cluster # 14823

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Oryza sativa
cluster # 14823 cluster # 14823 Sequences # 18 consensus # 3

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consensus_14823#2 length = 481 sequences # 2

consensusID : consensus_14823#0
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Sequences nbr = 15
consensus length = 1197
fasta sequence

                              [GCTACGCAACGGCATGACAGTGCTTTCTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTGCAGTTGAGTTGGGGTGCTACGCACTAGCTACTCAAGTGCATGAGCTAGCTCAAACAATCGATCGATGGCGATGAAGGCGGTGATCAAGGGCGGCGATGGCGGAGGCGGGTGCATGGTGGTGGTGGCGCACGTGCTAGCGGTGGCGGCGACGGCGATGGTGTTGGTGTGGTGCGTTCACTTCCGCGGCGGACTCGCCCTGCGCTCCCACAACAAGCAGCTCATCTTCAACACCCACCCGGTGCTCAT-GGTGCTTGGCCTCGTCGTCCTCGCCGCCGAGGCCATCCTCTCCTACCGCTCCCTCTCCATCATCGTCAGCAGCAGGGACGCCAGAAAGAAGGTGCACCTGGGGCTGCACGCCGTGGGGCTCGCCCTCGGCGGCGTCGGCATCTACGCGGTGTTCAAGTACCACGCCGAGGCCGACATCCCCAACCTCTACTCCCTCCACTCCTGGATCGGCATCGCCACCATCTCCCTCTACGCGCTCCACTGGCTCCTCGCCTTCCTCACCTTCTTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAAC-TTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTC-GGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCCATCGTGCATCTTTAATTACCATGCATG--TATATATATATCTGGCCGAGTGTAAATACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATACACACTTACGTACTCATCTGTAAAATACATAATATATTGCGTCTCATCTGTGTACGTATAAAAAA]

