These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6907#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1030 fasta sequence [TTGTTAGCGTGGATTTTACTGATTTTAAAGTTGTCATGTACATTGACAGAGAAGTTGCCAGTTATTATCTGGCACGGGATGGGCGATCGAGGGACGGGTATGGGTATACTTAAGCTGGCTACTGCGATACAAAACGAAATACCTAGGACATATGTCAAATGCATTACCACTAGTGACTCAGTAATTGAGGATATTGAAGATACATATTTCATGCCAATCAACGATCAATTGGATTATGTTTGTCGCATGATACATGAAGACAAAAACTTATCTAATGGTTTACATATGATTGGTATATCACAGGGTGGATTATTTGTTAGAGCGTTAGTCCAAAAATGCAATTTCTCGAAAGTTGGCACCGTTGTTTCGATTGGAGGACCTCAACAGGGTATATTTGGGATTCCGAAATGCATTAATGATGGCTTTATTCATCTATGCTTATTAATGAACGAGCTACTTTCATATGGAGCCTATATAAATTTTATTCAGAGCCACCTTGTTCAAGCTCAATACTGGCATGATCCATTGGAGGAAGATGTCTATCGCAAATACTCCCAATTTTTAGCTGATATTAATCAGGAAAATGAAATAAACGAAATTTATCGTGAAAAAATGAAAAATATTCAAAGATTAGTATTGGTAAAGTTTTCGGGTGACACTATTGTAATCCCCAAAGAATCTGAATGGTTTGGATTTTATCAGAATGGATCGTCGACAAATACAACAACGTTACAAGACAGCATTCTGTATACTGAAGATCGTCTAGGTCTTANAGAACTTGATAAAAGGGGTGATTTACATTNTATTGAAAAAGATGGTGATCATTTACATTNTGATGTGAATTGGTTTATTGAAAAGATTGTTATTGCTTTTTTGAAATAACTTTAATTCATAGAATATACACTATTTACTTCGTACATTTCAAAGTAGTATATATGGCATTNGGTAATTTTTGACCCGTTAATATCATACTGCAAGAACACATAATCTTTCTGATTTACATTAAAACTTTTTACATTTCTGAATAATT] [+] EMBL CD083504 [TTGTTAGCGTGGATTTTACTGATTTTAAAGTTGTCATGTACATTGACAGAGAAGTTGCCAGTTATTATCTGGCACGGGATGGGCGATCGAGGGACGGGTATGGGTATACTTAAGCTGGCTACTGCGATACAAAACGAAATACCTAGGACATATGTCAAATGCATTACCACTAGTGACTCAGTAATTGAGGATATTGAAGATACATATTTCATGCCAATCAACGATCAATTGGATTATGTTTGTCGCATGATACATGAAGACAAAAACTTATCTAATGGTTTACATATGATTGGTATATCACAGGGTGGATTATTTGTTAGAGCGTTAGTCCAAAAATGCAATTTCTCGAAAGTTGGCACCGTTGTTTCGATTGGAGGACCTCAACAGGGTATATTTGGGATTCCGAAATGCATTTATGATGGCTTTATTCATC ] [+] EMBL CD083572 [ ggCGGGTATGGGTATACTTAAGCTGGCTACTGCGATACAAAACGAAATACCTAGGACATATGTCAAATGCATTACCACTAGTGACTCAGTAATTGAGGATATTGAAGATACATATTTCATGCCAATCAACGATCAATTGGATTATGTTTGTCGCATGATACATGAAGACAAAAACTTATCTAATGGTTTACATATGATTGGTATATCACAGGGTGGATTATTTGTTAGAGCGTTAGTCCAAAAATGCAATTTCTCGAAAGTTGGCACCGTTGTTTCGATTGGAGGACCTCAACAGGGTATATTTGGGATTCCGAAATGCATTAATGATGGCTTTATTCATCTATGCTTATTAATGAACGAGCTACTTTCATATGGAGCCTATATAAATTTTATTCAGAGCCACCTTGTTCAAGCTCAATACTGGCATGATCCATTGGAGGAAGATGTCTATCGCAAATACTCCCAATTTTTAGCTGATATTAATCAGGAAAATGAAATAAACGAAATTTATCGTGAAAAAATGAAAAATATTCAAAGATTAGTATTG ] [+] EMBL CD079873 [ gTGAAGATACATATTTCATGCCAATCAACGATCAATTGGATTATGTTTGTCGCATGATACATGAAGACAAAAACTTATCTAATGGTTTACATATGATTGGTATATCACAGGGTGGATTATTTGTTAGAGCGTTAGTCCAAAAATGCAATTTCTCGAAAGTTGGCACCGTTGTTTCGATTGGAGGACCTCAACAGGGTATATTTGGGATTCCGAAATGCATTAATGATGGCTTTATTCATCTATGCTTATTAATGAACGAGCTACTTTCATATGGAGCCTATATAAATTTTATTCAGAGCCACCTTGTTCAAGCTCAATACTGGCATGATCCATTGGAGGAAGATGTCTATCGCAAATACTCCCAATTTTTAGCTGATATTAATCAGGAAAATGAAATAAACGAAATTTATCGTGAAAAAATGAAAAATATTCAAAGATTAGTATTGGTAAAGTTTTCGGGTGACACTATTGTAATCCCCAAAGAATCTGAATGGTTTGGATTTTATCAGAATGGATCGTCGACAAATACAACAACGTTACAAGACAGCATTCTGTATACTGAAGATCGTCTAGGTCTTANAGAACTTGATAAAAGGGGTGATTTACATTNTATTGAAAAAGATGGTGATCATTTACATTNTGATGTGAATTGGTTTATTGAAAAGATTGTTATTGCTTTTTTGAAATAACTTTAATTCATAGAATATACACTATTTACTTCGTACATTTCAAAGTAGTATATATGGCATTNGGTAATTTTTGACCCGTTAATATCATACTGCAAGAACACATAATCTTTCTGATTTACATTAAAACTTTTTACATTTCTGAATAATT] [+] EMBL CD079874 [ ACATAATTCATGCCAATCAACGATCAATTGGATTATGTTTGTCGCCTGATACATGAAGACAAAAACTTATCTAATGG TTACATATGATTGGTATATCACAGGGTGGATTATTTGTTAGAGCGTTAGTCCAAAAATGCAATTTCTCGAAAGTTGGCACCGTTGTTTCGATTGGAGGACCTCAACAGGGTATATTTGGGATTCCGAAATGCATTAATGATGGCTTTATTCATCTATGCTTATTAATGAACGATCTACTTTCATATGGAGCCTATATAAATTTTATTCAGAGCCACCTTGTTCAAGCTCAATACTGGCATGATCCATTGGAGGAAGATGTCTATCGCAGATACTCCCAATTTTTAGCTGATATTAATCAGGAAAATGAAATAAACGAAATTTATCGTGAAACAATGAAAAATATTCAAAGATTAGTATTGGTAAAGTTTTCGGGTGACACTATTGTAATCCCCAAAGAATCTGAATGGTTTG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||