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Oryza sativa
cluster # 3229 cluster # 3229       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3229#0 length = 2742 sequences # 2  

consensusID : consensus_3229#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2742
fasta sequence
                              [GTTCCCCCATCCCTCCTCTTCCTTTGCCCTGCCCTGCCCTAGCGCCGCCGCCGCTTTTCCTTCCCTCCCCGGCTTCTCTTCGCCGGCGACGACGATGCGGTGCGGTGTCTCCGGCTCAGATTCTCAAGAATTCTCGAGCTCTCCATGTCAAGTAGAGGGAGTGGACGGTGCGGTCTGTTCCCCGAAACCCTAGCCACCACTATTCCCCCACCCTTCTCTCGCTCTCTCCCCTGACCTTTGCGACGGCGCAGCCTCGACCTCGACTTGCCCTCCTCTTCTCAACGCCGCCGCCGCCAGCCTTCCTCGCATGCCCTCCTCTGACCTACCCCATATCCTGGAGCTCTCCCTACCAATGCTCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCCCTCAGTTGAGCTAGCTCCGGGGAATGTGGTGATGGAGATCAATGGTGAGGGGGATCAATCCGCTAGCCCGGTGCTTGATTTGGTGGATAGGCGCACTCAATCTTGAATCCGGTGGTGTTGTGCTCAGCTCGGGCATGAGGGGGTTGATCCAGAACTGTGGATTGAACTCAAGATGGTGATGGTGAGGCAAGAGCTCCACGGTGGGGTGGCATCTCTTGCTCAAGCTTAAGGATCCGCCGTTGTGCGCGCCATCATCACTATTCATCGGTTCTACATCTAGGCGGTAGGTCAGATTGAAACCACATGCCGTCGCATAGAAAAACTTCATTTGCAGTTGGGATGCCGTCCTCACTTCCGGTGAGTCAAAGCATCAATCTCTTTCTCTGTAGACTTGCCTCATGTATAGCTGGCATGCATCTTCTTTTTCCTGCTTCCCTGGGTTCCCTGCTCACACTGTGATTCTAACATCCCAATCTGAACAGGCAAACTGTCAAACTTCGTTTTTTTTTCATGTATCATTCTTCTATTCACAATGATAAACATTGATAGCCTATCAAATTTCTTTATCATAAGTGCTAGAATATTTCTGATTTGTACTGCATCTCAAATTGTACATGCGTGTGAGCTATCAAGCTTGATCAAGTAACGGGAATTTCGTAATATTTGTTTAAATTTGATTAATTTTTGTTCAAAATGTTGGAAATTTCGGACCGAAATTTCTAGAAATTTCGCCATATTGGCACTCCCAATACAAATACCGAAAGCAAAAACGAAAGATTGAACCCTGGCTATGAGCCTGTGAGCTGCTTGCTGTGCAAATCCATGAGTTGTTTTTCCACTGAACAATCACTAAAGCGCCGAAGGAATCATTCACAATGTCCGTAAAACATTTGCCCTGCTTTAGATGCTCAGAGTAGCTCTCTCGCATTTACTGAATGCATCCATGTTTCATACTGTCCAGCACAAAGATAGGGTGCCGCAAAGGTAAATTCTATTTTTAGGTGCCCTCTAGCTGTTTGATGTATTTCTCTACAGAATCAAATGCAAATATGAAGGGTCATCGCCACTTCAAAATTCAGGTCAGTTTGAGATCATGTCACTGTGTCCCTATTGACTTTGCCTAGCCAACATAAAACCCTTGACTTGAAAAGTATCCATGACAACTTTATTAAATAAAAAGGGATGCTCTACACTGGCTTGGGTTTCAGAGTAGAAATTTGATTAGATTTGCAAGATGTTCTTTATGTGTTTTTCATGCATAGTTCTCTTTAAGGGACTTACAATTTCATGGTTGCTGTTGATTTAAGTCCATAAAACTTCTTGCCTAGGAGACGCAACTCACACTTTTGCCGAGCCATTCTCATTAGTTAATTAAAGCATATTACTAGATTTGAATGTACATTACAGTTGTGTTTCTATGTACAAGAAGGTTAAATATTGCTAATATCTATGTTCTTTTCCAGTTTGCCTTCTACTCTAGATGGTAGTTTGAAATTATAAGTAGAATATGTTTTTAGAGAGAAAAAAGTGCAATCTAATTATAAATGTGAATATTGAATCTGGTAATTATTTTTGTCTTATCTGTATAAAAATGATTGGTTGCTACCATAGAAGGTGCTCAGGTTTGTGAAGACTGTAGGTGCATGCTTGGCTATCTATTAGCCTTGTGGTTCACTGCTTGTGCTTTCTCAGTCCTAAGCAATTGCATTGCAATCTCATTTTATAACAATCTTTGTATATGTGAGAATTGCCATTTAGCTTAAGTATATTAAGGGTGTCACTGCTAATTAGTTGCCATGACAAGAACAAACAACTTGACAATAGAGCTTTGCTGCACAAATTAGTTAGCTGGGATGTTCTTCTGTACCTGTAAGTTTCATGTAAGTAAGGAAAATTTCTTATGACTTATACAATGAATTAATTTTCATAGGTTCAATTTTTCTAGAAGAGGCAAAAATGGATGAGTATGTCTTCTTTTGTTTTTAGTTCTGAATAGTGTTTTTTATGAGCCTGTCAATGTTATTGTAACAGGAGTACACCTCAGGCACTGTGGGAAGTGGGACATATGGATCACCAGCCATGCCGCATGGTCAACATCAAGGCCATGGCATTCGTTCAAAAAAAAAAACATCAAGGCCATGGCCGTTGAAGGTGGATCACCGTCCAAGCTTAGTCAACGTCAATAATTTCATATATCTCCATAACAAACTGTGTGGTTTTGTATAACTTGCAAGGAACCAATAAACTTACCCTCCTATGTTTCGTATCTTATATTGTGCTAGCTCAAACTATCTTTGATGTATCTTTACATGAGCATGCTTAGTTCTATCGTACTTAAT]

[+] EMBL CF318147             [GTTCCCCCATCCCTCCTCTTCCTTTGCCCTGCCCTGCCCTAGCGCCGCCGCCGCTTTTCCTTCCCTCCCCGGCTTCTCTTCGCCGGCGACGACGATGCGGTGCGGTGTCTCCGGCTCAGATTCTCAAGAATTCTCGAGCTCTCCATGTCAAGTAGAGGGAGTGGACGGTGCGGTCTGTTCCCCGAAACCCTAGCCACCACTATTCCCCCACCCTTCTCTCGCTCTCTCCCCTGACCTTTGCGACGGCGCAGCCTCGACCTCGACTTGCCCTCCTCTTCTCAACGCCGCCGCCGCCAGCCTTCCTCGCATGCCCTCCTCTGACCTACCCCATATCCTGGAGCTCTCCCTACCAATGCTCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCCCTCAGTTGAGCTAGCTCCGGGGAATGTGGTGATGGAGATCAATGGTGAGGGGGATCAATCCGCTAGCCCGGTGCTTGATTTGGTGGATAGGCGCACTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AK067312             [     CCCATCCCTCCTCTTCCTTTGCCCTGCCCTGCCCTAGCGCCGCCGCCGCTTTTCCTTCCCTCCCCGGCTTCTCTTCGCCGGCGACGACGATGCGGTGCGGTGTCTCCGGCTCAGATTCTCAAGAATTCTCGAGCTCTCCATGTCAAGTAGAGGGAGTGGACGGTGCGGTCTGTTCCCCGAAACCCTAGCCACCACTATTCCCCCACCCTTCTCTCGCTCTCTCCCCTGACCTTTGCGACGGCGCAGCCTCGACCTCGACTTGCCCTCCTCTTCTCAACGCCGCCGCCGCCAGCCTTCCTCGCATGCCCTCCTCTGACCTACCCCATATCCTGGAGCTCTCCCTACCAATGCTCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCCCTCAGTTGAGCTAGCTCCGGGGAATGTGGTGATGGAGATCAATGGTGAGGGGGATCAATCCGCTAGCCCGGTGCTTGATTTGGTGGATAGGCGCACTCAATCTTGAATCCGGTGGTGTTGTGCTCAGCTCGGGCATGAGGGGGTTGATCCAGAACTGTGGATTGAACTCAAGATGGTGATGGTGAGGCAAGAGCTCCACGGTGGGGTGGCATCTCTTGCTCAAGCTTAAGGATCCGCCGTTGTGCGCGCCATCATCACTATTCATCGGTTCTACATCTAGGCGGTAGGTCAGATTGAAACCACATGCCGTCGCATAGAAAAACTTCATTTGCAGTTGGGATGCCGTCCTCACTTCCGGTGAGTCAAAGCATCAATCTCTTTCTCTGTAGACTTGCCTCATGTATAGCTGGCATGCATCTTCTTTTTCCTGCTTCCCTGGGTTCCCTGCTCACACTGTGATTCTAACATCCCAATCTGAACAGGCAAACTGTCAAACTTCGTTTTTTTTTCATGTATCATTCTTCTATTCACAATGATAAACATTGATAGCCTATCAAATTTCTTTATCATAAGTGCTAGAATATTTCTGATTTGTACTGCATCTCAAATTGTACATGCGTGTGAGCTATCAAGCTTGATCAAGTAACGGGAATTTCGTAATATTTGTTTAAATTTGATTAATTTTTGTTCAAAATGTTGGAAATTTCGGACCGAAATTTCTAGAAATTTCGCCATATTGGCACTCCCAATACAAATACCGAAAGCAAAAACGAAAGATTGAACCCTGGCTATGAGCCTGTGAGCTGCTTGCTGTGCAAATCCATGAGTTGTTTTTCCACTGAACAATCACTAAAGCGCCGAAGGAATCATTCACAATGTCCGTAAAACATTTGCCCTGCTTTAGATGCTCAGAGTAGCTCTCTCGCATTTACTGAATGCATCCATGTTTCATACTGTCCAGCACAAAGATAGGGTGCCGCAAAGGTAAATTCTATTTTTAGGTGCCCTCTAGCTGTTTGATGTATTTCTCTACAGAATCAAATGCAAATATGAAGGGTCATCGCCACTTCAAAATTCAGGTCAGTTTGAGATCATGTCACTGTGTCCCTATTGACTTTGCCTAGCCAACATAAAACCCTTGACTTGAAAAGTATCCATGACAACTTTATTAAATAAAAAGGGATGCTCTACACTGGCTTGGGTTTCAGAGTAGAAATTTGATTAGATTTGCAAGATGTTCTTTATGTGTTTTTCATGCATAGTTCTCTTTAAGGGACTTACAATTTCATGGTTGCTGTTGATTTAAGTCCATAAAACTTCTTGCCTAGGAGACGCAACTCACACTTTTGCCGAGCCATTCTCATTAGTTAATTAAAGCATATTACTAGATTTGAATGTACATTACAGTTGTGTTTCTATGTACAAGAAGGTTAAATATTGCTAATATCTATGTTCTTTTCCAGTTTGCCTTCTACTCTAGATGGTAGTTTGAAATTATAAGTAGAATATGTTTTTAGAGAGAAAAAAGTGCAATCTAATTATAAATGTGAATATTGAATCTGGTAATTATTTTTGTCTTATCTGTATAAAAATGATTGGTTGCTACCATAGAAGGTGCTCAGGTTTGTGAAGACTGTAGGTGCATGCTTGGCTATCTATTAGCCTTGTGGTTCACTGCTTGTGCTTTCTCAGTCCTAAGCAATTGCATTGCAATCTCATTTTATAACAATCTTTGTATATGTGAGAATTGCCATTTAGCTTAAGTATATTAAGGGTGTCACTGCTAATTAGTTGCCATGACAAGAACAAACAACTTGACAATAGAGCTTTGCTGCACAAATTAGTTAGCTGGGATGTTCTTCTGTACCTGTAAGTTTCATGTAAGTAAGGAAAATTTCTTATGACTTATACAATGAATTAATTTTCATAGGTTCAATTTTTCTAGAAGAGGCAAAAATGGATGAGTATGTCTTCTTTTGTTTTTAGTTCTGAATAGTGTTTTTTATGAGCCTGTCAATGTTATTGTAACAGGAGTACACCTCAGGCACTGTGGGAAGTGGGACATATGGATCACCAGCCATGCCGCATGGTCAACATCAAGGCCATGGCATTCGTTCAAAAAAAAAAACATCAAGGCCATGGCCGTTGAAGGTGGATCACCGTCCAAGCTTAGTCAACGTCAATAATTTCATATATCTCCATAACAAACTGTGTGGTTTTGTATAACTTGCAAGGAACCAATAAACTTACCCTCCTATGTTTCGTATCTTATATTGTGCTAGCTCAAACTATCTTTGATGTATCTTTACATGAGCATGCTTAGTTCTATCGTACTTAAT]


>consensus_3229#0 GTTCCCCCATCCCTCCTCTTCCTTTGCCCTGCCCTGCCCTAGCGCCGCCGCCGCTTTTCC TTCCCTCCCCGGCTTCTCTTCGCCGGCGACGACGATGCGGTGCGGTGTCTCCGGCTCAGA TTCTCAAGAATTCTCGAGCTCTCCATGTCAAGTAGAGGGAGTGGACGGTGCGGTCTGTTC CCCGAAACCCTAGCCACCACTATTCCCCCACCCTTCTCTCGCTCTCTCCCCTGACCTTTG CGACGGCGCAGCCTCGACCTCGACTTGCCCTCCTCTTCTCAACGCCGCCGCCGCCAGCCT TCCTCGCATGCCCTCCTCTGACCTACCCCATATCCTGGAGCTCTCCCTACCAATGCTCCC TTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCCCTCAGTTGAGCTAGCTC CGGGGAATGTGGTGATGGAGATCAATGGTGAGGGGGATCAATCCGCTAGCCCGGTGCTTG