These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10323#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 15 consensus length = 1058 fasta sequence [TAGTGGTAACGATGGGGCGTGTTGGCGTCTCTGTTCCAAAAGAGCGGTTCCTACTCTGCTTAAGCTTCATTTACTTGTTTGCTTTTGCTTCTCTGTACATTCAGCTTCCTGGGTTATATAGTGAGTATGGTGTGACGCCTATCCAAACGCTATCATTAAGTGCCCCAAAGGACGCATCAGACTTCATTAACAATCTTAACGTCGTACGGCTTGCCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACAAATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATCGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTTTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCCCAGGTACTTCTGCAACTGTCGATAATTTTGACGGGGAACTACAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATTCTCTACTGAAAGATGATGACTTCAATCCTCGGCGCAGACGAAAGTGGACCGTGTCTGGATTATTGTCTTTTGCGGCTTCATGGTTTCTTATCATCTCAGTATTCGGGATTAGTGGTTATCTGCTCAATTTTTCTATTTCCAATTATTCAGTCGGTGCCTCTGTAGGTTTCACCAAAAAGGAGTTCGCTTGGTTCGTAAATACATCTGTCAAATACAGT] [+] EMBL CD095019 [TAGTGGTAACGATGGGGCGTGTTGGCGTCTCTGTTCCAAAAGAGCGGTTCCTACTCTGCTTAAGCTTCATTTACTTGTTTGCTTTTGCTTCTCTGTACATTCAGCTTCCTGGGTTATATAGTGAGTATGGTGTGACGCCTATCCAAACGCTATCATTAAGTGCCCCAAAGGACGCATCAGACTTCATTAACAATCTTAACGTCGTACGGCTTGCCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACAAATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATCGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTTTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTAT ] [+] EMBL CD179034 [TAGTTGTAACGATGGGGCGTGTTGGCGTCTCTATTCCAAAAGAGCGGTTCCTACTCTGCTTAAGCTTCATTTACTTATTTGCTTTTGCTTCTCTGTACATTCAGCTTCCTGGGTTATATAGTGAGTATGGTGTGACGCCTATCCAAACGCTATCATTAATAGCCCCAAAGGACGCATCAGACTTTATTAAAAATCTAAACGTCGTACGGCTTACCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACAAATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATTGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTCTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTTCTAGCCCTTTGGATGCTGTATCTAAGCGCCTTANAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTNTATAGCAATTCTTTTGTCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGACAAAAT ] [+] EMBL CD114275 [ CGTGTTGGCGTCTCTGTTCCAAAAGAGCGGTTCCTACTCTGCTTAAGCTTCATTTACTTGTTTGCTTTTGCTTCTCTGTACATTCAGCTTCCTGGGTTATATAGTGAGTATGGTGTGACGCCTATCCAAACGCTATCATTAAGTGCCCCAAAGGACGCATCAGACTTCATTAACAATCTTAACGTCGTACGGCTTGCCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACAAATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATCGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTTTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCANGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAAT ] [+] EMBL CD114235 [ CGTGTTGGCGTCTCTGTTCCAAAAGAGCGGTTCCTACTCTGCTTAAGCTTCATTTACTTGTTTGCTTTTGCTTCTCTGTACATTCAGCTTCCTGGGTTATATAGTGAGTATGGTGTGACGCCTATCCAAACGCTATCATTAAGTGCCCCAAAGGACGCATCAGACTTCATTAACAATCTTAACGTCGTACGGCTTGCCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACAAATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATCGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTTTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCGATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAG ] [-] EMBL CD094663 [ ATTAATAGCCCCAAAGGACGCATCAGACTTTATTAAAAATCTAAACGTCGTACGGCTTACCGAATTCTTGCAACTTGACTCCTACAAATGTCTTGAACTTGTAACTGTTGTGGGCATTGTATTGTCATTCCTGTCGAGTTTCTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTTCTAGCCCTTTGGATGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTGTCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGACAAAATAGGAATGTGGTTGTTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAA ] [+] EMBL CD068728 [ TATTGTCATTCCTGTCGAGTTTTTCC CAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTATACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCCCAGGTACTTCTGCAACTGTCGAT ] [-] EMBL CD178910 [ TTGTCATTCCTGTCGAGTTTTCCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTT ] [-] EMBL CD095317 [ AGTTTTTCCACAGCCTTCCGGACAGGGCCAGTCTTCCTGGCCCTTTGGGTGCTGTATCTAAGCGCCTTAAAGGTTGGCCAAACTTTCTTATGGTTTCAATGGGATATCTTACTTTTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCCCAGGTACTTCTGCAACTGTCGATAATTTTGACGGGGAACTACAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATTCCCTACTGAAAGATGATGACTTC ] [+] EMBL CD200958 [ gatTTTATCATATTATCTTAGGGATATCTTACTTGTGGAGTCCGGCTTTATAGCAATTCTTTTATCAAGTTTCGGCACAGTCATTTCTCTTCCACGAGTGGTTGCTAGTGATAAAATAGGAATGTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTGGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCTTATTCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCCAACTGCACCCCTTGTA ] [-] EMBL CD114283 [ GTGGTTACTACGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCG ] [-] EMBL CD125133 [ CGTTGGCTTCTATTTCGGCTAATGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAACTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCATTACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCCCAGGTACTTCTGCAACTGTCGATAATTTTGACGGGGAACTACAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATTCCCTACTGAAAGATGATGACTTCAATCCTCGGCGCAGACGAAAGTGGACCGTATCTGGATTATTGTCTTTTGCGGCTTCATGGTTTCTTATCATCTCAGTATTCGGGATTAGTGGTTATCTGCTCAATTTTTCTATTTCCAATT ] [-] EMBL CD114092 [ TGTTCTCATCTGGTGTAGTTAAAGTGACCAGCGACTGTCCCACTTGGTGGGGTTTGAAAGCAATACACTGGCACTATCAGTCCCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTGCATTCATAATCG ] [-] EMBL CD095049 [ ATTACACTGGCACTATCAGTCNCAGTGTATTCCAACACCAGTAGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTACATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCACAGGTACTTCTGCAACTGTCGATAATTTTGACGGGGAACTGCAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATTCTCTACTGAAAGATGATGACTTC ] [-] EMBL CD119036 [ AGCTTGGTATGCACATCACCTACCAGGATGGATTCATAACCTGTGTGTCGCAGGTACATTCATAATCGAAATCCCACTACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCACAGGTACTTCTGCAACTGTCGATAATTTTGACGGGGAACTACAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATTCTCTACTGAAAGATGATGACTTCAATCCTCGGCGCAGACGAAAGTGGACCGTGTCTGGATTATTGTCTTTTGCGGCTTCATGGTTTCTTATCATCTCAGTATTCGGGATTAGTGGTTATCTGCTCAATTTTTCTATTTCCAATTATTCAGTCGGTGCCTCTGTAGGTTTCACCAAAAAGGAGTTCGCTTGGTTCGTAAATACATCTGTCAAATACAGT] [-] EMBL CD119285 [ ACCACTTTTGTTTTTCGTACCCTTCCGAACTGCACGCCTTGTATCATTTTATTCACAGGTACTTCTGCAACTGTCGATAATTTTGACGGGGAACTACAATTTCTTCAATTTGTTAACCATTGCTTTATGTTATTCTCTACTGAAAGATGATGACTTCAATCCTCGGCGCAGACGAAAGTGGACCGTGTCTGGATTATTGTCTTTTGCGGCTTCATGGTTTCTTATCATCTCAGTATTCGGGATTAGTGGTTATCTGCTCAATTTTTCTATTTCCAATTATTCAGTCGGTGCCTCTGTAGGTTTCACCAAAAAGGAGTTCGCTTGGTTCGTAAATACATCTGTCAAATACAGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||