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Oryza sativa
cluster # 7801 cluster # 7801       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7801#0 length = 1943 sequences # 5  

consensusID : consensus_7801#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1943
fasta sequence
                              [TGCTACTTTGGTCATGACAGGTTAAATGTGTTATAGGAGTACTTCAGCTTTTACTGTTTCATGAGTTCAAAATATAAATTGATCTTTGAGGAATGAAAAGCAAATGTTCTCTTCAGCTATCTTTTCTGAAGTTCAAATGTGTCCTTTGATTGAATTAATCTTCTGTAACATTTTGAAACCTCCAGACTAGCATCATCATCTCTCAATACTATCGACATTAATTCAGTATCCATTTTATTAATCCAGTTTCACATTTTACTTTGATGTTCTTAATAATCTTCAGCGGAAAGAGATGTTCTACAGCTCTGCACTTTATCTCTGCCTGTTAGTAGCACTCTGAAGAACAGCCTAAGCTTATCACCCATCATTTCCTCTCTCTCCTTTTCTACTGTCTTCATTGATGCTGCTATATTGAAATTGCATTTTGATATTGGTTCTTTGACAACTGTGGAGCAGCTTGCCAAGACAAAGGCAGCTCATCTGCTGAATTATCCTGATGCGAAGATACTGTGGATCGGTTGCCCTACATATCTTTGCATTGTTGCTCTTAATATAACAAACGCCAGTCGTGTAGCTTCAGATTATTTATATTGCAGTATATCAAGAACATAGCTATACGATGTTTGGTTAGAGATATCAACTAGCTTTATGATAAGCAGCTTTCAATCCATTTGTCATAGATGGGCTAGCAGGCAGCCAGTCACTGTGTCTGTGCACATACACAAAGTGAGAACATTGAGATTCTTAGCTCAAATGCAAAGAATCTGATATTGTCCTCCTCTTATCCACATGATAAAAGCTAGAGCTAAAGTGTACTAATTCAAGTCAAAGGTCACATTGACTGTGAAGTGAAATAATATACATGTTTGTAACCAGGAAAAATAGTATGGACAAGACCAAGTAAAGACGAGAAATTATTTCCCTCTGTTTGGAACTCGTCTTGCTTTGATCCAAGCTCCATATACTTTATCTTGACACACCAAATATAACCTCAATTTGTCACCTTTCCTCCTCCTCTCTTAGTCTTAAAAAGAGCGAAAACTTAGCTTTACACTGCACTGCAACCATGTTACACATATATATGCATGTATA-TAACTTTAGGTTCACAGATAGCGTTACCACATCAACCGAAAAAAAAATATTTCTTTCAATA-TTTGGTTAACAACTTCTTATAAAAGAAAACACTAGTATCAGCAAAGAACATGGATCATGTGATCTGATCATCTGAGTAACTGATACAATTATCTTGATGTAGTATTTGCTAAAAAAACATTAGGTATGCATAATCAAGAAGCATCGTCTGACTTTTGCCCCCCCTTTTTTTTCATAGATTTGCTCTTTCATTGTGAGACTAATGGTATATCAAGTCCTACCGTTTTACTTTATTTTTCTCTCATTTTGCTTTGTCTGTGAACATAACAATATATCAATTTATAACTGCTTTACTCAATTTGTTTTCTAGAAAAAGTTCGTTTATTTACTGTGAGCATCGAGACATAAAGATTATGCATCTACATGGCAGGCTGTATCAGGGGTGCTGCAAGAAAATATTTTGAGGGAACGTTACTACGAACATATCATGTACACTAAAGTCCGTATCAATGCATACAATTGCTATGCCGTTATGATGTGCACTCTATATCAGGAATGGATTTATTTTGATCCCAAAATGGACGCTAAGATTGCTGAGATGAATCCGATGAATGAGAATGAGGTTGATTGGGCTATGGTTTATTGGTTTTATCAAAGTTGGTACGACAAGATATGGTGCAATTCTTCTATGTGCCTCAACGATGACTTGTATAGTTATACTTATTGTCTTTTGTTATAAGCTTTTTTTTTTTTAAAATGGAAGCATCATACACATGTGAGCTGTGTAATTTAATATTTTCAAACATTTTAATGAACATCAGATATTGGAGTATTTTCGGAAACGAAATGCA]

