These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7576#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 700 fasta sequence [GAACCTGAGATTTTACGACTGAGTTATTCGGATCAAGCGATGTTACGTTATTCAGACTAGTGACCACCATTTGACTTGATCGGTAAAACTTGATCTGAACTAAGAACTTGATAAAATGATATTTGTTATTACTCAATGACTGAATAATTTAGAGCTTATGTTGATTAAAAGAAATAGTTGAAGAGACAGTATGATCTAATCAATAAACTATGAATATCAGTTACCTGTTTATGTCAAATACATATTAATTACGGTATCTAGAATATGAATAAAAGATCATTGACTTAAAACTTAAACAGCTGATGGAATGAAAGTGCAATACATACGGGAAGGATTTCTCAACCTTTGATTAGTAATCTGAAAACAACTAGATTTCGATTGTAATCCTTGTCACCAAATGATATACCTTTTTTCAAAAGAAAATTTACTTTTCTCCCTCGGCAAATAATGAAGCTGTATTAAATACAAAAAAGTAAATATTCATGGTTATGTTTTGTGTCTAAATGAGCTATAAACAGTGGAAAACCTTCCATTCTAGAAATGGAGGACACTTTCTGACCATATTAATTCAAATCATTATTTTATGATCAAATCAAGAAATTATGTCGACTTTTATAAGTAATCATTGATTTCTGTTGATTTCCTTTACCGTCTTANGAATC-CCG-AAATATCAAATAACTTACAAGTATTAAACTAACAC] [+] EMBL CD161902 [GAACCTGAGATTTTACGACTGAGTTATTCGGATCAAGCGATGTTACGTTATTCAGACTAGTGACCACCATTTGACTTGATCGGTAAAACTTGATCTGAACTAAGAACTTGATAAAATGATATTTGTTATTACTCAATGACTGAATAATTTAGAGCTTATGTTGATTAAAAGAAATAGTTGAAGAGACAGTATGATCTAATCAATAAACTATGAATATCAGTTACCTGTTTATGTCAAATACATATTAATTACGGTATCTAGAATATGAATAAAAGATCATTGACTTAAAACTTAAACAGCTGATGGAATGAAAGTGCAATACATACGGGAAGGATTTCTCAACCTTTGATTAGTAATCTGAAAACAACTAGATTTCGATTGTAATCCTTGTCACCAAATGATATACCTTTTTTCAAAAGAAAATTTACTTTTCTCCCTCGGCAAATAATGAAGCTGTATTAAATACAAAAAAGTAAATATTCATGGTTATGTTTTGTGTCTAAATGAGCTATAAACAGTGGAAAACCTTCCATTCTAGAAATGGAGGACACTTTCTGACCATATTAATTCAAATCATTATTTTATGATCAAATCAAGAAATTATGTCGACTTTTATAAGTAATCATTGATTTCTGTTGATTTCCTTTACCGTCTTANGAATCNCCG ANATATCAAATAACTTACAAGTATTAAACTAACAC] [+] EMBL CD161819 [ ACTGAGTTATTCGGATCAAGCGATGTTACGTTATTCAGACTAGTGACCACCATTTGACTTGATCGGTAAAACTTGATCTGAACTAAGAACTTGATAAAATGATATTTGTTATTACTCAATGACTGAATAATTTAGAGCTTATGTTGATTAAAAGAAATAGTTGAAGAGACAGTATGATCTAATCAATAAACTATGAATATCAGTTACCTGTTTATGTCAAATACATATTAATTACGGTATCTAGAATATGAATAAAAGATCATTGACTTAAAACTTAAACAGCTGATGGAACGAAAGTGCAATACATGCGGGAAGGATTTCTCAACCTTTGATTAGTAATCTGAAAA ] [+] EMBL CD161901 [ CTGAGTTATTCGGATCAAGCGATGTTACGTTATTCAGACTAGTGACCACCATTTGACTTGATCGGTAAAACTTGATCTGAACTAAGAACTTGATAAAATGATATTTGTTATTACTCAATGACTGAATAATTTAGAGCTTATGTTGATTAAAAGAAATAGTTGAAGAGACAGTATGATCTAATCAATAAACTATGAATATCAGTTACCTGTTTATGTCAAATACATATTAATTACGGTATCTAGAATATGAATAAAAGATCATTGACTTAAAACTTAAACAGCTGATGGAATAAAAGTGCAATACATACGGGAAGGATTTCTCAACCTTTGATTAGTAATCTGAAAACAACTAGATTTCGATTGTAATCCTTGTCACCAAATGATATACCTTTTTTCAAAAGAAAATTTACTTTTCTCCCTCGGCAAATAATGAAGCTGTATTAAATACAAAAAAGTAAATATTCATGGTTATGTTTTGTGTCTAAATGAGCTATAAACAGTGGAAAACCTTCCATTCTAGAAATGGAGGACACTTTCTGACCATATTAATTCAAATCATTATTTTATGATCAAATCAAGAAATTATGTCGACTTTTATAAGTAATCATTGATTTCTGTTGATTTCCTTTACCGTCTTAAGAATC CCG AAATATCANATAACTTACAAGTATTAAACT ] [+] EMBL CD161809 [ CTGAGTTATTCGGATCAAGCGATGTTACGTTATTCAGACTAGTGACCACCATTTGACTTGATCGGTAAAACTTGATCTGAACTAAGAACTTGATAAAATGATATTTGTTATTACTCAATGACTGAATAATTTAGAGCTTATGTTGATTAAAAGAAATAGTTGAAGAGACAGTATGATCTAATCAATAAACTATGAATATCAGTTACCTGTTTATGTCAAATACATATTAATTACGGTATCTAGAATATGAATAAAAGATCATTGACTTAAAACTTAAACAGCTGATGGAATGAAAGTGCAATACATACGGGAAGGATTTCTCAACCTTTGATTAGTAATCTGAAAACA ] [-] EMBL CD161938 [ TTCATGGTTATCTTTTGTGTGTAAATGAGCTATAAACAGTGCAAAACCTTCCATTCTAGAAATGGAGGACACTTTCTGACCATATTAATTCAAATCATTATTTTATGATCGAATCAAGAAATTATGTCGGCTTGTATAAGTAATCATTCATGTCTGTTGATTTCCTTTACCGTATTAGGAATC CCGAAAATATCGAATAACTTACAAGTATTAAACTAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||