cluster # 5523

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5523 cluster # 5523 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5523#0 length = 957 sequences # 3

consensusID : consensus_5523#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 957
fasta sequence

                              [NAAATAACACATCAGTCTCAGAAAATAATACTACCAACAACAATAGTAATGGTACTAATCAAACCAATAAAACCCGTCGAAGAAATAATTCCATGAATGTAAATTTTGAACGTGTTTTTGTTGAAATTGGTGGAATAACTGAATCACAGCCACATGGTACGGATCAGGTTGCTTTTTATCGTTTACGTCCTGACTATACAGTATTTTGTACCGCGGATTACATAAAACTCCCACAACAAGTTCGATATGTGAACTGTTGTGCGCATCAAGATACCAACCTGGTGTACATATTTTGGGAATCAACAAGTGAATTATCAGTTTTGGATCTTCATCGTCACACACTACGCTCACTAGCTCCCTTGGTTTCTTCCTCTACTTCATCTCCAAACGAAGCACGGATTCATGCTGGGTTATCGTGGGTTGGAGAGCATTTGTATGTAATTGGAGGATTTAGTGAGTTTGTTGGTGATGATCGACGCCCTACTGGTCCACGAGATGATGTCCACTGCTATGATCCGACAACGAATACATGGTCTTGCATTAAAGTTCTAAATACAACAGTCCCTCGAGCTATCTTCGGTTGTGTTTGTCTCAATATGTGATACACCAATATTGGGGTTGTACGAACTTTCATATCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCATAGCAAAAATTATGTTTATTTTAATGTGATACTTCCTAATCGTAGGACCTAAATATAAGAAGGATGTTTTCTGCCCACTTATTTTCATGTGATTTTTTAAAAATTTTTAACTGTGTCCATTATGCGAAGACATATATTTGCTCTTTAACTTGCCAAATTATTTCATTTTAATTGTCCCGCTGGTTCGGGTCGTACATTTGTTTTATGAGATATCACCTAGGCATTATAATCATGCAGAGTGTTATCCACAAAAATGCATTTATACTGT]

