These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6984#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 528 fasta sequence [TTGTTGCATGGTCTTTTAAATCTACCTTAACAATGATCGCGCATTGGATGCCTTGTAAAATTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGATGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAGGGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCGTGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATAATCCTATGGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTCATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGTTCACACTTATTGTATGTCTTGTTATGCTGACGGCTAATGTTTTACATATCTGTACAACTAAACGAATGATGATCATACAAATATTNNTTTGTAACTGATTTTTTGACTTTATAAAG] [+] EMBL AI977207 [TTGTTGCATGGTCTTTTAAATCTACCTTAACAATGATCGCGCATTGGATGCCTTGTAAAATTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGATGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAGGGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCGTGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATAATCCTATGGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTCATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGCTCACACTTATTGAATGTCTTGTTATGCTGACGGCTAATGTTTTACATATCTGTACAACTAAACGAATGATGATCATACAAATATTNNTTTGTAACTGATTTTTTGACTTTATAAAG] [+] EMBL AI976854 [TTGTTGCATGGTCTTTTAAATCTACCTTAACAATGATCGCGCATTGGATGCCTTGTAAAATTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGATGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAGGGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCGTGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATAATCCTATGGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTCATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGTTCACACTTATTGTATGTCTTGTTATGCTGACGGCTAATGTTTTACATATCTGTACAACTAAACGAATGATGATCATACAAATATTTTTTTGTAACTGATTTTTTGACTTTATAAAG] [+] EMBL AI977201 [ acGCCTTGTAAAATTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGACGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTTAAATTTCCGTGGT ] [+] EMBL AA629493 [ TTTGAACGATGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAGGGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCGTGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATNNTCCTATGGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTCATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGTTCACACTTATTGTATGTCTTGTTATGCTGACNGCTAATGTTTTACATGNNTGTACAACTNAACGAATGATGAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||