These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10091#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 681 fasta sequence [GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA-GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA-TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC-AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA-AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC-AAAAGAATTAG-TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT--TATAAAATCAAATTATGAAATCAAACAACTTAAAACTTCGGTTATTGCAGCGGTTGAGTCTCTTAAGTCGGCTATGCAAATTACACAACCAGGAATAACTGAAACTGCTTTACAAAGTTACATAGAATACCAAATGCGCAGCCGAGGCTGCTCTGTTGGGTATCCACCTGTTGTCGCTGGTGGGGACAGAACAAACAT] [+] EMBL CD137091 [GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT TATAAAATCAAATTATGAAATCAAACAACTTANAACTTCGGTTATTGCAGCGGTTGAGTCTCTTAAGTCGGCTATGCAAATTACACAACCAGGAATAACTGAAACTGCTTTACAAAGTTACATAGAATACC ] [+] EMBL CD136648 [GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT TATAAAATCAAATTATGAAATCAAACAACTTANAACTTNCGTTATTGCAGCGGTTGAGTCTCT ] [+] EMBL CD120269 [GGTAATACCTGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGNTAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTNTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAAGTTGNTTTGAAAANNGA TGTAGAATTCTCCCGGNCAATTAACGAC NAAAGAATTAGTTTTTGAAAATCAAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT TA ] [+] EMBL CD120294 [GGAAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGG ] [+] EMBL CD120461 [GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTAATTCACA GGGTTGAA GAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGGGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAN CAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT TAT AAATCAAATTAT ] [+] EMBL CD120347 [GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCCAAAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATT ACGAC AAAAGAATTAG NTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCTTNNNATAAA ] [+] EMBL CD120417 [GGTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGACNAAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT TAT ] [-] EMBL CD137313 [ GTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC GAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT TATAAAATCAAATTATGAAATCAAACAACTTAAAACTTCGGTTATTGCAGCGGT ] [-] EMBL CD137043 [ GTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACAGGGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCCTTATCTGCACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGATTACTTAATCGACAGCATTCGCCT TATAAAGTCAAATTATGAAggg ] [-] EMBL CD137261 [ GTAATACCAGCTTCCGAAATACAGTATATGGCATACCATGTCCCATACCCTTTTCACCAAGATCCCAACTTCTTCTACTTCACA GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT TATA ] [-] EMBL CD120280 [ A GGGTTGAATGAACCAAATGGAATTCTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT TATA ] [+] EMBL CD067335 [ CTGTTATTTTGCACAGATAAAACAGAAGAACGTGACGATCAAAGTGACCTTAACTGGTCGACCCATCTTTTCGTGGAGACTCGGAACAAACATGCTGAGATCTGGAATGGTCCATCCTTGACGTTATCAGAAGCTTCTTTGGCAACTGGGGTTGATAATTCCCATCCTTTGAGTGAA TTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT TATAAAATCAAATTATGGAATCAAACAACTTAAAACTTCGGTTATTGCAGCTGTTGAGTCTCTTAAGTCGGCTATGCAAATTACACA ] [-] EMBL CD120028 [ TGATAATTCCCATCC TTGAGTGAATTTTAGTAAATTTTTGGACCATCAAGCTTTATCTACACAATCCATATGTGTTTGGTATAGTCCATTATCATCC AAAAATTTTGTTGAGCGCCCCTTGAATAAGTTTGTTTTGAAAA AGATTGTAGAATTCTCCCGGCAAATTAACGAC AAAAGAATTAG TTTTGAAAATCCAGACTACTTAATCGACAGCATTCGCCT TATAAAATCAAATTATGAAATCAAACAACTTAAAACTTCGGTTATTGCAGCTGTTGAGTCTCTTAAGTCGGCTATGCAAATTACACAACCAGGAATAACTGAAACTGCTTTACAAAGTTACATAGAATACCAAATGCGCAGCCGAGGCTGCTCTGTTGGGTATCCACCTGTTGTCGCTGGTGGGGACAGAACAAACAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||