAACATCGATATGTAA TCTTTTATATTAAAGATGAAAAACAAATTGATGTTGAAGTCATTGGACCTCGTGATGCAG CATATGATGCCTTCCTTGAAGATTTGCAAAAAGGTGGTAGCGGAGAATGTCGCTATGGCC TTTTCGATTTTGAATACACTCATCAATGTCAAGGAACTTCTGAGGCTTCCAAGAAACAAA AATTGTTTTTGATGTCGTGGTGTCCTGACACGGCTAAAGTTAAGAAGAAGATGTTGTACT CTAGTTCTTTTGATGCTTTGAAAAAGTCCTTAGTTGGTGTGCAAAAATATATACAGGCAA CAGACCTATCAGAGGCTTCTGAAGAAGCTGTTGAAGAGAAGCTCCGAGCCACTGACAGGA ATTAGGAGTATTTAAGCAAATCCAAAATTATTAATATTATTGAGAGAAATCAAGTGAAAA ACAGTACGCAAATTCCCTTCCCCAAAATAATGCTCTGTACCGTCGTTGCATCGAACGTTC ACGTTTTTACACATTTTTCACGTTTAAACGAAAACGATTACTAAGTATTTGTGCTACATG TATTAGTCATTGGGGAGCGTAAACATTNNNAGAAAGGAACATAAAAGGAACAAAAAATAT ATAAAGAAAAAAACACTTTTCATACTGCGAACGTTGTGTGAATCTGTCTGATATAATATT AATATTATACTATTATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)