[+] EMBL CD079439             [NAAATAACACATCAGTCTCAGAAAATAATACTACCAACAACAATAGTAATGGTACTAATCAAACCAATAAAACCCGTCGAAGAAATAATTCCATGAATGTAAATTTTGAACGTGTTTTTGTTGAAATTGGTGGAATAACTGAATCACAGCCACATGGTACGGATCAGGTTGCTTTTTATCGTTTACGTCCTGACTATACAGTATTTTGTACCGCGGATTACATAAAACTCCCACAACAAGTTCGATATGTGAACTGTTGTGCGCATCAAGATACCAACCTGGTGTACATATTTTGGGAATCAACAAGTGAATTATCAGTTTTGGATCTTCATCGTCACACACTACGCTCACTAGCTCCCTTGGTTTCTTCCTCTACTTCATCTCCAAACGAAGCACGGATTCATGCTGGGTTATCGTGGGTTGGAGAGCATTTGTATGTAATTGGAGGATTTAGTGAGTTTGTTGGTGATGATCGACGCCCTACTGGTCCACGAGATGATGTCCACTGCTATGATCCGACAACGAATACATGGTCTTGCATTAAAGTTCTAAATACAACAGTCCCTCGAGCTATCTTCGGTTGTGTTTGTCTCAATATGTGATACACCAATATTGNGGTTGTACGAACTTTCATATCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCATAGCAAAAA TATGTTTATTTTAA                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD073710             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACAAGTGAATTATCAGTTTTGGATCTTCATCGTCACACACTACGCTCACTAGCTCCCTTGGTTTCTTCCTCTACTTCATCTCCAAACGAAGCACGGATTCATGCTGGGTTATCGTGGGTTGGAGAGCATTTGTATGTAATTGGAGGATTTAGTGAGTTTGTTGGTGATGATCGACGCCCTACTGGTCCACGAGATGATGTCCACTGCTATGATCCGACAACGAATACATGGTCTTGCATTAAAGTTTTAAATACAACAGTCCCTCGAGCTATCTTCGGTTGTGTTTGTCTCAATATGTGATACACCAATATTGGGGTTGTACGAACTTTCATATCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCATAGCAAAAATTATGTTTATTTTAATGTGATACTTCCTAATCGTAGGACCTAAATATAAGAAGGATGTTTTCTGCCCACTTATTTTCATGTGATTTTTTAAAAATTTTTAACTGTGTCCATTATGCGAAGACATATATTTGCTCTTTAACTTGCCAAATTATTTCATTTTAATTGTCCCGCTGGTTCGGGTCGTACATTTGTTTTATGAGATATCACCTAGGCATTATAATCATGCAGAGTGTTATCCACAAAAATGCATTTATACTGT]
[-] EMBL CD074410             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTGAATANTCAGTTNTGGATCTTCATCGTCACACACTACGCTCACTAGCTCCCTTGGTTTCTTCCTCTACTTCATCTCCAAACGAAGCACGGATTCATGCTGGGTTATCGTGGGTTGGAGAGCATTTGTATGTAATTGGAGGATTTAGTGAGTTTGTTGGTGATGATCGACGCCCTACTGGTCCACGAGATGATGTCCACTGCTATGATCCGACAACGAATACATGGTCTTGCATTAAAGTTCTAAATACAACAGTCCCTCGAGCTATCTTCGGTTGTGTTTGTCTCAATATGTGATACACCAATATTGGGGTTGTACGAACTTTCATATCC    TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCATAGCAAAAATTATGTTTATTTTAATGTGATACTTCCTAATCGTAGGACCTAAATAT ATAAGGATGTTTTCTGCCCACTTATTTTCATGTGATTTTTTAAAAATTTTTAACTGTGTCCATTATGCGAAGACATATATTTGCTCTTTAACTTGCCAAATTATTTCATTTTAATTGTCCCGCTGGTTCGGGTCGTACATTTGTTTTATGAGATATCACCTAGGCATTATAATCAT CAGAGTGTTATCCACAAAAATGCATTTAT     ]




>consensus_5523#0
NAAATAACACATCAGTCTCAGAAAATAATACTACCAACAACAATAGTAATGGTACTAATC
AAACCAATAAAACCCGTCGAAGAAATAATTCCATGAATGTAAATTTTGAACGTGTTTTTG
TTGAAATTGGTGGAATAACTGAATCACAGCCACATGGTACGGATCAGGTTGCTTTTTATC
GTTTACGTCCTGACTATACAGTATTTTGTACCGCGGATTACATAAAACTCCCACAACAAG
TTCGATATGTGAACTGTTGTGCGCATCAAGATACCAACCTGGTGTACATATTTTGGGAAT
CAACAAGTGAATTATCAGTTTTGGATCTTCATCGTCACACACTACGCTCACTAGCTCCCT
TGGTTTCTTCCTCTACTTCATCTCCAAACGAAGCACGGATTCATGCTGGGTTATCGTGGG
TTGGAGAGCATTTGTATGTAATTGGAGGATTTAGTGAGTTTGTTGGTGATGATCGACGCC
CTACTGGTCCACGAGATGATGTCCACTGCTATGATCCGACAACGAATACATGGTCTTGCA
TTAAAGTTCTAAATACAACAGTCCCTCGAGCTATCTTCGGTTGTGTTTGTCTCAATATGT
GATACACCAATATTGGGGTTGTACGAACTTTCATATCCTATATATATATATATATATATA
TATATATATATATATATATATATATATCATAGCAAAAATTATGTTTATTTTAATGTGATA
CTTCCTAATCGTAGGACCTAAATATAAGAAGGATGTTTTCTGCCCACTTATTTTCATGTG
ATTTTTTAAAAATTTTTAACTGTGTCCATTATGCGAAGACATATATTTGCTCTTTAACTT
GCCAAATTATTTCATTTTAATTGTCCCGCTGGTTCGGGTCGTACATTTGTTTTATGAGAT
ATCACCTAGGCATTATAATCATGCAGAGTGTTATCCACAAAAATGCATTTATACTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case