These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6868#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 853 fasta sequence [AATAGTTATTTCGTCATAATAGAGTTGACTTTTTAACTTCACATCAACGTTCATATTTCGGTTGATTAATGGATGTAAAAGTTGGTAAACCGAGAGAAAAGCCTTCATACTACGGTGGGGATAAAGTTGATGCTGACGATGAAGAATCTCAAAAGCTTTGTATTAATGATTGTCGACAAAAGCAGGCAGCATTGTACCCTCCCTTTTTGTTTAAATCCTCGTCGGCACAGTTGCTTCTCTCACCTCCAGATGCAAGTGAACTTCTTGTTATAACTGGTCAAAGTAGAATTCATCTATATATACAGCAAAATTTAAATGAACCTTCTCTCAAAACATGTGAAAATTACAATAACTCTAATCACTCAGACATCTCAAATCCTACTGAAGTCGATTTGGTTGTTTGCAAACTAAGTAATCTTAGTATTCCATCGTTTCCTCAAAATTTGTCTTCTGAAGTTTCAATATTTCGATCTCATGGACTTCCTTTACTTGTTTGGCCTAAGTCAGCTGATAAAAATGCTCATTCANAAGTATTTTAATGATAACTATCCGGATTGTGGTCGTTGGTTTAGTGAACTAGATAAAGTAACCGGCTGGTTAGAACAGAAATGGAGGCCATTAACACGAAACTTGGGGCATAGTTAATAATGATGAAATCAGTAATAATGATGATTGGATCGAATTGGATAAGAATATATGCATTCGTGGTCTTCCCACAAGTTGCGTTGCTGTAATTTATTTGAAAAACGTTCACACATATGAAAATATGCCAGTTTATAAAAGCTTACTTTACTCCTCGTCTAAATTTACACAGCTTTTCATCATAATCCATACATAGAGACTTGAGACATTA] [+] EMBL CD077898 [AATAGTTATTTCGTCATAATAGAGTTGACTTTTTAACTTCACATCAACGTTCATATTTCGGTTGATTAATGGATGTAAAAGTTGGTAAACCGAGAGAAAAGCCTTCATACTACGGTGGGGATAAAGTTGATGCTGACGATGAAGAATCTCAAAAGCTTTG ] [+] EMBL CD120324 [ GGATAAAGTTGATGCTGACGATGAAGAATCTCAAAAGCTTTGTATTAATGATTGTCGACAAAAGCAGGCAGCATTGTACCCTCCCTTTTTGTTTAAATCCTCGTCGGCACAGTTGCTTCTCTCACCTCCAGATGCAAGTGAACTTCTTGTTATAACTGGTCAAAGTAGAATTCATCTATATATACAGCAAAATTTAAATGAACCTTCTCTCAAAACATGTGAAAATTACAATAACTCTAATCACTCAGACATCTCANATCCTACTGAAGTCGATTTGGTTGTTTGCAAACTAAGTAATCTTAGTATTCCATCGTTTCCTCAAAATTTGTCTTCTGAAGTTTCAATATTTCGATCTCATGGACTTCCTTTACTTGTTTGGCCTAAGTCAGCTGATAAAAATGCTCATTCANAAGTATTTTAAT ] [+] EMBL AI964718 [ CTCAAAACATGTGDAAATTACAATAACTCTAATCACTCAGACATCTCAAATCCTACTGAAGTCGATTTGGTTGTTTGCAAACTAAGTAATCTTAGTATTCCATCGTTTCCTCAAAATTTGTCTTCTGAAGTTTCAATATTTCGATCTCATGGACTTCCTTTACTTGTTTGGCCTAGGTCAGCTGAT AAAATGCTCATTCAAAAGTATTTAAATGATAACTATCCGGATTGTGGTCGTTGGTTTAGTGAACTAGATAAAGTAACCGGCTGGTTAGAACAGAAATGGAGGCCATTAACACGAAACTTGGGGCATAGTTAATAATGATGAAATCAGTAATAATGATGATTGGATCGAATTGGATAAGAATATATGCATTCGTGGTCTTCCCACAAGTTGCGTTGCTGTAATTTATTTGAAAAACGTTCACACATATGAAAATATGCCAGTTTATAAAAGCTTACTTTACTCCTCGTCTAAATTTACACAGCTTTTCATCATAATCCATACATAGAGACTTGAGACATTA] [+] EMBL AI740272 [ CTCAAAACATGTGAAAATTACAATAACTCTAATCACTCAGACATCTCAAATCCTACTGAAGTCGATTTGGTTGTTTGCAAACTAAGTAATCTTAGTATTCCATCGTTTCCTCAAAATTTGTCTTCTGAAGTTTCA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||