[+] EMBL CB674642             [TGCTACTTTGGTCATGACAGGTTAAATGTGTTATAGGAGTACTTCAGCTTTTACTGTTTCATGAGTTCAAAATATAAATTGATCTTTGAGGAATGAAAAGCAAATGTTCTCTTCAGCTATCTTTTCTGAAGTTCAAATGTGTCCTTTGATTGAATTAATCTTCTGTAACATTTTGAAACCTCCAGACTAGCATCATCATCTCTCAATACTATCGACATTAATTCAGTATCCATTTTATTAATCCAGTTTCACATTTTACTTTGATGTTCTTAATAATCTTCAGCGGAAAGAGATGTTCTACAGCTCTGCACTTTATCTCTGCCTGTTAGTAGCACTCTGAAGAACAGCCTAAGCTTATCACCCATCATTTCCTCTCTCTCCTTTTCTACTGTCTTCATTGATGCTGCTATATTGAAATTGCATTTTGATATTGGTTCTTTGACAACTGTGGAGCAGCTTGCCAAGACAAAGGCAGCTCATCTGCTGAATTATCCTGATGCGAAGATACTGTGGATCGGTTGCCCTACATATCTTTGCATTGTTGCTCTTAATATAACAAACGCCAGTCGTGTAGCTTCAGATTATTTATATTGCAGTATATCAAGAACATAGCTATACGATGTTTGGTTAGAGATATCAACTAGCTTTATGATAAGCAGCTTTCAATCCATTTGTCATAGATGGGCTAGCAGGCAGCCAGTCACTGTGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CB660982             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGCTATACGATGTTTGGTTAGAGATATCAACTAGCTTTATGATAAGCAGCTTTCAATCCATTTGTCATAGATGGGCTAGCAGGCAGCCAGTCACTGTGTCTGTGCACATACACAAAGTGAGAACATTGAGATTCTTAGCTCAAATGCAAAGAATCTGATATTGTCCTCCTCTTATCCACATGATAAAAGCTAGAGCTAAAGTGTACTAATTCAAGTCAAAGGTCACATTGACTGTGAAGTGAAATAATATACATGTTTGTAACCAGGAAAAATAGTATGGACAAGACCAAGTAAAGACGAGAAATTATTTCCCTCTGTTTGGAACTCGTCTTGCTTTGATCCAAGCTCCATATACTTTATCTTGACACACCAAATATAACCTCAATTTGTCACCTTTCCTCCTCCTCTCTTAGTCTTAAAAAGAGCGAAAACTTAGCTTTACACTGCACTGCAACCATGTTACACATATATATGCATGTATA TAACTTTAGGTTCACAGATAGCGTTACCACATCAACCGAAAAAAAAATATTTCTTTCAATA TTTGGTTAACAACTTCTTATAAAAGAAAACACTAGTATCAGCAAAGAACATGGATCATGTGATCTGATCATCTGAGTAACTGATACAATTATCTTGATGTAGTATTTGCTAAAAAAACATTAGGTATGCATAATCAAGAAGCATCGTCTGACTTTTGCCCCCCCTTTTTTTTCATAGATTTGCTCTTTCATTGTGAGACTAATGGTATATCAAGTCCTACCGTTTTACTTTATTTTTCTCTCATTTTGCTTTGTCTGTGAACATAACAATATATCAATTTATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CF323992             