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Schistosoma mansoni
cluster # 10446 cluster # 10446       Sequences # 16       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10446#0 length = 1108 sequences # 12  
consensus_10446#1 length = 981 sequences # 4  

consensusID : consensus_10446#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 1108
fasta sequence
                              [ATGCGTAAACCTAACATCATTGTTGGTACAGACAATATATAAGCGAATGTCCCAATGAAAAAATGTAACCAATTAAACCAAGGTCTGTATTCATGAGCTGGATTACAACGGCATAATGCGATAATTGGATTAATCAAAGCCAAAGAGAAGACAATTAAACCAAGTATTGGATGTATATAATATGGATATGCTGTTGCTTGTGAATAGCCTTCACAATAGATAAAAATCAAAATTATACTAATACACGTTAAACCGACACATATGCCTTGCAGTATTCTATGTGATTGAAACCAGACACGTTCACCTAATAGACCAGAATTAGGCCATACATCTTTGTAATAACGAGCTAGTATAATACCAATACTAGCGCATAACACCCAAGCTAATACCATAAGACATCCATGAGTTTTAGCTATTGCAG-AACCACGACCAATTATGCCTGTCATACTTCCGTAAATAGGTGAAGTAATGACAACCGGACGTTGAGACACCGATTCTCCACCAGCGAAAGGACGACCGAATCCGTCTTTTTTACGTTCAACACCACGAGTAACAATCAAATGGTATGCATTCGGTGATGTTAAATCCATTAATTGATGAACTGTATCCAGTGGTCGAACACGTCGTCTAAAACGACATTGTAATGTACCATCCATTGCATTAAATGTACCACCTAAATTCTCACCGTCTGTTATTAATAATTCTTCATCTGGTCCATTATAAAAATTCGTAGTTTTACCAGCTATATCATTATATCCAGCTCGAATATTCACAGTATTTGTTGATGATTGATAATAACAACCAACAACCCCATCGTCACCTACTCTTTGATCTTTCGAGAAAGCCAGTGCTATAAAGCCTGTGACTTTCTGAATATTTCCTCTAAGCTCAAACTCCACGTAATTTTCAGACTTCACAGACACCAACTTCCAGGTGACGAGAAATGCACAAGATGATTCGGTACACATGGCGGGTCTCAAACATCCCTTTGTTAGAGCACACTCGTGCAATGTAATGTCGGGAAAAATGGCGTTAGCAAAGGTAGCTGACAAAGCCAAGTTAACAAGTACTGAAATCAGGAGGGACATGACTATGTAGCAAACAACAT]

[+] EMBL CD147506             [ATGCGTAAACCTAACATCATTGTTGGTACAGACAATATATAAGCGAATGTCCCAATGAAAAAATGTAACCAATTAAACCAAGGTCTGTATTCATGAGCTGGATTACAACGGCATAATGCGATAATTGGATTAATCAAAGCCAAAGAGAAGACAATTAAACCAAGTATTGGATGTATATAATATGGATATGCTGTTGCTTGTGAATAGCCTTCACAATAGATAAAAATCAAAATTATACTAATACACGTTAAACCGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD147804             [ATGCGTAAACCTAACATCATTGTTGGTACAGACAATATATAAGCGAATGTCCCAATGAAAAAATGTATCCAATTAAACCAAGGTCTGTATTCATGAGCTGGATTACAACGGCATAATGCGATAATTGGATTAATCAAAGCCAAAGAGAAGACAATTAAACCAAGTATTGGATGTATATAATATGGATATGCTGTTGCTTGTGAATAGCCTTCACAATAGATAAAAATCAAAATTATACTAATACACGTTAAACCGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD138612             [                                                                                                           ACGGCATAATGCGATAATTGGATTAATCAAAGCCAAAGAGAAGACAATTAAACCAAGTATTGGATGTATATAATATGGATATGCTGTTGCTTGTGAATAGCCTTCACAATAGATAAAAATCAAAATTATACTAATACACGTTAAACCGACACATATGCCTTGCAGTATTCTATGTGATTGAAACCAGACACGTTCACCTAATAGACCAGAATTAGGCCATACATCTTTGTAATAACGAGCTAGTATAATACCAATACTAGCGCATAACACCCAAGCTAATACCATAAGACATCCATGAGTGTTAGCTATTGCAGAAACCACGA GAATTATGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD124938             [                                                                                                                                                                                     ATGGATATGCTGTTGCTTGTGAATAGCCTTCACAATAGATAAAAATCAAAATTATACTAATACACGTTAAACCGACACATATGCCTTGCAGTATTCTATGTGATTGAAACCAGACACGTTCACCTAATAGACCAGAATTAGGCCATACATCTCTGTAATAACGAGCTAGTATAATACCAATACTAGCGCATAACACCCAAGCTAATACCATAAGACATCCATGAGTTTTAGCTATTGCAG AACCACGACCAATTATGCCTGTCATACTTCCGTAAATAGGTGAAGTAATGACAACCGGACGTTGAGACACCGATTCTCCACCAGCGAAAGGACGACCGAATCCGTCTTTTTTACGTTCAACACCACGAGTAACAATCAAATGGTATGCATTCGGTGATGTTAAATCCATTAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD181905             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGGCCATACATCTTTGTAATAACGAGCTAGTATAATACCAATACTAGCGCATAACACCCAAGCTAATACCATAAGACATCCATGAGTTTTAGCTATTGCAG AACCACGACCAATTATGCCTGTCATACTTCCGTAAATAGGTGAAGTAATGACAACCGGACGTTGAGACACCGATTCTCCACCAGCGAAAGGACGACCGAATCCGTCTTTTTTACGTTCAACACCACGAGTAACAATCAAATGGTATGCATTCGGTGATGTTAAATCCATTAATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD180891             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GACCGAATCCGTCTTTTTTACGTTCAACACCACGAGTAACAATCAAATGGTATGCATTCGGTGATGTTAAATCCATTAATTGATGAACTGTATCCAGTGGTCGAACACGTCGTCTAAAACGACATTGTAATGTACCATCCATTGCATTAAATGTACCACCTAAATTCTCACCGTCTGTTATTAATAATTCTTCATCTGGTCCATTATAAAAATTCGTAGTTTTACCAGCTATATCATTATATCCAGCTCGAATATTCACAGTATTTGTTGATGATTGATAATAACAACCAACAACCCCATCGTCACCTACTCTTTGATCTTTCGAGAAAGCCAGTGCTATAAAGCCTGTGACTTTCTGAATATTTCCTCTAAG                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD181109             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GACCGAATCCGTCTTTTTTACGTTCAACACCACGAGTAACAATCAAATGGTATGCATTCGGTGATGTTAAATCCATTAATTGATGAACTGTATCCAGTGGTCGAACACGTCGTCTAAAACGACATTGTAATGTACCATCCATTGCATTAAATGTACCACCTAAATTCTCACCGTCTGTTATTAATAATTCTTCATCTGGTCCATTATAAAAATTCGTAGTTTTACCAGCTATATCATTATATCCAGCTCGAATATTCACAGTATTTGTTGATGATTGATAATAACAACCAACAACCCCATCGTCACCTACTCTTTGATCTTTCGAGAAAGCCAGTGCTATAAAGCCTGTGACTTTCTGAATATTTCCTCTAAGCTCAAACTCCACGTAATTTTCAGACTTCACAGACACCAACTTCCAGGTGACGAGAAATGCACAAGATGATTCGGTACACATGGCGGGTCTCAAACATCCCTTTGTTAGAGCACACTCGTGCAATGTAATGTCGGGAAAAATGGCGTTAGCAAAGGTAGCTGACAAAGCCAAGTTAACAAGTACTGAAATCAGGAGGGACATGACTATGTAGCAAACAACAT]
[-] EMBL CD149772             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGAATCCGTCTTTTTTACGTTCAACACCACGAGTAACAATCAAATGGTATGCATTCGGTGATGTTAAATCCATTAATTGATGAACTGTATCCAGTGGTCGAACACGTCGTCTAAAACGACATTGTAATGTACCATCCATTGCATTAAATGTACCACCTAAATTCTCACCGTCTGTTATTAATAATTCTTCATCTGGTCCATTATAAAAATTCGTAGTTTTACCAGCTATATCATTATATCCAGCTCGAATATTCACAGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD111239             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCCGTCTTTTTTACGTTCAACACCACGAGTAACAATCAAATGGTATGCATTCGGTGATGTTAAATCCATTAATTGATGAACTGTATCCAGTGGTCGAACACGTCGTCTAAAACGACATTGTAATGTACCATCCATTGCATTAAATGTACCACCTAAATTCTCACCGTCTGTTATTAATAATTCTTCATCTGGTCCATTATAAAAATTCGTAGTTTTACCAGCTATATCATTATATCCAGCTCGAATATTCACAGTATTTGTTGATGATTGATAATAACAACCAACAACCCCATCGTCACCTACTCTTTGATCTTTCGAGAAAGCCAGTGCTATAAAGCCTGTGACTTTCTGAATATTTCCTCTAAGCTCAAACTCCACGTAATTTTCAGACTTCACAGACACCAACTTCCAGGTGACGAGAAA                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD148717             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTAATGTACCATCCATGCCATTAAATGTACCACCTAAATTCTCACCGTCTGTTATTAATAATTCTTCATCTGGTCCATTATAAAAATTCGTAGTTTTACCAGCTATATCATTATATCCAGCTCGAATATTCACAGTATTTGTTGATGATTGATAATAACAACCAACAACCCCATCGTCACCTACTCTTTGATCTTTCGAGAAAGCCAGTGCTATAAAGCCTGTGACTTTCTGAATATTTCCTCTAAGCTCAAACTCCACGTAATTTTCAGACTTCACAGACACCAACTTCCAGGTGACGAGAAATGCACAAGATGATTCGGTACACATGGCGGGTCTCAAACATCCCTTTGTTAGAGCACACTCGTGCAATGTAATGTCGGGAAAAATGGCGTTAGCAAAGGTAGCTGACAAAGCCAAGTTAACAAGTACTGAAATCAGGAGGGACATGACTATGTAGCA        ]
[-] EMBL CD125737             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAAAATTCGTAGTTTCACCAGCTATATCATTATATCCAGCTCGAATATTCACAGTATTTGTTGATGATTGATAATAACAACCAACAACCCCATCGTCACCTACTCTTTGATCTTTCGAGAAAGCCAGTGCTATAAAGCCTGTGACTTTCTGAATATTTCCTCTAAGCTCAAACTCCACGTAATTTTCAGACTTCACAGACACCAACTTCCAGGTGACGAGAAATGCACAAGATGATTCGGTACACATGGCGGGTCTCAAACATCCCTTTGTTAGAGCACACTCGTG                                                                                                     ]
[+] EMBL CD150012             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcggCAACCCCACC  CACCTACTCTTTGATCTTTTGAGAAAGCCAGTGCTATAAAGCCTGTGACTTTCTGAATATTTCCTGTAAGCTCAAACTCCACGTAATTTTCAGACTTTACAGACACCAACTTTCATGTGACGAGACATGCACAACAT                                                                                                                                                          ]


>consensus_10446#0 ATGCGTAAACCTAACATCATTGTTGGTACAGACAATATATAAGCGAATGTCCCAATGAAA AAATGTAACCAATTAAACCAAGGTCTGTATTCATGAGCTGGATTACAACGGCATAATGCG ATAATTGGATTAATCAAAGCCAAAGAGAAGACAATTAAACCAAGTATTGGATGTATATAA TATGGATATGCTGTTGCTTGTGAATAGCCTTCACAATAGATAAAAATCAAAATTATACTA ATACACGTTAAACCGACACATATGCCTTGCAGTATTCTATGTGATTGAAACCAGACACGT TCACCTAATAGACCAGAATTAGGCCATACATCTTTGTAATAACGAGCTAGTATAATACCA ATACTAGCGCATAACACCCAAGCTAATACCATAAGACATCCATGAGTTTTAGCTATTGCA GAACCACGACCAATTATGCCTGTCATACTTCCGTAAATAGGTGAAGTAATGACAACCGGA CGTTGAGACACCGATTCTCCACCAGCGAAAGGACGACCGAATCCGTCTTTTTTACGTTCA ACACCACGAGTAACAATCAAATGGTATGCATTCGGTGATGTTAAATCCATTAATTGATGA ACTGTATCCAGTGGTCGAACACGTCGTCTAAAACGACATTGTAATGTACCATCCATTGCA TTAAATGTACCACCTAAATTCTCACCGTCTGTTATTAATAATTCTTCATCTGGTCCATTA TAAAAATTCGTAGTTTTACCAGCTATATCATTATATCCAGCTCGAATATTCACAGTATTT GTTGATGATTGATAATAACAACCAACAACCCCATCGTCACCTACTCTTTGATCTTTCGAG AAAGCCAGTGCTATAAAGCCTGTGACTTTCTGAATATTTCCTCTAAGCTCAAACTCCACG TAATTTTCAGACTTCACAGACACCAACTTCCAGGTGACGAGAAATGCACAAGATGATTCG GTACACATGGCGGGTCTCAAACATCCCTTTGTTAGAGCACACTCGTGCAATGTAATGTCG GGAAAAATGGCGTTAGCAAAGGTAGCTGACAAAGCCAAGTTAACAAGTACTGAAATCAGG AGGGACATGACTATGTAGCAAACAACAT



consensusID : consensus_10446#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 981
fasta sequence
                              [ATTGTCTGTACCAACAATGATGTTAGGTTTACGCATGCCTGCGGCTGGCCTACAACTACAATTTATTAATTATCCATTATGGATTTTAATATTTTTTGTAATCTTCCAATTTATGATTGAAATTATCCTGGAGATACATGGATGTTTCTATTATCGTCGAAATAAAAATAAGCGTCGGACATATGTACTAGAGATTGATCAATATCAAGCTGCAAAGCGTTTAAACAACGCACGTCAACCAAGACCTCCTGAACCGGAACCTTCTGGTCGCATGTTCAAATATTTCATAATTGGACTCCATGCTACAGTTTGCGCAATTGTTGCCGTTATCCTCGTTATAATCATAGCAGTTAATTAATAGTTATTTTCTGTTTAGCTTTTACACTACTTAACTGTTTTATCAGTAGTCTAAGTAACTATTGTAAATGTGCCTTATATACAAATGTCTTATCTATAACTGGCCATATTTCTTTAGGTTATCGTTTGCGTGTACTCAGTGTCTTTTCTTTCTTTAAATCTTAAACAATTTTTTCCGCGCATATATCCACGAATTTTTATTTTATCGCTAGATATATAAATAATGAATAGAATCTCAGCTTCCTTTATTCTGTAATATGTAAAACGTCATCCAGTTCGAAAAACATTTCACAAATGTTAAAAAAAGCAATGAAAATAATTTTCTTCATAAATAATAACCTTGAATGACGCAAGTTAGTTTGTTCTATTAGAGTTCCCTTGAAAAACTTTCTATCCTTCTAACTATTGCTTATAACTTGTCTTAACTTCATTTGGTTTTTTGTGCCTTCTTATTTTAAGAATTAATGGGATAAAAAAGGAGTAAATACGACTTACTTTTCAAGATTCTTCTTTAAAACAAAATAATTCATGTCGATGGGCACACACAAACACATTAGTTGGGACATACCACTTATGCACCACACTAATATTTATAANGCATTATTATTATTATTATTATTATTA]