ATTTGGTGGATAGGCGCACTCAATCTTGAATCCGGTGGTGTTGTGCTCAGCTCGGGCATG AGGGGGTTGATCCAGAACTGTGGATTGAACTCAAGATGGTGATGGTGAGGCAAGAGCTCC ACGGTGGGGTGGCATCTCTTGCTCAAGCTTAAGGATCCGCCGTTGTGCGCGCCATCATCA CTATTCATCGGTTCTACATCTAGGCGGTAGGTCAGATTGAAACCACATGCCGTCGCATAG AAAAACTTCATTTGCAGTTGGGATGCCGTCCTCACTTCCGGTGAGTCAAAGCATCAATCT CTTTCTCTGTAGACTTGCCTCATGTATAGCTGGCATGCATCTTCTTTTTCCTGCTTCCCT GGGTTCCCTGCTCACACTGTGATTCTAACATCCCAATCTGAACAGGCAAACTGTCAAACT TCGTTTTTTTTTCATGTATCATTCTTCTATTCACAATGATAAACATTGATAGCCTATCAA ATTTCTTTATCATAAGTGCTAGAATATTTCTGATTTGTACTGCATCTCAAATTGTACATG CGTGTGAGCTATCAAGCTTGATCAAGTAACGGGAATTTCGTAATATTTGTTTAAATTTGA TTAATTTTTGTTCAAAATGTTGGAAATTTCGGACCGAAATTTCTAGAAATTTCGCCATAT TGGCACTCCCAATACAAATACCGAAAGCAAAAACGAAAGATTGAACCCTGGCTATGAGCC TGTGAGCTGCTTGCTGTGCAAATCCATGAGTTGTTTTTCCACTGAACAATCACTAAAGCG CCGAAGGAATCATTCACAATGTCCGTAAAACATTTGCCCTGCTTTAGATGCTCAGAGTAG CTCTCTCGCATTTACTGAATGCATCCATGTTTCATACTGTCCAGCACAAAGATAGGGTGC CGCAAAGGTAAATTCTATTTTTAGGTGCCCTCTAGCTGTTTGATGTATTTCTCTACAGAA TCAAATGCAAATATGAAGGGTCATCGCCACTTCAAAATTCAGGTCAGTTTGAGATCATGT CACTGTGTCCCTATTGACTTTGCCTAGCCAACATAAAACCCTTGACTTGAAAAGTATCCA TGACAACTTTATTAAATAAAAAGGGATGCTCTACACTGGCTTGGGTTTCAGAGTAGAAAT TTGATTAGATTTGCAAGATGTTCTTTATGTGTTTTTCATGCATAGTTCTCTTTAAGGGAC TTACAATTTCATGGTTGCTGTTGATTTAAGTCCATAAAACTTCTTGCCTAGGAGACGCAA CTCACACTTTTGCCGAGCCATTCTCATTAGTTAATTAAAGCATATTACTAGATTTGAATG TACATTACAGTTGTGTTTCTATGTACAAGAAGGTTAAATATTGCTAATATCTATGTTCTT TTCCAGTTTGCCTTCTACTCTAGATGGTAGTTTGAAATTATAAGTAGAATATGTTTTTAG AGAGAAAAAAGTGCAATCTAATTATAAATGTGAATATTGAATCTGGTAATTATTTTTGTC TTATCTGTATAAAAATGATTGGTTGCTACCATAGAAGGTGCTCAGGTTTGTGAAGACTGT AGGTGCATGCTTGGCTATCTATTAGCCTTGTGGTTCACTGCTTGTGCTTTCTCAGTCCTA AGCAATTGCATTGCAATCTCATTTTATAACAATCTTTGTATATGTGAGAATTGCCATTTA GCTTAAGTATATTAAGGGTGTCACTGCTAATTAGTTGCCATGACAAGAACAAACAACTTG ACAATAGAGCTTTGCTGCACAAATTAGTTAGCTGGGATGTTCTTCTGTACCTGTAAGTTT CATGTAAGTAAGGAAAATTTCTTATGACTTATACAATGAATTAATTTTCATAGGTTCAAT TTTTCTAGAAGAGGCAAAAATGGATGAGTATGTCTTCTTTTGTTTTTAGTTCTGAATAGT GTTTTTTATGAGCCTGTCAATGTTATTGTAACAGGAGTACACCTCAGGCACTGTGGGAAG TGGGACATATGGATCACCAGCCATGCCGCATGGTCAACATCAAGGCCATGGCATTCGTTC AAAAAAAAAAACATCAAGGCCATGGCCGTTGAAGGTGGATCACCGTCCAAGCTTAGTCAA CGTCAATAATTTCATATATCTCCATAACAAACTGTGTGGTTTTGTATAACTTGCAAGGAA CCAATAAACTTACCCTCCTATGTTTCGTATCTTATATTGTGCTAGCTCAAACTATCTTTG ATGTATCTTTACATGAGCATGCTTAGTTCTATCGTACTTAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)