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Schistosoma mansoni
cluster # 7218 cluster # 7218       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7218#0 length = 1091 sequences # 5  
consensusID : consensus_7218#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1091
fasta sequence 
                              [TGTACGAGGCCACATTTAATTTATGTTAAATAAACAATAATTTGAGGAATACATTTTTATCAAAAATTTGTTTTAAAACTATTTTCAAAGTAATTATAAGACGGGACAAATTGAATAGCTACACAGTGATCAAATTCATAAATACTGAATTCAATTAATGAATGGTATACTTTGAAAACTGATTGGACGTTTGCACATCTGCTATCATTATAATACTATTTCAAATAGTTTAAAAAATGATCATACTATTAATGAAAGGTAGCTACAATCATGTGTTGGTATTACTATCGTTGATAATTTATGTATCTAGGCAATCAACAGTCAGTTCGGCTGTAGAACGTGGTAATGACTGTCCAGAAAGTCAACCTTGGCCTTGTCGAACACCTAGAATATGTCTATCTTTTGATTTTATTTGTGACGGGGAACCAGATTGTCCAGATGAATATGATGAAGATCCTGAAATGTGCACGGCAAAGTTAAGACCAGCACAAGAACATTTAGCTGGATTTATACATCGTTACCAAAACTGGCTAGTACCAAAGTTTTTAGGATATGGAACGCCAGAAGAATTAGCTGCCAAACTTGTTGAAAGCAAAACAGTATCGGATTATGCAAGAGCAGCAAAATTAAATGAGACACAATTAAAAAATTTAATTAAATTAATGGAAGGTGTTAAATCAGGCAAAGAAATGGAATTATTTTTA-TTGGGTATGCCATTAGGTGCATGGAGTGAATTATATACATTATTTCATCGTATTTATATTAGTGGATTTTTAGATAATTTAGAACCAGCTGAAAATTTTCAATCATTAAATCGACAACAAAAAGAAGAATTTTGGAGGAATCATATTTATCAACAAGTCAAACGTTTTCTTTATTAATATTAATTTTATTGAGAATATACACACAAAAAAAACCTTTTTTTTTGCTTATAAAATGATTTTGCTAGAATACTATGCAGAAACTTAAGTATCTATGTTCAGTAATAATAATAATGATACTTGCAATAAGTGAATTGATGAAATCTCTTATCATTCTAGTCTGATTGATTATAATAAACAGTATACAAAAAGAAATGTATTATACATTGT]

[+] EMBL CD082293             [TGTACGAGGCCACATTTAATTTATGTTAAATAAACAATAATTTGAGGAATACATTTTTATCAAAAATTTGTTTTAAAACTATTTTCAAAGTAATTATAAGACGGGACAAATTGAATAGCTACACAGTGATCAAATTCATAAATACTGAATTCAATTAATGAATGGTATACTTTGAAAACTGATTGGACGTTTGCACATCTGCTATCATTATAATACTATTTCAAATAGTTTAAAAAATGATCATACTATTAATGAAAGGTAGCTACAATCATGTGTTGGTATTACTATCGTTGATAATTTATGTATCTAGGCAATCAACAGTCAGTTCGGCTGTAGAACGTGGTAATGACTGTCCAGAAAGTCAACCTTGGCCTTGTCGAACACCTAGAATATGTCTATCTTTTGATTTTATTTGTGACGGGGAACCAGATTGTCCAGATGAATATGATGAAGATCCTGAAATGTGCACGGCAAAGTTAAGACCAGCACAAGAACATTTAGCTGGATTTATACATCGTTACCAAAACTGGCTAGTACCAAAGTTTTTAGGATATGGAACGCCAGAAGAATTAGCTGCCAAACTTGTTGAAAGCAAAACAGTATCGGATTATGCAAGAGCAGCANAATTAAATGAGACACAATTAAAAAATTTAATTAAATTAATGGAAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD078944             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGGCTGTAGAACGTGGTAATGACTGTCCAGAAAGTCAACCTTGGCCTTGTCGAACACCTAGAATATGTCTATCTTTTGATTTTATTTGTGACGGGGAACCAGATTGTCCAGATGAATATGATGAAGATCCTGAAATGTGCACGGCAAAGTTAAGACCAGCACAAGAACATTTAGCTGGATTTATACATCGTTACCAAAACTGGCTAGTACCAAAGTTTTTAGGATATGGAACGCCAGAAGAATTAGCTGCCAAACTTGTTGAAAGCAAAACAGTATCGGATTATGCAAGAGCAGCAAAATTAAATGAGACACAATTAAAAAATTTAATTAAATTAATGGAAGGTGTTAAATCAGGCAAAGAAATGGAATTATTTTTANTTGGGTATGCCATTANGNGCNTGGAGNGAANTATATACATTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD076991             