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Schistosoma mansoni
cluster # 727 cluster # 727       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_727#0 length = 660 sequences # 2  

consensusID : consensus_727#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 660
fasta sequence
                              [ATTTATTTAGGCATCGAGTTAACCTGGAATAATATGCTACTGTATAGTCGGAAAATGGATGCTTATTTCAAACTGACAATCGAAAAAACTATTAAAAATGACAACCACCAGATTCCAGCTCATTGATTTTATAGTATAGTACTCATTGTAATAATTTAAAACTTTAATTCTATCATGTGGACAAAATAAACATCCATCGATCGACCTATAATTTTCACTGGTTCGCCAACACACGTTACATTCCAAACAACTGTGAGCGCTTTAATGTTATAGGATCTATATACAGCTTATAGATAAGTGATTCCGATTAGGTATTTACTACATCATGTTACATAAATGCAAATCAACTGAAAGCAAACAATTAGTCTTCAGTAATATGCAAAAATTTCATTTTTTTTATTTGACTATTCTGTTGTTGTTTTTGATTGGTGAAATAAGCTTTTAGTGGATAAATGAGTTAACTAACCTGATAACCTAAATAGCAATAAAGGTTATCGATTTTTTGTACATTCCGTATCTAGTGATTAGTTAGTAATAAGGTGAATTTTGTGACTGTTATTAACTAATTGAAAAAGAAATAATTTCCTGTAGCCTAATTTAGATTTTATCAAATATATTTGTATGCATTAGTTTAAATTATGTTTTTCGTGTTTTGTTTAT]

[+] EMBL CD185212             [ATTTATTTAGGCATCGAGTTAACCTGGAATAATATGCTACTGTATAGTCGGAAAATGGATGCTTATTTCAAACTGACAATCGAAAAAACTATTAAAAATGACAACCACCAGATTCCAGCTCATTGATTTTATAGTATAGTACTCATTGTAATAATTTAAAACTTTAATTCTATCATGTGGACAAAATAAACATCCATCGATCGACCTATAATTTTCACTGGTTCGCCAACACACGTTACATTCCAAACAACTGTGAGCGCTTTAATGTTATAGGATCTATATACAGCTTATAGATAAGTGATTCCGATTAGGTATTTACTACATCATGTTACATAAATGCAAATCAACTGAAAGCAAACAATTAGTCTTCAGTAATATGCAAAAATTTCATTTTTTTTATTTGACTATTCTGTTGTTGTTTTTGA                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD192251             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATGCAAATCAACTGAAAGCAAACAATTAGTCTTCAGTAATATGCAAAAATTTCATTTTTTTTATTTGACTATTCTGTTGTTGTTTTTGATTGGTGAAATAAGCTTTTAGTGGATAAATGAGTTAACTAACCTGATAACCTAAATAGCAATAAAGGTTATCGATTTTTTGTACATTCCGTATCTAGTGATTAGTTAGTAATAAGGTGAATTTTGTGACTGTTATTAACTAATTGAAAAAGAAATAATTTCCTGTAGCCTAATTTAGATTTTATCAAATATATTTGTATGCATTAGTTTAAATTATGTTTTTCGTGTTTTGTTTAT]


>consensus_727#0 ATTTATTTAGGCATCGAGTTAACCTGGAATAATATGCTACTGTATAGTCGGAAAATGGAT GCTTATTTCAAACTGACAATCGAAAAAACTATTAAAAATGACAACCACCAGATTCCAGCT CATTGATTTTATAGTATAGTACTCATTGTAATAATTTAAAACTTTAATTCTATCATGTGG ACAAAATAAACATCCATCGATCGACCTATAATTTTCACTGGTTCGCCAACACACGTTACA TTCCAAACAACTGTGAGCGCTTTAATGTTATAGGATCTATATACAGCTTATAGATAAGTG ATTCCGATTAGGTATTTACTACATCATGTTACATAAATGCAAATCAACTGAAAGCAAACA ATTAGTCTTCAGTAATATGCAAAAATTTCATTTTTTTTATTTGACTATTCTGTTGTTGTT TTTGATTGGTGAAATAAGCTTTTAGTGGATAAATGAGTTAACTAACCTGATAACCTAAAT AGCAATAAAGGTTATCGATTTTTTGTACATTCCGTATCTAGTGATTAGTTAGTAATAAGG TGAATTTTGTGACTGTTATTAACTAATTGAAAAAGAAATAATTTCCTGTAGCCTAATTTA GATTTTATCAAATATATTTGTATGCATTAGTTTAAATTATGTTTTTCGTGTTTTGTTTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)