These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10668#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 19 consensus length = 1802 fasta sequence [CTCCGTCTTCATGTTCAGTTACTGCCTTGGCAGGTTTAGTAAATAGTTGTGCACCTGCATTACTCCATGTTGGAGCATTAGTTGGTGAACCCCATTTTGGTTGACTGTCTTTAGAGGCAGCATCACTCAACGTTGAAAAACTAATTAAACCCTTGACTTGTGGGATGTACATGGGAGACGATGAAGTTGTAACTACTTTTGTACACTGAACCTCGGTAGTTACGTTTTGCTGTTTGGAAGTTGGTGTGAGTTTAATGGTAGAATCACTATCTGAATATTCTGTAGCAGTAGTACAATTTTTTCTATTACTTTTCACAGCAGCTTCTAATAGTGCATCTTCTTCGGCCTCTTCTCGTGCTGTGAGATGCTCTGATTCACCAGTTA-TGTGACCATTTTCAAAACTGTAAAATTCATCAGGTAATTTAAGTCTACGAGCTCTAGATAATTGATCATCTGATACCTTTAAAGGAAGTTCAACGACAACTACATCAGAGTCCGTATCATCACCATTTTGATCTAGATCTACTGTTTCTTTATTCGACAGCTTTATTTCGCTTGATTGAGAATTTTTGGCACGGTTCTCAGCTGTTTGAACAGCTTCTTCAAAAAGCGATCGAAATTCATCACTATGTTCAGTAAGCTTAAAACGAGCTGCAAATGTCTCACGTCTACCTCCACCAACCAAATCAGACGAGTCGGTTTCGGTTGTTTTGTTAGCTTCATCAGGCTGCTCAGAGTAATCGATAGCCCACCAACTCCAAGCACGACCACCTCCAGTATTCATAGGTTTTAAATGCATACCAGCTCCGATCACATGATTACAGCATACTTTCAAGACATGATCACGACGCATCACACAACGTATTACACCAGTTATTGTAGAACGAAGTAATTTTAAATCACCAACTCCACGTTCGTGCCAAGTGTTATTGTCCCAACGATAAAGTTTGGCGCGCTGACAAAATATAACGTCATCATTTTCTTCTCCAGTTACAACTTTAATCTTTTGTGGCATAACTTCAAGCACAGGTTTAAATGTCAACTTCGAATCATCTAGAAGTTCGACTTTATCGTCATCATTATCGTCGTTGTGATGACTACTACTAAGAGTAGGAGTTGAAAAATTAACTGTCGATGGATTATTCGTTTCATTCAG-TTTAGAT-AATGCGTTACCAAAAGAAAAAGTGAATCCTGTACTGGGTGCAACTGTTTTTTTCTCGTTAGCTGACGCATTGGATACTAAAGGAGTAGAAAATGTAGGAATCGATGGTGCGCATACAGAAGAGTTTGTAGTGAATGGAGAAGTAAAAAGGAACGACTTTGTTACTGGTGTCTGAGATGATGATATAGGAGGAAATGCATTTGTAAGTTGCTTAGGAGAGGTGGCAACAAAACTGAATATAGGTTTATGTGCTATTGACGTTGTAACTGTTGCTGTGGCTATTGTAACAGAATCAGTAATATTAGCACTAGTAGTAGTCGTGAACTCTGGACCTTTTGTATTTCCAAATACAAAACCACCAGAATTTTGTAAAATGCCACCAAATAAAGATGTTGAAAGAGTAGCTTTAGAAGTAACAGTTGAATTTTCTCCTGAAGAGCCCGGTTTACCAGTGCAACATGCTGAGCACACAGTAATAGACGAGTCATGATACAGTAAACAAGTTGGACATTCCCATGAATCTAACTTAGGAGCANACTTTGATAGATCTATATTCGATGACGGTTTGATTGATTGAACAGTGTTTTTCGATTCGTCTACTTTTAATGGCTTAGTATTAACATTCACAGTTGATTGAATA] [-] EMBL CD197811 [CTCCGTCTTCATGTTCAGTTACTGCCTTGGCAGGTTTAGTAAATAGTTGTGCACCTGCATTACTCCATGTTGGAGCATTAGTTGGTGAACCCCATTTTGGTTGACTGTCTTTAGAGGCAGCATCACTCAACGTTGAAAAACTAATTAAACCCTTGACTTGTGGGATGTACATGGGAGACGATGAAGTTGTAACTACTTTTGTACACTGAACCTCGGTAGTTACGTTTTGCTGTTTGGAAGTTGGTGTGAGTTTAATGGTAGAATCACTATCTGAATATTCTGTAGCAGTAGTACAATTTTTTCTATTACTTTTCACAGCAGCTTCTAATAGTGCATCTTCTTCGGCCTCTTCTCGTGCTGTGAGATGCTCTGATTCACCAGTTAGTGTGACCATTTTCAAAACTGTAAAATTCATCAGGTAATTTAAGTCTACGAGCTCTAGATAA ] [-] EMBL CD120932 [ TGCTCTGATTCACCAGTTA TGTGACCATTTTCGAAACTGTAAAATTCATCAGGTAATTTAAGTCTACGAGCTCTAGATAATTGATCATCTGATACCTTTAAAGGAAGTTCAACGACAACTACATCAGAGTCCGTATCATCACCATTTTGATCTAGATCTACTGTTTCTTTATTCGACAGCTTTATTTCGCTTGATTGAGAATTTTTGGCACGGTTCTCAGCTGTTTGAACAGCTTCTTCAAAAAGCGATCGAAATTCATCACTATGTTCAGTAAGCTTAAAACGAGCTGCAAATGTCTCACGTCTACCTCCACCAACCAAATCAGACGAGTCGGTTTCGGTTGTTTTGTTAGCTTCATCAGGCTGCTCAGAGTAATCGATAGCC ] [-] EMBL CD121727 [ TGCTCTGATTCACCAGTTA TGTGACCATTTTCAAAACTGTAAAATTCATCAGGTAATTTAAGTCTACGAGCTCTAGATAATTGATCATCTGATACCTTTAAAGGAAGTTCAACGACAACTACATCAGAGTCCGTATCATCACCATTTTGATCTAGATCTACTGTTTCTTTATTCGACAGCTTTATTTCGCTTGATTGAGAATTTTTGGCACGGTTCTCAGCTGTTTGAACAGCTTCTTCAAAAAGCGATCGAAATTCATCACTATGTTCAGTAAGCTTAAAACGAGCTGCAAATGTCTCACGTCTACCTCCACCAACCAAATCAGACGAGTCGGTTTCGGTTGTTTTGTTAGCTTCATCAGGCTGCTCAGAGTAATCGATAGCC ] [-] EMBL CD115497 [ CTCTAGATAATTGATCATCTGATACC TTAAAGGAAGTTCAACGACAACTACATCAGAGTCCGTATCATCACCATTTTGATCTAGATCTACTGTTTCTTTATTCGACAGCTTTATTTCGCTTGATTGAGAATTTTTGGCACGGTTCTCAGCTGTTTGAACAGCTTCTTCAAAAAGCGATCGAAATTCATCACTATGTTCAGTAAGCTTAAAACGAGCTGCAAATGTCTCACGTCTACCTCCACCAACCAAATCAGACGAGTCGGTTTCGGTTGTTTTGTTAGCTTCATCAGGCTGCTCAGAGTAATCGATAGCCCACCAACTCCAAGCACGACCACCTCCAGTATTCATAGGGTGTGGAGGCATACCAGCTCCGATCACATGATTACAGCATACTTTCAAGACATGATCACCACGCATCACACAACGTATT CACCAGTTA AATAGAACAAAGTAATTT ] [-] EMBL CD115557 [ TAGATCTACTGTTTCTTTATTCGACAGCTTTATTTCGCTTGATTGAGAATTTTTGGCACGGTTCTCAGCTGTTTGAACAGCTTCTTCAAAAAGCGATCGAAATTCATCACTATGTTCAGTAAGCTTAAAACGAGCTGCAAATGTCTCACGTCTACCTCCACCAACCAAATCAGACGAGTCGGTTTCGGTTGTTTTGTTAGCTTCATCAGGCTGCTCAAAGTAATCGATAGCCCACCAACTCCAAGCACGACCACCTCCAGTATTCATAGGTTTTAAATGCATACCAGCTCCGATCACATGATTACAGCATACTTTCAAGACATGATCACGACGCATCACACAACGTATTACACCAGTTATTGTAGAACGAAGTAATTTTAAATCACCAACTCCACGTTCGTGCCAAGTGTTATTGTCCCAACGATAAAGTTTGGCGCGCTGACAAAATATAACGTCATCATTTTCTTCT ] [-] EMBL CD159341 [ TTTGGCACGGTTCTCAGCTGTTTGAACAGCTTCTTCAAAAAGCGATCGAAATTCATCACTATGTTCAGTAAGCTTAAAACGAGCTGCAAATGTCTCACGTCTACCTCCACCAACCAAATCAGACGAGTCGGTTTCGGTTGTTTTGTTAGCTTCATCAGGCTGCTCAGAGTAATCGATAGCCCACCAACTCCAAGCACGACCACCTCCAGTATTCATAGGTTTTAAATGCATACCAGCTCCGATCACATGATTACAGCATACTTTCAAGACATGATCACGACGCATCACACACCGTATTACACCAGTTATTGTAGAACGAAGTAATTTTAAATCACCAACTCCACGTTCGTGCCAAGTGTTATTGTCCCAACGATAAAGTTTGGCGCGCTGACAAAATATAACGTCATCATTTTCTTCTCCAGTTACAACTTTAATCTTTTGTG ] [+] EMBL CD130754 [ ATCGAAATTCATCACTATGTTCAGTAAGCTTAAAACGAGCTGCAAATGTCTCACGTCTACCTCCACCAACCAAATCAGACGAGTCGGTTTCGGTTGTTTTGTTAGCTTCATCAGGCTGCTCAGAGTAATCGATAGCCCACCAACTCCAAGCACGACCACCTCCAGTATTCATAGGTTTTAAATGCATACCAGCTCCGATCACATGATTACAGCATACTTTCAAGACATGATCACGACGCATCACACAACGTATTACACCAGTTATTGTAGAACGAAGTAATTTTAAATCACCAACTCCACGTTCGTGCCAAGTGTTATTGTCCCAACGATAAAGTTTGGCGCGCTGACAAAATATAACGTCATCAT ] [-] EMBL CD194663 [ ACGTCTACCTCCACCAACCAAATCAGACGAGTCGGTTTCGGTTGTTTTGTTAGCTTCATCAGGCTGCTCAGAGTAATCGATAGCCCACCAACTCCAAGCACGACCACCTCCAGTATTCATAGGTTTTA ] [+] EMBL CD094351 [ TAGGTTTTAAATGCATACCAGCTCCGATCACATGATTACAGCATACTTTCAAGACATGACCACGGCGCATCACACAACGTATTACACCAGTTATTGTAGAACGAAGTAATTTTAAATCACCAACTCCACGTTCGTGCCAAGTGTTATTGTCCCAACGATAAAGTTTGGCGCGCTGACAAAATATAACGTCATCATTTTCTTCTCCAGTTACAACTTTAATCTTTTGTGGCATAACTTCAAGCACAGGTTTAAATGTCAACTTCGAATCATCTAGAAGTTCGACTTTATCGTCATCATTATCGTCGTTGTGATGACTACTACTAAGAGTAGGAGTTGAAAAATTAACTGTCGATGGATTATTCGTTTCATTCAG TTTAGAT AATGCGTTACCAAAAGAAAAAGTGAATCCTGTACTGGGTGCAACTGTTTTTTTCTCGTTAGCTGACGCATTGGATACTAAAGGAGTAGAAAATGTAGGAATCGATGGTGCGCATACAGAAGAGTTTGTAGTGAATGGAGAAGT AAAAGGGACGACTNTGTTACTGGTGTCTGAGATGATGATATAGGAGGAAATGCATTTGTAAG ] [+] EMBL CD070252 [ ATGATTACAGCATACTTTCAAGACATGATCACGACGCATCACACAACGTATTACACCAGTTATTGTAGAACGAAGAAATTTTAAATCACCAACTCCACGTTCGTGCCAAGTGTTATTGTCCCAACGATAAAGTTTGGCGCGCTGACAAAATATAACGTCATCATTTTCTTCTCCAGTTACAACTTTAATCTTTTGTGGCATAACTTCAAGCACAGGTTTAAATGTCAACTTCGAATCATCTAGAAGTTCGACTTTATCGTCATCATTATCGTCGTTGTGATGACTACTACTAAGAGTAGGAGTTGAAAAATTAACTGTCGATGGATTATTCGTTTCATTCAGNTTTAGAT ATGCGTTACCAAAAGAAna ] [+] EMBL CD070205 [ ATGATTACAGCATACTTTCAAGACATGATCACGACGCATCACACAACGTATTACACCAGTTATTGTAGAACGAAGTAATTTTAAATCACCAACTCCACGTTCGTGCCAAGTGTTATTGTCCCAACGATAAAGTTTGGCGCGCTGACAAAATATAACGTCATCATTTTCTTCTCCAGTTACAACTTTAATCTTTTGTGGCATAACTTCAAGCACAGGTTTAAATGTCAACTTCGAATCATCTAGAAGTTCGACTTTATCGTCATCATTATCGTCGTTGTGATGACTACTACTAAGAGTAGGAGTTGAAAAATTAACTGTCGATGGATTATTCGTTTCATTCAG TTTAGATAAATGCG TACCAAAAG ] [-] EMBL CD070311 [ TGATTACAGCATAC TTCAAGACATGATCACGACGCATCACACAACGTATTACACCAGTTATTGTAGAACGAAGTAATTTTAAATCACCAACTCCACGTTCGTGCCAAGTGTTATTGTCCCAACGATAAAGTTTGGCGCGCTGACAAAATATAACGTCATCATTTTCTTCTCCAGTTACAACTTTAATCTTTTGTGGCATAACTTCAAGCACAGGTTTAAATGTCAACTTCGAATCATCTAGAAGTTCGACTTTATCGTCATCATTATCGTCGTTGTGATGACTACTACTAAGAGTAGGAGTTGAAAAATTAACTGTCGATGGATTATTCGTTTCATTCAG TTTAGAT AATGCGTTACCAAAAGAAAAA ] [-] EMBL CD070292 [ TGATTACAGCATACTTCAAAGACATGATCACGACGCATCACACAACGTATTACACCAGTTATTGTAGAACGAAGTAA TTTAAATCACCAACTCCACGTTCGTGCCAAGTGTTATTGTCCCAACGATAAAGTNTGGCGCGCTGACAAAATATAACGTCATCATTTTCTTCTCCAGTTACAACTTTAATCTTTTGTGGCATAACTTCAAGCACAGGTTTAAATGTCAACTTCGAATCATCTAGAAGTTCGACTTTATCGTCATCATTATCGTCGTTGTGATGACTACTACTAAGAGTAGGAGTTGAAAAATTAACTGTCGATGGATTATTCGTTTCATTCAG TTTAGAT AATGCGTTACCAAAAGAAAAA ] [-] EMBL CD070244 [ TACTTTCAAGACATGATCACGACGCATCACATAACGTATTACACCAGTTATTGTAGAACGAAGTAATTTTAAATCACCAACTCCACGTTCGTGCCAAGTGTTATTGTCCCAACGATAAAGTTTGGCGCGCTGACAAAATATAACGTCATCATTTTCTTCTCCAGTTACAACTTTAATCTTTTGTGGCATAACTTCAAGCACAGGTTTAAATGTCAACTTCGAATCATCTAGAAGTTCGACTTTATCGTCATCATTATCGTCGTTGTGATGACTACTACTAAGAGTAGGAGTTGAAAAATTAACTGTCGATGGATTATTCGTTTCATTCAG