These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7194#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 632 fasta sequence [TCCTCTACCACTAGACCTATCAGCAGACGTACATTAGGATCAAGTATGCTGTTCAATTCCGTCACTTCTCAGAGTCCTTTGTTAACAAATCGAACTTCTAATTTAATGAATTCACAACCTGCACTATTACCTACACCACAACAATCTACGCCGTCTGTCGGAACAGTTGCAACGATACAGCTGGAGGTCCCACGACCCCCTGCAATAATTCGGTGTGATAACGAACCCAATCGTGTCACTGTCGGGTTGTTAGATTTACAACCACGTTATGAATACGTAACTGTGCCAAAGCGTTCTTTGTATGCTTATTTGAAAGCGACAGCCGTGAACAATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATATGCC-GATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG-GTTG-TGATCAAGTTCCGGTCAGTGCAGAGGATAAAATTAAAGTT] [+] EMBL CD193075 [TCCTCTACCACTAGACCTATCAGCAGACGTACATTAGGATCAAGTATGCTGTTCAATTCCGTCACTTCTCAGAGTCCTTTGTTAACAAATCGAACTTCTAATTTAATGAATTCACAACCTGCACTATTACCTACACCACAACAATCTACGCCGTCTGTCGGAACAGTTGCAACGATACAGCTGGAGGTCCCACGACCCCCTGCAATAATTCGGTGTGATAACGAACCCAATCGTGTCACTGTCGGGTTGTTAGATTTACAACCACGTTATGAATACGTAACTGTGCCAAAGCGTTCTTTGTATGCTTATTTGAAAGCGACAGCCGTGAACAATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATATGCC GATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTATGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATGTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATGNGTTG TGATCA ] [+] EMBL CD158655 [ TTGTTAGATTTACAACCACGTTATGAATACGTAACTGTGCCAAAGCGTTCTTTGTATGCTTATTTGAAAGCGACAGCCGTGAACAATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATATGCC GATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG GTTGCTGATCAAGTTCCGGTCAGTGCAGAGGATAAAATTAAAGTT] [+] EMBL CD086601 [ CAATACAGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATATGCC GATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATGCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG GCTG Ttga ] [-] EMBL CD086592 [ ATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATA GCCGGATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG GTTGTTGAT ] [+] EMBL CD197420 [ GGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG GTTGTTGATCAAGTTCCAGTCAGTGCAGAGGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||