[-] EMBL CD154017             [ATTGTCTGTACCAACAATGATGTTAGGTTTACGCATGCCTGCGGCTGGCCTACAACTACAATTTATTAATTATCCATTATGGATTTTAATATTTTTTGTAATCTTCCAATTTATGATTGAAATTATCCTGGAGATACATGGATGTTTCTATTATCGTCGAAATAAAAATAAGCGTCGGACATATGTACTAGAGATTGATCAATATCAAGCTGCAAAGCGTTTAAACAACGCACGTCAACCAAGACCTCCTGAACCGGAACCTTCTGGTCGCATGTTCAAATATTTCATAATTGGACTCCATGCTACAGTTTGCGCAATTGTTGCCGTTATCCTCGTTATAATCATAGCAGTTAATTAATAGTTATTTTCTGTTTAGCTTTTACACTACTTAACTGTTTTATCAGTAGTCTAAGTAACTATTGTAAATGTGCCTTATATACAAATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD193849             [                                                       CTACAATTTATTAATTATCCATTATGGATTTTAATATTTTTTGTAATCTTCCAATTTATGATTGAAATTATCCTGGAGATACATGGATGTTTCTATTATCGTCGAAATAAAAATAAGCGTCGGACATATGTACTAGAGATTGATCAATATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD078699             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCTGTTTAGCTTTTACACTACTTAACTGTTTTATCAGTAGTCTAAGTAACTATTGTAAATGTGCCTTATATACAAATGTCTTATCTATAACTGGCCATATTTCTTTAGGTTATCGTTTGCGTGTACTCAGTGTCTTTTCTTTCTTTAAATCTTAAACAATTTTTTCCGCGCATATATCCACGAATTTTTATTTTATCGCTAGATATATAAATAATGAATAGAATCTCAGCTTCCTTTATTCTGTAATATGTAAAACGTCATCCAGTTCGAAAAACATTTCACAAATGTTAAAAAAAGCAATGAAAATAATTTTCTTCATAAATAATAACCTTGAATGACGCAAGTTAGTTTGTTCTATTAGAGTTCCCTTGAAAAACTTTCTATCCTTCTAACTATTGCTTATAACTTGTCTTAACTTCATTTGGTTTTTTGTGCCTTCTTATTTTAAGAATTAATGGGATAAAAAAGGAGTAAATACGACTTACTTTTCAAGATTCTTCTTTAAAACAAAATAATTCATGTCGATGGGCACACACAAACACATTAGTTGGGACATACCACTTATGCACCACACTAATATTTATAANGCATTATTATTATTATTATTATTATTA]
[-] EMBL CD195735             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTGTCTTTTCTTTCTTTAAATCTTAAACAATTTTTTCCGCGCATATATCCACGAATCTTTATTTTATCGCTAGATATATAAATAATGAATAGAATCTCAGCTTCCTTTATTCTGTAATACGTAAAACGTCATCCAGTTCGAAAAACATTTCACAAATGTTAAAAAAAGCAATGAAAATAATTTTCTTCATAAATAATAACCTTGAATGTCGCAAGTTAGTTTGTTCTATT                                                                                                                                                                                                                                                               ]


>consensus_10446#1 ATTGTCTGTACCAACAATGATGTTAGGTTTACGCATGCCTGCGGCTGGCCTACAACTACA ATTTATTAATTATCCATTATGGATTTTAATATTTTTTGTAATCTTCCAATTTATGATTGA AATTATCCTGGAGATACATGGATGTTTCTATTATCGTCGAAATAAAAATAAGCGTCGGAC ATATGTACTAGAGATTGATCAATATCAAGCTGCAAAGCGTTTAAACAACGCACGTCAACC AAGACCTCCTGAACCGGAACCTTCTGGTCGCATGTTCAAATATTTCATAATTGGACTCCA TGCTACAGTTTGCGCAATTGTTGCCGTTATCCTCGTTATAATCATAGCAGTTAATTAATA GTTATTTTCTGTTTAGCTTTTACACTACTTAACTGTTTTATCAGTAGTCTAAGTAACTAT TGTAAATGTGCCTTATATACAAATGTCTTATCTATAACTGGCCATATTTCTTTAGGTTAT CGTTTGCGTGTACTCAGTGTCTTTTCTTTCTTTAAATCTTAAACAATTTTTTCCGCGCAT ATATCCACGAATTTTTATTTTATCGCTAGATATATAAATAATGAATAGAATCTCAGCTTC CTTTATTCTGTAATATGTAAAACGTCATCCAGTTCGAAAAACATTTCACAAATGTTAAAA AAAGCAATGAAAATAATTTTCTTCATAAATAATAACCTTGAATGACGCAAGTTAGTTTGT TCTATTAGAGTTCCCTTGAAAAACTTTCTATCCTTCTAACTATTGCTTATAACTTGTCTT AACTTCATTTGGTTTTTTGTGCCTTCTTATTTTAAGAATTAATGGGATAAAAAAGGAGTA AATACGACTTACTTTTCAAGATTCTTCTTTAAAACAAAATAATTCATGTCGATGGGCACA CACAAACACATTAGTTGGGACATACCACTTATGCACCACACTAATATTTATAANGCATTA TTATTATTATTATTATTATTA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10446#0      ATGCGTAAACCTAACATCATTGTTGGTACAGACAATATATAAGCGAATGTCCCAATGAAA 60
consensus_10446#1      ---------------------------------------------ATTGTCTGTACCAAC 15
                                                                    * ****   *  ** 

