cluster # 4429

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Schistosoma mansoni
cluster # 4429 cluster # 4429 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4429#0 length = 850 sequences # 3

consensusID : consensus_4429#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 850
fasta sequence

                              [GTAAGCATATCCATACTACCCCTATGTATACCTAAAAGGATCTCTTTTGTTATGTTGCTTACAGTAATCTTAAAGAACTAATTGATGCTAGGCATATTATAATATTACTCTTTTTTAACATCACTAATCATGCATAACGACTTCTATTAGTGAGTATGTTTCTATGTACAAATGGAATATGTTTTCAACTGTATCCTGTCTCTCTCTCGCACACACACACACACACCTACAAGTGGATGTCAATACATAATCAGTTTTGTTGATTTAGGTAGACATCATCAATAATTAGTAGAATGAATGTGATTGTCACATTGTATCATTACTATTGTTGATGGTGTTGTTCCCTTTTTTATTCCCGGTACATTCATTTAACGATTGTAAATTCGTATTCATTATTCTGTTTTATTATTAGTGACAGTATGTTTTGTAATACTATTGATAATAATAATAATGTTACTGTATGTATCATGTTAAGTAAAAGTATGATTTCACCAGTTTGATTCGAGTCTCAAACTAGGACGAAACGGCCGTCCAGGTTTTCCATAGTAGTCTAGCTTTATTCGACTCATGAATTCAATTATTAAATTGCTACAAACTCCATAAAACCCCCTTTTTGATATATTTAAGTAAATAACTTGTTGTAATTACCTTGTGTTTGGTGCGTGCTAACGAGTCGGATGCCACAGTTGACTTCCAACTCCTCCGAGCCACTAGCAACGAAAAGTCTGATATGAGTGAAATGATCTGAAGCTGATGACACTCGAACTAGTGATATAATATGGAAAGGAGTGTCGGTCGATGGGCCGTGTTTTTTGAGCAATATTTCAGGTGATGTGTTACCCCACCGATA]

[+] EMBL CD081307             [GTAAGCATATCCATACTACCCCTATGTATACCTAAAAGGATCTCTTTTGTTATGTTGCTTACAGTAATCTTAAAGAACTAATTGATGCTAGGCATATTATAATATTACTCTTTTTTAACATCACTAATCATGCATAACGACTTCTATTAGTGAGTATGTTTCTATGTACAAATGGAATATGTTTTCAACTGTATCCTGTCTCTCTCTCGCACACACACACACACACCTACAAGTGGATGTCAATACATAATCAGTTTTGTTGATTTAGGTAGACATCATCAATAATTAGTAGAATGAATGTGATTGTCACATTGTATCATTACTATTGTTGATGGTGTTGTTCCCTTTTTTATTCCCGGTACATTCATTTAACGATTGTAAATTCGTATTCATTATTCTGTTTTATTATTAGTGACAGTATGTTTTGTAATACTATTGATAATAATAATAATGTTACTGTATGTATCATGTTAAGTAAAAGTATGATTTCACCAGTTTGATTCGAGTCTCAAACTAGGACGAAACGGCCGTCCAGGTTTTCCATAGTAGTCTAGCTTTATTCGACTCATGAATTCAATTATTAAATTGCTA                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD075139             [ TAAGCATATCCATACTACCCCTATGTATACCTAAAAGGATCTCTTTTGTTATGTTGCTTACAGTAATCTTAAAGAACTAATTGATGCTAGGCATATTATAATATTATTCTTTTTTAACATCACTAATCATGCATAACGACTTCTATTAGTGAGTATGTTTCTATGTACAAATGGAATATGTTTTCAACTGTATCCTGTCTCTCTCTCGCACACACACACACACACCTACAAGTGGATGTCAATACATAATCAGTTTTGTTGATTTAGGTAGACATCATCAATAATTAGTAGAATGAATGTGATTGTCACATTGTATCATTACTATTGTTGATGGTGTTGTTCCCTTTTTTATTCCCGGTACATTCATTTAACGATTGTAAATTCGTATTCATTATTCTGTTTTATTATTAGTGACAGTATGTTTTGTAATACTATTGATAATAATAATAATGTTACTGTATGTATCATGTTAAGTAAAAGTATGATTTCACCAGTTTGATTCGAGTCTCAAACTAGGACGAAACGGCCGTCCAGGTTTTCCATAGTAGTCTAGCTTTATTCGACTCATGAATTCAATTATTAAATTGCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD116307             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCATTTAACGATGGTAAATTCGTATTCATTATTCTGTTTTATTATTAGTGACAGTATGTTTTGTAATACTATTGATAATAATAATAATGTTACTGTATGTATCATGTTAAGTAAAAGTATGATTTCACCAGTTTGATTCGAGTCTCAAACTAGGACGAAACGGCCGTCCAGGTTTTCCATAGTAGTCTAGCTTTATTCGACTCATGAATTCAATTATTAAATTGCTACAAACTCCATAAAACCCCCTTTTTGATATATTTAAGTAAATAACTTGTTGTAATTACCTTGTGTTTGGTGCGTGCTAACGAGTCGGATGCCACAGTTGACTTCCAACTCCTCCGAGCCACTAGCAACGAAAAGTCTGATATGAGTGAAATGATCTGAAGCTGATGACACTCGAACTAGTGATATAATATGGAAAGGAGTGTCGGTCGATGGGCCGTGTTTTTTGAGCAATATTTCAGGTGATGTGTTACCCCACCGATA]




>consensus_4429#0
GTAAGCATATCCATACTACCCCTATGTATACCTAAAAGGATCTCTTTTGTTATGTTGCTT
ACAGTAATCTTAAAGAACTAATTGATGCTAGGCATATTATAATATTACTCTTTTTTAACA
TCACTAATCATGCATAACGACTTCTATTAGTGAGTATGTTTCTATGTACAAATGGAATAT
GTTTTCAACTGTATCCTGTCTCTCTCTCGCACACACACACACACACCTACAAGTGGATGT
CAATACATAATCAGTTTTGTTGATTTAGGTAGACATCATCAATAATTAGTAGAATGAATG
TGATTGTCACATTGTATCATTACTATTGTTGATGGTGTTGTTCCCTTTTTTATTCCCGGT
ACATTCATTTAACGATTGTAAATTCGTATTCATTATTCTGTTTTATTATTAGTGACAGTA
TGTTTTGTAATACTATTGATAATAATAATAATGTTACTGTATGTATCATGTTAAGTAAAA
GTATGATTTCACCAGTTTGATTCGAGTCTCAAACTAGGACGAAACGGCCGTCCAGGTTTT
CCATAGTAGTCTAGCTTTATTCGACTCATGAATTCAATTATTAAATTGCTACAAACTCCA
TAAAACCCCCTTTTTGATATATTTAAGTAAATAACTTGTTGTAATTACCTTGTGTTTGGT
GCGTGCTAACGAGTCGGATGCCACAGTTGACTTCCAACTCCTCCGAGCCACTAGCAACGA
AAAGTCTGATATGAGTGAAATGATCTGAAGCTGATGACACTCGAACTAGTGATATAATAT
GGAAAGGAGTGTCGGTCGATGGGCCGTGTTTTTTGAGCAATATTTCAGGTGATGTGTTAC
CCCACCGATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case