cluster # 1916

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Schistosoma mansoni
cluster # 1916 cluster # 1916 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1916#0 length = 945 sequences # 2

consensusID : consensus_1916#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 945
fasta sequence

                              [GCGCTTTCATACAATCAAAAAGTGATTCTGTTCGAGAGTATTTATAATAATTTTACACTGAATCATGTGCAATGGAATTTGTATACAGTTGCTTTCCTACTGCTTCATTCATGTAAACTAATGATCTATAAACCTTCACTGATAAAAAGTTGTCTAGCTAAAATATCACGTAAACTACGAATATCAGCTTATCATCCTACTATAAATCAATCCCAGTGGATTAACGCTATCCTTGCTGCTTTAGCTAATTACACTGTTAGTTTTAATGGTGCAAGTGGAAATTGTGAAGAAGAATTACAATATTTCATTAAACCACCTTGTCGTAATCACAACAACAATACAATGTCAATATCTAAAACCATATGTGTTCCGTACGACGTATTTACTGCTGATTGNGTCCGCACATTATTCAGTAATATATGTCAGCATGTCACAAGTCAAGAAATAGTAGATTATAATTCTTTGAAGTGTTTAGCACAGATTACTTATTCCTTGTCTTTGTTTGGTTACAAGGCGGATTCCCTTATTGAACATTTTGATAAAGCAATAAAAAAAACTTAACAATGATGCTTCCTCTAACATATCGACATCATCAACAACTGACTTTTGTCAACTACAACTATATATAAATATGGCTAAATGTCTACTTACCCCACTTTCTAAAAATAGTAGTGAAACTGAAAAACTATCGATTTCTTCATTACCTAGTGACTATTGGAGATTTTATTATCATTGTGGTCTTGGACTTTTACAAAGCAATGAAATAAACGATCCAGTGATTTCTAAAAAAATGGTGAATAAAAGAAAAGTCGTGGATAGAATACACTATGCGTTCCTTAAAAATAATAAACTGTTCACAGAATTAAGTATGAATGCATTTCAGTGTATACTGTATCCTAATAGTGATAACAGTAATGTATACCTTGCAGATATTCTCTTTAAACA]

[+] EMBL CD080078             [GCGCTTTCATACAATCAAAAAGTGATTCTGTTCGAGAGTATTTATAATAATTTTACACTGAATCATGTGCAATGGAATTTGTATACAGTTGCTTTCCTACTGCTTCATTCATGTAAACTAATGATCTATAAACCTTCACTGATAAAAAGTTGTCTAGCTAAAATATCACGTAAACTACGAATATCAGCTTATCATCCTACTATAAATCAATCCCAGTGGATTAACGCTATCCTTGCTGCTTTAGCTAATTACACTGTTAGTTTTAATGGTGCAAGTGGAAATTGTGAAGAAGAATTACAATATTTCATTAAACCACCTTGTCGTAATCACAACAACAATACAATGTCAATATCTAAAACCATATGTGTTCCGTACGACGTATTTACTGCTGATTGNGTCCGCACATTATTCAGTAATATATGTCAGCATGTCACAAGTCAAGAAATAGTAGATTATAATTCTTTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD145479             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTATTCAGTAATATATGTCAGCATGTCACAAGTCAAGAAATAGTAGATTATAATTCTTTGAAGTGTTTAGCACAGATTACTTATTCCTTGTCTTTGTTTGGTTACAAGGCGGATTCCCTTATTGAACATTTTGATAAAGCAATAAAAAAAACTTAACAATGATGCTTCCTCTAACATATCGACATCATCAACAACTGACTTTTGTCAACTACAACTATATATAAATATGGCTAAATGTCTACTTACCCCACTTTCTAAAAATAGTAGTGAAACTGAAAAACTATCGATTTCTTCATTACCTAGTGACTATTGGAGATTTTATTATCATTGTGGTCTTGGACTTTTACAAAGCAATGAAATAAACGATCCAGTGATTTCTAAAAAAATGGTGAATAAAAGAAAAGTCGTGGATAGAATACACTATGCGTTCCTTAAAAATAATAAACTGTTCACAGAATTAAGTATGAATGCATTTCAGTGTATACTGTATCCTAATAGTGATAACAGTAATGTATACCTTGCAGATATTCTCTTTAAACA]




>consensus_1916#0
GCGCTTTCATACAATCAAAAAGTGATTCTGTTCGAGAGTATTTATAATAATTTTACACTG
AATCATGTGCAATGGAATTTGTATACAGTTGCTTTCCTACTGCTTCATTCATGTAAACTA
ATGATCTATAAACCTTCACTGATAAAAAGTTGTCTAGCTAAAATATCACGTAAACTACGA
ATATCAGCTTATCATCCTACTATAAATCAATCCCAGTGGATTAACGCTATCCTTGCTGCT
TTAGCTAATTACACTGTTAGTTTTAATGGTGCAAGTGGAAATTGTGAAGAAGAATTACAA
TATTTCATTAAACCACCTTGTCGTAATCACAACAACAATACAATGTCAATATCTAAAACC
ATATGTGTTCCGTACGACGTATTTACTGCTGATTGNGTCCGCACATTATTCAGTAATATA
TGTCAGCATGTCACAAGTCAAGAAATAGTAGATTATAATTCTTTGAAGTGTTTAGCACAG
ATTACTTATTCCTTGTCTTTGTTTGGTTACAAGGCGGATTCCCTTATTGAACATTTTGAT
AAAGCAATAAAAAAAACTTAACAATGATGCTTCCTCTAACATATCGACATCATCAACAAC
TGACTTTTGTCAACTACAACTATATATAAATATGGCTAAATGTCTACTTACCCCACTTTC
TAAAAATAGTAGTGAAACTGAAAAACTATCGATTTCTTCATTACCTAGTGACTATTGGAG
ATTTTATTATCATTGTGGTCTTGGACTTTTACAAAGCAATGAAATAAACGATCCAGTGAT
TTCTAAAAAAATGGTGAATAAAAGAAAAGTCGTGGATAGAATACACTATGCGTTCCTTAA
AAATAATAAACTGTTCACAGAATTAAGTATGAATGCATTTCAGTGTATACTGTATCCTAA
TAGTGATAACAGTAATGTATACCTTGCAGATATTCTCTTTAAACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case