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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_809#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 574 fasta sequence
[TTTGTTCAAATGATTTACAAAATGAAAACTTTGATCATTATTCCTCGATTTCGCTTATTATCGTCAAAGGAAGATACTTAATATTATAAGTTGCCTAAAAGACAATTTTGGTTCCTTAAACCTGGATGAAGCTTCTTGTAAAAGATTTCGAAGATATAGGAGCGCTTTTCGAAGCTCGATATATGCGAATGATATATAAACGACACGACTTGGAGCAACTTTGCTATAACACCCACTGTGCTTGAAATTTGTTGGAATTTAACGCTCTATTATAATTTTTTTATTGCTATTATTTGATTGGATTTTGGAAATTCACCGAACCTTAAATATTCTTGTATCATTATTATAGCACCACAAATATATTCACAACGACTATCCCACGACTTTCGTGCAAGGAAGCAAGAAAGCGATGGGATAGTCGTTGTTGGTCTTAAACTGTAAAAGTTAACTGTAAAAAGTTAATTATTAACGAGATTGATTTTTGGAATCGAGTGAAAACGAATTATTATAACGAATAATAATAATAATACTGTCGAGCGTTAAATTAAATTTGGAAAGTTGCTTGAAACGAGTT]
[+] EMBL BI514652 [TTTGTTCAAATGATTTACAAAATGAAAACTTTGATCATTATTCCTCGATTTCGCTTATTATCGTCAAAGGAAGATACTTAATATTATAAGTTGCCTAAAAGACAATTTTGGTTCCTTAAACCTGGATGAAGCTTCTTGTAAAAGATTTCGAAGATATAGGAGCGCTTTTCGAAGCTCGATATATGCGAATGATATATAAACGACACGACTTGGAGCAACTTTGCTATAACACCCACTGTGCTTGAAATTTGTTGGAATTTAACGCTCTATTATAATTTTTTTATTGCTATTATTTGATTGGATTTTGGAAATTCACCGAATCTTAAATATTCTTGTATCATTATTATAGCACCACAAATATATTCACAACGACTATCCCACGACTTTCGTGCAAGGAAGCAAGAAAGCGATGGGATAGTCGTTGTTGGTCTTAAACTGTAAAAGTTAACTGTAAAAAGTTAATTATTAACGAGATTGATTTTTGGAATCGAGTGAAAACGAATTATTATAACG ]
[-] EMBL BI515173 [ TCCTTAAACCTGGATGAAGCTTCTTGTAAAAGATTTCGAAGATATAGGAGCGCTTTTCGAAGCTCGATATATGCGAATGATATATAAACGACACGACTTGGAGCAACTTTGCTATAACACCCACTGTGCTTGAAATTTGTTGGAATTTAACGCTCTATTATAATTTTTTTATTGCTATTATTTGATTGGATTTTGGAAATTCACCGAACCTTAAATATTCTTGTATCATTATTATAGCACCACAAATATATTCACAACGACTATCCCACGACTTTCGTGCAAGGAAGCAAGAAAGCGATGGGATAGTCGTTGTTGGTCTTAAACTGTAAAAGTTAACTGTAAAAAGTTAATTATTAACGAGATTGATTTTTGGAATCGAGTGAAAACGAATTATTATAACGAATAATAATAATAATACTGTCGAGCGTTAAATTAAATTTGGAAAGTTGCTTGAAACGAGTT]
consensusID : consensus_809#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 476 fasta sequence
[TCGTCAAAGGAAGATACTTAATATTATAAGTTGCCTAAAAGACAATTTTGGTTCCTTAAACCTGGATGAAGCTTCTTGTAAAAGATTTCGAAGATATAGGAGCGCTTTTCGAAGCTCGATATATGCGAATGATATATAAACGACACGACTTGGAGCAACTTTGCTATAACACCCACTGTGCTTGAAATTTGTTGGAATTTAACGCTCTATTATAATTTTTTTATTGCTATTATTTGATTGGATTTTGGAAATTCACCGAACCTTAAATATTCTTGTATCATTATTATAGCACCACAAATATATTCACAACGACTATAAAAGTTAACTGTAAAAAGTTAATTATTAACGAGATTGATTTTTGGAATCGAGTGAAAACGAATTATTATAACGAATAATAATAATACTGTCGAGCGTTAAATTAAATTTGGAAAGTTGCTTGAAACGAGTTGAAAAAACAAACTCGAGAAAAGAAAGAT]
