cluster # 7058

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Oryza sativa
cluster # 7058 cluster # 7058 Sequences # 4 consensus # 1
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Direct access to contigs :
consensus_7058#0 length = 889 sequences # 4
consensusID : consensus_7058#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 889
fasta sequence
                              [TATTGTCAGTCAGGAAGATGTTTGGATCATCATCTTCCACATCCGCATCACTTATGAGGAGATTGTGGATCAGAAAGTCCGATGTATCAT-CCAGTGAGTGGAAATTGTTGCAGCACAGGCCAAAACTTGAGGAACTAACCATCGAATACTGCGAAATGGTACGTGTTCTTGCAGAACCCATCAGGTACCTTACCACTCTGCGAAAGCTGAAGATCAGCAATTGCTCTGAATTGGACGCGCTTCCAGAATGGATTGGTGATCTTGTAGCACTTGAATCTCTTCAAATAAGTTGCTGCCCAAAGTTGGTCTCGATCCCAAAAGGTTTGCAACATTTGACTGCTCTGGAGGAGTTAACTGTCACTGCCTGTAGCTCTGAGTTGAACGAAAACTGCAGGAAAGATACAGGCAAGGATTGGTTCAAGATCTGTCATATCCCAAACATAGTAATCTCGTGACAGATAACTATGCAACTTCTGTTGATCAATTAAACAAAAAAAAAGTCCTGGTGAGTTGCAAGTTCATCTGATTATGCTGAAGTTATCCTCTACTCAATTTGTTCCCATCATGCATTGTCCTTGAATGGTTTATCTAGTGAGTCGGAGATTATAGTCAATGAACAGATATTTTATTCTAATTTTTATGTCTATATAGACAGGAGTTGATTGTCAGTGTCTGTAGCTCTGTAGGAGTGAGAACTATAGT-AAAAAAATATGCAGGGAAAGATTGGAAATGTAATTAGTGTGCAATTTTTTTTTGAGGTGGTTCAATGAGTGCCCAATTGACAATATGTAAGTATGTAACTGGCCATCCCTTGACCCTTAACAATGTAACTGGAGTGCAGCTGACGTATAAAAATGAAGCCCATTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[-] EMBL CB662144             [TATTGTCAGTCAGGAAGATGTTTGGATCATCATCTTCCACATCCGCATCACTTATGAGGAGATTGTGGATCAGAAAGTCCGATGTATCAT CCAGTGAGTGGAAATTGTTGCAGCACAGGCCAAAACTTGAGGAACTAACCATCGAATACTGCGAAATGGTACGTGTTCTTGCAGAACCCATCAGGTACCTTACCACTCTGCGAAAGCTGAAGATCAGCAATTGCTCTGAATTGGACGCGCTTCCAGAATGGATTGGCGATCTTGTAGCACTTGAATCTCTTCAAATAAGTTGCTGCCCAAAGTTGGTCTCGATCCCAAAAGGTTTGCAACATTTGACTGCTCTGGAGGAGTTAACTGTCACTGCCTGTAGCTCTGAGTTGAACGAAAACTGCAGGAAAGATACAGGCAAGGATTGGTTCAAGATCTGTCATATCCCAAACATAGTAATCTCGTGACAGATAACTATGCAACTTCTGTTGATCAATTAAACAAAAAAAAAGTCTTGGTGAGTTGCAAGTTCATTTGATTATGGTGAAGTTATCCTCTACTCAATTTGTTCCCATCATGCATTGTCCTTGAATGGTTTATTTAGTGAGTCGGAGATTATAGTCAATGAACAGATATTTTATTGTAATTTTTATGTCTATATAGACAGGA                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AU078742             [                                                                      CAGAAAGTCCGATGTATCATCCCAGTGAGTGGAAATTGTTGCAGCACAGGCCAAAACTTGAGGAACTAACCATCGAATACTGCGAAATGCTACGTGTTCTTGCAGAACCCATCAGGTACCTTACCACTCTGCGAAAGCTGAAGATCAGC ATTGCACTGAATTGGACGCGCTTCCAGAATGGATTGGTGATCTTGTAGCACTTGAATCTCTTCAAATAAGTTGCTGCCCAAAGTTGGTCTCGATCCCAAAAGGTTTGCAACATTTGACTGCTCTGGAGGAGTTAACTGTCACTGCCTGTAGCTCTGAGTTGAACGAAAACTGCAGGAAAGATACAGGCAAGGATTGGTTCAAGATCTGTCATATCCCAAACATCGTAATCTCGTGACAGATAACTATGCAACTTCTGTTGATCAATTAAACAAAAAAAAAGTCCTGGTGAGTTGCAAGTTCATCTGATTATGCTGAAGTTATCCTCTACTCAATTTGTTCCCATCATGCATTGTCCTTGAATGGTTTATCTAGTGAGTCGGAGATTATAGTCAATGAACAGATATTTTATTCTAATTTTTATGTCTATATAGACAGGAGTTGATTGTCAGTGTCTGTAGCTCTGTAGGAGTGAGAACTATAGT AAAAAAATATGCAGGGAAAGATTGGAAATGTAATTAGTGTGCAATTTTTTTTaaaaaaaa                                                                                                                               ]
