cluster # 9059

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Oryza sativa
cluster # 9059 cluster # 9059 Sequences # 6 consensus # 1
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consensus_9059#0 length = 3325 sequences # 6
consensusID : consensus_9059#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
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Sequences nbr = 6
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fasta sequence
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[+] EMBL CA762040             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGCAAGGGATCAACTTAGTGTAGGAATTAGCGGTGGTAGTGTTGGCATGGGTGCTAGCCATGAAGCTGAAATTCATGGAATTGATGTTTCTTTGCAAAGGGCTGAAAGTGTTGTAGGTGATGCAGAACCTAATACTGAGCTAACAGAGACGATGGGTCATACTGGTGAATCAGTTCCTGGACCTGGACTAATGGATGAGTTTGTACCTGACGAAGTTGATCGGCAAGAACCTCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CB630290             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATGTTT TTTGCAAAGGGCTGAAAGTGTTGTAGGTGATGCAGAACCTAATACTGAGCTAACAGAGACGATGGGTCATACTGGTGAATCAGTTCCTGGACCTGGACTAATGGATGAGTTTGTACCTGACGAAGTTGATCGGCAAGAACCTCATGGAGATAGCCAAGATATGGTGTCTCAGTCAGTCGGCCAAGCTGACAGTGGCTCAAAAATTTATGGTTCCACTAAAGCTGATTCTGTTGAGAGTGGAGAAAAGATAGGAGGGCATGCTGTTGGTCATGCAAGCAGGATGCATCCTTCTCTTTCTTGCAATGCAGGGATGCAGACCGGTTTGGATGTATCTAAAGAGGAAGTGACACAGGCTGGCAAACTATTGATCGCTGGTGATGTGCCAATGGGGTTAGATTATGACCCTCAGAATGGATTAGGAGCAACAAATGGAGAAAATGATTTTGAATCAGGACTTCCAGAATTTGATCCTGTTAAGCATCACAACAGTTACTGCCCATGGGTAAATGGAACTGTGGCAGCAGCTTGCTGTAGCAACACTGAATCAAGCTCAAGTAGTTCACCACTTTCTGGCTGGCAATTAACAGTTGATGCACTTGACACATTCCAGTCTCTTGGTCAAGCTCAAAATCATGCTATGCGATCTGATTCCGCAGCCTCGTTATATATGGATGATCATGTAACTCCTAACCACAAGCTCGCCAGAAGGGCATCAGTGAGCAGAAGCCATGGGAAATGCTGATTTGAGGCCCTTCCACGCATGCTAGCCTTTACTAATCACCCAAGTTTGCAGCGAGATACTATACCAGTAATTTCACAGCTTATCCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AK063754             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTTGGTCATGCAAGCAGGATGCATCCTTCTCTTTCTTGCAATGCAGGGATGCAGACCGGTTTGGATGTATCTAAAGAGGAAGTGACACAGGCTGGCAAACTATTGATCGCTGGTGATGTGCCAATGGGGTTAGATTATGACCCTCAGAATGGATTAGGAGCAACAAATGGAGAAAATGATTTTGAATCAGGACTTCCAGAATTTGATCCTGTTAAGCATCACAACAGTTACTGCCCATGGGTAAATGGAACTGTGGCAGCAGCTTGCTGTAGCAACACTGAATCAAGCTCAAGTAGTTCACCACTTTCTGGCTGGCAATTAACAGTTGATGCACTTGACACATTCCAATCTCTTGGTCAAGCTCAAAATCATGCTATGCGATCTGATTCCGCAGCCTCGTTATATATGGATGATCATGTAACTCCTAACCACAAGCTCGCCAGAAGGGCATCAGTGAGCAGAAGCCATGGGAAATGCTGATTTGAGGCCCTTCCACGCATGCTAGCCTTTACTAATCACCCAAGTTTGCAGC A ATACTATACCAGTAATTTCACAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CA762041             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGGGTAAATGGAACTGTGGCAGCAGCTTGCTGTAGCAACACTGAATCAAGCTCAAGTAGTTCACCACTTTCTGGCTGGCAATTAACAGTTGATGCACTTGACACATTCCAGTCTCTTGGTCAAGCTCAAAATCATGCTATGCGATCTGATTCCGCAGCCTCGTTATATATGGATGATCATGTAACTCCTAACCACAAGCTCGCCAGAAGGGCATTAGTGAGCAGAAGCCATGGGAAATGCTGATTTGAGGCCCTTCCACGCATGCTAGCCTTTACTAATCACCCAAGTTTGCAGC A ATACTATACCAGTAATTTCACAGCTTATCCGAATCAAAAAGAAAAAAAAGTAAAGACCCAGCTTTTCAATCATAAGTAACATTCGCCAGAGATCCAATTTGGCACATCGAGGAGCGTATTTACATGTAATTCTTTTTGAATTATGTTGGGTTGGACATCATCCCCAATATGTTGCGCTGCCCATGATCAGACAGGATAAACCGGCTAATTAATAATCCATGTTAGTTACACCGTGT GACCTATATAGTTGTTGCTCAGAAACCGGCAATTTGATGTGGTGTCCAAACGATAATATTATAGTACTGTATTTATTTTGAAAGAGTCGATTCAATGAAGTTGTCCCCAGATTGGCATGAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL CA998449             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGCCAGAGATCCAATTTGGCACATGGAGGAGCGTATTTACACGTAATTCTTTCTGAATTATGTTGGGTTGGTCATCATCCCCAGTATGTTGAGCTGCCCATGATCAGACAGGATAACCCGGCTAATTAATAATCCATGTTAGTTACACCCTGTCGACGTATATAGTTGTTGTTCAGAATCCGGCAATTTGAGGTGGTGTCCAAGCGATAATATCATAGTTATGTATTTATTTTGAAAGAGTTCATTCAAAGAAGTTGTCCCCAGATT                  ]




>consensus_9059#0
CGCGGCGAGGAGGAGAGGGGCGGCGACGCGGCGCGGCGAGGGGGAGAGGTGAGGAGAGGA
GAGGGGAGGGGAGATGCGGGAGGAGGTGAGGAGCTCGTCGGGGGCGGCGGCCGAGCCGCC
TCCTACGCCGGTTGCAAGTTCTGCAGGACCCTCGTCACCTGCTATGCAAGCTAATGTTGC
CAGCATAGATTGGTCGGGTAGCAGACAAGCTTCCAGAGTTGATTCCTCATCACATGTTGC
TCCGCATGCCCATCAGCCTTCTCATAGTTTCGATGCCACTGGAACTGCTTTGGATTCTGC
ACCGTCATGTAGGCCATGGGAACGCGGAGACTTACTTCGTCGACTGGCAACATATAAGCC
TACAACTTGGGCTTCTAGGCCTAAGGCTGCTAGTTCTTTGGCTTGTGCTCGGAGAGGTTG
GGTTAACGTTGACATGGACAAAATTGAATGCGAGTCATGTGGTGCACATCTCATATTCAG
TACATTGACATCCTGGTCTCCAGCTGAAGTTTCAAATGCTGGAGAAGCCTTTGCCGAGCA
GCTTGATGCATCACACCATAATAGCTGTCCCTGGAGAGGCAATAGCTGTGCTGACAGCTT
GGTGCAGCTCCACCTAACACAATCAGCCCTTATTGGGGGTTTTAAAGATCGATGTGATGG
ACTTCTGCAGTTTACTTCCCTTCCAGTGATTGCTTCATCAGCAATTGAGCACATGAGGCT
GACCAGGAGTTCCCAGATTGACCGCTTATTATCCCAATCAATTACCTTTTTATCTGGAGA
GCTTAGTTACAAAGCAGAGAGCACAACAGGAATTGATATCCAGCAAGATTCCTCTTGTAG
CTACTCAAAAGCTAGGAAGCTTATAAGCCTTTGTGGATGGGAGCCTAGGTGGCTTCCAAA
TGTTCAAGACTGTGAAGAAAATTCAACCCACTCAGCTAAAAATGCAGATTCGGTGGAACC
ATTTTTTCCCCGTTTTGCTGAACATCAAAAAAATTCATTCTCTGGGTCAGCCAAAAAAGA