[-] EMBL BI511638 [TCGTCAAAGGAAGATACTTAATATTATAAGTTGCCTAAAAGACAATTTTGGTTCCTTAAACCTGGATGAAGCTTCTTGTAAAAGATTTCGAAGATATAGGAGCGCTTTTCGAAGCTCGATATATGCGAATGATATATAAACGACACGACTTGGAGCAACTTTGCTATAACACCCACTGTGCTTGAAATTTGTTGGAATTTAACGCTCTATTATAATTTTTTTATTGCTATTATTTGATTGGATTTTGGAAATTCACCGAACCTTAAATATTCTTGTATCATTATTATAGCACCACAAATATATTCACAACGACTATAAAAGTTAACTGTAAAAAGTTAATTATTAACGAGATTGATTTTTGGAATCGAGTGAAAACGAATTATTATAACGAATAATAATAATACTGTCGAGCGTTAAATTAAATTTGGAAAGTTGCTTGAAACGAGTTGAAAAAACAAACTCGAGAAAAGAAAGAT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_809#0 TTTGTTCAAATGATTTACAAAATGAAAACTTTGATCATTATTCCTCGATTTCGCTTATTA 60
consensus_809#1 ------------------------------------------------------------
consensus_809#0 TCGTCAAAGGAAGATACTTAATATTATAAGTTGCCTAAAAGACAATTTTGGTTCCTTAAA 120
consensus_809#1 TCGTCAAAGGAAGATACTTAATATTATAAGTTGCCTAAAAGACAATTTTGGTTCCTTAAA 60
************************************************************
consensus_809#0 CCTGGATGAAGCTTCTTGTAAAAGATTTCGAAGATATAGGAGCGCTTTTCGAAGCTCGAT 180
consensus_809#1 CCTGGATGAAGCTTCTTGTAAAAGATTTCGAAGATATAGGAGCGCTTTTCGAAGCTCGAT 120
************************************************************
consensus_809#0 ATATGCGAATGATATATAAACGACACGACTTGGAGCAACTTTGCTATAACACCCACTGTG 240
consensus_809#1 ATATGCGAATGATATATAAACGACACGACTTGGAGCAACTTTGCTATAACACCCACTGTG 180
************************************************************
consensus_809#0 CTTGAAATTTGTTGGAATTTAACGCTCTATTATAATTTTTTTATTGCTATTATTTGATTG 300
consensus_809#1 CTTGAAATTTGTTGGAATTTAACGCTCTATTATAATTTTTTTATTGCTATTATTTGATTG 240
************************************************************
consensus_809#0 GATTTTGGAAATTCACCGAACCTTAAATATTCTTGTATCATTATTATAGCACCACAAATA 360
consensus_809#1 GATTTTGGAAATTCACCGAACCTTAAATATTCTTGTATCATTATTATAGCACCACAAATA 300
************************************************************
consensus_809#0 TATTCACAACGACTATCCCACGACTTTCGTGCAAGGAAGCAAGAAAGCGATGGGATAGTC 420
consensus_809#1 TATTCACAACGACTAT-------------------------------------------- 316
****************
consensus_809#0 GTTGTTGGTCTTAAACTGTAAAAGTTAACTGTAAAAAGTTAATTATTAACGAGATTGATT 480
consensus_809#1 -------------------AAAAGTTAACTGTAAAAAGTTAATTATTAACGAGATTGATT 357
*****************************************
consensus_809#0 TTTGGAATCGAGTGAAAACGAATTATTATAACGAATAATAATAATAATACTGTCGAGCGT 540
consensus_809#1 TTTGGAATCGAGTGAAAACGAATTATTATAACGAATAATAATAATA---CTGTCGAGCGT 414
********************************************** ***********
consensus_809#0 TAAATTAAATTTGGAAAGTTGCTTGAAACGAGTT-------------------------- 574
consensus_809#1 TAAATTAAATTTGGAAAGTTGCTTGAAACGAGTTGAAAAAACAAACTCGAGAAAAGAAAG 474
**********************************
consensus_809#0 --
consensus_809#1 AT 476
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| Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |