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Schistosoma mansoni
cluster # 10583 cluster # 10583       Sequences # 18       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10583#0 length = 897 sequences # 18  

consensusID : consensus_10583#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 18
consensus length = 897
fasta sequence
                              [AACAC-GATTTCAATCCAGTGTTATATGTAACTTCCGACCACTATAAATAGGCATAACAATAATATAACGAGTAAAGTGGAAATTTAATTAAAGTTTTATA-TTTGAACATTAAACATTTTGAACAAGCAAAATGAACAAATCTATTTATGTACTAATTACTATCTCTATTGTTTGTGTAAACTGGATAACTCTAGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACTCCGTCAATGGCAACGACAACACAAAGACCGATAACTGAATCAGACAAAGA-GGATAATGAAGAACCAATAGTGGATGATTCAGATGACCAATCACCGTGTAGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACACGGTGATATTGATGGAAATGATCACATGGAATCCAATAGCCATGATGAAGATGATTATATGCCTGCAGATGATTATGATTTCCACCCAATCTATTCTTGGCTTGGAAGAGACGATTCTTTTCACCAACGTCCAAGAAAACCGTATCATAAACCTACGCGTAATACATGGTATTCACGATATGACACTTTCCCTTTCTAAAGTTCTCATAAATACTGAATGCAAAGTAATGATGTTATACCAAACATACATTTTTAATCAGTTATAATATTTTTTAATCATGACGTTTATATTGATCAACTTA-ACACCCAATAAATTACTACTTAC-ATCAACAGTAGTATGTC-TTATATATTAACTATTAGTGATTATGATTACTTTGATGTAAAATCTGAGTTCCTATTTTCATATTAAACAAGATT]

[+] EMBL CD065592             [AACAC GATTTCAATCCAGTGTTATATGTAACTTCCGACCACTATAAATAGGCATAACAATAATATAACGAGTAAAGTGGAAATTTAATTAAAGTTTTATA TTTGAACATTAAACATTTTGAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD128407             [AACACTGATTTCAATCCAGTGTTATATGTAACTTCCGACCACTATAAATAGGCATAACAATAATATAACGAGTAAAGTGGAAATTTAATTAAAGTTTTATA TTTGAACATTAAACATTTTGAACAAGCAAAATGAACAAATCTATTTATGTACTAATTACTATCTCTATTGTTTGTGTAAACTGGATAACTCTAGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACTCCGTCAATGGCAACGACAACACAAg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI975298             [               CCAGTGTTATATGTAACTTCCGACCACTATAAATAGGCATAACAATAATATAACGAGTAAAGTGGAAATTTAATTAAAGTTTTATA TTTGAACATTAAACATTTTGAACAAGCAAAATGAACAAATCTATTTATGTACTAATTACTATCTCTATTGTTTGTGTAAACTGGATAACTCTAGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACTCCGTCAATGGCAACGACAACACAAAGACCGATAACTGAATCAGACAAAGA GGATAATGAAGAACCAATAGTGGATGATTCAGATGACCAATCACCGTGTAGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACACGGTGATATTGATGGAAATGATCACATGGAATCCAATAGCCATGATGAAGATGATTATATGCCTGCAGATGATTATGATTTCCACCCAATCTATTCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD084371             [                                                                                      cgaggAAGTTTTATA TTTGAACATTAAACATTTTGAACAAGCAAAATGAACAAATCTATTTATGTACTAATTACTATCTCTATTGTTTGTGTAAACTGGATAACTCTAGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACTTCGTCAATGGCAACGACAACACAAAGACCGATAACTGAATCAGACAAAGA GGATAATGAAGAACCAATAGTGGATGATTCAGATGACCAATCACCGTGTAGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACACGGTGATATTGATGGAAATGATCACATGGAATCCAATAGCCATGATGAAGATGATTATATGCCTGCAGATGATTATGATTTCCACCCAATCTATTCTTGGCTTGGAAGAGACGATTCTTTTCANCAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD077705             [                                                                                        gaggAGTTTTATATTTTGAACATTAAACATTTTGAACAAGCAAAATGAACAAATCTATTTATGTACTAATTACTATCTCTATTGTTTGTGTAAACTGGATAACTCTAGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACTCCGTCAATGGCAACGACNACACAAAGACCGANTACTGAATCAGACAAAGAGGGAT ATGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD082045             [                                                                                               TTTATA TTTGAACATTAAACATTTTGAACAAGCAAAATGAACAAATCTATTTATGTACTAATTACTATCTCTATTGTTTGTGTAAACTGGATAACTCTAGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACACCGTCAATGGCAACGACAACACAAAGACCGATAACTGAATCAGACAAAGA GGATAATGAAGAACCAATAGTGGATGATTCAGATGACCAATCACCGTGTAGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACACGGTGATATTGATGGAAATGATCACATGGAATCCAATAGCCATGATGAAGATGATTATATGCCTGCAGATGATTATGATTTCCACCCAATCTATTCTTGGCTTGGAAGAGACGATTCTTTTCACCAACGTCCAAGAAAACCGTATCATAAACCTACGCGTAATACATGGTATTCACGATATGACACTTTCCCTTTCTAAAGTTCTCATAAATACTGAATGCAAAGTAATGATGTTATACCAAACATACATTNTTAATCAGTTATAATATTTTTTAATCATGACGTTTATATTGATCAACTTA ACACCCAAT AATTACTACTTAC ATCAACAGTAGTATGTC TTATATATTAACTATTAGTGATTATGATTACTTTGATGTANAATCTGAGTTCCTATTTTCATATTAAAACAGAT ]
[+] EMBL CD080316             [                                                                                                          acCATTAAACATTTTGAACAAGCAAAATGAACAAATCTATTTATGTACTAATTACTATCTCTATTGTTTGTGTAAACTGGATAACTCTAGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACTTCGTCAATGGCAACGACAACACAAAGACCGATAACTGAATCAGACAAAGA GGATAATGAAGAACCAATAGTGGATGATTCAGATGACCAATCACCGTGTAGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACACGGTGATATTGATGGAAATGATCACATGGAATCCAATAGCCATGATGAAGATGATTATATGCCTGCAGATGATTATGATTTCCACCCAATCTATTCTTGGCTTGGAAGAGACGATTCTTTTCACCAACGTCCAAGAAAACCGTATCATAAACCTACGCGTAATACATGGTATTCACGATATGACACTTTCCCTTTCTAAAGTTCTCATAAATACTGAATGCANAGTAATGATGTTATACCAAACATACATTNTTAGTCAGTTATAATATTTTTTAATCATGACGNTTATATTGATCAACTTACAC CCCCATAA  TACT                                                                                                    ]
[+] EMBL CD079069             [                                                                                                                     gTTTGAACAAGCAAAATGAACAAATCTATTTATGTACTAATTACTATCTCTATTGTTTGTGTAAACTGGATAACTCTAGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACTCCGTCAATGGCAACGACAACACAAAGACCGATAACTGAATCAGACAAAGA GGATAATGAAGAACCAATAGTGGATGATTCAGATGACCAATCACCGTGTAGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACACGGTGATATTGATGGAAATGATCACATGGAATCCAATAGCCATGATGAAGATGATTATATGCCTGCAGATGATTATGATTTCCACCCAATCTATTCTTGGCTTGGAAGAGACGATTCTTTTCACCAACGTCCAAGAAAACCGTATCATANACCTACGCGTAATACATGGTATTCACGATATGACACTTTCCCTTTCTAAAGTTCTCATAAATACTGAATGCAAAGTAATGATGTTATACCAAACATACATTNTTAATCAGTTATAATATTTTTTAAT                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD123278             [                                                                                                                            CAAGCAAAATGAACAAATCTATTTATGTACTAATTACTATCTCTATTGTTTGTGTAAACTGGATAACTCTAGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD095510             [                                                                                                                                  AAATGAACAAATCTTTTCCTGTACTAATTAATATAACTATTGTTTGCGTAAACTGGATAACTCTAGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACTTCGTCAATGTTTACGACAACACAAAGACCGATAACTGAATCAGACAAAGA GGATAATGAAGACCCAATAGTGGATGATTCAGATGACCAATCACCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD082965             [                                                                                                                                               TATTTATGTACTAATTACTATCTCTATTGTTTGTGTAAACTGGATAACTCTAGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACTTCGTCAATGGCAACGACAACACAAAGACCGATAACTGAATCAGACAAAGA GGATAATGAAGAACCAATAGTGGATGATTCAGATGACCAATCACCGTGTAGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACACGGTGATATTGATGGAAATGATCACATGGAATCCAATAGCCATGATGAAGATGATTATATGCCTGCAGATGATTATGATTTCCACCCAATCTATTCTTGGCTTGGAAGAGACGATTCTTTTCACCAACGTCCAAGAAAACCGTATCATA                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD194744             [                                                                                                                                                                                                  AGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD164131             [                                                                                                                                                                                                     TGCTAGGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACTCCGTCAATGGCAACGACAACAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD074236             [                                                                                                                                                                                                                               AAACTTCTGAAAGTGGAGACGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAATTTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACTTCGTCAATGGCAACGACAACACAAAGACCGATAACTGAATCAGACAAAGA GGATAATGAAGAACCAATAGTGGATGATTCAGATGACCAATCACCGTGTAGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACACGGTGATATTGATGGAAATGATCACATGGAATCCAATAGCCATGATGAAGATGATTATATGCCTGCAGATGATTATGATTTCCACCCAATCTATTCTTGGCTTGGAAGAGACGATTCTTTTCACCAACGTCCAAGAAAACCGTATCATAAACCTACGCGTAATACATGGTATTCACGATATGACACTTTCCCTTTCTAAAGTTCTCATAAATACTGAATGCAAAGTAATGATGTTATACCAAACATACATTTTTAGTCAGTTATAATATTTTTTAATCATGACGTTTATATTGATGAACTTA ACACCCAATAAAATACTA                                                                                                   ]
[-] EMBL CD075659             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAACGATCGACAACCTACTAAGACGACACCGTCAATGGCAACGACAACACAAAGACCGATAACTGAATCAGACAAAGA GGATAATGAAGAACCAATAGTGGATGATTCAGATGACCAATCACCGTGTAGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACACGGTGATATTGATGGAAATGATCACATGGAATCCAATAGCCATGATGAAGATGATTATATGCCTGCAGATGATTATGATTTCCACCCAATCTATTCTTGGCTTGGAAGAGACGATTCTTTTCACCAACGTCCAAGAAAACCGTATCATAAACCTACGCGTAATACATGGTATTCACGATATGACACTTTCCCTTTCTAAAGTTTTCATAAATACTGAATGCAAAGTAATGATGTTATACCAAACATACATTTTTAATCAGTTATAATATTTTTTAATCATGACGTTTATATTGATCAACTTA ACACCCAATAAATTACTACTTACAATCAACAGTAGTATGTCTTTATATATTAACTATTAGTGATTATGATTACTTTGATGTAAAATCTGAGTTCCTATTTTCATATTAAACAAGATT]
[-] EMBL CD073524             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATCGACAACCTATTAAGACGACTCCGTCAATGGCAACGACAACACAAAGACCGATAACTGAATCAGACAAAGA GGATAATGAAGAACCAATAGTGGATGATTCAGATGACCAATCACCGTGTAGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACACGGTGATATTGATGGAAATGATCACATGGAATCCAATAGCCATGATGAAGATGATTATATGCCTGCAGATGATTATGATTTCCACCCAATCTATTCTTGGCTTGGAAGAGACGATTCTTTTCACCAACGTCCAAGAAAACCGTATCATAAACCTACGCGTAATACATGGTATTCACGATATGACACTTTCCCTTTCTAAAGTTTTCATAAATACTGAATGCAAAGTAATGATGTTATACCAAACATACATTTTTAATCAGTTATAATATTTTTTAATCATGACGTTTATATTGATCAACTTA ACACCCAATAAATTACTACTTACAATCAACAGTAGTATGTCTTTATATATTAACTATTAGTGATTATGATTACTTTGATGTAAAATCTGAGTTCCTATTTTCATATTAAACAAGATT]
[+] EMBL CD120803             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAACTGAATCAGACAAAGA GGATAATGAAGAACCAATAGTGGATGATTCAGATGACCAATCACCGTGTGGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACACGGTGATATTGACGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD076548             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATGATTCAGATGACCAATCACCGTGTAGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACACGGTGATATTGATGGAAATGATCACATGGAATCCAATAGCCATGATGAAGATGATTATATGCCTGCAGATGATTATGATTTCCACCCAATCTATTCTTGGCTTGGAAGAGACGATTCTTTTCACCAACGTCCAAGAAAACCGTATCATAAACCTACGCGTAATACATGGTATTCACGATATGACACTTTCCCTTTTTAAAGTTTTCATAAATACTGAATGCAAAGTAATGATGTTATACCAAACATACATTTTTAGTCAGTTATAATATTTTTTAATCATGACGTTTATATTGATCAACTTA ACACCCAATAAATTACTACTCACAATCAACAGTAGTATGTCTTTATATATTAACTATTAGTGATTATGATTACTTTGATGTAAAATCTGAGTTCCTATTTTCATATTAAACAAGATT]


>consensus_10583#0 AACACGATTTCAATCCAGTGTTATATGTAACTTCCGACCACTATAAATAGGCATAACAAT AATATAACGAGTAAAGTGGAAATTTAATTAAAGTTTTATATTTGAACATTAAACATTTTG AACAAGCAAAATGAACAAATCTATTTATGTACTAATTACTATCTCTATTGTTTGTGTAAA CTGGATAACTCTAGATGCTAAGCCAGTTCACTTAAAAAGTGAAACTTCTGAAAGTGGAGA CGAACTTCTTGATATTAATAAGGATGATCAATATTCTGATTATGATGAACTAAAACGAAT TTTTCAAGAAGGCTCCATTAACGATCGACAACCTACTAAGACGACTCCGTCAATGGCAAC GACAACACAAAGACCGATAACTGAATCAGACAAAGAGGATAATGAAGAACCAATAGTGGA TGATTCAGATGACCAATCACCGTGTAGCTATGGAGGGACAGTATTCACATATACAATACA CGGTGATATTGATGGAAATGATCACATGGAATCCAATAGCCATGATGAAGATGATTATAT GCCTGCAGATGATTATGATTTCCACCCAATCTATTCTTGGCTTGGAAGAGACGATTCTTT TCACCAACGTCCAAGAAAACCGTATCATAAACCTACGCGTAATACATGGTATTCACGATA TGACACTTTCCCTTTCTAAAGTTCTCATAAATACTGAATGCAAAGTAATGATGTTATACC AAACATACATTTTTAATCAGTTATAATATTTTTTAATCATGACGTTTATATTGATCAACT TAACACCCAATAAATTACTACTTACATCAACAGTAGTATGTCTTATATATTAACTATTAG TGATTATGATTACTTTGATGTAAAATCTGAGTTCCTATTTTCATATTAAACAAGATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)