cluster # 3784

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 3784 cluster # 3784 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3784#0 length = 743 sequences # 2

consensusID : consensus_3784#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 743
fasta sequence

                              [CGGAATCTTGAAGAAGCTGGTGGTGATAAAACTCTTATTGGATCCACGAGTTTAGCTACACTTCAACAATTCTCCTCTCTTAAATACCAATACTTACCAACACTTCCAGTGTTATTGGCATTTTTAGATTTTATGAAAGATCAAGGATATTTGGTGAATCGATTACACGAATTGGCTAGAGAAAGCTGTCTTCAAGAGTTTCGTTGGGATTCTGGATCAAAAAGTACTGAATGGCCATGGAAAGAACATTTACCATCTGATAGCATTATTCTGTTACATTTATTTGCTACTTATATGGATACACGTATGCCACCACATCCCAAATGTTTATCTGGTCGTGTATTTAGTCAATTGAATGTTGTTCGACTTCCAGATAAACCTGATTTAAAAAGTAAACATAATTGTCAATTTTATCAAGTTGCTGTACAACCACCTCAATTTAAATTAGTATTAAATGGAAGAATATACAATTTAATTTCTGGTCCCAAAAATATCTATCATGCCATCTTATTATTCTTTCATTATTATGNAACAAGGAATGANNAGTTTAGATCCGTTTCACTTGGTCCATCAGGTTTAAATGTTGCATGGATATTNTCTAAAAATTGATTGTANTTACCCACCACANCANCAAAC-AAAAAAAAGAAAGATATTAACTGGAAAA-AACTTTTTGGATTG-GGATATGNATTCT-CTTATCTAA-TATTGANG-TTCATGGTAAT-CATTGGNATCAAA--GGAAAGTTTGT]

[+] EMBL CD078911             [CGGAATCTTGAAGAAGCTGGTGGTGATAAAACTCTTATTGGATCCACGAGTTTAGCTACACTTCAACAATTCTCCTCTCTTAAATACCAATACTTACCAACACTTCCAGTGTTATTGGCATTTTTAGATTTTATGAAAGATCAAGGATATTTGGTGAATCGATTACACGAATTGGCTAGAGAAAGCTGTCTTCAAGAGTTTCGTTGGGATTCTGGATCAAAAAGTACTGAATGGCCATGGAAAGAACATTTACCATCTGATAGCATTATTCTGTTACATTTATTTGCTACTTATATGGATACACGTATGCCACCACATCCCAAATGTTTATCTGGTCGTGTATTTAGTCAATTGAATGTTGTTCGACTTCCAGATAAACCTGATTTAAAAAGTAAACATAATTGTCAATTTTATCAAGTTGCTGTACAACCACCTCAATTTAAATTAGTATTAAATGGAAGAATATACAATTTAATTTCTGGTCCCAAAAATATCTATCATGCCATCTTATTATTCTTTCATTATTATGNAACAAGGAATGANNAGTTTAGATCCGTTTCACTTGGTCCATCAGGTTTAAATGTTGCATGGATATTNTCTAAAAATTGATTGTANTTACCCACCACANCANCAAAC AAAAAAAAGAAAGATATTAACTGGAAAA AACTTTTTGGATTG GGATATGNATTCT CTTATCTAA TATTGANG TTCATGGTAAT CATTGGNATCAAA  GGAAAGTT   ]
[-] EMBL CD073369             [                                                                                                                                                                                                                 TTCTGGATCAAAAAGTACTGAATGGCCATGGAAAGAACATTTACCATCTGATAGCATTATTCTGTTACATTTATTTGCTACTTATATGGATACACGTATGCCACCACATCCCAAATGTTTATCTGGTCGTGTATTTAGTCAATTGAATGTTGTTCGACTTCCAGATAAACCTGATTTAAAAAGTAAACATAATTGTCAATTTTATCAAGTTGCTGTACAACCACCTCAATTTAAATTAGTATTAAATGGAAGAATATACAATTTAATTTCTGGTCCCAAAAATATCTATCATGCCATCTTATTATTCTTTCATTATTATGTAACAAGGAATGAAAAGTTTAGATCCGTTTCACTTGGTCCATCAGGTTTAAATGTTGCATGGATATTTTCTAAAAATTGATTGTAATTACCAACCACAACAACAAACAAAAAAAAAGAAAGATATTAACTGTAAAATAACTTTTTGTATTGTGTATATGTATTCTCCTTATCTAATTATTGATGTTTCATGTTTATCCATTGTATTCAAAATGTAGAGTTTGT]




>consensus_3784#0
CGGAATCTTGAAGAAGCTGGTGGTGATAAAACTCTTATTGGATCCACGAGTTTAGCTACA
CTTCAACAATTCTCCTCTCTTAAATACCAATACTTACCAACACTTCCAGTGTTATTGGCA
TTTTTAGATTTTATGAAAGATCAAGGATATTTGGTGAATCGATTACACGAATTGGCTAGA
GAAAGCTGTCTTCAAGAGTTTCGTTGGGATTCTGGATCAAAAAGTACTGAATGGCCATGG
AAAGAACATTTACCATCTGATAGCATTATTCTGTTACATTTATTTGCTACTTATATGGAT
ACACGTATGCCACCACATCCCAAATGTTTATCTGGTCGTGTATTTAGTCAATTGAATGTT
GTTCGACTTCCAGATAAACCTGATTTAAAAAGTAAACATAATTGTCAATTTTATCAAGTT
GCTGTACAACCACCTCAATTTAAATTAGTATTAAATGGAAGAATATACAATTTAATTTCT
GGTCCCAAAAATATCTATCATGCCATCTTATTATTCTTTCATTATTATGNAACAAGGAAT
GANNAGTTTAGATCCGTTTCACTTGGTCCATCAGGTTTAAATGTTGCATGGATATTNTCT
AAAAATTGATTGTANTTACCCACCACANCANCAAACAAAAAAAAGAAAGATATTAACTGG
AAAAAACTTTTTGGATTGGGATATGNATTCTCTTATCTAATATTGANGTTCATGGTAATC
ATTGGNATCAAAGGAAAGTTTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case