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTCAATCCATTTGTCATAGATGGGCTAGCAGGCAGCCAGTCACTGTGTCTGTGCACATACACAAAGTGAGGACATTGAGATTCTTAGCTCAAATGCAAAGAATCTGATATTGTCCTCCTCTTATCCACATGATAAAAGCTAGAGCTAAAGTGTACTAATTCAAGTCAAAGGTCACATTGACTGTGAAGTGAAATAATATACATGTTTGTAACCAGGAAAAATAGTATGGACAAGACCAAGTAAAGACGAGAAATTATTTCCCTCTGTTTGGAACTCGTCTTGCTTTGATCCAAGCTCCATATACTTTATCTTGACACACCAAATATAACCTCAATTTGTCACCTTTCCTCCTCCTCTCTTAGTCTTAAAAAGAGCGAAAACTTAGCTTTACACTGCACTGCAACCATGTTACACATATATATGCATGTATANTAACTTTAGGTTCACAGATAGCGTTACCACATCAACCGAAAAAAAAATATTTCTTTCAATANTTTGGTTAACAACTTCTTATAAAAGAAAACACTAGTATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CB660983             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CATGGATCATGTGATCTGATCATCTGAGTAACTGATACAATTATCTTGATGTAGTATTTGCTAAAAAAACATTAGGTATGCATAATCAAGAAGCATCGTCTGACTTTTGCCCCCCCTTTTTTTTCATAGATTTGCTCTTTCATTGTGAGACTAATGGTATATCAAGTCCTACCGTTTTACTTTATTTTTCTCTCATTTTGCTTTGTCTGTGAACATAACAATATATCAATTTATAACTGCTTTACTCAATTTGTTTTCTAGAAAAAGTTCGTTTATTTACTGTGAGCATCGAGACATAAAGATTATGCATCTACATGGCAGGCTGTATCAGGGGTGCTGCAAGAAAATATTTTGAGGGAACGTTACTACGAACATATCATGTACACTAAAGTCCGTATCAATGCATACAATTGCTATGCCGTTATGATGTGCACTCTATATCAGGAATGGATTTATTTTGATCCCAAAATGGACGCTAAGATTGCTGAGATGAATCCGATGAATGAGAATGAGGTTGATTGGGCTATGGTTTATTGGTTTTATCAAAGTTGGTACGACAAGATATGGTGCAATTCTTCTATGTGCCTCAACGATGACTTGTATAGTTATACTTATTGTCTTTTGTTATAAGCTTTTTTTTTTTTAAAATGGAAGCATCATACACATGTGAGCTGTGTAATTTAATATTTTCAAACATTTTAATGAACATCAGA                             ]
[-] EMBL CB674643             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGGATCATGTGATCTGATCATCTGAGTAACTGATACAATTATCTTGATGTAGTATTTGCTAAAAAAACATTAGGTATGCATAATCAAGAAGCATCGTCTGACTTTTGCCCCCCCTTTTTTTTCATAGATTTGCTCTTTCATTGTGAGACTAATGGTATATCAAGTCCTACCGTTTTACTTTATTTTTCTCTCATTTTGCTTTGTCTGTGAACATAACAATATATCAAGTTATAACTGCTTTACTCAATTTGTTTTTTAGAAAAAGTTCGTTTATTTACTGTGAGCATCGAGACATAAAGATTATGCATTTACATGGCAGGCTGTATCAGGGGTGCTGCAAGAAAATATTTTGAGGGAACGTTACTACGAACATATCATGTACACTAAAGTCCGTATCAATGCATACAATTGCTATGCCGTTATGATGTGCACTCTATATCAGGAATGGATTTATTTTGATCCCAAAATGGACGCTAAGATTGCTGAGATGAATCCGATGAATGAGAATGAGGTTGATTGGGCTATGGTTTATTGGTTTTATCAAAGTTGGTACGACAAGATATGGTGCAATTTTTTTATGTGCCTCAACGATGACTTGTATAGTTATACTTATTGTCTTTTGTTATAAGCTTTTTTTTTTTTAAAATGGAAGCATCATACACATGTGAGCTGTGTAATTTAATATTTTCAAACATTTTAATGAACATCAGATATTGGAGTATTTTCGGAAACGAAATGCA]


