These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6915#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 961 fasta sequence [TCCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGAGAGCAGCGCATCCGCGAGTGTTAACGATTGTTTACAATTTAAGGGTACAATCGGCTACCGTGTTCTATAACTTGGAGTCATATTGCCACGATGGGGGGACAACAAGAGACAGACAGTGTCACATATGGTTCATACTATTTGCAAATTGCTTTTAATCCTATCATGGGCTTGGATGAGGATATTGAAGCATTTACCGAAGAATTCGCCGATTTTGGCAGTCCTCGTTTTGTAGATTTTGTGGCGCTCTGGAAGAAGTACAAAATGATCCATTTAATTCAGGGAAGGCAGAGCCAACACGGTTTATATGACATAGTTGGCTGCATTTTTCACCGGTTGGTTAGTCTATTTCAGCCAACCTTATCTAGAAACAAGTTAGTTCGTATATGCGCACTTTACCTCCTCTATGCTTTCCACGGGAAGCAGCCTATTCGCAATCATGTTCATATACGTGTATGTCCTAAAAGTTGGTCTTGGATCTTACAAGTTGCTACAGAGGCTCGTGACGAAGGACACTTAGATGTCTATTATGTTTTTCGGAAACTATGTGCTGCGAATGCATTTCTATTTTGTGCAATGCGGCAAGTGTTATATCCAGGGGCTCCTCTTTTTGACAGTCCTGCTGTGAATCAGGATGATTTTACAGAAGACCATGCCGCCTTGCCAGATGAAGGTTTATCCGATGTATCAAAAGCTACTTTCAGTCATCGACGTGACCTTCTTACTTGTTCTCTACCTGTTGTCAAAGCTCTTCAGGCTCCTTCAGGATTAAACCAAACGGTACAATGTTTAAATATGAGTTTGTCGCGTTATGCTGAGGCCAAACGATTACTTACACAAAAAATTAGGGTAAATGATGGAAATATTGCTTTGGATTCTTCGAAGATACAAGGCAATGAGGGAATGGAAGATCCAGAGGAAGAATACTGCCAGGCCTA] [+] EMBL CD080396 [TCCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGAGAGCAGCGCATCCGCGAGTGTTAACGATTGTTTACAATTTAAGGGTACAATCGGCTACCGTGTTCTATAACTTGGAGTCATATTGCCACGATGGGGGGACAACAAGAGACAGACAGTGTCACATATGGTTCATACTATTTGCAAATTGCTTTTAATCCTATCATGGGCTTGGATGAGGATATTGAAGCATTTACCGAAGAATTCGCCGATTTTGGCAGTCCTCGTTTTGTAGATTTTGTGGCGCTCTGGAAGAAGTACAAAATGATCCATTTAATTCAGGGAAGGCAGAGCCAACACGGTTTATATGACATAGTTGGCTGCATTTTTCACCGGTTGGTTAGTCTATTTCAGCCAACCTTATCTAGAAACAAGTTAGTTCGTATATGCGCACTTTACCTCCTCTATGCTTTCCACGGGAAGCAGCCTATTCGCAATCATGTTCATATACGTGTATGTCCTAAAAGTTGGTCTTGGATCTTACAAGTTGCTACAGAGGCTCGTGACGAAGGACACTTAGATGTCTATTATGTTTTTCGGAAACTATGTGCTGCGAATGCATTTCTATTTTGTGCAATGCGGNCAGTGTTATATCCAGGGGCTCCTCTTTTTGACAGTCCTGCTGTGAATCAGGATGATTTTACAGAAGACCATGCC ] [+] EMBL CD115371 [ ACAAGCGACAGACAGTGTCACATATGGTTCATACTATTTGCAAATTGCTTTTAATCCTATCATGGGCTTGGATGAGGATATTGAAGCATTTACCGAAGAATTCGCCGATTTTGGCAGTCCTCGTTTTGTAGATTTTGTGGCGCTCTGGAAGAAGTACAAAATGATCCATTTAATTCAGGGAAGGCAGAGCCAACACGGTTTATATGACATAGTTGGCTGCATTTTTCACCGGTTGGTTAGTCTATTTCAGCCAACCTTATCTAGAAACAAGTTAGTTCGTATATGCGCACTTTACCTCCTCTATGCTTTCCATGGGAAGCAGCCTATTCGCAATCATGTTCATATACGTGTATGTCCTAAAAGTTGGTCTTGGATCTTACAAGTTGCTACAGAGGCTCGTGACGAAGGACACTTAGATGTCTATTATGTTTTTCGGAAACTATGTGCTGCGAATGCATTTCTATTTTGTGCAATGCGGCAAGTGTTATATCCAGGGGCTCCTCTNTTTGACAGTCCTGCTGTGAATCANGATGATTNTACAGAAGACCATGCC ] [-] EMBL CD115463 [ CCTATTCGCAATCATGTTCATATACGTGTATGTCCTAAAAGTTGGTCTTGGATCTTACAAGTTGCTACAGAGGCTCGTGACGAAGGACACTTAGATGTCTATTATGTTTTTCGGAAACTATGTGCTGCGAATGCATTTCTATTTTGTGCAATGCGGCAAGTGTTATATCCAGGGGCTCCTCTTTTTGACAGTCCTGCTGTGAATCAGGATGATTTTACAGAAGACCATGCCGCCTTGCCAGATGAAGGTTTATCCGATGTATCAAAAGCTACTTTCAGTCATCGACGTGACCTTCTTACTTGTTCTCTACCTGTTGTCAAAGCTCTTCAGGCTCCTTCAGGATTAAACCAAACGGTACAATGTTTAAATATGAGTTTGTCGCGTTATGCTGAGGCCAAACGATTACTTACACAAAAAATTAGGGTAAATGATGGAAATATTGCTTTGGATTCTTCGAAGATACAAGGCAATGAGGGAATGGAAGATCCAGAGGAAGAATACTGCCAGGCCTA] [-] EMBL CD189180 [ TTGCTACAGAGGCTCGTGACGAAGGACACTTAGATGTCTATTATGTTTTTCGGAAACTATGTGCTGCGAATGCATTTCTATTTTGTGCAATGCGGCAAGTGTTATATCCAGGGGCTCCTCTTTTTGACAGTCCTGCTGTGAATCAGGATGATTTTACAGAAGACCATGCCGCCTTGCCAGATGAAGGTTTATCCGATGTATCAAAAGCTATTTTCAGTCATCGACGTGACCTTCTTACTTGTTCTCTACCTGTTGTCAAAGCTCTTCAGGCTCCTTCAGGATTAAACCAAACGGTACAATGTTTAAATATGAGTTTGTCGCGTTATGCTGAGGCCAAACGATTACTTACACAAAAAATTAGGGTAAATGATGGAAATATTGCTTTGGATTCTTCGAAGATACAAGGCAATGAGGGAATGGAAGATCCAGAGGAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||