[-] EMBL CA759937             [                                                                                                                                                                                                                                                             TTGGTGATCTTGTAGCACTTGAATCTCTTCAAATAAGTTGCTGCCCAAAGTTGATCTCGATCCCAAAAGGTTTGCAACATTTGACTGCTCTGGAGGAGTTAACTGTCACTGCCTGTAGCTTTGAGTTGAACGGAAACTGCAGGAAAGATACAGGCAAGGATTGGTTCAAGATCTGTCATATCCCAAACATTGTAATCTCGTGACAGATAACTATGCAACTTCTGTTGATCAATTAAACAAAAAAAAAGTCCTGGTGAGTTGCAAGTTCATCTGATTATGCTGAAGTTATCCTCTACTCAATTTGTTCCCATCATGCATTGTCCTTGAATGGTTTATCTAGTGAGTCGGAGATTATAGTCAATGAACAGATATTTTATTCTAATTTTTATGTCTATATAGACAGGAGTTGATTGTCAGTGTCTGTAGCTCTGTAGGAGTGAGAACTATAGTAAAAAAAATATGCAGGGAAAGATTGGAAATGTAATTAGTGTGCAATTTTTTTTTGTGGTGGTTCAATGAGTGCCCAATTGACAATATGTAAGTATGTAACTGGCCATCCCTTGACCCTTAACAATGTAACTGGAGTGCAGCTGACGTATAAAAATGAAGCCCATTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CB684803             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCTGATGATCAATTAAACAAAAAAAAAGTCCTGGAGAGTTGCCAGCTCATCTGATTATGCTGAAGTTATCCTCTACTCAATTTGTTCCCATCATGCATTGTCCTTGAATGGTTTATCTAGTGAGTCAGAGATTATAGTCAGTGAACAGATATTTTATTCTAATTTTTATGACTATATATACAGGAGTTGATTGTCAGGGTCTGTATCTCTGTAGGAGTGACAACTATAGT AAAAAAATATGCAGGGAAAGATTGGAAATGTAATTAGTGTGCAATTTTTTTTTGAGGTGGCTCAATGAGTGCACAATTGACAATATGTAAGTATGTAACTGGCCATCACTTGACCCTTAACAATGTAACTGGAGTGCAGCTGACGTATAAAAATGAAGC                            ]




>consensus_7058#0
TATTGTCAGTCAGGAAGATGTTTGGATCATCATCTTCCACATCCGCATCACTTATGAGGA
GATTGTGGATCAGAAAGTCCGATGTATCATCCAGTGAGTGGAAATTGTTGCAGCACAGGC
CAAAACTTGAGGAACTAACCATCGAATACTGCGAAATGGTACGTGTTCTTGCAGAACCCA
TCAGGTACCTTACCACTCTGCGAAAGCTGAAGATCAGCAATTGCTCTGAATTGGACGCGC
TTCCAGAATGGATTGGTGATCTTGTAGCACTTGAATCTCTTCAAATAAGTTGCTGCCCAA
AGTTGGTCTCGATCCCAAAAGGTTTGCAACATTTGACTGCTCTGGAGGAGTTAACTGTCA
CTGCCTGTAGCTCTGAGTTGAACGAAAACTGCAGGAAAGATACAGGCAAGGATTGGTTCA
AGATCTGTCATATCCCAAACATAGTAATCTCGTGACAGATAACTATGCAACTTCTGTTGA
TCAATTAAACAAAAAAAAAGTCCTGGTGAGTTGCAAGTTCATCTGATTATGCTGAAGTTA
TCCTCTACTCAATTTGTTCCCATCATGCATTGTCCTTGAATGGTTTATCTAGTGAGTCGG
AGATTATAGTCAATGAACAGATATTTTATTCTAATTTTTATGTCTATATAGACAGGAGTT
GATTGTCAGTGTCTGTAGCTCTGTAGGAGTGAGAACTATAGTAAAAAAATATGCAGGGAA
AGATTGGAAATGTAATTAGTGTGCAATTTTTTTTTGAGGTGGTTCAATGAGTGCCCAATT
GACAATATGTAAGTATGTAACTGGCCATCCCTTGACCCTTAACAATGTAACTGGAGTGCA
GCTGACGTATAAAAATGAAGCCCATTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case