consensus_10446#0      AAATGTAACCAATTAAACCAAGGTCTGTATTCATGAGCTGGATTACAACGGCATAATGCG 120
consensus_10446#1      AA-TGATGTTAGGTTTACGCATGCCTGCG-------GCTGGCCTACAAC--TACAATTTA 65
                       ** **     *  *  **  * * ***         *****  ******   * ***   

consensus_10446#0      ATAATTGGATTAATCAAAGCCAAAGAGAAGACAATTAAAC---CAAGTATTGGATGTATA 177
consensus_10446#1      TTAATT--ATCCATTATGGATTTTAATATTTTTTGTAATCTTCCAATTTATGATTGAAAT 123
                        *****  **  ** *  *      * *       *** *   *** *  **  ** *  

consensus_10446#0      TAATATGGATATGCTGTTGCTTGTGAATAGCCTTCACAATAGATAAAAATCAAAATTATA 237
consensus_10446#1      TATCCTGGAGATACATGGATGTTTCTATTATCGTCG----AAATAAAAATAAGCGTCGGA 179
                       **   **** ** *       * *  **   * **     * ******** *   *   *

consensus_10446#0      CTAATACACGTTAAACCGACACATATGCCTTGCAGTATTCTATGTGATTGAAACCAGACA 297
consensus_10446#1      CATATGTACTAGAGATTGATCAATAT------CAAGCTGCAAAGCG-TTTAAACAACGCA 232
                       *  **  **   * *  **   ****      **   * * * * * ** **** *  **

consensus_10446#0      CGTTCACCTAATAGACCAGAATTAGGCCATACATCTTTGTAATAACGAGCTAGTATAATA 357
consensus_10446#1      CGTCAACCAAGACCTCCTGAACCGG-------AACCTTCTGGTCGCATGTTCAAATATTT 285
                       ***  *** *     ** ***   *       * * ** *  *  *  * *   *** * 

consensus_10446#0      CCAATACTAGCGCATAACACCCAAGCTAATACCATAA--GACATC-CATGAGTTTTAGCT 414
consensus_10446#1      C--ATAATTGGACTCCATGCTACAGTTTGCGCAATTGTTGCCGTTATCCTCGTTATAATC 343
                       *  *** * *  *   *  *   ** *    * **    * * *       *** **   

consensus_10446#0      ATTGCAGAACCACGACCAATTATGC-CTGTCATACTTCCGTAAATAGGTGAAGTAATGAC 473
consensus_10446#1      ATAGCAGT-TAATTAATAGTTATTTTCTGTTTAGCTTT--TACACTACTTAACTGTT--T 398
                       ** ****    *  *  * ****   ****    ***   ** *    * ** *  *   