[+] EMBL CF332483             [GCTACGCAACGGCATGACAGTGCTTTCTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTGCAGTTGAGTTGGGGTGCTACGCACTAGCTACTCAAGTGCATGAGCTAGCTCAAACAATCGATCGATGGCGATGAAGGCGGTGATCAAGGGCGGCGATGGCGGAGGCGGGTGCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AK104211             [                                             TTGCAGTTGAGTTGGGGTGCTACGCACTAGCTACTCAAGTGCATGAGCTAGCTCAAACAATCGATCGATGGCGATGAAGGCGGTGATCAAGGGCGGCGATGGCGGAGGCGGGTGCATGGTGGTGGTGGCGCACGTGCTAGCGGTGGCGGCGACGGCGATGGTGTTGGTGTGGTGCGTTCACTTCCGCGGCGGACTCGCCCTGCGCTCCCACAACAAGCAGCTCATCTTCAACACCCACCCGGTGCTCAT GGTGCTTGGCCTCGTCGTCCTCGCCGCCGAGGCCATCCTCTCCTACCGCTCCCTCTCCATCATCGTCAGCAGCAGGGACGCCAGAAAGAAGGTGCACCTGGGGCTGCACGCCGTGGGGCTCGCCCTCGGCGGCGTCGGCATCTACGCGGTGTTCAAGTACCACGCCGAGGCCGACATCCCCAACCTCTACTCCCTCCACTCCTGGATCGGCATCGCCACCATCTCCCTCTACGCGCTCCACTGGCTCCTCGCCTTCCTCACCTTCTTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAAC TTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTC GGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCCATCGTGCATCTTTAATTACCATGCATG  TATATATATATCTGGCCGAGTGTAAATACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATATATGTATGGATAC                                                                ]
[+] EMBL AK061172             [                                                 AGTTGAGTTGGGGTGCTACGCACTAGCTACTCAAGTGCATGAGCTAGCTCAAACAATCGATCGATGGCGATGAAGGCGGTGATCAAGGGCGGCGATGGCGGAGGCGGGTGCATGGTGGTGGTGGCGCACGTGCTAGCGGTGGCGGCGACGGCGATGGTGTTGGTGTGGTGCGTTCACTTCCGCGGCGGACTCGCCCTGCGCTCCCACAACAAGCAGCTCATCTTCAACACCCACCCGGTGCTCAT GGTGCTTGGCCTCGTCGTCCTCGCCGCCGAGGCCATCCTCTCCTACCGCTCCCTCTCCATCATCGTCAGCAGCAGGGACGCCAGAAAGAAGGTGCACCTGGGGCTGCACGCCGTGGGGCTCGCCCTCGGCGGCGTCGGCATCTACGCGGTGTTCAAGTACCACGCCGAGGCCGACATCCCCAACCTCTACTCCCTCCACTCCTGGATCGGCATCGCCACCATCTCCCTCTACGCGCTCCACTGGCTCCTCGCCTTCCTCACCTTCTTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAAC TTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTC GGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCCATCGTGCATCTTTAATTACCATGCATGTATATATATATATCTGGCCGAGTGTAAATACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATACACACTTACGTACTCATCTGTAAAATACATAATATATTGCGTCTCATCTGTGTACG         ]
[+] EMBL CF294827             [                                                   TTGAGTTGGGGTGCTACGCACTAGCTACTCAAGTGCATGAGCTAGCTCAAACAATCGATCGATGGCGATGAAGGCGGTGATCAAGGGCGGCGATGGCGGAGGCGGGTGCATGGTGGTGGTGGCGCACGTGCTATCGGTGGCGGCGACGGCGATGGTGTTGGTGTGGTGCGTTCACTTCCGCGGCGGACTCGCCCTGCGCTCCCACAACAAGCAGCTCATCTTCAACACCCACCCGGTGCTCATAGGTGCTTGGCCTCGTCGTCCTCGCCGCCGAGGCCATCCTCTCCTACCGCTCCCTCTCCATCATCGTCAGCAGCAGGGACGCCAGAAAGAAGGTGCACCTGGGGCTGCACGCCGTGGGGCTCGCCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AK070102             [                                                       GTTGGGGTGCTACGCACTAGCTACTCAAGTGCATGAGCTAGCTCAAACAATCGATCGATGGCGATGAAGGCGGTGATCAAGGGCGGCGATGGCGGAGGCGGGTGCATGGTGGTGGTGGCGCACGTGCTAGCGGTGGCGGCGACGGCGATGGTGTTGGTGTGGTGCGTTCACTTCCGCGGCGGACTCGCCCTGCGCTCCCACAACAAGCAGCTCATCTTCAACACCCACCCGGTGCTCAT GGTGCTTGGCCTCGTCGTCCTCGCCGCCGAGGCCATCCTCTCCTACCGCTCCCTCTCCATCATCGTCAGCAGCAGGGACGCCAGAAAGAAGGTGCACCTGGGGCTGCACGCCGTGGGGCTCGCCCTCGGCGGCGTCGGCATCTACGCGGTGTTCAAGTACCACGCCGAGGCCGACATCCCCAACCTCTACTCCCTCCACTCCTGGATCGGCATCGCCACCATCTCCCTCTACGCGCTCCACTGGCTCCTCGCCTTCCTCACCTTCTTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAAC TTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTC GGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATT                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CB684939             [                                                                         AGCTCCTCAAGTGCATGAGCTAGCTCAAACAATCGATCGATGGCGATGAAGGCGGTGATCAAGGGCGGCGATGGCGGAGGCGGGTGCATGGTGGTGGTGGCGCACGTGCTAGCGGTGGCGGCGACGGCGATGGTGTTGGTGTGGTGCGTTCACTTCCGCGGCGGACTCGCCCTGCGCTCCCACAACAAGCAGCTCATCTTCAACACCCACCCGGTGCTCAT GGTGCTTGGCCTCGTCGTCCTCGCCGCCGAGGCCATCCTCTCCTACCGCTCCCTCTCCATCATCGTCAGCAGCAGGGACGCCAGAAAGAAGGTGCACCTGGGGCTGCACGCCGTGGGGCTCGCCCTCGGCGGCGTCGGCATCTACGCGGTGTTCAAGTACCACGCCGAGGCCGACATCCCCAACCTCTACTCCCTCCACTCCTGGATCGGCATCGCCACCATCTCCCTCTACGCGCTCCACTGGCTCCTCGCCTTCCTCACCTTCTTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACTGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAAC TTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTC GGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTANATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CB680435             [                                                                                                                                                                                    GCTAGCCGTGGCGGCGACGGCGATGGTGTTGGTGTGGTGCGTTCACTTCCGCGGCGGACTCGCCCTGCGCTCCCACAACAAGCAGCTCATCTTCAACACCCACCCGGTGCTCAT GGTGCTTGGCCTCGTCGTCCTCGCCGCCGAGGCCATCCTCTCCTACCGCTCCCTCTCCATCATCGTCAGCAGCAGGGACGCCAGAAAGAAGGTGCACCTGGGGCTGCACGCCGTGGGGCTCGCCCTCGGCGGCGTCGGCATCTACGCGGTGTTCAAGTACCACGCCGAGGCCGACATCCCCAACCTCTACTCCCTCCACTCCTGGATCGGCATCGCCACCATCTCCCTCTACGCGCTCCACTGGCTCCTCGCCTTCCTCACCTTCTTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAAC TTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTC GGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATT                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CF299234             [                                                                                                                                                                                                                                                            CCACAACAAGCAGCTCATCTTCAACACCCACCCGGTGCTCAT GGTGCTTGGCCTCGTCGTCCTCGCCGCCGAGGCCATCCTCTCCTACCGCTCCCTCTCCATCATCGTCAGCAGCAGGGACGCCAGAAAGAAGGTGCACCTGGGGCTGCACGCCGTGGGGCTCGCCCTCGGCGGCGTCGGCATCTACACGGTGTTCAAGTACCACGCCGAGGCCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BF430778             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCTCCTACCGCTCCCTCTCCATCATCGTCAGCAGCAGGGACGCCAGAAAGAAGGTGCACCTGGGGCTGCACGCCGTGGGGCTCGCCCTCGGCGGCGTCGGCATCTACGCGGTGTTCAAGTACCACGCCGAGGCCGACATCCCCAACCTCTACTCCCTCCACTCCTGGATCGGCATCGCCACCATCTCCCTCTACGCGCTCCACTGGCTCCTCGCCTTCCTCACCTTCTTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAAC TTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTC GGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCT   TTATTACTCTACATATAATCGATGGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGTAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTG AATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTC                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CB680436             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCGGCATCGCCACCATCTCCCTCTACGCGCTCCACTGGCTCCTCGCCTTCCTCACCTTCTTTTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTTTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAAC TTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTC GGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCCATCGTGCATCTTTAATTACCATGCATG  TATATATATATCTGGCCGAGTGTAAATACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATACACACTTACGTACTCATCTGTAAAATCCTTAAGGTATTGCGTCTCATCTCTG             ]
[-] EMBL CB680492             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CCACCATCTCCCTCTACGCGCTCCACTGGCTCCTCGCCTTCCTCACCTTATTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGATCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTATTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAAC TTCACGGCGATGGTGGTCCTCCTCCTC GGCGTGGCCGTCGTCCTCGCCCCCGCCAACGTGGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTCCCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCCATCGTGCATCTTTAATTACCATGCATG  TATATATATATCTGGCCGAGTGTAAATACTATGTATGTATGTATGTACGTCTGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATTCACACTT TTAAAGGATCTGTAAAATCCATAA                                 ]
[-] EMBL CF295647             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAAC TTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTC GGCGTCGCCGTTGTCCTCGCCACCGCCAACGTNGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCCATCGTGCATCTTTAATTACCATGCATG  TATATATATATCTGGCCGAGTGTAAATACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATACACACTTACGTACTCATCTGTAAAATACATAATATATTGCGTCTCATCTGTGTACGTATAAAAAA]
[-] EMBL CF299233             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAAC TTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTC GGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCCATCGTGCATCTTTAATTACCATGCATG  TAaaa                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL BE230621             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acGGGCGNAGGCGTTACTCGTCAACTTTCACGGCGNTGGTGGTCTTCCTCCTCGGGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTTGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCCATCGTGCATCTTTAATTACCATGCATG  TATATATATATCTGGCCGAGTGTAAATACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATACACACTTACGTACTCATCTGTAAAATACATAATATATTGCGTCTaaaaa                ]
[-] EMBL CF294090             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCATTTTATTATACATATATTTCATCCCCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCCATCGTGCATCTTTAATTCCCATGCATG  TATATATATATCTGGCCGAGTGTAAATACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATACACACTTACGTACTCATCTGTAAAATACATAATATATTGCGTCTCAaaaaaaaaa          ]




