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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6313#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1820 fasta sequence
[GCAGAGGAGCGCGATCCCCCACCCCAAACCGGCACGGGATGCCTCAGCGGCGGCCGCGCCTGGCGCCCCTCACCCGCCGCCTCTCCACCTGCCGGGACGGCGACCTCGCCGCCCTCCTCTCGGTCCTCCGCTCGCCGCCAGCATCCTCCACGTCGCTCCCGCGCGCACTCTCCAGTGCCTTCCCGTCCCCATCCGACTCCTTCCCCCTCGGCAAGCTCCCCTCCCTCCTCCCGCTCCTCCCCTCCCCACTCCTCTCCCTCCGGTTCCTCCTGTGGCGCCTTCCCCCCTCCTCGCCGCTCCCGTCCTCGTACGCCCTCTCCTCGCTCGCCGCCTCGCTCCCCGATCTCCCGTCCGCCGTGCCCCTCCTCCTCTCCTCGTCGCCGCAACCTCTCCCGCTCAGGCACTACGCCCTCCTCCTGGGCATCTCCGCACACGCTGGACTATTCCCCGCCTCCCTCGCTCTCCTGCGGCACATGCGCTCCTTCGGCCTCGCCCCCGATGCTGCTTGCTTCCGCTCCGCCCTCCGCTCGGCCGGCTCTCCCGGCGATGTCTGTGCCGTTCTCGGTATCATGTCGGCGTGCGGTGTCTCGCCGAGCGTCCCACTGGTTGTGACCTCGGTGCATAAGCTGGCAACCGCGGGGGACTTCGTCGGTGCCCGCCAGCTGATCGAGAAAATGCCGGAGTTTGGGTGCGTGACCAATGTGGCCGTGTACACCGCGTTGCTCGACGGGATGTGCAGTTTCGGGGATGTGGATGCAGCGCTGAGGCTGGTGGAAGAGATGGAGGGTTGGAGCTTGGGTGCAGGGTGCGTGCCCAACGTGGTGTCGTATACGTGTTTGGTGAAATGCCTGTGTGGGAAAAAGAGGATGGGGGAGGCGCTGAGCTTGCTGGATAGGATGACAGGAAGAGGGGTGATGCCCAACCGGGTGTTCGTGCGAACGCTCGTCGGCGGATTCTGTTCAGAGGAGATGGTCGCAGACGCTTATGCTGTAGTGGAGCGTGTGGTCAGCGATGGGAGTGTGTCGAGCGACCAATGCTACAATGTGCTGCTTATTTGCCTGTGGAGGGTTGGGATGGATGGTGAAGCTGAAGGGCTTGTGCAGAGGATGATGAAGAAAGGGGTGCGGCTGAGCCCTCTTGCGGCCAGTGTTATGGTCAGAGAGC-TTTGCAAT-AGGAATAGGCTATTG-GATGCTTGCTACTGGATAGGAGTCATGGAAGAGAACGGGGTGCTCTGTGACAC-TGATGTCTACAA-TGG-TTTG-TTGCTTAGGCTGTGTGTGGAAGGGCATGTTGGTGAGGCCTTGGCGTTGGCTAAGAAGGTTGCTGAGAGGGGGATTCTCATAGAGGCTTCTTGTGCTGATCGTTTGATGGATTTGCTAAAGCAATATGGTGATGAGGAGCTAGCACCAAAAATATCAGAACTGAGGAGGTGCTCTGAAGTGCTGTCACATTAACCAATGTGTGATCCGAACCCTCCTACAAGTATCATGCTTGGTTGATTTCAAATCAAGAAAAATGCTTCCGTGCTGCATGATTACAGCAA-G-AAAAGGCTTTGA-GGGTTTGTTA-CGCTGAAATAGATTGGTGGGGATAGGGTGCAGCACAGAGTGATTTGTGTGAGCAAAATGTGGATGAGTTACTTCATTTACTTGCCCATTTCCTGTAGTTTTTCTGAACTCTGTTCAGATCCTCCAGTCCAAGGGATGCTTCAGGACATGTGAACTATGATTGCGATGGAATTCTCAGGTTCCTCATTAGTATGCTCCCAAACAGATATGTTTGTTTAAGTGGTGATCAATCAAATGTTTTACATTTTTAAAGAAAAA]
[+] EMBL AK067384 [GCAGAGGAGCGCGATCCCCCACCCCAAACCGGCACGGGATGCCTCAGCGGCGGCCGCGCCTGGCGCCCCTCACCCGCCGCCTCTCCACCTGCCGGGACGGCGACCTCGCCGCCCTCCTCTCGGTCCTCCGCTCGCCGCCAGCATCCTCCACGTCGCTCCCGCGCGCACTCTCCAGTGCCTTCCCGTCCCCATCCGACTCCTTCCCCCTCGGCAAGCTCCCCTCCCTCCTCCCGCTCCTCCCCTCCCCACTCCTCTCCCTCCGGTTCCTCCTGTGGCGCCTTCCCCCCTCCTCGCCGCTCCCGTCCTCGTACGCCCTCTCCTCGCTCGCCGCCTCGCTCCCCGATCTCCCGTCCGCCGTGCCCCTCCTCCTCTCCTCGTCGCCGCAACCTCTCCCGCTCAGGCACTACGCCCTCCTCCTGGGCATCTCCGCACACGCTGGACTATTCCCCGCCTCCCTCGCTCTCCTGCGGCACATGCGCTCCTTCGGCCTCGCCCCCGATGCTGCTTGCTTCCGCTCCGCCCTCCGCTCGGCCGGCTCTCCCGGCGATGTCTGTGCCGTTCTCGGTATCATGTCGGCGTGCGGTGTCTCGCCGAGCGTCCCACTGGTTGTGACCTCGGTGCATAAGCTGGCAACCGCGGGGGACTTCGTCGGTGCCCGCCAGCTGATCGAGAAAATGCCGGAGTTTGGGTGCGTGACCAATGTGGCCGTGTACACCGCGTTGCTCGACGGGATGTGCAGTTTCGGGGATGTGGATGCAGCGCTGAGGCTGGTGGAAGAGATGGAGGGTTGGAGCTTGGGTGCAGGGTGCGTGCCCAACGTGGTGTCGTATACGTGTTTGGTGAAATGCCTGTGTGGGAAAAAGAGGATGGGGGAGGCGCTGAGCTTGCTGGATAGGATGACAGGAAGAGGGGTGATGCCCAACCGGGTGTTCGTGCGAACGCTCGTCGGCGGATTCTGTTCAGAGGAGATGGTCGCAGACGCTTATGCTGTAGTGGAGCGTGTGGTCAGCGATGGGAGTGTGTCGAGCGACCAATGCTACAATGTGCTGCTTATTTGCCTGTGGAGGGTTGGGATGGATGGTGAAGCTGAAGGGCTTGTGCAGAGGATGATGAAGAAAGGGGTGCGGCTGAGCCCTCTTGCGGCCAGTGTTATGGTCAGAGAGC TTTGCAAT AGGAATAGGCTATTG GATGCTTGCTACTGGATAGGAGTCATGGAAGAGAACGGGGTGCTCTGTGACAC TGATGTCTACAA TGG TTTG TTGCTTAGGCTGTGTGTGGAAGGGCATGTTGGTGAGGCCTTGGCGTTGGCTAAGAAGGTTGCTGAGAGGGGGATTCTCATAGAGGCTTCTTGTGCTGATCGTTTGATGGATTTGCTAAAGCAATATGGTGATGAGGAGCTAGCACCAAAAATATCAGAACTGAGGAGGTGCTCTGAAGTGCTGTCACATTAACCAATGTGTGATCCGAACCCTCCTACAAGTATCATGCTTGGTTGATTTCAAATCAAGAAAAATGCTTCCGTGCTGCATGATTACAGCAA G AAAAGGCTTTGA GGGTTTGTTA CGCTGAAATAGATTGGTGGGGATAGGGTGCAGCACAGAGTGATTTGTGTGAGCAAAATGTGGATGAGTTACTTCATTTACTTGCCCATTTCCTGTAGTTTTTCTGAACTCTGTTCAGATCCTCCAGTCCAAGGGATGCTTCAGGACATGTGAACTATGATTGCGATGGAATTCTCAGGTTCCTCATTAGTATGCTCCCAAACAGATATGTTTGTTTAAGTGGTGATCAATCAAATGTTTTACATTTTT ]
[+] EMBL C27277 [ AACCGGGTGTNCGTNCGAACNCTCGTCGGCGGATTCTGTTCAGAGGAGATGGTCGCAG CGCTTATNCTGTAGTGGAGCGTGTGGTCAGCGATGGGAGTGTGTCGAGCGACCAATGCTACAATGTGCTGCTTATTTNCCTGTGGAGGGTTGGGATGGATGGTGAAGCTGAAGGGCTTGTNCAGAGGATGATGAAGAAAGGGGTGCGGCTGAGCCCTCTTGCGGCCAGTGTTATGGTCAGAGAGCTTTTGCAATAAGGAATAGGCTATTGTGATGCTTGCTACTGGATAGGAGTCATGG AGAGAACGGGGTACTCTGTGACACTTNATGTCAACAANTGGTTTTGTTTGCTTAGG ]
[+] EMBL C28068 [ GGTGCTCTGTGACAC TGATGTCTACAA TGG TTTG TTGCTTAGGCTGTGTGTGGAAGGGCATGTTGGTGAGGCCTTGGCGTTGGCTAAGAAGGTTGCTGAGAGGGGGATTCTCATAGAGGCTTCTTGTGCTGATCGTTTGATGGATTTGCTAAAGCAATATGGTGATGAGGAGCTAGCACCAAAAATATCAGAACTGAGGAGGTGCTCTGAAGTGCTGTCACATTAACCAATGTGTGATCCGAACCCTCCTACAAGTATCATGCTTGGTTGATTTCAAATCAAGANAAATTCTTCCGAGCTGCATGATTACAGCAANGAAAAAGGCTTTGAGGGGTTTGTTACCGTTGNAAT ]
[-] EMBL CF324732 [ CACATTAACCAATGTGTGATCCGAACCCTCCTACAAGTATCATGCTTGGTTGATTTCAAATCAAGAAAAATGCTTCCGTGCTGCATGATTACAGCAA G AAAAGGCTTTGA GGGTTTGTTA CGCTGAAATAGATTGGTGGGGATAGGGTGCAGCACAGAGTGATTTGTGTGAGCAAAATGTGGATGAGTTACTTCATTTACTTGCCCATTTCCTGTAGTTTTTCTGAACTCTGTTCAGATCCTCCAGTCCAAGGGATGCTTCAGGACATGTGAACTATGATTGCGATGGAATTCTCAGGTTCCTCATTAGTATGCTCCCAAACAGATATGTTTGTTTAAGTGGTGATCAATCAAATGTTTTACATTTTTAAAGAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||