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATATGATGAAGATCCTGAAATGTGCACGGCAAAGTTAAGACCAGCACAAGAACATTTAGCTGGATTTATACATCGTTACCAAAACTGGCTAGTACCAAAGTTTTTAGGATATGGAACGCCAGAAGAATTAGCTGCCAAACTTGTTGAAAGCAAAACAGTATCGGATTATGCAAGAGCAGCAAAATTAAATGAGACACAATTAAAAAATTTAATTAAATTAATGGAAGGTGTTAAATCAGGCAAAGAAATGGAATTATTTTTA TTGGGTATGCCATTAGGTGCATGGAGTGAATTATATACATTATTTCATCGTATTTATATTAGTGGATTTTTAGATAATTTAGAACCAGCTGAAAATTTTCAATCATTAAATCGACAACAAAAAGAAGAATTTTGGAGGAATCATATTTATCAACAAGTCAAACGTTTTCTTTATTAATATTAATTTTATTGAGAATATACACACAAAAAAAACCTTTTTTTTTGCTTATAAAATGATTTTGCTAGAATACTATGCAGAAACTTAAGTATCTATGTTCAGTAATAATAATAATGATACTTGCAATAAGTGAATTGATGAAATCTCTTATCATTCTAGTCTGATTGATTATGATAA                                 ]
[-] EMBL CD075898             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGACCAGCACAAGAACATTTAGCTGGATTTATACATCGTTACCAAAACTGGCTAGTACCAAAGTTTTTAGGATATGGAACGCCAGAAGAATTAGCTGCCAAACTTGTTGAAAGCAAAACAGTATCGGATTATGCAAGAGCAGCAAAATTAAATGAGACACAATTAAAAAATTTAATTAAATTAATGGAAGGTGTTAAATCAGGCAAAGAAATGGAATTATTTTTA TTGGGTATGCCATTAGGTGCATGGAGTGAATTATATACATTATTTCATCGTATTTATATTAGTGGATTTTTAGATAATTTAGAACCAGCTGAAAATTTTCAATCATTAAATCGACAACAAAAAGAAGAATTTTGGAGGAATCATATTTATCAACAAGTCAAACGTTTTCTTTATTAATATTAATTTTATTGAGAATATACACACAAAAAAAACCTTTTTTTTTGCTTATAAAATGATTTTGCTAGAATACTATGCAGAAACTTAAGTATCTATGTTCAGTAATAATAATAATGATACTTGCAATAAGTGAATTGATGAAATCTCTTATCATTCTAGTCTGATTGATTATAATAAACAGTATACAAAAAGAAATGTATTATACATTGT]
[-] EMBL CD076873             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCAAACGTTTTCTTTATTAATATTAATTTTATTGAGAATATACCCCCAAAAAAAACCTTTTTTTTTGCTTATAAAATGATTTTGCTAGAATACTATGCAGAAACTTAAGTATCTATGTTCAGTAATAATAATAATGATACTTGCAATAAGTGAATTGATGAAATCTCTTATCATTCTAGTCTGATTGATTATAATAA                                 ]




>consensus_7218#0
TGTACGAGGCCACATTTAATTTATGTTAAATAAACAATAATTTGAGGAATACATTTTTAT
CAAAAATTTGTTTTAAAACTATTTTCAAAGTAATTATAAGACGGGACAAATTGAATAGCT
ACACAGTGATCAAATTCATAAATACTGAATTCAATTAATGAATGGTATACTTTGAAAACT
GATTGGACGTTTGCACATCTGCTATCATTATAATACTATTTCAAATAGTTTAAAAAATGA
TCATACTATTAATGAAAGGTAGCTACAATCATGTGTTGGTATTACTATCGTTGATAATTT
ATGTATCTAGGCAATCAACAGTCAGTTCGGCTGTAGAACGTGGTAATGACTGTCCAGAAA
GTCAACCTTGGCCTTGTCGAACACCTAGAATATGTCTATCTTTTGATTTTATTTGTGACG
GGGAACCAGATTGTCCAGATGAATATGATGAAGATCCTGAAATGTGCACGGCAAAGTTAA
GACCAGCACAAGAACATTTAGCTGGATTTATACATCGTTACCAAAACTGGCTAGTACCAA
AGTTTTTAGGATATGGAACGCCAGAAGAATTAGCTGCCAAACTTGTTGAAAGCAAAACAG
TATCGGATTATGCAAGAGCAGCAAAATTAAATGAGACACAATTAAAAAATTTAATTAAAT
TAATGGAAGGTGTTAAATCAGGCAAAGAAATGGAATTATTTTTATTGGGTATGCCATTAG
GTGCATGGAGTGAATTATATACATTATTTCATCGTATTTATATTAGTGGATTTTTAGATA
ATTTAGAACCAGCTGAAAATTTTCAATCATTAAATCGACAACAAAAAGAAGAATTTTGGA
GGAATCATATTTATCAACAAGTCAAACGTTTTCTTTATTAATATTAATTTTATTGAGAAT
ATACACACAAAAAAAACCTTTTTTTTTGCTTATAAAATGATTTTGCTAGAATACTATGCA
GAAACTTAAGTATCTATGTTCAGTAATAATAATAATGATACTTGCAATAAGTGAATTGAT
GAAATCTCTTATCATTCTAGTCTGATTGATTATAATAAACAGTATACAAAAAGAAATGTA
TTATACATTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)