TAAAGGAAAAGGCAAAAGGCCACTCAAAGACTCTGGATGTAGCATGAGATCACCTTTGTT
AGATTGTAGCTTTTGTGGCTCTACAGTCAAGATCTGGGACTTTAGATCTGTGTCACGTCC
TTGTCGTTTTAGTCCAAATAACATTGATGCACCTGAAACAGGCAAGAAGCTTGCTCTGAC
ACGTGGAATTAGCGCTGCCAGTGGGATCAATGAATGGGTTACTGATGGGATGGAAAGAGA
TCCTGCTGAAGGGCGTGATGAAGAAGCAACAAATGAGGGTAAATCATTATCAAATGCTGG
AGTGGACCTGAATCTAACAATGGCTGGAGGATTACCATCAATTCAATCTTCTATACGAAT
TGCATCTGAGCGTTTCAACGGAGGATTGGGAAGAGATCTGATGATTGGACAACCTACTGG
AAGTGAAGTTGGTGATCATGCAACTTCATACGAGTCCCGAGGTCCAAGCTCAAGGAAGCG
CAACCATGAGGAAGGTGGGAGCACAGTTGACAAGCCACAGGACAGGCTTCAGCATGCTGA
TAGCATAGAAGGAAGTGTGATAGATCGTGATGGTGAGGAAGTTGATGATGCTGCGCAAGA
TTCGGACATCCCGAATAAAAGGTCACGTGGGTTTGATCTATTTGGTTCCTATCTTCCATC
TTCTTCTGGAGCTGGTCCCAGTAGAAACTTTTGCTTTGATCCTGATGCGGATGCTGGTAA
ATTCAGTCATGCTAGAGCTGCAGGTCTAGCCGCTGTTGACAGAGATTCTATGAGGGAATC
TTCTGTAGCTGCAATGGATACTGTTCATAGTGCTGATGAAGACTCCATGGAGAGCGTTGA
ATACTATCCAGGTGATGGTAATGATATTGACATGCCCTCATCTAGTGCACACAGAAATAT
TGAAATGGATGATGTCTTGGGCCTGAACTATAGTAACCAAGCACAGCAAAGTGCATGTGT
ACAGCCTGCTTCTGGAAGTGATGGAAGGGAAATAGGAGGAAGCAGTACAAATGAAGGGGA
GGAAGTCCTTGATGCAGTAACAGCCCCTGCTTTTGCAAGGGATCAACTTAGTGTAGGAAT
TAGCGGTGGTAGTGTTGGCATGGGTGCTAGCCATGAAGCTGAAATTCATGGAATTGATGT
TTCTTTGCAAAGGGCTGAAAGTGTTGTAGGTGATGCAGAACCTAATACTGAGCTAACAGA
GACGATGGGTCATACTGGTGAATCAGTTCCTGGACCTGGACTAATGGATGAGTTTGTACC
TGACGAAGTTGATCGGCAAGAACCTCATGGAGATAGCCAAGATATGGTGTCTCAGTCAGT
CGGCCAAGCTGACAGTGGCTCAAAAATTTATGGTTCCACTAAAGCTGATTCTGTTGAGAG
TGGAGAAAAGATAGGAGGGCATGCTGTTGGTCATGCAAGCAGGATGCATCCTTCTCTTTC
TTGCAATGCAGGGATGCAGACCGGTTTGGATGTATCTAAAGAGGAAGTGACACAGGCTGG
CAAACTATTGATCGCTGGTGATGTGCCAATGGGGTTAGATTATGACCCTCAGAATGGATT
AGGAGCAACAAATGGAGAAAATGATTTTGAATCAGGACTTCCAGAATTTGATCCTGTTAA
GCATCACAACAGTTACTGCCCATGGGTAAATGGAACTGTGGCAGCAGCTTGCTGTAGCAA
CACTGAATCAAGCTCAAGTAGTTCACCACTTTCTGGCTGGCAATTAACAGTTGATGCACT
TGACACATTCCAATCTCTTGGTCAAGCTCAAAATCATGCTATGCGATCTGATTCCGCAGC
CTCGTTATATATGGATGATCATGTAACTCCTAACCACAAGCTCGCCAGAAGGGCATCAGT
GAGCAGAAGCCATGGGAAATGCTGATTTGAGGCCCTTCCACGCATGCTAGCCTTTACTAA
TCACCCAAGTTTGCAGCAATACTATACCAGTAATTTCACAGCTTATCCGAATCAAAAAGA
AAAAAAAATAAAGACACAGCTTCTCAATCATAAGTAACATTCGCCAGAGATCCAATTTGG
CACATCGAGGAGCGTATTTACATGTAATTCTTTCTGAATTATGTTGGGTTGGACATCATC
CCCAGTATGTTGCGCTGCCCATGATCAGACAGGATAAACCGGCTAATTAATAATCCATGT
TAGTTACACCGTGTGACCTATATAGTTGTTGCTCAGAAACCGGCAATTTGATGTGGTGTC
CAAACGATAATATCATAGTACTGTATTTATTTTGAAAGAGTCGATTCAATGAAGTTGTCC
CCAGATTGGCATGAAAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case