>consensus_14823#0
GCTACGCAACGGCATGACAGTGCTTTCTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTGCAGTTGAGTTGG
GGTGCTACGCACTAGCTACTCAAGTGCATGAGCTAGCTCAAACAATCGATCGATGGCGAT
GAAGGCGGTGATCAAGGGCGGCGATGGCGGAGGCGGGTGCATGGTGGTGGTGGCGCACGT
GCTAGCGGTGGCGGCGACGGCGATGGTGTTGGTGTGGTGCGTTCACTTCCGCGGCGGACT
CGCCCTGCGCTCCCACAACAAGCAGCTCATCTTCAACACCCACCCGGTGCTCATGGTGCT
TGGCCTCGTCGTCCTCGCCGCCGAGGCCATCCTCTCCTACCGCTCCCTCTCCATCATCGT
CAGCAGCAGGGACGCCAGAAAGAAGGTGCACCTGGGGCTGCACGCCGTGGGGCTCGCCCT
CGGCGGCGTCGGCATCTACGCGGTGTTCAAGTACCACGCCGAGGCCGACATCCCCAACCT
CTACTCCCTCCACTCCTGGATCGGCATCGCCACCATCTCCCTCTACGCGCTCCACTGGCT
CCTCGCCTTCCTCACCTTCTTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGT
CCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCT
CGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGG
GGCGGAGGCGCTACTCGTCAACTTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTCGGCGTCGCCGT
CGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTAT
TATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAG
CTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGC
GCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCC
ATCGTGCATCTTTAATTACCATGCATGTATATATATATCTGGCCGAGTGTAAATACTATG
TATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATACACACTTA
CGTACTCATCTGTAAAATACATAATATATTGCGTCTCATCTGTGTACGTATAAAAAA