>consensus_7801#0 TGCTACTTTGGTCATGACAGGTTAAATGTGTTATAGGAGTACTTCAGCTTTTACTGTTTC ATGAGTTCAAAATATAAATTGATCTTTGAGGAATGAAAAGCAAATGTTCTCTTCAGCTAT CTTTTCTGAAGTTCAAATGTGTCCTTTGATTGAATTAATCTTCTGTAACATTTTGAAACC TCCAGACTAGCATCATCATCTCTCAATACTATCGACATTAATTCAGTATCCATTTTATTA ATCCAGTTTCACATTTTACTTTGATGTTCTTAATAATCTTCAGCGGAAAGAGATGTTCTA CAGCTCTGCACTTTATCTCTGCCTGTTAGTAGCACTCTGAAGAACAGCCTAAGCTTATCA CCCATCATTTCCTCTCTCTCCTTTTCTACTGTCTTCATTGATGCTGCTATATTGAAATTG CATTTTGATATTGGTTCTTTGACAACTGTGGAGCAGCTTGCCAAGACAAAGGCAGCTCAT CTGCTGAATTATCCTGATGCGAAGATACTGTGGATCGGTTGCCCTACATATCTTTGCATT GTTGCTCTTAATATAACAAACGCCAGTCGTGTAGCTTCAGATTATTTATATTGCAGTATA TCAAGAACATAGCTATACGATGTTTGGTTAGAGATATCAACTAGCTTTATGATAAGCAGC TTTCAATCCATTTGTCATAGATGGGCTAGCAGGCAGCCAGTCACTGTGTCTGTGCACATA CACAAAGTGAGAACATTGAGATTCTTAGCTCAAATGCAAAGAATCTGATATTGTCCTCCT CTTATCCACATGATAAAAGCTAGAGCTAAAGTGTACTAATTCAAGTCAAAGGTCACATTG ACTGTGAAGTGAAATAATATACATGTTTGTAACCAGGAAAAATAGTATGGACAAGACCAA GTAAAGACGAGAAATTATTTCCCTCTGTTTGGAACTCGTCTTGCTTTGATCCAAGCTCCA TATACTTTATCTTGACACACCAAATATAACCTCAATTTGTCACCTTTCCTCCTCCTCTCT TAGTCTTAAAAAGAGCGAAAACTTAGCTTTACACTGCACTGCAACCATGTTACACATATA TATGCATGTATATAACTTTAGGTTCACAGATAGCGTTACCACATCAACCGAAAAAAAAAT ATTTCTTTCAATATTTGGTTAACAACTTCTTATAAAAGAAAACACTAGTATCAGCAAAGA ACATGGATCATGTGATCTGATCATCTGAGTAACTGATACAATTATCTTGATGTAGTATTT GCTAAAAAAACATTAGGTATGCATAATCAAGAAGCATCGTCTGACTTTTGCCCCCCCTTT TTTTTCATAGATTTGCTCTTTCATTGTGAGACTAATGGTATATCAAGTCCTACCGTTTTA CTTTATTTTTCTCTCATTTTGCTTTGTCTGTGAACATAACAATATATCAATTTATAACTG CTTTACTCAATTTGTTTTCTAGAAAAAGTTCGTTTATTTACTGTGAGCATCGAGACATAA AGATTATGCATCTACATGGCAGGCTGTATCAGGGGTGCTGCAAGAAAATATTTTGAGGGA ACGTTACTACGAACATATCATGTACACTAAAGTCCGTATCAATGCATACAATTGCTATGC CGTTATGATGTGCACTCTATATCAGGAATGGATTTATTTTGATCCCAAAATGGACGCTAA GATTGCTGAGATGAATCCGATGAATGAGAATGAGGTTGATTGGGCTATGGTTTATTGGTT TTATCAAAGTTGGTACGACAAGATATGGTGCAATTCTTCTATGTGCCTCAACGATGACTT GTATAGTTATACTTATTGTCTTTTGTTATAAGCTTTTTTTTTTTTAAAATGGAAGCATCA TACACATGTGAGCTGTGTAATTTAATATTTTCAAACATTTTAATGAACATCAGATATTGG AGTATTTTCGGAAACGAAATGCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)