Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4938 cluster # 4938       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4938#0 length = 442 sequences # 3  

consensusID : consensus_4938#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 442
fasta sequence
                              [ACCAATTATAAAATTAATCCCAAATATTATGTACACAAAATTGAACCAAGAGAAAAGTAACCAATCATCAATACAATTCAGTAAGCATTAAAAATTGATTATCATTATGAAAGTAGTAAACAAAATTCATTGATTGATCAATATGGATATTTGTAATTATTAAGATTAATTAATGAATTAATTATCATAGTTTATCTTTGCAAATTGAACTGAAGTAAAAGGAAGAAGCAAATGAATGGTTACTTATTAAAAGTATAGGGGTATATTGTCTTTCTTTACCTTTTACTCTCTTTATTGATATGATATACATCACTGGTGGAATACATTCATGTATGCGGTATATATATATATATATATGTGAATGGTTAATATTGTTAGATCAGGTATTCCATTTCATATTGTACTTTTTTTTTTAAAAAAAAAGGGTTTCTAATTCAATCAA]

[-] EMBL AW146500             [ACCAATTATAAAATTAATCCCAAATATTATGTACACAAAATTGAACCAAGAGAAAAGTAACCAATCATCAATACAATTCAGTAGGCATTAAAAATTGATTATCATTATGAAAGTAGTAAACAAAATTCATTGATTGATCAATATGGATATTTGTAATTATTAAGATTAATTAATGAATTAATTATCATAGTTTATCTTTGCAAATTGAACTGAAGTAAAAGGAAGAAGCAAATGAATGGTTACTTATTAAAAGTATAGGGGT                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD197194             [                                                             CAATCATCAATACAATTCAGTAAGCATTAAAAATTGATTATCATTATGAAAGTAGTAAACAAAATTCATTGATTGATCAATATGGATATTTGTAATTATTAAGATTAATTAATGAATTAATTATCATAGTTTATCTTTGCAAATTGAACTGAAGTAAAAGGAAGAAGCAAATGAATGGTTACTTATTAAAAGTATAGGGGTATATTGTCTTTCTTTACCTTTTACTCTCTTTATTGATATGATATACATCACTGGTGGAATACATTCATGTATGCGGTATATATATATATATATATGTGAATGGTTAATATTGTTAGATCAGGTATTCCATTTCATATTGTACTTTTTTTTTTAAAAAAAAAGGGTTTCTAATTCAATCA ]
[-] EMBL CD196946             [                                                              AATCATCAATACAATTCAGTAAGCATTAAAAATTGATTATCATTATGAAAGTAGTAAACAAAATTCATTGATTGATCAATATGGATATTTGTAATTATTAAGATTAATTAATGAATTAATTATCATAGTTTATCTTTGCAAATTGAACTGAAGTGAAAGGAAGAAGCAAATGAATGGTTACTTATTAAAAGTATAGGGGTATATTGTCTTTCTTTACCTTTTACTCTCTTTATTGATATGATATACATCACTGGTGGAATACATTCATGTATGCGGTATATATATATATATATATGTGAATGGTTAATATTGTTAGATCAGGTATTCCATTTCATATTGTAC TTTTTTTTTAAAAAAAAAGGGTTTCTAATTCAATCAA]


>consensus_4938#0 ACCAATTATAAAATTAATCCCAAATATTATGTACACAAAATTGAACCAAGAGAAAAGTAA CCAATCATCAATACAATTCAGTAAGCATTAAAAATTGATTATCATTATGAAAGTAGTAAA CAAAATTCATTGATTGATCAATATGGATATTTGTAATTATTAAGATTAATTAATGAATTA ATTATCATAGTTTATCTTTGCAAATTGAACTGAAGTAAAAGGAAGAAGCAAATGAATGGT TACTTATTAAAAGTATAGGGGTATATTGTCTTTCTTTACCTTTTACTCTCTTTATTGATA TGATATACATCACTGGTGGAATACATTCATGTATGCGGTATATATATATATATATATGTG AATGGTTAATATTGTTAGATCAGGTATTCCATTTCATATTGTACTTTTTTTTTTAAAAAA AAAGGGTTTCTAATTCAATCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)