CTTAGAT AATGCGTTACCAAAAGAAAAA ] [-] EMBL CD070449 [ GACGCATCACACAACGTATTACACCAGTTATTGTAGAACGAAGTAATTTTAAATCACCAACTCCACGTTCGTGCCAAGTGTTATTGTCCCAACGATAAAGTNTGGCGCGCTGACAAAATATAACGTCATCATTTTCTTCTCCAGTTACAACTTTAATCTTTTGTGGCATAACTTCAAGCACAGGTTTAAATGTCAACTTCGAATCATCTAGAAGTTCGACCTTATCGTCATCATTATCGTCGTTGTGATGACTACTACTAAGAGTAGGAGTTGAAAAATTAACTGTCGATGGATTATTCGTTTCATTCAG TTTAGAT AATGCGTTACCAAAAGAAAAA ] [-] EMBL CD166068 [ AAAGTGAATCCTGTACTGGGTGCACCTGTTTTTTTCTCGTTAGCTGACGCATTGGATACTAAAGGAGTAGAAAATGTAGGAATCGATGGTGCGCATACAGAAGAGTTAGTAGTGAATGGAGAAGTAAAAAGGAACGCCTTTGTTACTGGTGTCTGAGATGATGATATAGGAGGAAATGCATTTGTAAGT ] [+] EMBL CD189795 [ cTTTTTTCTCGTTAGCTGACGCATTGGATACCAAAGGAGTAGAAAATGTAGGAATCGATGGTGCGCATACAGAAGAGTTTGTAGTGAATGGAGAAGTAAAAAGGAACGACTTTGTTACTGGTGTCTGAGATGATGATATAGGAGGAAATGCATTTGTAAGTTGCTTAGGAGAGGTGGCAACAAAACTGAATATAGGTTTATGTGCTATTGACGTTGTAACTGTTGCTGTGGCTATTGTAACAGAATCAGTAATATTAGCACTAGTAGTAGTCGTGAACTCTGGACCTTTTGTATTTCCAAATACAAAACCACCAGAATTTTGTAAAATGCCACCAAATAAAGATGTTGAAAGAGTAGCTTTAGAAGTAACAGTTGAATTTTCTCCTGAAGAGCCCGGTTTACCAGTGCAACATGCTGAGCACACAGTAATAGACGAGTCATGATACAGTAAACAAGTTGGACATTCCCATGAATCTAACTTAGGAGCANACTTTGATAGATCTA ] [-] EMBL CD132714 [ GATGATATAGGAGGAAATGCATTTGTAAGTTGCTTAGGAGAGGTGGCAACAAAACTGAATATAGGTTTATGTGCTATTGACGTTGTAACTGTTGCTGTGGCTATTGTAACAGAATCAGTAATATTAGCACTAGTAGTAGTCGTGAACTCTGGACCTTTTGTATTTCCAAATACAAAACCACCAGAATTTTGTAAAATGCCACCAAATAAAGATGTTGAAAGAGTAGCTTTAGAAGTAACAGTTGAATTTTCTCCTGAAGAGCCCGGTTTACCAGTGCAACATGCTGAGCACACAGTAATAGGCGAGTCATGATACAGTAAACAAGTTGGACATTCCCATGGATCTAATTTAGGAGCAAACTTTGATAGATCTATATTCGATGACGGTTTGATTGATTGAACAGTGTTTTTCGATTCGTCTACTTTTAATGGCTTAGTATTAACATTCACAGTTGATTGAATA] [+] EMBL CD149362 [ AGGAGGAAATGCATTTGTAAGTTGCTTAGGAGAGGTGGCAACAAAACTGAATATAGGTTTATGTGCTATTGACGTTGTAACTGTTGCTGTGGCTATTGCAACAGAATCAGTAATATTAGCACTAGTAGTAGTCGTGAACTCTGGACCTTTTGTATTTCCAAATACAAAACCACCAGAATTTTGTAAAATGCCACCAAATAAAGATGTTGAAAGAGTAGCTTTAGAAGTAACAGTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||