consensusID : consensus_14823#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 644
fasta sequence

                              [ATTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAACTTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTCGGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGAGTCCGCTAAATACGCCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTGCTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTCCCATATATCCATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCCTATCGTGCATCTTTAATTGCCATGCATGTATATATATATCTGACGGAGCGTCAATACTATGTACGTACGTAGGTATGTACGTACGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATACACACCTCCGTAGTCATCTGTAAAATACATAATATATTGCGTCTACAAAAAAGGGAAAACAAACTCGAG]

[-] EMBL CB684940             [ATTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAACTTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTCGGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGAGTCCGCTAAATACGCCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTGCTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTCCCATATATCCATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCCTATCGTGCATCTTTAATTGCCATGCATGTATATATATATCTGACGGAGCGTCAATACTATGTACGTACGTAGGTATGTACGTACGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATACACACCTCCGTAGTCATCTGTAAAATACATAATATATTGCGTCTACAAAAAAGGGAAAACAAACTCGAG]




>consensus_14823#1
ATTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCT
CGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCT
CACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGT
CAACTTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTCGGCGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAA
CGTCGAGTCCGCTAAATACGCCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCA
TCTTTTCTTTATTATTGCTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACG
CAGTGTCGTCCCATATATCCATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATG
TGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCCTATCGTGCATCTTTAATT
GCCATGCATGTATATATATATCTGACGGAGCGTCAATACTATGTACGTACGTAGGTATGT
ACGTACGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATACACACCTCCGTAGTCATCTGTAAAA
TACATAATATATTGCGTCTACAAAAAAGGGAAAACAAACTCGAG

consensusID : consensus_14823#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 481
fasta sequence

                              [CTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTTGTTTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAACTTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTCGGCGTCGCCGTTGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGCCGTGACGTAGC]

[-] EMBL CF294826             [CTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTTGTTTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAACTTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTCGGCGTCGCCGTTGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGCCGTGACGTAGC]
[-] EMBL CF294583             [                                                                                                                                              TACGGGGCGGAGGCGATACTCGTCAACTTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTCGGGGTCGCCGTCGTCCTCGCCACCGCCAACGTGGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTACACCCATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTACTCTTATTCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA                       ]




>consensus_14823#2
CTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGTCCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTTGTTTT
CGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCTCGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGC
CCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGGGGCGGAGGCGCTACTCGTCAACTTCACGGCGCT
GGTGGTCCTCCTCCTCGGCGTCGCCGTTGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAA
ATACACCGCCATGTAATTCCATTTTATTATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTAT
TACTCTACATATAATCGATCGATCTAGCTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATA
TATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGCGCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATT
AATTAATTATTATTATTCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGCCGTGACGTAG
C