consensus_10446#0      AACCGGACGTTGAGACACCGATTCTCCACCAGCGAAAGGACGACCGAATCCGTCTTTTTT 533
consensus_10446#1      TATCAGTAGTCTAAGTAACTATTGTAAATGTGCCTTATA--TACAAATGTCTTATCTATA 456
                        * * *  **  *   * * *** *  *   **   *     **  *   * * * * * 

consensus_10446#0      ACGTTCAACACCACGAGTAACAATCAAATGGTATGCATTCGGTGATGTTAAATCCATTAA 593
consensus_10446#1      ACTGGCCATATTTCTTTAGGTTATCGTTTG-CGTGTACTCAGTGTCTTTTCTTTCTTTAA 515
                       **   * * *   *        ***   **   ** * ** ***   **   * * ****

consensus_10446#0      TTGATGAACTGTATCCAGTGGTCGAACACGTCGTCTAAAACGACATTGTAATGTACCATC 653
consensus_10446#1      ATCTTAAACAATTTTTTCCG--CGCATATATC-CACGAATTTTTATTTTATCGCTAGATA 572
                        *  * ***  * *     *  ** * *  **     **     *** **  *    ** 

consensus_10446#0      CATTGCATTAAATGTACCACCTAAATTCTCACCGT-CTGTTATTAATAATTCTTCATCTG 712
consensus_10446#1      TAT-AAATAATGAATAGAATCTCAGCTTCCTTTATTCTGTAATATGTAAAACGTCATCCA 631
                        **   ** *    **  * ** *  *  *    * **** **   ***  * *****  

consensus_10446#0      GTCCATTATAAAAATTCGTAGTTTTACCAGCTATATCATTATATCCAGCTCGAATATTCA 772
consensus_10446#1      GTTCG----AAAAAC-----ATTTCACAA---ATGTTAAAAAAAGCAATGAAAATAAT-- 677
                       ** *     *****       *** ** *   ** * *  * *  **     **** *  

consensus_10446#0      CAGTATTTGTTGATGATTGATAATAACAACCAACAACCCCATCGTCACCTACTCTTTGAT 832
consensus_10446#1      -----TTTCTTCATAA---ATAATAACCTTGAATGACGCAA--GTTAG------TTTGTT 721
                            *** ** ** *   ********    **  ** * *  ** *       **** *

consensus_10446#0      CTTTCGAGAAAGCCAGTGCTATAAAGCCTGTGACTTTCTGAATATTTCCTCTAAGCTCAA 892
consensus_10446#1      CTATT-AGAGTTCCCTTG--AAAAACTTTCTATCCTTCTAACTATTGCTTATAACTT--G 776
                       ** *  ***   **  **  * ***   * *  * **** * **** * * ***  *   

consensus_10446#0      ACTCCACGTAATTTTCAGACTTCACAGACACCAACTTCCAGGTGACGAGAAATGCACAAG 952
consensus_10446#1      TCTTAACTTCATTT--GGTTTTTTGTGCCTTCTTATTTTAAG-AATTAATGGGATAAAAA 833
                        **  ** * ****   *  **    * *  *   **  * *  *  *       * ** 

consensus_10446#0      ATGATTCGGTACACATGGCGGGTCTCAAACATCCCTTTGTTAGAGCACACTCGTGCAATG 1012
consensus_10446#1      AGGAGTAAATACGACTTAC---TTTTCAAGATTCTTCT-TTAAAACAAAATAATTCATGT 889
                       * ** *   ***   *  *   * *  ** ** * * * *** * ** * *  * **   

consensus_10446#0      TAATGT-CGGGAAAAATGGCGTTAGCAAAGGTAGCTGACAAA---GCCAAGTTAACAAGT 1068
consensus_10446#1      CGATGGGCACACACAAACACATTAGTTGGGACATACCACTTATGCACCACACTAATATTT 949
                         ***  *    * **   * ****    *  *    **  *    ***   *** *  *

consensus_10446#0      ACTGAA-ATCAGGAGGGACATGACTATGTAGCAAACAACAT 1108
consensus_10446#1      ATAANGCATTATTATTATTATTATTAT-TATTA-------- 981
                       *      ** *  *     ** * *** **  *        




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)