Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 2818 cluster # 2818       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2818#0 length = 385 sequences # 2  
consensusID : consensus_2818#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 385
fasta sequence 
                              [ACAAAACAA-GTGGGAGAGATAATGATGTAATCATTACATCAAGTTTGGATGAAAAATTTATTTAAAAGAATACTTTCCGTTTAATTGTGTTTTTCAATAATTTATCTTCATAACACTTTTATAAGGTTAAACATCAAACCTTAAAATCCTAGTGAGTAAGATAAGGACTTGACAGGATTTAATTAATTGTCGATTAACGGTTGCCAGTCGTGAAACTAAATATTAATTTTAAAGATATGTACTATGACAGGGTATATATATTAATATAACAAGAATTTACTTGTTGTGGTTAAGCATTTACTCTGAGTAATTCTTTAGAAATATTTCAAGTAACCCATGTGTTACCTGATCTGTGTATGAGTGCTTTCAATTTTATATTTCTTTA]

[+] EMBL CD067382             [ACAAAACAA GTGGGAGAGATAATGATGTAATCATTACATCAAGTTTGGATGAAAAATTTATTTAAAAGAATACTTTCCGTTTAATTGTGTTTTTCAATAATTTATCTTCATAACACTTTTATAAGGTTAAACATCAAACCTTAAAATCCTAGTGAGTAAGATAAGGACTTGACAGGATTTAATTAATTGTCGATTAACGGTTGCCAGTCGTGAAACTAAATATTAATTTTAAAGATATGTACTATGACAGGGTATATATATTAATATAACAAGAATTTACTTGTTGTGGTTAAGCATTTACTCTGAGTAATTCTTTAGAAATATTTCAAGTAACCCATGTGTTACCTGATCTGTGTATGAGTGCTTTCAATTTTATATTTCTTTA]
[+] EMBL CD067506             [gggAAACAAGGTGGGAGAGATAATGATGTAATCATTAGATCAAGTTTGGATGAAAAATTTATTTAAAAGAATACTTTCCGTTTAATTGTGTTTTTCAATAATTTATCTTCATAACACTTTTAGAAGGTTAAACATCAAACCTTAAAATCCTAGTGAGTAAGATAAGGACTTGACAGGATTTAATTAATTGTCGATTAACGGTTGCCAGTCGTGAAACTAAATATTAATTTTAAAGATATGTACTATGACAGGGTATATATATTAATATAACAAGAATTTACTTGTTGGGGTTAAGCATTTACTCTGAGTAATTCTTTAGAAATATTTCAAGTAACCCATGTGTTACCTGATCTGTGTATGAGTGCTTTCAATTTTATATTTC    ]




>consensus_2818#0
ACAAAACAAGTGGGAGAGATAATGATGTAATCATTACATCAAGTTTGGATGAAAAATTTA
TTTAAAAGAATACTTTCCGTTTAATTGTGTTTTTCAATAATTTATCTTCATAACACTTTT
ATAAGGTTAAACATCAAACCTTAAAATCCTAGTGAGTAAGATAAGGACTTGACAGGATTT
AATTAATTGTCGATTAACGGTTGCCAGTCGTGAAACTAAATATTAATTTTAAAGATATGT
ACTATGACAGGGTATATATATTAATATAACAAGAATTTACTTGTTGTGGTTAAGCATTTA
CTCTGAGTAATTCTTTAGAAATATTTCAAGTAACCCATGTGTTACCTGATCTGTGTATGA
GTGCTTTCAATTTTATATTTCTTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)