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_14823#0      GCTACGCAACGGCATGACAGTGCTTTCTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTGCAGTTGAGTTGG 60
consensus_14823#1      ------------------------------------------------------------
consensus_14823#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_14823#0      GGTGCTACGCACTAGCTACTCAAGTGCATGAGCTAGCTCAAACAATCGATCGATGGCGAT 120
consensus_14823#1      ------------------------------------------------------------
consensus_14823#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_14823#0      GAAGGCGGTGATCAAGGGCGGCGATGGCGGAGGCGGGTGCATGGTGGTGGTGGCGCACGT 180
consensus_14823#1      ------------------------------------------------------------
consensus_14823#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_14823#0      GCTAGCGGTGGCGGCGACGGCGATGGTGTTGGTGTGGTGCGTTCACTTCCGCGGCGGACT 240
consensus_14823#1      ------------------------------------------------------------
consensus_14823#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_14823#0      CGCCCTGCGCTCCCACAACAAGCAGCTCATCTTCAACACCCACCCGGTGCTCATGGTGCT 300
consensus_14823#1      ------------------------------------------------------------
consensus_14823#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_14823#0      TGGCCTCGTCGTCCTCGCCGCCGAGGCCATCCTCTCCTACCGCTCCCTCTCCATCATCGT 360
consensus_14823#1      ------------------------------------------------------------
consensus_14823#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_14823#0      CAGCAGCAGGGACGCCAGAAAGAAGGTGCACCTGGGGCTGCACGCCGTGGGGCTCGCCCT 420
consensus_14823#1      ------------------------------------------------------------
consensus_14823#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_14823#0      CGGCGGCGTCGGCATCTACGCGGTGTTCAAGTACCACGCCGAGGCCGACATCCCCAACCT 480
consensus_14823#1      ------------------------------------------------------------
consensus_14823#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_14823#0      CTACTCCCTCCACTCCTGGATCGGCATCGCCACCATCTCCCTCTACGCGCTCCACTGGCT 540
consensus_14823#1      ------------------------------------------------------------
consensus_14823#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_14823#0      CCTCGCCTTCCTCACCTTCTTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGT 600
consensus_14823#1      ------------------ATTCTTCCCCGGCGCCTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGT 42
consensus_14823#2      ---------------------------------CTCCCACGACACCAGGCGCTCCGCCGT 27
                                                        ***************************

consensus_14823#0      CCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCT 660
consensus_14823#1      CCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTCGTCTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCT 102
consensus_14823#2      CCCGTGGCACGCGCTCCTCGGCCTCCTTGTTTTCGCGCTCGCCGTGGGCAACGCCCAGCT 87
                       *************************** ** *****************************

consensus_14823#0      CGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGG 720
consensus_14823#1      CGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGG 162
consensus_14823#2      CGGCTTCCTCGAGAAGCTCACCTTCCTGCAGGCCCCGCCGCTGCGCCTGTCCAGGTACGG 147
                       ************************************************************

consensus_14823#0      GGCGGAGGCGCTACTCGTCAACTTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTCGGCGTCGCCGT 780
consensus_14823#1      GGCGGAGGCGCTACTCGTCAACTTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTCGGCGTCGCCGT 222
consensus_14823#2      GGCGGAGGCGCTACTCGTCAACTTCACGGCGCTGGTGGTCCTCCTCCTCGGCGTCGCCGT 207
                       ************************************************************

consensus_14823#0      CGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTAT 840
consensus_14823#1      CGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGAGTCCGCTAAATACGCCGCCATGTAATTCCATTTTAT 282
consensus_14823#2      TGTCCTCGCCACCGCCAACGTCGACTCCACTAAATACACCGCCATGTAATTCCATTTTAT 267
                        *********************** *** ******** **********************

consensus_14823#0      TATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAG 900
consensus_14823#1      TATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTGCTCTACATATAATCGATCGATCTAG 342
consensus_14823#2      TATACATATATTTCATCATCTTTTCTTTATTATTACTCTACATATAATCGATCGATCTAG 327
                       ********************************** *************************

consensus_14823#0      CTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGC 960
consensus_14823#1      CTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTCCCATATATCCATGCATCGCGCTGAGTGTGTGC 402
consensus_14823#2      CTACACACCCGTAGTACGCAGTGTCGTACCATATATACATGCATCGCGCTGAGTGTGTGC 387
                       *************************** ******** ***********************

consensus_14823#0      GCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCC 1020
consensus_14823#1      GCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAATTCC 462
consensus_14823#2      GCGCGCGCACGTGTCATGTGGCTTTGTGTAATTAATTAATTATTATTATTCCTCAAAAAA 447
                       ********************************************************    

consensus_14823#0      -ATCGTGCATCTTTAATTACCATGCATGTATATATATATCTGGCCGAGTGTAAATACTAT 1079
consensus_14823#1      TATCGTGCATCTTTAATTGCCATGCATGTATATATATATCTGACGGAGCGTCAATACTAT 522
consensus_14823#2      AAAAAAAAAAAAC--ACTGTCATGCCGTGACGTAGC------------------------ 481
                        *      *      * *  *****    *  **                          

consensus_14823#0      GTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATACACACTT 1139
consensus_14823#1      GTACGTACGTAGGTATGTACGTACGTATGTATGTATGTATGTATGTATGGATACACACCT 582
consensus_14823#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_14823#0      ACGTACTCATCTGTAAAATACATAATATATTGCGTCTCATCTGTGTACGTATAAAAAA-- 1197
consensus_14823#1      CCGTAGTCATCTGTAAAATACATAATATATTGCGTCT--ACAAAAAAGGGAAAACAAACT 640
consensus_14823#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_14823#0      ----
consensus_14823#1      CGAG 644
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